| 鸡蛋卵转铁蛋白过敏原B细胞线性表位的预测研究 |
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| 引用本文： | 佟平,高金燕,陈红兵,李欣,简姗,张银.鸡蛋卵转铁蛋白过敏原B细胞线性表位的预测研究[J].食品科学,2011,32(17):225. |
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| 作者姓名： | 佟平 高金燕 陈红兵 李欣 简姗 张银 |
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| 作者单位： | 南昌大学食品科学与技术国家重点实验室;南昌大学中德联合研究院;南昌大学生命科学与食品工程学院食品系; |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目(31060215); 教育部新世纪优秀人才支持计划项目(NCET-08-0704); 南昌大学食品科学与技术国家重点实验室目标导向项目(SKLF-MB-201002) |
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| 摘 要： | 为预测鸡蛋过敏原卵转铁蛋白的B细胞线性表位,以GenBank中提供的鸡蛋卵转铁蛋白氨基酸序列为基础,分别用Jameson-Wolf法、Kyte-Doolittle法、Emini法和Karplus-Schulz法对鸡蛋卵转铁蛋白的抗原指数、亲水性、蛋白表面可及性及柔韧性进行预测,并用Chou-Fasman法和Deleage-Roux法预测其二级结构,综合分析以上预测结果,得出鸡蛋卵转铁蛋白可能的B细胞线性表位区。结果表明鸡蛋卵转铁蛋白存在7个潜在表位区,包括蛋白第174～181、215～222、231～240、288～294、332～344、415～429、547～555位可能为B细胞线性表位优势区域。该结果将有助于鸡蛋卵转铁蛋白B细胞表位的进一步精确定位。
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| 关 键 词： | 卵转铁蛋白 B细胞线性表位 鸡蛋过敏 预测 |
Prediction of B-cell Linear Epitopes in Egg Allergen Ovotransferrin |
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| TONG Ping,GAO Jin-yan,CHEN Hong-bing,LI Xin,JIAN Shan,ZHANG Yin.Prediction of B-cell Linear Epitopes in Egg Allergen Ovotransferrin[J].Food Science,2011,32(17):225. |
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| Authors: | TONG Ping GAO Jin-yan CHEN Hong-bing LI Xin JIAN Shan ZHANG Yin |
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| Affiliation: | TONG Ping1,2,GAO Jin-yan3,CHEN Hong-bing1,LI Xin1,JIAN Shan1,ZHANG Yin1,2(1.State Key Laboratory of Food Science and Technology,Nanchang University,Nanchang 330047,China,2.Sino-German Joint Research Institute,3.Department of Food Science,School of Life Sciences and Food Engineering,China) |
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| Abstract: | In order to predict B-cell linear epitopes of egg allergen ovotransferrin(OVT),the antigen index,hydrophilicity,and surface accessibility and flexibility of egg OVT were predicted using Jameson-Wolf,Kyte-Doolittle,Emini and Karplus-Schulz methods,respectively.The secondary structure of OVT was predicted by Chou-Fasman and Deleage-Roux methods based on the amino acid sequence of egg OVT derived from Genbank.Based on the above comprehensive analysis,7 possible B-cell linear epitope candidates in egg OVT were ... |
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| Keywords: | ovotransferrin B-cell linear epitope egg allergy prediction |
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