图形软件与Gaussian 98 W程序的联合应用研究

根据量子化学计算的要求,探讨了以图形方式输入计算所需初始坐标的方法,并在Gaussian 98w平台上对相关计算模型进行了优化,进而用可视化软件分析了Gaussian 98 W的计算结果,实现了Gaussian 98 w程序的图形输入和图形输出,使量子化学计算和讨论方便直观。     

OpenGL在可视化有限元图形结果处理系统开发中的应用

利用OpenGL图形标准良好的3D图像生成功能，针对燕山大学开发的钢管张力减径过程专用有限元仿真系统，开发了可视化图形后处理系统，以等值云图的形式显示钢管在有限元模拟过程中的变形和受力情况，大大提高了有限元程序的可用性和计算结果的可读性。     

利用HyperChem获取反应过渡态的方法

利用HyperChem的动态数据交换DDE(Dynamic Data Exchange)功能，通过Excel中的Visual BasicA编程来控制HyperChem的运行，从而控制反应过程中的反应坐标和反应步长，计算得到反应系统沿反应坐标的能量变化曲线，从而可获取反应的过渡态和活化能△E。利用该计算方法搜寻了喹啉分子在S-Mo-Ni催化剂晶体表面催化加氢反应的过渡态，取得较好的效果。利用该方法可以确定复杂反应过渡态，从而为实验研究起理论指导作用。     

基于Brenner作用势的碳纳米结构计算程序开发

数值模拟方法是当前人们研究纳米尺度结构的主要手段之一。以著名的分子模拟软件HyperChem为平台开发出基于第二代Brenner作用势的用户计算程序,并应用于各种碳纳米结构的分子力学模拟,相关计算结果已经在若干国际刊物上发表。     

一种面向对象程序的过程间切片算法

程序切片是一种程序分析技术，它通过把程序减少到只包含与某个特定计算相关的那些语句来分析程序，过程间切片作为图形可达性问题时，需要扩展过程内切片所用的程序依赖图（PDG）成系统依赖图（SDG），然后利用两阶段图形可达性算法计算比较精确的切片，目前程序切片技术的研究以面向对象程序切片为主，文中讨论了一种合适面向对象程序的分层切片方法，并综合分层切片方法和两阶段图形可达性算法提出了一种简化的计算面向对象程序过程间切片的算法。     

快速显示汉字的方法

该文详细分析了Ｍｉｃｒｏｓｏｆｔ Ｃ的Ｉｍａｇｅ结构，并利用Ｉｍａｇｅ操作函数提出了快速显示汉字的方法，且给出了各种图形显示模式下的汉字显示程序。     

基于Java Applet的Web数据库图形显示技术研究

文章介绍了利用Java Applet实现Web数据库的图形显示技术，详细阐述了其工作原理及其开发过程，同时给出了程序实例。     

Windows中位图的文伯结构及其DOS下的显示

利用Ｗｉｎｄｏｗｓ中的ＰａｉｎｔＢｒｕｓｈ工具可以方便地绘制显示效果很佳的位图图形，这类位图图形的文件结构固定且简单。本文在分析位图文件结构的基础上，讨论了在ＤＯＳ状态下显示位图图形的方式，并且用Ｑｕｉｃｋ ＢＡＳＩＣ编制程序直接调用位图图形文件。文末附有用Ｑｕｉｃｋ ＢＡＳＩＣ显示十六色位图图形的源程序。     

有限元分析计算结果的计算机图形可视化显示

科学计算结果的计算机图形可视化显示是提高计算效率，减少劳动强度，保证设计正确的有效方法，本文将计算机图形可视化技术应用于有限元分析中，开发了一个有限元分析结果的可视化显示系统，介绍了该系统所采用的、数据管理和实现的功能。重点介绍了有限元分析的网格、计算结果的位移和应力的可视化显示方法。     

有限元计算结果图形自动显示程序

本文给出一完整的有限元计算结果图形自动显示程序,该程序能用于显示有限元模型的几何图形、三维的压力或温度形函数、速度或热通量分布、等压或等温线和两个方向的等流量分布线。程序用 GWBASIC 语言写成,可在普通的 IBM—PC 或兼容机上运行.不需要特殊终端、画图机和专用的 CAD 软件,屏面图形可用普通打印机拷贝。     

常用化学软件多媒体教学软件的开发研究

该教学软件采用计算机多媒体技术讲授了ChemDrRw、ChemWindow、ChemSketch、Gaussian、Hyper Chem和Origin等常用化学软件的基本功能,并给出了在化学化工领域中大量的应用实例。介绍了该多媒体教学软件的基本内容、设计思想、开发工具、制作方法、特点和功效。     

多巴胺D2受体抑制剂定量构效关系的研究

利用HyperChem软件包中的AM1半经验量子化学算法,将58个多巴胺D2受体抑制剂,作几何结构优化和计算,选取一些可能会影响及pIC_(50)值的26个理化和电子结构参数,作为描述分子的变量研究QSAR,利用偏最小二乘(PLS),穷举回归(QLS)及人工神经网络法(CGANN),以建立物理化学和电子结构等参数与其抑制活性之间的QSAR模型。结果表明:当化合物R_3位的疏水参数较大,R_5位疏水参数较小时抑制多巴胺D_2受体的能力较大,苯环上有硝基取代时不利于增加抑制活性。当该类化合物偶极矩较小,分子表面积较小、电子能较小,则有利于提高化合物的抑制活性。     

分子计算理论方法及在化工计算中的应用

论述了量子力学中从头计算、半经验和密度泛函方法及分子力学的基础理论,概述了常用的MD、MC分子模拟方法,总结了多种应用软件的主要功能,并结合实例对HyperChem．7软件的功能进行了具体的说明。     

细胞色素P450 1A2抑制剂的定量构效关系研究

利用HyperChem软件包中的PM3半经验量子化学计算方法,将50个细胞色素氧化酶P450(CPY1A2)抑制剂,作几何结构优化和计算,选取一些可能会影响及pIC_(50)值的22个物理化学和电子结构参数,作为描述分子的变量进行QSAR研究,利用偏最小二乘(PLS),穷举回归(QLS)及人工神经网络方法(CGANN),以建立物理化学和电子结构等参数与其抑制活性之间的QSAR模型。结果表明:该类化合物的折射率较大、生成热较小,且log P取值在2．1～2．9之间时,具有较高的抑制细胞色素P450 CYP1A2的活性。     

基于自适应高斯混合模型的软件测试用例集约简算法研究

为了最大化的找出软件测试用例集中的相似用例,实现对用例的最优精简,提出了一种自适应的高斯混合模型;提出的模型使用K-means初始化EM,自适应地确定聚类簇数目,在此过程中能够评判聚类结果,同时给出式高斯混合模型的所有参数,这些参数作为各个聚类簇进行新一轮迭代计算的参数,最终得到的结果更趋于最优解;实验结果表明,相对现有的高斯混合模型和模糊K-Means聚类模型等算法,文章提出的自适应高斯混合模型算法能够最小化软件测试用例集,约简后的用例所覆盖的范围相对更广,测试出的软件错误率较高,对软件测试用例集多变的适应性好。     

PTP1B中Arg221各种突变下底物与催化结构域相互作用变化的理论研究(英文)

蛋白酪氨酸磷酸酯酶1B(PTP1B)在胰岛素受体去磷酸化过程中发挥重要作用.本研究目的在于阐述PTP1B催化位点中Arg 221的作用.各种Arg 221的突变体通过HyperChem Release 7.0软件生成.结果表明Arg 221的突变会对底物与蛋白相互作用产生显著影响.当Arg 221突变为碱性残基时,底物与蛋白之间总静电相互作用能增加,但与催化相关残基的静电相互作用能降低,其余的突变则导致底物与蛋白之间总静电相互作用能降低.这一结果表明,Arg 221突变为碱性残基町减弱PTP1B的催化活性,但使底物与蛋白的结合能力增强,其余的突变则会同时减弱酶的催化活性及底物与蛋白的结合能力.     

编写Tcl-Hcl混合脚本程序模拟沸石转晶

利用丝光沸石(MOR)和方沸石(ANA)的晶体学数据建立它们的三维骨架模型,并用HyperChem提供的脚本语言,编写Tcl—Hcl的混合脚本程序从拓扑学角度对MOR到ANA的转晶过程进行计算机模拟。简要地介绍了分子建模与计算机模拟的基本方法并给出了数据读人、移动原子、数据输出三部分的具体实现代码。     

Performance analysis of error-control B-spline Gaussian collocation software for PDEs

B-spline Gaussian collocation software has been widely used in the numerical solution of boundary value ordinary differential equations (BVODEs) and 1D partial differential equations (PDEs) for several decades. Such packages represent the numerical solution in terms of a piecewise polynomial (B-spline) basis with basis coefficients determined through the use of Gaussian collocation. The software package, BACOL, developed over a decade ago, was the first 1D PDE package of this type to provide both temporal and spatial error control. A recently developed package, BACOLI, improves upon the efficiency of BACOL through the use of new types of spatial error estimation and control. The complexity of the interactions among the component numerical algorithms used by these packages (particularly the spatial and temporal error estimation and control algorithms) implies that extensive testing and analysis of the test results is an essential factor in the ongoing development of these packages In this paper, we investigate the performance of BACOL and BACOLI with respect to several important machine independent algorithmic measures, examine the effectiveness of the new spatial error estimation and control strategies, and investigate the influence of the choice of the degree of the B-spline basis on the performance of the solvers. These results will provide new insights into how to improve BACOLI, potentially lead to improvements in Gaussian collocation BVODE solvers, and guide further development of B-spline Gaussian collocation software with error control for 2D PDEs.