甘蔗种质遗传多态性的ISSR分析

本研究以30个甘蔗栽培种或原种为材料,用ISSR标记方法进行了遗传多态性分析。结果表明：供试30份甘蔗种质材料的遗传相似性系数在0．375～1．000之间,其中,甘蔗栽培种与热带种的遗传相似性系数在0．850～0．950之间,说明这些甘蔗栽培种与热带种的血缘关系近;甘蔗栽培种与割手密之间遗传相似性系数在0．525～0．675之间,说明这些甘蔗栽培种与割手密有一定的血缘关系;甘蔗栽培种与斑茅的遗传相似性系数为在0．375—0．525之间,表明这些甘蔗栽培品种与斑茅的血缘关系较远（实质上参试的甘蔗品种都不是斑茅的后代）;参试的23份栽培种之间的遗传相似性系数关系在0．725～1．000之间,说明这些甘蔗栽培种之间的血缘关系较近,种质血缘窄,应加强含有多个野生种质的杂交后代的选育。同时,聚类分析结果表明,在遗传相似性系数为0．720水平上可将30份供试甘蔗种质材料分为3个类群,其中3个热带种和23个栽培种聚为一类,3个割手密聚为一类,斑茅单独聚为一类。     

基于ISSR标记的云南紫苏资源的遗传多样性研究

利用14条引物对滇产16份紫苏资源的遗传多样性进行ISSR分析,共扩增出128条条带,其中81条为多态带,平均多态率为62.54%,表明云南紫苏资源的遗传多样性程度较高。采用SPSS16.0软件分析,16份滇产紫苏资源间的Rogers-Tanimoto相似性系数界于0.463～0.882之间。UPGMA法聚类将16份紫苏资源分为5类,分别对应紫苏种下的5个变种,研究结果为云南紫苏种下变种的分类提供了分子水平的依据。     

红曲菌ISSR分子标记体系的构建和聚类分析

从分子水平上建立并优化红曲菌的简单序列重复区间（ISSR）分子标记体系,进而对6株红曲菌和1株米曲霉进行ISSR聚类分析,为菌种分类和菌株鉴别提供一种有效的辅助工具.本研究以6株红曲菌和1株米曲霉为材料,采用正交试验和单因素试验相结合的方法对ISSR-PCR分析体系进行优化,建立稳定的红曲菌ISSR分子标记体系,并使用多态性较好的ISSR引物对7株菌进行IS-SR-PCR扩增,获得ISSR指纹图谱,然后利用NTSYS pc 2.10e分析软件进行聚类分析.结果表明,ISSR分子标记体系不仅能有效鉴别红曲菌的菌种,而且对某些种内的不同菌株也有一定的鉴别能力.     

ISSR标记分析油菜黑胫病原菌遗传多样性

利用ISSR分子标记技术分析了油菜黑胫病菌（Leptosphaeria biglobosa）的遗传多样性。分离获得国内菌株84株,并以15株国外（英国、加拿大、波兰）油菜黑胫病菌菌株作为参照,利用筛选出的24条引物对这99株病原菌进行ISSR—PCR扩增。共扩增出245条带,遗传相似性系数为0．65～1．00,国内和国外油菜黑胫病菌菌株很明显被分为两个菌群,中国84株菌基本按地理来源分为5个类群,只有江苏省菌株分布于各个类群。各省的Nei’s基因多样性指数范围是0．1081～0．2527,而香农（Shannon’S）信息指数的范围是0．1575～0．3726,顺序为江苏〉湖北〉安徽〉内蒙古〉上海〉四川。中国与英国和加拿大菌株的遗传一致度分别为0．8343和0．7839。     

常见水稻品种的DNA指纹图谱构建及其遗传

通过筛选的10条引物对供试的18种水稻材料进行PCR扩增。共扩增出清晰、重复性好的谱带144个,其中多态性带为138条,多态性比率高达95.8%;应用引物808、809、810、816及其组合获得了每个品种的ISSR特征带,有效区分出所有供试材料,并建立18个水稻品种的ISSR指纹图谱;统计10条ISSR引物的标记信息,对18个水稻样品的遗传相似性进行计算,得出遗传相似性系数在0.42⁰.94之间存在显著的遗传变异,平均相似性系数为0.680。通过UPGMA法构建的树状聚类图,在相似性系数为0.719时可以将18个供试样本以粳、籼稻严格地划分为2个大类群。     

基于SSR标记的黑龙江省绿豆品种遗传多样性分析及指纹图谱构建

目的:为明确黑龙江地区绿豆品种遗传多样性水平并构建SSR指纹图谱,为绿豆育种研究及品种鉴定奠定基础。方法:基于SSR荧光标记技术,利用筛选得到的14对SSR引物对黑龙江地区35份绿豆品种进行遗传多样性分析及SSR指纹图谱构建。结果:14对SSR引物在35个绿豆品种中共检测到49个等位基因,每对引物检测到2~7个,平均3.5个;多态性信息含量PIC值介于0.106~0.761之间,平均为0.398。参试品种遗传相似系数变幅介于0.6966~1.0000之间,平均为0.894,其中在0.82~0.86之间的遗传相似系数占全部数据的51.2%。在遗传相似系数为0.83的阈值处可将参试材料分为三大类群。构建了35份具有品种特异性的绿豆SSR指纹图谱及分子身份证,具有唯一性,可用于绿豆品种鉴定。结论:黑龙江地区绿豆品种遗传多样性水平不够丰富,SSR指纹图谱具可应用于绿豆品种真伪鉴定。      

江苏中烟核心原料产区烤烟品种遗传分析及分子身份证构建

烟叶原料的稳定性、一致性是保障烟草工业公司产品高质量发展的关键,有效区分和鉴别烟叶原料是当前工业公司亟需解决的难点。本研究以江苏中烟核心原料产区主栽的23个烤烟品种为材料,利用聚丙烯酰胺凝胶电泳技术,从212对SSR引物中最终筛选出12对多态性高且条带清晰的引物,等位基因数介于2～5,多态性信息含量介于0.333 8～0.571 1。聚类分析发现,各品种按照遗传背景聚为4类;群体遗传结构和主成分分析均将供试材料划分为2个亚群,且类群内各品种的分布结果高度一致,与种质亲缘关系吻合度较高。该组引物高效可靠,可用于烤烟品种的DNA指纹图谱构建和遗传多样性分析。本研究可为江苏中烟核心产区主栽烤烟品种的育种利用和烟叶原料鉴定提供理论依据。     

ISSR标记烟属不同种的遗传图谱

近几年,DNA技术的应用,尤其是PCR技术在植物遗传多样性评价上的应用得到了快速发展。      

利用GBS技术开发烟草SNP标记及遗传多样性分析

研究烟草种质资源的遗传背景,为烟草种质资源的高效利用提供依据。采用GBS （genotyping-by-sequencing）技术,挖掘92份烟草种质资源的SNP位点,并进行遗传多样性和遗传结构分析。结果表明,测序共获得了147.165 Gb数据,平均每个样本1.599 Gb,筛选后共获得93 685个高质量的SNP位点;不同地理来源烟草群体等位基因数（Na）为1.27~1.93,观测杂合度（Ho）变化范围为0.22~0.76,期望杂合度（He）为0.32~0.59,多态性位点数（PLN）范围为15 877~44 249,多态性位点比率（PPL）为26.61%~74.17%,遗传多样性指数（H）为0.19~0.52,遗传距离（GD）为-0.0148~0.3849。基于遗传距离的NJ聚类将材料划分为两个类群;群体遗传结构分析表明,本研究所用材料基于模型可划分为4个亚群。通过GBS技术得到的测序数据量较大且质量较高,群体多态性较高,整体遗传多样性偏低,群体结构划分与种质来源不完全相关。     

部分烟草核心种质过氧化物同工酶标记分析

对40个不同类型烟草核心种质进行了过氧化物同工酶标记分析，结果表明，种问遗传差异是比较明显的，但多数品种间遗传差异不明显，这与过氧化物酶本身所能表达的遗传多样性有关，但也与实验环境控制及实验技术的掌握有关。40个种质的酶带可划分为13个种群，其中种群A、B和J包括较多的种质，3个野生种具有特异的谱型，种质问的遗传差异与栽培类型并无必然联系，主要取决于种质间演化关系。采用信息聚类法进一步将40个种质划分为3大聚类群，3个野生种分属3个不同聚类群，反映了与其它种质的亲缘关系。类群Ⅰ包含种群A、C、D、M共17个种质；类群Ⅱ包含种群B、E、F共9个种质；类群Ⅲ包含种群G、H、I、J、K、L共14个种质。其聚类群的遗传差异以类群Ⅱ最大，其次是类群Ⅰ，类群Ⅲ最小。     

基于烟叶挥发性成分分析的卷烟叶组配方设计

为了提高卷烟内在品质,采用GC/MS法分析了红河卷烟厂不同年份、不同产地、不同品种、不同等级的烟叶原料及"红河"卷烟A的3个模块烟丝中的挥发性成分,依据主要挥发性成分分析结果,结合产品风格定位及品质设计目标,对卷烟A的3个模块烟丝分别进行优化,并在此基础上对叶组配方比例进行重新设计和感官评吸.结果表明:①"红河"卷烟A的原叶组与模块烟丝、原料烟叶挥发性成分组成分布趋势较一致,酮、酸、醇、酯以及烯烃类成分为其主要挥发性成分;②不同年份、品种、部位、等级红河烟叶原料的挥发性成分含量差别较为明显;③配方调整后的叶组,其主要致香成分较原配方叶组均有一定提高,特别是酮类、醇类物质增幅达10%以上,而醛类含量有明显降低,降幅9.21%;其内在品质较原叶组有一定提升,风格特征与设计要求趋势一致.     

SSR和ISSR标记技术应用进展

介绍了SSR和ISSR标记的原理和特点,综述了这两种技术在种质遗传多样性、基因定位及分子标记辅助育种、遗传图构建及种子纯度和真伪鉴定等研究中的应用进展,并提出了在烟草遗传育种中应用的建议。     

烟叶原料对卷烟主流烟气水分的影响

为了解烟叶原料对卷烟主流烟气水分的影响,对云南不同地区生产的98个不同等级的K326、红花大金元、云烟85和V2烟叶样品的总糖、还原糖、总氮、钾离子、氯离子和主流烟气水分的检测数据进行了统计分析。结果表明:①K326、红花大金元、云烟85烟叶主流烟气水分差异不大,平均为3.7 mg/支,V2品种烟叶主流烟气水分平均为2.5 mg支/;②同一品种,上部烟叶主流烟气水分中部烟叶下部烟叶;③同一品种不同产地烟叶主流烟气水分有一定差异,但差异小于部位,尤其是上、中部与下部;④主流烟气水分与烟叶的总糖、还原糖、钾离子负相关,与总氮正相关,与氯离子不相关。     

中国金顶侧耳菌株遗传多态性的ISSR分析

金顶侧耳是重要的食药用真菌。本实验收集全国各地18种金顶侧耳菌株,通过ISSR分子标记技术分析金顶侧耳菌株种内遗传多态性,11种引物扩增出102个条带,其中78个条带具有多态性,多态率为76.4%。结果表明,金顶侧耳菌株内具有丰富的遗传多样性,遗传相似系数在0.50～0.96。采用平均分类法UPGMA分析表明,在遗传相似系数为0.62时,18种菌株分为两大类。当遗传相似系数增大到0.75时,它们分为7类。16号菌株具有独立的遗传体系。     

主流烟气中的氨与烟叶中的氨、亚硝酸根、硝酸根的相关性

为了解单料烟主流烟气中的氨释放量与其烟叶中的亚硝酸根、硝酸根和氨含量的相关性,采用离子色谱法测定了18个2007和2008年山东、云南、福建产的不同部位烤烟烟叶样品和3个进口烤烟烟叶样品中的亚硝酸根、硝酸根和氨含量及其单料烟主流烟气中的氨含量,并对检测结果进行了简单相关分析和相关系数的显著性检验.结果表明,单料烟主流烟气中氨的释放量与其烟叶中的亚硝酸根含量显著正相关,与烟叶中的氨和硝酸根含量相关性不显著.     

山东烟草番茄黄化曲叶病毒的分子检测和序列分析

2012年7月从山东泰安烟草种植区采集疑似感染番茄黄化曲叶病毒的烟草样品。利用双生病毒的通用引物PA／PB对样品进行扩增和测序,所得序列经NCBIBLAST比对证明,该感病烟草的病毒分离物为番茄黄化曲叶病毒（Tomatoyellowleafcurlvirus,TYLCV）。随后对TYLCV进行全基因组序列扩增和测序（GenBank登录号JX856172）,经分子比对和进化分析发现,其与山东泰安番茄分离物TYLCV（JF414236）同源性最高为99％,并与山东其他地区和天津、北京等地报道的TYLCV同属一个大的进化分支,均属于以色列株系（TYLcv-IL）。本研究首次明确了在自然条件下烟草受到TYLCV的侵染。     

烟草及卷烟材料中金属元素含量分析技术研究进展

综述了烟叶、卷烟材料和烟气中金属元素的前处理方法,以及常量、微量和痕量金属元素的测定方法。     

23 株酿酒酵母ISSR指纹图谱分析及SCAR标记的建立

目的：构建酿酒酵母菌株的简单重复序列间多态性指纹图谱数据库并建立序列特异性扩增区（sequencecharacterized amplified region,SCAR）标记技术,为酿酒酵母菌株的分类、遗传亲缘关系鉴定及菌种专利保护提供可靠的DNA分子标记技术依据。方法：在简单重复序列间多态性（inter-simple sequence repeat,ISSR）指纹数据分析基础上进行聚类分析并对菌种进行分类鉴定,同时将酿酒酵母菌株9号和15号中扩增获得的ISSR特异性DNA带转化为可以直接用于菌株快速鉴定的SCAR分子标记。结果：构建23 株酿酒酵母的ISSR指纹图谱,并在相似系数为0.85水平上将23 个供试菌株分为3大类,其中,1、2、4、7、15、16、17、19、20、21、23聚为第一类;10、11、12、13、14、18号菌株聚为第二类且10号和11号菌为同一菌株;3、5、6、8、9、22号菌聚为第三类且属于同一菌株。此外,利用所获得的2 个特异性条带成功转化为序列特异性扩增区分子标记。结论：在生产上酿酒酵母菌株遗传背景差异不大,常存在同物异名现象,而采用ISSR指纹及其SCAR分子标记技术快速鉴定酿酒酵母菌株在工业生产上具有重要意义。