Ⅰ型新德里金属β内酰胺酶的生物信息学分析

目的应用生物信息学方法分析Ⅰ型新德里金属β内酰胺酶(New Delhi metallo-β-lactamase 1,NDM1)的基本性质,并与常见的β内酰胺类抗生素进行分子对接,在理论上研究NDM1对β内酰胺类抗生素和抑制剂的水解活性。方法应用EMBOSS 6.3.1.1软件包的程序分析NDM1的基本性质,并分别利用SWISS-MODEL同源建模和PHYRE 2.0折叠识别法构建NDM1的空间结构,再运用Arguslab 4.0软件的dock模块进行β内酰胺类抗生素与NDM1分子对接。结果 NDM1共270个氨基酸残基,理论等电点为6.3,包含1个跨膜区,α螺旋占27%,β折叠占34.5%;与抗生素对接能量由低到高依次为氨苄西林、头孢拉啶、阿莫西林、头孢唑林、甲氧西林、美罗培南、亚胺培南、氨曲南、克拉维酸。结论NDM1对氨苄西林催化效率最高,对氨曲南催化效率最低,克拉维酸对NDM1无抑制作用。     

新德里金属-β-内酰胺酶的原核表达及其多克隆抗体的制备

目的原核表达新德里金属-β-内酰胺酶(New Delhi metallo-β-lactamase-1,NDM-1),并制备其多克隆抗体。方法以临床分离的产NDM-1的臭鼻克雷伯杆菌为模板,PCR扩增NDM-1基因,克隆入pET-28a载体,构建重组原核表达质粒pET-28a-NDM-1,转化E.coli BL21(DE3)pLyss,IPTG诱导表达重组蛋白。表达的重组蛋白经硫酸铵沉淀、离子交换层析、Ni亲和层析及分子筛层析纯化后,免疫日本大耳白兔,制备NDM-1多克隆抗体。抗体经硫酸铵沉淀和SPA-Sepharose亲和层析纯化后,Western blot鉴定其特异性。结果重组表达质粒pET-28a-NDM-1经PCR及测序鉴定构建正确;表达的重组蛋白相对分子质量约为28 000,诱导表达的重组菌破菌上清存在较强的β-内酰胺酶活性,表明NDM-1蛋白为可溶性形式表达;最终纯化获得的NDM-1蛋白纯度高于95%;制备的NDM-1多克隆抗体能与诱导表达的重组菌胞外蛋白特异性结合。结论成功原核表达了NDM-1,并制备了其多克隆抗体,为NDM-1的快速检测提供了新的思路。     

大肠埃希菌超广谱β-内酰胺酶基因型分析

目的研究临床分离产超广谱β-内酰胺酶(ESBLs)大肠埃希菌医院感染的临床分布及其基因型特征,为临床合理用药治疗大肠埃希菌引起的感染提供参考依据。方法采用聚合酶链反应(PCR)分别检测162株产ESBLS大肠埃希菌3种易常见的ESBLS基因TEM,SHV和CTX-M并对其标本来源和科室分布进行分析。结果ESBLS大肠埃希菌最多的科室为重外科(22.9%),可能与手术预防性用抗生素的因素有关。     

β沸石金属改性研究进展

综述了β沸石金属改性的研究,分别介绍了过渡金属、稀土金属、碱金属、碱土金属及一些其他金属对β沸石的改性研究。重点介绍了β沸石的过渡金属改性,其中包括铂、铱及钯等贵金属改性,钴、铜、铁及锆等非贵金属改性以及一些复合金属改性,指出β沸石经过不同金属改性后,依然保留了原有的晶型结构,在不同反应中均表现出良好的催化活性和选择性。     

普鲁士蓝显色光度法测定牛奶中β-内酰胺酶的含量

目的 建立并优化牛奶中β-内酰胺酶含量的普鲁士蓝显色光度检测法.方法 基于青霉素分子中硫原子将Fe3+还原为Fe2+后,可与[Fe(CN)6]3-反应生成可溶性普鲁士蓝KFeⅢ[FeⅡ(CN)6]的原理建立β-内酰胺酶含量的检测方法,并对方法中的吸收波长(500～900 nm)、0.01 mol/L Fe3+硫酸溶液体...     

超级细菌NDM-1及其检测方法的研究进展

抗生素滥用造成细菌的耐药性问题日益严重,对人类健康和卫生安全构成极大威胁.新德里金属β-内酰胺酶能水解碳青霉烯在内的绝大多数β-内酰胺类抗生素,导致产该酶的细菌仅对替加环素和多粘菌素敏感,因此也被称为超级细菌NDM-1.编码该酶的blaNDM-1基因大多定位在质粒上,能通过水平传播,加剧多重耐药菌的产生,由于缺乏特效抑...     

β-内酰胺的研究进展

主要介绍了近年来β-内酰胺立体选择合成方面的研究进展,同时对其在抗生素与胆固醇吸收抑制剂方面的应用也作了简短的介绍。     

金属试剂参与的α,β-不饱和羰基化合物的不对称共轭加成反应研究进展

α,β-不饱和化合物尤其是羰基化合物的不对称共轭加成反应在有机合成中是一类非常重要的反应。文章综述了格氏试剂、锌试剂以及芳基金属试剂和α,β-不饱和羰基化合物在铜或镍的催化作用下的不对称共轭加成反应。结果表明,金属试剂参与的该类反应,大都能够得到比较好的收率和选择性。同时,配体的研究开发对于该类反应的结果有着较大程度的影响。     

β-环糊精包合物的研究进展

β-环糊精(β-CD)是一类环状低聚糖,价格低廉且易得,因有独特的空腔结构而常被当作宿主分子,与其他物质形成包合物。β-环糊精包合物常被作为一种药物制剂的中间体,可大量用于增加药物溶解度、提高稳定性、液体药物固体化、降低刺激性等。β-环糊精包合物也在食品和化妆品领域应用广泛。综述了β-环糊精包合物包合条件、影响因数及应用,并在β-环糊精包合物应用前景进行了展望。     

The Effects of One-Point Mutation on the New Delhi Metallo Beta-Lactamase-1 Resistance toward Carbapenem Antibiotics and β-Lactamase Inhibitors: An In Silico Systematic Approach

Antibiotic resistance has been becoming more and more critical due to bacteria’s evolving hydrolysis enzymes. The NDM-1 enzyme could hydrolyze not only carbapenems but also most of β-lactam’s antibiotics and inhibitors. In fact, variant strains could impose a high impact on the resistance of bacteria producing NDM-1. Although previous studies showed the effect of some variants toward antibiotics and inhibitors binding, there has been no research systematically evaluating the effects of alternative one-point mutations on the hydrolysis capacity of NDM-1. This study aims to identify which mutants could increase or decrease the effectiveness of antibiotics and β-lactamase inhibitors toward bacteria. Firstly, 35 different variants with a high probability of emergence based on the PAM-1 matrix were constructed and then docked with 5 ligands, namely d-captopril, l-captopril, thiorphan, imipenem, and meropenem. The selected complexes underwent molecular dynamics simulation and free energy binding estimation, with the results showing that the substitutions at residues 122 and 124 most influenced the binding ability of NDM-1 toward inhibitors and antibiotics. The H122R mutant decreases the binding ability between d-captopril and NDM-1 and diminishes the effectiveness of this antibiotic toward Enterobacteriaceae. However, the H122R mutant has a contrary impact on thiorphan, which should be tested in vitro and in vivo in further experiments.     

肺炎支原体感染流行病学及耐药状况的研究进展

肺炎支原体是呼吸道感染病原之一,是引起儿童获得性肺炎常见的病原体。学龄期前和学龄期的儿童是易感人群,感染后多见社区获得性肺炎。但是由于地理位置、气候和性别的差异,在同一季节不同地区的儿童肺炎支原体感染的流行特征也存在差异。近年来重症及难治性肺炎支原体肺炎相关报道逐渐增多,耐药菌株的出现造成了治疗的困难。肺炎支原体感染除了引起呼吸道疾病外,还会引发神经系统和消化系统疾病等并发症。本文就肺炎支原体的病原生物学特征、流行病学特征、耐药状况等作一综述。     

木聚糖酶基因克隆和表达的研究进展

半纤维素分解微生物在自然界的物质循环过程中起着重要作用,半纤维素是植物多糖的重要成分之一,而木聚糖则是半纤维素的主要成分。木聚糖酶(xylanase)可催化木聚糖的水解,在各种生物体内均发现木聚糖酶。在过去几十年中,已有上百种木聚糖酶基因被克隆至同源或异源宿主内来表达木聚糖酶,以期改变宿主特性并适于商业应用。本文综述了木聚糖酶基因的克隆和表达,并对基因工程技术在木聚糖酶上的应用前景进行了展望。     

肠道病毒71型基因重组的研究进展

肠道病毒71型(Enterovirus 71,EV71)是手足口病(Hand,foot and mouth disease,HFMD)的主要病原体,属于肠道小RNA病毒,这类病毒的基因组由脆性平链RNA组成,易断裂,有较高的突变性。在混合感染中会发生同型不同株不同亚型,或同属不同型间的基因交换形成新的重组病毒,EV71也具有重组特性。新形成的重组病毒可能导致其生物学特性和致病性的改变,进而影响疾病的防控。本文就EV71病毒基因重组及可能引发的防控问题进行综述。     

触变性研究新进展

对近年来触变性研究过程中触变性的影响因素及触变性理论解释进行了综述     

鲎素抗菌肽的研究进展及应用前景

鲎素抗菌肽是生物天然免疫的重要组成部分,具有广谱抗菌活性,对细菌、真菌、肿瘤细胞及一些病毒均具有强大的抑制作用(包括多药物耐受微生物),而且这种作用具有较好的选择性。本文主要介绍鲎素的种类和生物活性、鲎素的结构与功能关系、鲎素抗菌机理及鲎素基因工程表达制备方面的最新研究进展,并对鲎素临床应用面临的问题及对策作一简要综述。     

人C1酯酶抑制剂的研究进展

C1酯酶抑制剂(C1 esterase inhibitor,C1-INH),又称C1抑制物(C1 inhibitor),是目前已知的唯一一种既能通过经典途径,又能通过凝集素途径对补体系统进行调节的血浆蛋白酶抑制物,其在补体系统、激肽释放酶-激肽系统、纤溶系统和凝血系统中发挥重要的调节作用。目前有4种C1-INH浓缩制剂批准上市,均用于治疗或预防遗传性血管性水肿(hereditary angioedema,HAE)。本文就C1-INH的生化性质与生理功能、相关疾病与临床研究、C1-INH浓缩制剂的制备工艺及产品比较作一综述。     

炼油厂“三泥”处理新技术研究进展

炼油厂污水处理过程中产生的＂三泥＂成分复杂,对环境造成污染而且处理难度较大,其处理问题一直是石化企业以及环保工作者的研究热点。本文综述了目前国内外炼油厂＂三泥＂的最新处理技术,分析了各种处理技术的特性,并展望了其应用前景。     

聚硅酸金属盐絮凝剂形态研究进展

聚硅酸金属盐絮凝剂由于具有优良的絮凝性能,成为絮凝剂研究的热点。对聚硅酸金属盐无机高分子絮凝剂中金属离子和硅形态、结构与性能等研究的新进展进行了评述,指出合成方式、合成条件、测试方法等因素对其结构都有影响。认为今后对絮凝剂溶液中形态和结构的研究应采取合适的方式进行表征,并提出应加强混凝机理和稳定性的研究。