| 一种基于极大团的蛋白质相互作用预测方法 |
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| 引用本文： | 王建新,蔡钊,李敏.一种基于极大团的蛋白质相互作用预测方法[J].高技术通讯,2009,19(1). |
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| 作者姓名： | 王建新 蔡钊 李敏 |
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| 作者单位： | 中南大学信息科学与工程学院,长沙,410083 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金，教育部新世纪优秀人才支持计划，教育部长江学者和创新团队发展计划 |
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| 摘 要： | 针对大规模、高通量方法识别出的蛋白质相互作用数据集包含噪声较高的问题,根据蛋白质相互作用网络中噪声数据的特点和网络拓扑属性,提出了一种基于极大团的相互作用预测方法以提高识别出的这种数据集的可靠性.该方法通过蛋白质与蛋白质团之间的关联程度来预测蛋白质间是否存在相互作用,同时结合噪声数据在网络中的特点将预测结果放大并将伪相互作用分离出来,最后可获得可靠性较高的预测数据集.实验结果显示,所提出的方法不仅可以预测更多相互作用而且具有更高的可靠性.
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| 关 键 词： | 蛋白质相互作用网络 相互作用预测 假阳性 极大团 |
A maximal clique-based method for predicting interactions in protein networks |
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| Wang Jianxin,Cai Zhao,Li Min.A maximal clique-based method for predicting interactions in protein networks[J].High Technology Letters,2009,19(1). |
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| Authors: | Wang Jianxin Cai Zhao Li Min |
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| Affiliation: | Wang Jianxin,Cai Zhao,Li Min(School of Information Science and Engineering,Central South University,Changsha 410083) |
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| Abstract: | This paper analyzes the problem that the protein-protein interaction datasets identified by present large-scale, highthroughput methods contain a relatively high level of noise, and then proposes a maximal clique-based method for predicting interactions in protein networks according to the distribution characteristics of noise data and topological properties in the networks, to overcome the drop of the reliability in the dataset identification due to the noise. The method predicts the interactions among pro... |
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| Keywords: | protein-protein interaction network interaction prediction false positive maximal clique |
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