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| 军曹鱼淋巴囊肿病毒的系统关系研究及基因型分析 | |
| 引用本文： | 闫秀英,孙修勤,吴淑勤,吴谡琦,张进兴,洪旭光,郑凤荣,曲凌云.军曹鱼淋巴囊肿病毒的系统关系研究及基因型分析[J].高技术通讯,2007,17(10):1087-1091. |
| 作者姓名： | 闫秀英 孙修勤 吴淑勤 吴谡琦 张进兴 洪旭光 郑凤荣 曲凌云 |
| 作者单位： | 1. 中国海洋大学生命科学与技术学部,青岛,266003 2. 国家海洋局第一海洋研究所,青岛,266061 3. 中国水产科学院珠江水产研究所,广州,510380 |
| 基金项目： | 国家高技术研究发展计划(863计划) |
| 摘 要： | 从患淋巴囊肿病的养殖军曹鱼肿瘤中分离到一种虹彩病毒,命名为淋巴囊肿病毒军曹鱼分离株(LCDV-rc).为探讨LCDV-rc的系统地位,从DNA水平上分析了该病毒株与淋巴囊肿病毒中国牙鲆分离株(LCDV-cn)、淋巴囊肿病毒韩国鲈鱼分离株(LCDV-sb)、淋巴囊肿病毒日本牙鲆分离株(LCDV-jf)、淋巴囊肿病毒欧洲分离株(LCDV-1)和淋巴囊肿病毒日本岩鱼分离株(LCDV-rf)的系统关系.以核衣壳蛋白(MCP)基因为分子标记,通过PCR扩增和克隆测序获得了长度为1356bp的含178个信息位点的mcp基因序列;用最大简约法、最大似然法、邻接法和Bayesian法构建了分子系统树并进行了置信度检验.结果表明,构建的淋巴囊肿病毒ML、NJ、MP和Bayesian系统树的拓扑结构一致,LCDV-rc和LCDV-sb聚为一支,LCDV-cn和LCDV-jf聚为一支,LCDV-1和LCDV-rf分别各为一支.在35种虹彩病毒的系统关系分析中,LCDV-rc与另5株淋巴囊肿病毒在系统树上聚为一大支,说明LCDV-rc与淋巴囊肿病毒的关系近于其他虹彩病毒.根据遗传距离和系统关系分析认为,LCDV-rc属于一种新的基因型,称其为淋巴囊肿病毒Ⅳ型基因型. |
| 关 键 词： | 虹彩病毒 淋巴囊肿病毒军曹鱼分离株(LCDV-rc) 系统关系 基因型 |
| 收稿时间： | 2006-11-30 |
| 修稿时间： | 2006年11月30 |
The phylogenetic analysis of LCDV-rc, a new genotype of lymphocystivirus isolated from China rachycentron canadum |
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| Yan Xiuying,Sun Xiuqin,Wu Shuqin,Wu Suqi,Zhang Jinxing,Hong Xuguang,Zheng Fengrong,Qu Lingyun.The phylogenetic analysis of LCDV-rc, a new genotype of lymphocystivirus isolated from China rachycentron canadum[J].High Technology Letters,2007,17(10):1087-1091. | |
| Authors: | Yan Xiuying Sun Xiuqin Wu Shuqin Wu Suqi Zhang Jinxing Hong Xuguang Zheng Fengrong Qu Lingyun |
| Affiliation: | 1College of Life Science and Technology, Ocean University of China, Qingdao 266003;2 First Institute of Oceanography, State Oceanic Administration, Qingdao 266061;3 Pearl River Fishery Research Institute, Chinese Academic of Fishery Science, Guangzhou 510380 |
| Abstract: | |
| Keywords: | |
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