2016年北京市海产品中创伤弧菌的污染调查及两种检测方法比较

目的 对北京市市售海产品的创伤弧菌污染情况进行调查,并比较实时荧光聚合酶链式反应(RT-PCR)法与VITEK鉴定方法检测结果的一致性。方法 采用传统检验方法结合分子生物学方法对在北京市市场随机采集的105份海产品进行创伤弧菌检验,并比较了RT-PCR法和VITEK鉴定方法的准确性。结果 105份海产品中,有40份样品检出创伤弧菌,检出率为38.10%;其中,虾类产品检出率高达52.38%(11/21),其次为贝类产品(37.88%,25/66)和鱼类产品(22.22%,4/18)。经rpoB基因测序验证,RT-PCR和VITEK方法的准确率分别为100.00%(40/40)和67.50%(27/40)。结论 北京市海产品中存在创伤弧菌的污染,应对海产品中创伤弧菌引起食源性污染的潜在风险进行评估,预防食物中毒的发生。     

海水中溶藻弧菌的分离、鉴定及其耐药性分析

用无菌采样器在上海临港海域采集100份海水,经过增菌培养和选择性分离后,进行3种生理生化鉴定和PCR鉴定,共得到33株溶藻弧菌。采用优化的K-B法测定分离菌株对20种抗生素的耐药性,结果表明:溶藻弧菌对四环素的耐药性最高（100.0%）,其次是氨苄青霉素（97.0%）和羧苄青霉素（93.9%）;对头孢吡肟、安曲南、红霉素、环丙沙星、诺氟沙星和氯霉素敏感。本次分离的溶藻弧菌具有严重的多重耐药性,所有分离菌均对3种及3种以上抗生素多重耐药,同时对6种及6种以上抗生素耐药的有15株（45.5%）,同时对8种及8种以上抗生素耐药的有6株（18.2%）。本次关于溶藻弧菌对抗生素的耐药性分析结果可以为食源性疾病控制提供参考依据,同时为溶藻弧菌的耐药机制的研究奠定理论基础。      

溶藻弧菌实时荧光定量PCR快速检测方法的建立

为建立溶藻弧菌（VA）的快速检测方法,本研究以VA Collagenase基因为靶基因设计合成引物及Taq Man探针,建立了实时荧光定量PCR快速检测VA的方法。结果显示,对15株实验菌株进行荧光定量PCR检测,只有VA菌株检测为阳性,表明该检测方法特异性强;该方法的灵敏度为18 cfu/m L;稳定性和重复性实验结果表明,同一样品重复检测4次Ct值的变异系数均小于2%;利用该检测方法对采集的165份样品进行检测,共计检出2份VA阳性样品,与SN/T2564-2010行标法检测结果一致,显示了良好的实用性。该检测方法灵敏度高、特异性强,具有良好的实用性。      

纳米免疫磁分离-实时荧光聚合酶链式反应快速检测海产品中副溶血性弧菌

采用副溶血性弧菌单克隆抗体、纳米免疫磁分离技术,结合实时荧光聚合酶链式反应（polymerase chain reaction,PCR）检测方法,建立海产品中副溶血性弧菌纳米免疫磁分离-实时荧光PCR检测方法。副溶血性弧菌纳米免疫磁珠在菌体浓度为103 CFU/mL水平时,对副溶血性弧菌的捕获率达到74%。在纯培养、无需增菌情况下,该方法检测灵敏度达到140 CFU/mL;通过134 株副溶血性弧菌和74 株非目标菌的测试,实时荧光PCR技术具有良好的特异性;在食品基质添加实验中,其检测限为2 CFU/25 g样品,增菌时间缩短到8 h。     

巢式PCR快速检测海产品中的副溶血弧菌

副溶血弧菌是一种世界范围性的食源性致病菌,食用了该菌污染的海产品可导致胃肠炎等疾病。为了建立一种可快速、特异地检测海产品中副溶血弧菌的方法,通过把副溶血弧菌基因组序列和其它不同种类弧菌的基因组序列进行比较分析,筛选出了一个副溶血弧菌特异性的标记基因-VP1331,根据该基因建立了副溶血弧菌的巢式PCR快速检测方法,并评估了其特异性、敏感性和稳定性。实验结果表明,该方法只有在以副溶血弧菌基因组DNA为模板时才能扩增出目的片段,而其它11种弧菌和非弧菌均不能扩增出目的片段。该方法的最低检测限为副溶血弧菌基因组DNA 10 fg、纯培养物6.6 CFU。人工污染实验表明,初始菌液浓度为25.7 CFU/100 mL时只需经过2 h的增菌培养即可检出。上述结果表明,VP1331基因可以作为副溶血弧菌种特异性标记,本方法可以用于污染海产品中该菌的检测与鉴定。     

溶藻弧菌噬菌体Va2001的分离鉴定及其应用

为了开发水产品中溶藻弧菌的生物清除剂,以溶藻弧菌为宿主菌,从锦州市水产品市场、农贸市场、笔架山海域、超市及葫芦岛市某水产养殖场、鞍山市某养殖场等地方采集了约60份海产品及其养殖环境污水,应用双层平板法从中分离纯化获得1株烈性噬菌体,命名为Va2001。对Va2001的裂解谱、最佳感染复数（optimal multiplicity of infection）、一步生长曲线、温度和pH的稳定性等生物学特征进行了研究,并在牡蛎感染模型中测定了噬菌体对溶藻弧菌的清除效果。结果表明,该噬菌体Va2001属于有尾噬菌体目(Caudovirales),短尾噬菌体科（Podoviridae）,Va2001的裂解谱较窄,裂解率为32%,最佳感染复数为0.0001,潜伏期约为20 min,裂解期为100 min,平均裂解量为274 PFU/cell;在4~60 ℃、pH4~9范围内活性稳定。以牡蛎为感染模型的净化实验结果显示,噬菌体Va2001能够抑制养殖环境中溶藻弧菌的增长,降低牡蛎体内溶藻弧菌的含量;当养殖时间延长至72 h时,实验组中溶藻弧菌的数量降低约2个数量级。本研究的结果表明噬菌体Va2001具有良好的应用前景,可以作为海产品中溶藻弧菌的新型生物清除剂。     

水产品中创伤弧菌ddPCR定量方法的建立

选取创伤弧菌单拷贝基因met为靶基因,设计引物探针,建立对创伤弧菌准确定量的微滴式数字聚合酶链式反应(droplet digital polymerase chain reaction,ddPCR)方法,并进行特异性、灵敏度和重复性实验,同时与实时PCR(real-time PCR)方法进行比较。结果显示,所建立的ddPCR方法可以快速、高效地检测出创伤弧菌,细菌纯培养物中其定量限可达323拷贝数/mL,检测限可达61拷贝数/mL,人工污染牡蛎样品中能最低能检测到1.13×102拷贝数/g的目标菌。对人工污染样品中目标菌的检测,ddPCR的定量结果约为平板计数结果的1.4倍,比real-time PCR方法的检测更加稳定准确。本研究建立的ddPCR检测方法能快速准确、特异、灵敏地定量检测创伤弧菌。     

海产品中副溶血性弧菌免疫磁分离和环介导等温扩增快速检测方法的建立

采用纳米免疫磁珠分离副溶血性弧菌,建立副溶血性弧菌环介导等温扩增检测方法。方法 采用副溶血性弧菌单克隆抗体,制备纳米免疫磁珠,特异性吸附副溶血性弧菌,结合环介导等温扩增技术,建立副溶血性弧菌快速检测方法。结果 副溶血性弧菌纳米免疫磁珠在菌体浓度为10³cfu/ml水平时,对副溶血性弧菌的捕获率达到74%。免疫磁分离结合环介导等温扩增技术,在纯培养、无需增菌情况下,检测灵敏度达到140cfu/ml增菌液;通过对134株副溶血性弧菌和74株非目标菌的测试,环介导等温扩增技术具有良好的特异性;食品基质添加试验中,在增菌时间缩短至8h的条件下,其检测限为2cfu/25g样品。结论 副溶血性弧菌免疫纳米磁珠结合环介导等温扩增技术,有效缩短了增菌时间,适用于副溶血性弧菌的快速检测。     

微滴式数字聚合酶链式反应定量检测水产品中溶藻弧菌

目的建立水产品中溶藻弧菌微滴式数字聚合酶链式反应(ddPCR)快速定量检测方法。方法采用SN/T 1870—2016《出口食品中食源性致病菌检测方法实时荧光PCR法》中溶藻弧菌的引物探针,建立优化ddPCR反应体系,梯度稀释溶藻弧菌纯培养液,确定ddPCR方法的检出限(LOD)和定量限(LOQ);通过人工添加试验,比较ddPCR与实时荧光定量聚合酶链式反应(qPCR)方法定量的准确性,以验证ddPCR方法用于检测水产品中溶藻弧菌的可行性。结果所建立的水产品中溶藻弧菌ddPCR检测方法经过溶藻弧菌标准菌株、分离菌株以及其他近源菌株验证,具有良好的特异性;纯培养的LOD和LOQ一致,均为2.2拷贝/反应,相当于110 CFU/ml纯菌液,定值结果与传统平板计数方法相差0.04个对数值。在人工污染模拟试验中ddPCR的定量结果较qPCR更接近理论添加值,检测重复性以及对低浓度样品的检出情况也均优于qPCR。ddPCR对人工污染样品的LOQ可达120拷贝/g。结论溶藻弧菌ddPCR定量检测方法特异性好、灵敏度高、结果准确,可为快速定量检测溶藻弧菌提供参考。     

海产品中溶藻弧菌的筛选及其致病因子的研究

溶藻弧菌能引起人类食物中毒.溶血毒素、耐热性肠毒素(ST)和不耐热性肠毒素(LT)是致病性微生物中常见的致病因子.本文对从扇贝、牡蛎、贻贝、沙虾、虾蛄等海产品中筛选的溶藻弧菌的种属和致病因子进行了研究,生化鉴定显示分离到的两株溶藻弧菌来源不同,基因测定显示它们同属于溶藻弧菌(V. alginolyticu s);血琼脂平板法、兔小肠结扎法和乳鼠灌胃法显示来源不同的溶藻弧菌其产毒种类也不同,两株溶藻弧菌都能产生不耐热性肠毒素(LT)和耐热性肠毒素(ST),但只有1株能产生溶血毒素.     

基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱与VITEK和rpoB基因测序三种方法对食品中葡萄球菌鉴定效果的比较

目的 比较基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flightmass spectrometry,MALDI-TOF MS)、rpoB基因测序和VITEK 2 Compact三种方法对葡萄球菌的鉴定效果.方法 同时采用三种...     

淡水小龙虾弧菌分离株毒力基因的筛选与检测方法的建立

目的：筛选湖北淡水小龙虾弧菌分离株毒力基因并建立一种特异、灵敏的检测方法。方法：应用分子生物学--聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)技术,根据文献记载的弧菌属中6种不同的分离株CTX基因元件中的ctxA、RS1、zot基因,VPI毒力岛中的tcpA、toxT基因,RTX基因簇中的rtxC,以及toxR、T139、tcpH、toxRS、toxS、ctxAB基因序列设计PCR引物建立PCR检测方法。结果：该方法能够有效地对弧菌分离株毒力基因进行检测,简便快速、特异性强、检测周期短。     

副溶血性弧菌整合接合元件核心基因表达对温度变化的响应

采用实时荧光定量聚合酶链式反应方法分析在15～ 4 2 ℃ 温度范围内副溶血性弧菌（Vi b r i oparahaemolyticus）CHN25整合接合元件（integrative and conjugative elements,ICEs）ICEVpaChn1核心基因表达对温度变化的响应。结果表明：温度介导ICEVpaChn1元件保守模块核心基因表达发生显著变化,其中,编码进入排斥蛋白Eex（entry exclusion）的基因对温度变化最为敏感,低于或高于37 ℃的温度条件均强烈抑制eex基因表达（＞10 倍）。此外,在15～37 ℃范围内,温度的升高显著激活编码整合酶Int（integrase）、接合转移蛋白TraI（transfer protein I）和TraG、DNA修复蛋白RumA基因的表达,且在37 ℃达到最大值;与其他检测基因明显不同,温度升高抑制转录抑制子SetR基因的表达,促进int等基因转录激活子SetC和SetD的积累,进而刺激切离,促进ICEVpaChn1元件的接合转移。实验结果揭示了环境温度对ICEs元件核心基因表达的影响,发现低温（＜15 ℃）和高温（＞37 ℃）条件均可能阻遏ICEVpaChn1元件及其携带基因信息在不同种属细菌间的接合转移。     

16S rRNA基因序列、生化鉴定、质谱3类方法鉴定常见微生物的结果分析

目的比较16SrRNA基因序列、生化鉴定、质谱鉴定3类实验方法分析沙门氏菌、金黄色葡萄球菌、蜡样芽孢杆菌的鉴定结果的异同。方法挑选沙门氏菌、金黄色葡萄球菌、蜡样芽孢杆菌各50株,分别进行16S rRNA基因序列测定、VITEK COMPACT 2生化鉴定、质谱鉴定3类实验,并比较3类实验的鉴定结果。结果 3类实验方法对大部分沙门氏菌鉴定在属水平,生化鉴定方法对少数血清型鉴定到种水平;对金黄色葡萄球菌均鉴定到种水平; 16SrRNA基因序列、生化方法对蜡样芽孢杆菌鉴定到属水平,质谱鉴定到种水平。结论 3类实验方法对大部分沙门氏菌、所有金黄色葡萄球菌鉴定水平相同,质谱鉴定蜡样芽孢杆菌的结果更准确,且质谱鉴定时效性更高。     

Comparison of three types of methods for the isolation of DNA from flours,biscuits and instant paps

Three types of methods for the isolation of DNA from food products, namely, cetyltrimethylammonium bromide solubilization with liquid-phase extraction (CTAB-LPE), chaotropic solid-phase extraction (SPE) and non-chaotropic SPE were compared on the basis of yields. These were measured by UV spectrophotometry, fluorimetry of the SYBR Green I-DNA complex and by the determination of the maximum amplifiable dilution. The latter parameter, which proved to be the most informative, was determined using polymerase chain reaction (PCR) for soya, maize and wheat, respectively, in series of flours, biscuits, chocolate-containing biscuits and instant paps (a baby food preparation) containing the respective major ingredients. All three types of DNA isolation methods performed well for practically all food products analysed, yielding 10²×minimum amplifiable DNA concentration. Chaotropic SPE performed in most cases as well as to CTAB-LPE and may be recommended as a faster alternative for isolating DNA in PCR-based analyses of these types of food products.     

Biological characterization of two marine Bdellovibrio-and-like organisms isolated from Daya bay of Shenzhen, China and their application in the elimination of Vibrio parahaemolyticus in oyster

Bdellovibrio-and-like organisms (BALOs) are a group of highly motile delta-proteobacteria that prey on other gram-negative bacteria. However, nothing is known of the application potential of marine BALOs in safeguarding seafood safety. Here, biological characterization of two marine BALOs strains and their application in the elimination of Vibrio parahaemolyticus in oyster (Crassostrea ariakensis) at the laboratory scale were investigated.BALOs strains BDH12 and BDHSH06 were isolated from sediment of Daya bay in Shenzhen of China, with Shewanella putrefaciens strain 12 and V. parahaemolyticus strain SH06 as preys, respectively, when using double layer agar technique. They were identified as BALOs morphologically by transmission electron microscopy, while partial 16S rDNA sequencing analysis revealed that they showed no close relationships with members of the known genera Bdellovibrio, Bacteriolyticum, Bacteriovorax, or Peredibacter.Biological characterizations revealed that both strains had the optimal pH, salinity and temperature at 7.2, 3% and 30 °C, correspondingly. They could not utilize autoclaved, dead cells as hosts. Prey range analysis revealed that individually, BDH12 and BDHSH06 lysed 82.5% (47 strains) and 84.2% (48 strains) of the total 57 preys tested respectively. In combination, they lysed 98.2% (56 of 57) strains. All strains of V. parahaemolyticus, Vibrio cholerae and Vibrio alginolyticus tested could be lysed by both strains.A 7-day laboratory-scale V. parahaemolyticus elimination experiment in oyster showed that in the control, the cell counts of total vibrios and V. parahaemolyticus strain Vp plus in water and in oyster intestines were on the rise, whereas in the BALOs treated groups, their numbers were down from 8.09 ± 0.05 log CFU/ml and 8.02 ± 0.04 log CFU/ml to 2.39 ± 0.01 log CFU/ml and 2.33 ± 0.01 log CFU/ml, respectively. The same patterns could also be observed in oyster intestines. Results of this study indicate the feasibility of using BALOs to biologically control or even eliminate V. parahaemolyticus in seafood oyster.