高通量测序技术在航天大曲微生物多样性中的应用

太空搭载微生物已有多年历史,因太空具有超真空、超洁净、微重力、强辐射的特殊环境,可以引起染色体变异,导致表达性状改变。牛栏山酒厂利用太空搭载技术将牛栏山一号清香型低温大曲搭载神舟9号飞船,在太空遨游13 d,利用太空失重状态以及太空射线等因素对酒曲微生物进行诱导,采用免培养手段高通量测序技术对太空大曲和对照大曲进行微生物多样性分析。结果表明,大曲在航天飞行过程中,由于受到宇宙射线、高真空、弱磁场等多种环境因素的影响,改变了原有大曲中微生物的比例。     

应用高通量测序技术解析清香型大曲微生物多样性

目的:分析清香型大曲微生物整体数量、种类,确定清香型大曲优势菌,为进一步解析清香型大曲功能微生物,筛选优良酿造微生物奠定基础。方法:利用传统培养分离方法和高通量测序技术相结合,对采自北京、山西、台湾、黑龙江、河北5地的11份清香型大曲进行微生物种群多样性分析。结果:传统分离结果表明:11种清香大曲微生物总数各不相同,不同大曲中真菌数量均多于细菌数量。扣囊覆膜酵母是大曲真菌的主要组成部分,乳酸菌和芽孢杆菌分别构成不同大曲细菌的优势类群。高通量分析结果表明:11种大曲真菌多样性较为一致,扣囊覆膜酵母是优势真菌。细菌多样性则较为丰富,主要由乳酸菌、芽孢杆菌、放线菌、泛菌属、葡萄球菌5类组成。其中乳酸菌类是优势细菌,主要包括融合魏斯氏菌、戊糖片球菌、柠檬明串珠菌、耐酸乳杆菌这4个种。结论:清香型大曲微生物多样性丰富,不同大曲样品微生物总数差异较大,真菌数量远大于细菌数量。扣囊覆膜酵母、乳酸菌和芽孢杆菌为清香大曲真菌和细菌的主要组成部分。     

基于高通量测序技术分析牛栏山大曲微生物多样性

为了探究牛栏山大曲的微生物菌群结构,为制曲工艺及成品曲质量评估提供理论依据,该研究采用高通量测序方法对牛栏山低温大曲原核16S rDNA V3/V4区和真核ITS1区进行微生物多样性分析。研究结果表明,从牛栏山大曲中共获得358种原核操作分类单元（OTU）,乳酸菌类群是大曲中主体原核生物,维斯氏菌（Weissella confuse）、耐酸乳杆菌（Lactobacillus acetotolerans）和戊糖片球菌（Pediococcus pentosaceus）分别占大曲总OTU的22.68%、16.54%和9.84%,同时大曲中高温放线菌（Kroppenstedtia eburnea）可占14.78%;而真核多样性较低,仅获得69种OTU,扣囊覆膜酵母（Saccharomycopsis fibuligera）和库氏毕赤酵母（Pichia kudriavzevii）是主体真核微生物,其余真核微生物含量较低;综上得出,牛栏山大曲中原核微生物多样性要远高于真核微生物,且大曲主体微生物较为明显。     

高通量测序技术在乳制品研究中的应用

高通量测序技术以一次并行对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定为标志,目前已广泛应用于各个领域,对整个生命科学的发展起到极大的推动作用。本文结合前期开展的一些工作,综述高通量测序技术在乳制品微生物基因组和生物多样性中的应用情况。     

基于高通量测序技术分析北京清香型大曲微生物多样性

利用高通量测序方法对北京某清香型酒厂大曲细菌16S rDNA V4区和真菌ITS1区进行测序分析其微生物多样性,并对大曲微生物在不同分类水平相对丰度进行统计。结果表明：大曲中在细菌操作分类单元(OTU)为47、真菌OTU为11,细菌种类较真菌种类丰富;细菌中优势菌是乳酸菌,包括乳杆菌属、片球菌属、乳球菌属、明串珠菌属四个属。同时也检测到醋杆菌属、芽孢杆菌属等;真菌中优势菌是假丝酵母属,此外还有曲霉属、毛霉属、威克汉姆酵母属等;对大曲物种Alpha多样性分析表明测序深度基本覆盖该酒曲中微生物种类;最后分析讨论了大曲优势微生物在白酒酿造中的功能。该研究对于指导白酒生产具有重要意义。     

高通量测序技术在食品微生物检测中的应用

微生物超标及食源性致病菌引发的生物污染是影响国家公共卫生的主要因素。新一代的高通量测序技术因其高覆盖度、高灵敏度、高准确性和低成本等特点,已经作为食品安全检测最重要技术逐渐替代常规DNA诊断和微生物分型方法。本文通过综述测序的发展历史和二代测序原理及流程,着重论述以高通量测序为基础的16S rRNA、全基因组、宏基因组以及宏转录组分析在现代食品安全实验室中的应用,展现了高通量测序技术在食品微生物检测、食源性致病菌监控及食品发酵工艺等方面的巨大优势。     

高通量测序技术在肠道菌群研究中的应用

高通量技术作为新一代测序手段,可以同时对几百万DNA分子进行序列测定。肠道微生物作为人体最庞大、最复杂的微生态系统,高通量技术的出现能够完整快速地完成对肠道微生物群落信息的采集与分析,完善对肠道菌群的认识。总结高通量技术的主要方法及原理;介绍高通量技术在肠道微生物的多样性,与肥胖、过敏症、肠道疾病及其他疾病关系中的应用;综述宏基因组学在高通量平台下对肠道菌群的研究。旨在为今后肠道微生物的研究提供一定的参考,为高通量技术在肠道微生物中的研究提供新的思路。     

洋河大曲质量风格的探讨

洋河大曲质量风格的探讨郭永红，滕抗（江苏洋河酒厂）中国名酒洋河大曲素负盛名。自１９７９年获国家名酒称号以来，连获殊荣，在国际上。也得到金奖。洋河大曲之所以成为名酒。为酿酒专家所称道。深为广大消费者青睐，主要在于它具有独特的质量风格。一洋河大曲质量风格...     

基于高通量扩增子测序技术解析中高温大曲微生物来源

基于高通量测序技术分析中高温大曲及其制作环境的微生物群落结构,利用微生物溯源追踪技术对发酵开始时大曲中的微生物来源进行分析.研究结果表明,从曲室外到曲室内环境样品中的微生物逐渐被选择、富集.从大曲发酵开始到结束,细菌群落的多样性增加,而真菌群落的多样性降低.发酵开始时大曲中细菌以魏斯氏菌属(Weissella)为主,发...     

基于高通量测序技术分析浓香型白酒大曲真菌菌群多样性

采用高通量测序技术对15份浓香型白酒大曲真菌多样性进行分析。结果表明,不同样品真菌群落丰度和多样性存在显著差异。主坐标分析（PCoA）结果表明,样品NX-1、NX-3、NX-4、NX-10、NX-11真菌组成相似、样品NX-2、NX-8真菌组成相似、其余样品真菌组成存在差异。15份大曲样品中共检测到393个操作分类单元（OTUs）,隶属于6个门19个纲和117个属,其中子囊菌门（Ascomycota）、酵母纲（Saccharomycetes）和散囊菌纲（Eurotiomycetes）在15份大曲样品中的相对丰度均较高。在属分类水平上,15份大曲样品出现明显差异,样品NX-1、NX-4、NX-11中的热子囊菌属（Thermoascus）、嗜热真菌属（Thermomyces）,样品NX-3、NX-10、NX-13、NX-6和NX-14中的覆膜孢酵母属（Saccharomycopsis）、毕赤酵母属（Pichia）,样品NX-5、NX-12、NX-15、NX-7中的曲霉属（Aspergillus）,样品NX-9中的曲霉属和根毛霉属（Rhizomucor）、样品NX-2中的威克汉姆酵母属（Wickerhamomyces）、酵母属（Saccharomyces）,及样品NX-8中的耐碱酵母属（Galactomyces）和双足酵母属（Dipodascus）相对丰度较高。     

基于高通量测序技术解析高温大曲和中高温大曲的真菌群落结构

采用高通量测序技术对白酒高温大曲和中高温大曲进行分析,比较2种大曲真菌群落结构的差异。结果表明,霉菌是构成高温大曲的主要真菌,其中疏绵状嗜热丝孢菌(Thermomyces lanuginosus)和Wallemia sp.为高温大曲所特有,分别占总水平的80. 49%和4. 25%;酵母菌是构成中高温大曲的主要真菌,中高温大曲中霉菌含量仅有1/4左右,东方伊萨酵母(Issatchenkia orientalis)、扣囊复膜酵母(Saccharomycopsis fibuligera)、米曲霉(Aspergillus oryzae)、热带假丝酵母(Candida tropicalis)、阿氏丝孢酵母(Trichosporon asahii)、异常威克汉姆酵母(Wickerhamomyces anomalus)、微小根毛霉(Rhizomucor pusillus)为中高温大曲所特有,分别占总水平的38. 22%、25. 66%、21. 40%、3. 82%、2. 75%、1. 5%和1. 29%。此外,Aspergillus intermedius在高温大曲和中高温大曲中的含量分别为10. 95%和3. 45%。该研究初步揭示了高温大曲和中高温大曲真菌群落结构的差异,为大曲在酿造生产中的应用提供参考。     

高通量测序技术在酿酒微生物多样性研究中的应用

高通量测序技术是分析研究酿酒微生物多样性的重要手段,与其他方法相比,具有测序方法简单、通量高、速度快和准确度较高等特点。本文在阐述高通量测序技术特点和测序平台的基础上,着重介绍其在酿酒微生物多样性研究领域中常用的数据分析方法和应用现状,旨在为酿酒微生物多样性研究者提供较为系统、全面的关于高通量测序技术的使用策略。     

基于高通量测序技术分析南方清香型白酒大曲的微生物多样性

利用高通量测序技术对不同香型大曲及南北两地清香型大曲中微生物菌群结构进行分析比较。结果表明,南方清香型白酒大曲的细菌以芽孢杆菌属（Bacillus)为优势菌群,其次以魏斯氏菌属（Weissella)、片球菌属（Pediococcus)及其他乳酸菌（Lactobacillus)为主要菌群;真菌优势菌种为覆膜孢酵母属(Saccharomycopsis),其次是弯曲假丝酵母(Apiotrichum)、伊萨酵母属(Issatchenkia)、异常威克汉姆酵母属(Wickerhamomyces)等;霉菌以曲霉属(Aspergillus)占比最多。微生物群落由于制曲工艺不同与高温、中高温大曲有较为明显的差别,南北两地清香型白酒大曲的细菌真菌优势菌属均一致,但南方清香型白酒大曲中各类乳酸菌属与酵母属较北方清香型大曲丰富。     

高通量测序在动物检疫中的应用进展

面对无法预测、爆发突然及传播迅速的疫情,快速获知病原信息并真实地反映样品及环境中病原的多样性资料是各国卫生部门及口岸预警的核心工作之一。应用高通量测序技术全面监控研究复杂病原样品,是协助寻找传染溯源、防控动物疫病可行性的一条重要思路。目前,高通量测序在动物检疫上的应用与传统的病原研究方式最大的区别在于把病原微生物看成一个整体,摆脱了对单一病原分离培养的步骤,直接对样品基质中所有病原进行研究。随着测序技术和数据处理分析能力的飞速发展,以高通量测序为基础的宏基因组学研究已渗透到各个领域,在畜产品、养殖环境等样本检测方面显示了重要价值。本文对高通量测序的研究方法及在检验检疫上的应用趋势进行了综述。     

YH-AM复合酶制剂在洋河大曲生产中的研究与应用

从洋河酒厂在房大曲和酒醅中分离得到根霉菌、红曲霉、酵母茵，利用这3种菌株生产相应的粗酶制剂，并按4：4：2比例混合，制成复合酶制剂，可增加酒酷的糖化力、发酵力和酯化力。将该复合酶应用于大曲酒生产，不改变传统工艺，可提高出酒率7．21％，升级率提高19．55％。     

高通量测序技术在食醋涨壶微生物鉴定中的应用

利用高通量测序技术鉴定陈醋涨壶微生物菌群。提取陈醋样品中微生物元基因组,采用高通量测序并结合实时定量PCR检测技术对引起陈醋涨壶的微生物进行定性和定量检测。结果表明:陈醋中微生物以细菌为主,真菌为辅。16S r RNA V4区和ITS 1-2区的测序结果显示,与没有涨壶的陈醋样品相比,涨壶醋样中微生物数量增加了30倍,且主体菌群为厚壁菌门、广古菌门和变形菌门,其中厚壁菌门中的乳酸菌属占绝对优势。涨壶为多种微生物共同作用的结果,以芽孢杆菌为主。通过实时定量PCR对结果进行验证。以芽孢杆菌为主的多种产气微生物参与陈醋产品中气体的产生,最终导致产品贮存期的涨壶问题。     

高通量测序技术在食源性病原体快速检测中的应用进展

探讨高通量测序技术在食源性致病病原体早期检测方面的应用,以充分显示高通量测序技术在食品快速检测、预防食源性疾病传播、疫情调查及作为精细化食品安全管理手段等方面的巨大潜力。评价该技术的优势及缺陷,同时对其在食源性病原体快速检测的应用前景进行展望,以期推动、完善高通量技术在食品安全领域的应用。     

高通量测序技术及其在黄酒微生物多样性研究中的应用

黄酒是我国传统的发酵酒精饮料,口感醇厚、风味独特。由于传统微生物培养方法具有一定局限性,无法全面反映黄酒酿造微生物多样性,而高通量测序技术具备方法简单、通量更高、成本较低和速度较快等特点,将其应用于黄酒微生物多样性的研究中,为认识黄酒酿造微生物多样性提供了有利手段。该文综述了高通量测序技术的发展阶段、原理、方法、操作流程、数据分析方法及其在黄酒微生物多样性研究中的应用,并对黄酒微生物多样性的研究方向进行了展望,以期为全面解析传统黄酒酿造微生物多样性与群落结构提供参考。     

高通量测序技术在传统发酵食品微生物群落中的应用研究

传统发酵食品风味独特,营养丰富,历史悠久,生产方式多采用自然接种,部分食品的生产工艺已有数千年的历史,其最终质量与发酵过程中存在的多种微生物密切相关。研究表明,运用现代分子生物学技术,可从基因水平上揭示微生物的多样性和群落结构的动态变化,系统阐明其发酵机理。该文综述高通量测序技术在传统发酵食品微生物群落中的应用研究,对聚合酶链式反应-变性梯度凝胶电泳（PCR-DGGE）、实时荧光定量聚合酶链式反应（RT-FQPCR）、宏基因组、宏转录组测序等研究方法的原理、操作方法及其研究成果进行了总结,并对各分析技术优缺点进行了比较,旨在为传统发酵食品的微生物群落研究提供参考。     

YH-AM复合酶制剂在洋河大曲生产中的研究与应用

从洋河酒厂在房大曲和酒醅中分离到根霉菌、红曲霉、酵母茵，利用这三种茵株制作成相应的粗酶制剂，并按4：4：2比例混合，形成复合酶制剂，以增加酒醅的糖化力、发酵力和酯化力，出酒率提高7．21％，升级率提高19．55％。