| 比较基因组揭示广西酸菜乳杆菌碳水化合物活性酶谱 |
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| 引用本文： | 彭明芳,李培骏,单杨,陈玉秋,杨岱峻,雷丽嫦,黄芝辉,余孔新.比较基因组揭示广西酸菜乳杆菌碳水化合物活性酶谱[J].食品与发酵工业,2021(4):68-73. |
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| 作者姓名： | 彭明芳 李培骏 单杨 陈玉秋 杨岱峻 雷丽嫦 黄芝辉 余孔新 |
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| 作者单位： | 桂林理工大学化学与生物工程学院;湖南省农业科学院;湖南大学研究生院隆平分院 |
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| 基金项目： | 广西特聘专家团队项目(厅发[2018]39);广西科技基地和人才专项(桂科AD19110074);广西中青年教师基础能力提升项目(2018KY0257);广西电磁化学功能物质重点实验室开放基金(EMFM20162204)。 |
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| 摘 要： | 微生物中的碳水化合物活性酶(carbohydrate active enzymes,CAZymes)具有降解植物组织的作用,相对于真菌,目前对于乳杆菌的CAZymes研究还比较少。该研究从广西酸菜中筛选获得了3株产CAZymes的乳杆菌,并通过二代测序技术比较其编码基因。16S rRNA测序结果表明3株乳杆菌分别是Lactobacillus brevis DC4,Lactobacillus plantarum GLKK1和GLKK2;经液态发酵后,L.brevis DC4产果胶酶、纤维素酶和半纤维素酶分别为(0.40±0.01)、(0.04±0.01)和(0.19±0.01)U/mL。乳杆菌DC4、GLKK1和GLKK2编码序列分别有2615、3355以及3270个,COG注释均集中在碳水化合物转运与代谢、转录、氨基酸转运与代谢等;CAZymes注释均集中在糖苷水解酶(glycoside hydrolases,GHs)、糖基转移酶(glycosyl transferases,GTs)和碳水化合物酯酶(carbohydrate esterases,CEs)。3株乳杆菌包含17种CAZymes共有基因,包括纤维素、半纤维素、果胶、淀粉水解酶和酯酶。此外,L.brevis DC4菌株有10种特有基因,包括GH8、GH30和GH51家族,而L.plantarum GLKK1和L.plantarum GLKK2包含7种特有基因,包括GH39、GH13、CE2和GH78家族。
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| 关 键 词： | 乳杆菌 碳水化合物活性酶 植物多糖 比较基因组 酸菜 |
Comparative genome analysis of carbohydrate activity enzymes zymogram of Lactobacillus from Guangxi pickle |
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| PENG Mingfang,LI Peijun,SHAN Yang,CHEN Yuqiu,YANG Daijun,LEI Lichang,HUANG Zhihui,YU Kongxin.Comparative genome analysis of carbohydrate activity enzymes zymogram of Lactobacillus from Guangxi pickle[J].Food and Fermentation Industries,2021(4):68-73. |
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| Authors: | PENG Mingfang LI Peijun SHAN Yang CHEN Yuqiu YANG Daijun LEI Lichang HUANG Zhihui YU Kongxin |
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| Affiliation: | (College of Chemistry and Bioengineering,Guilin University of technology,Guilin 541004,China;Hunan Academy of Agricultural Sciences,Hunan Agricultural Processing Institute,Changsha 410125,China;Longping Branch Graduate School,Hunan University,Changsha 410125,China) |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Lactobacillus spp carbohydrate active enzymes plant polysaccharides comparative genome pickle |
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