基于Agent和FSM的细胞信号转导网络仿真

针对现有细胞信号转导网络仿真方法的不足,提出一种基于Agent和FSM的仿真方法,在宏观水平与微观水平之间构建多Agent系统,仿真复杂的细胞信号转导网络。融合了智能Agent技术和FSM模型实现分子建模,有效地模拟了信号传递的分子机制,并减少了外部通信。采用定性仿真建模分子构象,降低了组合复杂性。通过仿真实验证明了方法的有效性。     

基于Morris法的细胞信号转导网络全局灵敏性分析

细胞信号转导网络的结构复杂和动力学参数的不确定影响着系统的动态特性,如何定量系统输出与参数变化的关系,以及参数间的相互影响,已经成为系统生物学研究的重要问题之一。以TNF-α诱导NF-kB信号转导网络作为研究对象,采用Morris法的全局灵敏性分析技术,研究参数变化对输出NF-kBn的影响,确定参数的全局灵敏度。仿真结果表明,系统输出NF-kBn对于参数θ_(28)、θ_(36)、θ_(52)、θ_(61)、θ9、θ_(29)、θ_(19)和θ_(62)比较敏感,故它们影响着NF-kBn的振荡特性,从而说明这些参数是NF-kB信号转导网络关键的速率常数。     

细胞信号转导网络输入信号的最优实验设计

细胞信号转导网络的结构复杂,规模庞大,具有高度非线性,数学模型的参数和变量数目很多,有效估计未知参数是系统生物学主要的研究问题之一。提出以Fisher信息矩阵和估计参数的协方差矩阵为基础,利用不同的优化实验设计方法,研究NF-κB信号转导网络输人信号IKK初浓度的最优设计问题,分析模型参数的置信区间,为参数估计设计优化实验。仿真结果表明,采用E-最优实验设计准则,获得输入信号IKK初浓度为0.06μM,能够提供较多的实验信息,提高参数估计的精度。     

人体生理系统计算机仿真

人体生理系统是一个复杂的非线性动态系统，本文根据人体生理系统的数学模型Ｈｕｍａｎ，介绍了基于这种数学模型的仿真方法，并在微机上实现了计算机仿真系统ＨＰＳＳ，在文章的最后给出了若干仿真实验的结果。     

细胞复杂信号转导模拟系统的设计与实现

对于细胞复杂信号转导系统的计算机模拟,提出了一个基于胞内生物化学反应为中心的关系数据库的系统模型在此数据库模型的基础上,通过整合各信号途径,形成复杂的细胞信号转导网络,并进行模拟运算和图形输出采用VFP和VC 作为工具,对该模拟系统进行了设计和实现。     

生化过程计算机仿真

由于生化过程的复杂性和多样性,对生化过程的研究一直缺乏一个完整、方便实用的模型库来提供给需要者。该文介绍设计和实现生化过程模型库及计算机辅助设计（ＢｉｏＣＡＤ）系统。该系统总结了大量已有的过程模型和实际生产数据,在计算机上建立了生化反应过程的模型库,并且提供了方便的仿真工具。     

细胞信号转导的复杂网络分析

基于KEGG数据库,构建了一个节点数N=933,连接数L=6825的细胞信号转导网络．该网络为具幂律形式的度分布、遵循BA模型的无尺度网络;其中γ指数为1．7,平均路径长度5．63。通过广度优先搜索算法构建本网络的距离矩阵,并进行聚类分析,实现了对该信号网络的可视化处理和拓扑结构分析。结果表明,此细胞信号转导网络可以较好地描述细胞内蛋白质之间的相互作用关系,其基本属性与先验知识有较好的一致性。     

计算机仿真建模方法（二）

本讲给出两种建模方法的设计思想，作为这些思想应用的例子，介绍了Ａｄａｍｓ方法和ＲｕｎｇｅＫｕｔｔａ方法。     

线性控制系统计算机仿真的编程探析

本文从系统的传递函数出发,介绍了一种基于幂级数计算的线性控制系统的计算机仿真的实用算法和编程技巧,并总结出这种算法的编程思路。     

基于元胞自动机的植物生态仿真系统研究

为了建立植物生态系统微观与宏观之问的关联,并在多个层次上描述生态系统复杂性,文中建立了一个基于元胞自动机理论的植物生态仿真系统,以研究单植株与整体生态现象之间的关系.该方法避免了传统分析方法中直接求取单株属性与宏观统计量之间解析关系所遇到的困难,而且相较于其它模拟方法,元胞自动机理论提供了更为完善的理论框架,并且元胞空间与植物分布空间有着直接映射关系.为了说明该系统的有效性,选择了生态学中的一个实例濒危植物明党参(Changium smyrnioides)的种群生长进行了动态模拟,并选取同科的峨参(Anthriscus sylvestris)作为对照种进行了比较分析.实验分析表明,仿真系统能够较好的重现出物种个体规律和整体生态现象之间的关系,获得物种在不同生存策略上的显著差异,而且这些结果与实际生态学结论相吻合. 观统计量之间解析关系所遇到的困难,而且相较于其它模拟方法,元胞自动机理论提供了更为完善的理论框架,并且元胞空间与植物分布空问有着直接映射关系.为了说明该系统的有效性,选择了生态学中的一个实例濒危植物明党参(Changium smyrnioides)的种群生长进行了动态模拟,并选取同科的峨参(Anth iscus sylvestris)作为对照种进行了比较分析.实验分析表明,仿真系统能够较好的重现出物种个体规律和整体生态现象之间的关系,获得物种在不同生存策略上的显著差异,而且这些结果与实际生态学结论相吻合. 观统计量之间解析关系所遇到的困难,而且相较于其它模拟方法,元胞自动机理论提供了更为完善的     

神经网络控制系统计算机仿真研究

本文给出了一种基于神经网络预测控制新算法,并针对该算法用C＋＋进行了仿真程序设计,仿真程序具有Windows风格的输入界面和逻辑位图的仿真曲线输出图形,对非线性控制系统计算机仿真结果表明,基于神经网络预测控制新方法响应速度快,鲁椿性好,并可实现无形态余差。     

基于Matlab的元胞自动机的仿真设计

元胞自动机不仅是理论计算机科学领域的一个重要的计算模型 ,而且可视为一无限维的离散动力系统 ,被广泛应用于自然科学和社会科学各领域的复杂性的研究中 ,是一个重要的研究方法和工具。该文以Matlab为开发工具 ,开发了元胞自动机的可视模型 ,为其在各个领域的复杂性研究提供了一个简易、可行的计算机仿真工具。     

细胞结构与生物器官组织的计算机仿真

该文介绍了细胞结构的计算机仿真方法，二维肥皂泡的计算机仿真方法具有普遍性，这一方法可应用于其它领域类似的课题，生命科学中使用计算机仿真及其独特的优越性，本文还介绍了非洲爪蟾脊索器官形成的计算机仿真方法。     

Stability and Existence of Periodic Solutions of Periodic Cellular Neural Networks with Time-Vary Delays

By using the continuation theorem of Mawhins coincidence degree theory and constructing a suitable Lyapunov function, some new sufficient conditions are obtained ensuring existence and global asymptotical stability of periodic solution of cellular neural networks with periodic coefficients and delays, which do not require the activation functions to be differentiable and monotone nondecreasing. A numerical example is given to illustrate that the criteria are feasible. These results are helpful to design globally asymptotically stable and periodic oscillatory cellular neural networks.     

基于元胞自动机的交通流计算机模拟

元胞自动机是把复杂系统量化为简单的个体,在元胞自动机模型中.空间、时间都被离散化,每一个相互作用的单元仅为有限的状态.以元胞自动机理论为基础,把车辆在路段上交通流中运动的变化规律表述为元胞自动机的演化规则,建立了基于元胞自动机理论的交通流模拟模型,标定了元胞长度和最大速度等参数,分析了元胞变换的原则;详细探讨了元胞自动机在道路交通模拟中的应用,设计出了交通元胞自动机的结构,分析了交通元胞自动机所采取的状态变换原则,建立了一维(单车道)交通流模拟模型;并利用C语言编程实现模拟.模拟结果符合实际交通流的特点.     

计算机网络课程教学改革与实践

计算机网络是计算机科学与技术专业学生必修的一门核心课程.本文对计算机网络课程的教学改革进行了有益的探讨,提出了在计算机网络课程的教学中大胆引进国外著名大学的原版教材,采用双语教学;根据计算机网络发展的要求,设置先进的教学内容;特别强调重视学生动手能力的培养,鼓励学生参与网络协议的开发研究等等;在教学方法上,根据学生的要求和课程的特点,也进行了大胆的改革和创新.     

计算机网络信息安全与防范

随着计算机信息技术的飞速发展,计算机网络已广泛用于经济、军事、教育等各个领域。计算机网络在带来海量信息的同时,由于网络的开放性和自由性也产生了私有信息和数据被破坏或侵犯的可能性。因此,网络信息的安全性变得日益重要起来。对目前计算机网络存在的安全隐患进行了分析,并探讨了针对计算机安全隐患的防范策略。