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基于LC-MS/MS和比较基因组学技术解析海洋源解淀粉芽孢杆菌CMT-9产抗菌脂肽的分子机理
引用本文:花梅芳,李东迅,邓旗,孙力军,钟赛意,廖建萌.基于LC-MS/MS和比较基因组学技术解析海洋源解淀粉芽孢杆菌CMT-9产抗菌脂肽的分子机理[J].食品与发酵工业,2023(3):9-15.
作者姓名:花梅芳  李东迅  邓旗  孙力军  钟赛意  廖建萌
作者单位:1. 广东海洋大学食品科技学院广东省水产品加工与安全重点实验室广东省海洋食品工程技术研究中心广东省海洋生物制品工程实验室水产品深加工广东普通高等学校重点实验室;2. 海洋食品精深加工关键技术省部共建协同创新中心(大连工业大学);3. 湛江市食品药品检验所
摘    要:为探究海洋源解淀粉芽孢杆菌(Bacillus amyloliquefaciens)CMT-9产抗菌脂肽的分子机理。采用高效液相色谱串联质谱(liquid chromatography tandem mass spectrometry, LC-MS/MS)技术检测CMT-9发酵液的主要组分,结合Illumina高通量测序解析CMT-9的全基因组信息,并将其与B.velezensis CMT-6、B.amyloliquefaciens DSM7T、B.velezensis FZB42和B.subtilis 168中脂肽合成相关的代谢通路和关键基因进行比较分析。结果表明,CMT-9的发酵液含有表面活性素、伊枯草菌素、芬荠素3种脂肽。全基因组测序分析发现,CMT-9菌株染色体的基因组全长为3 928 149 bp, G+C含量为43.39%,tRNA数量为83,rRNA为9。通过GO、KEGG、COG数据库比对,其差异基因主要富集在碳水化合物代谢和氨基酸代谢等合成脂肽的相关通路;脂肽谱相近的菌株CMT-9、CMT-6、FZB42在基因组组分、G+C含量、共线性、同源性和共...

关 键 词:解淀粉芽孢杆菌CMT-9  抗菌脂肽  高效液相色谱串联质谱  全基因组测序  比较基因组学
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