真核细胞蛋白质翻译起始研究进展

在大量有关机制的研究基础上,针对真核蛋白质翻译起始,提出了核糖体沿mRNA滑动识别翻译起始位点的机制和核糖体从mRNA内部识别翻译起始位点的机制.     

隐Markov模型的基本原理及其在基因识别中的应用

隐Markov模型(Hidden Markov model，HMM)用于基因识别研究是生物信息学研究的新领域，剪接位点的识别是基因识别中的一个重要环节。本文中作者主要介绍了隐Markov模型的基本原理，讨论了HMM在生物信息学中的应用以及HMM用于识别基因的模型。HMM用于识别剪接位点的实验结果表明，该方法可以很好的提取剪接位点附近保守序列的统计特征．对剪接位点的识别率达到90％以上。     

RNA结合蛋白RB47、RB60在叶绿体翻译调节中的作用

光调节的叶绿体mRNA的翻译需要mRNA5′,非翻译区(5′ UTR)相互作用的中间作用因子.叶绿体多聚腺苷酸结合蛋白(cPABP)RB47特异性地与PsbAmRNA的5′ UTR结合,并对于该mRNA的翻译是很重要的.定位于叶绿体中与cPABP伴随纯化出来的一种蛋白质二硫化物异钩酶RB60表现出调节cPABP与PsbAmRNA的5′ UTR结合的特性.这种调节是通过可逆地改变有氧化还原特征的cPABP的氧化还原状态来实现,或通过ADP依赖的磷酸化来实现.这种机制就在调节叶绿体的基因表达中提供了一个简单可逆的开关机制.     

瑞氏木霉木聚糖酶Ⅰ基因的克隆、序列分析及在酵母中的表达

本实验从构建于大肠杆菌DH5α的瑞氏木霉cDNA文库中用PCR法体外扩增到木聚糖酶I（XynI)的DNA片段，然后连接至穿梭载体pAJ401,转化酵母H158,以刚果红染色法筛选阳性重组子并测序，当将其mRNA5‘端非翻译区的79个碱基删除后，木聚糖酶的表达水平显著提高，有可能此基因的调节区位于5‘端非翻译区内，而且可能被酵母的相关基因表达因子所识别。     

亲和沉降及质谱法分离和鉴定与EGFR 3'UTR结合的蛋白质

随着后基因组学研究的逐步深入,非编码RNA成为生物学研究的热点之一,其中对mRNA非翻译区的功能研究也逐渐广泛。mRNA非翻译区(UTR)的调控序列与一些蛋白质特异结合,对其自身mRNA命运进行调控。表皮生长因子受体(EGFR)是细胞信号转导的关键因子,其特异酪氨酸残基发生磷酸化,可招募诸如Shc、Grb2、磷脂酶Cγ和Src等信号蛋白,进而激活下游信号通路,研究证实EGFR与一些癌症的发生相关,因此探讨EGFR非翻译区对其mRNA的调控机制就显得尤为重要。运用亲和沉降及质谱,从HeLa细胞中分离到3种蛋白质与EGFR 3'UTR相结合:Ilf3、hnRNP A1和hnRNP A2/B1。这些蛋白质均为RNA结合蛋白并参与mRNA代谢。这为研究EGFR 3'UTR的调控机制提供了依据。     

核糖体脱嘌呤分析法分析检测核糖体失活蛋白

针对核糖体脱嘌呤分析法经常被用来分析检测新的核糖体失活蛋白(RIP),检测了由酸性苯胺催化在RIP催化脱嘌呤位点断裂产生的核糖体rRNA片段。利用文献发表的一级动力学速度常数,计算分析了核糖体失活蛋白含量对核糖体失活蛋白催化脱嘌呤分析的敏感性,并进行了部分实验验证。实验中核糖体失活蛋白和核糖体溶液混合后进行了30 min的恒温培养,结果表明:核糖体失活蛋白脱嘌呤分析法的敏感性取决于核糖体失活蛋白催化核糖体脱嘌呤反应的速度常数。还分析了核糖体失活蛋白脱嘌呤分析中可能出现的假阳性和假阴性结果及其原因,结果表明:在核糖体失活蛋白的大规模生产中使用核糖体脱嘌呤分析法作为定量分析的手段是比较复杂和困难的,该方法应该和一些常用的经典方法例如SDS PAGE分析法联合使用,而且联合使用时两种方法的最小检测限应该相近,以避免其中之一引起的假阳性结果。     

基于结合HM-SVM方法的HMM剪接位点识别研究

为了对剪接位点取得更加精确的预测结果，采用HMM方法设计并构建了剪接位点识别系统。该系统利用HM—SVM工作集最优化算法训练并优化HMM模型，依据剪接位点附近存在的序列保守性，高效地提取位点附近保守序列在边缘分布与条件分布上的统计特征。实验结果表明，该识别系统在用于剪接位点的识别中较常用的机器学习方法获得了更高的识别率。     

侧柏籽核糖体失活蛋白的分离及作用机制研究

提出了从裸子植物侧柏中分离纯化核糖体失活蛋白的制备和检测方法.通过盐溶液抽提、硫酸铵分级沉淀、阴离子交换层析、阳离子交换层析等步骤制备了该蛋白.该蛋白的检测方法是把这种蛋白作用于大鼠80S肝核糖体后, 不经过酸性苯胺处理,直接进行聚丙烯酰胺的尿素变性胶电泳.在电泳图上得到400bp左右的特征性核酸条带.分析结果表明,该蛋白为一种新的核糖酶型的核糖体失活蛋白,阐明了侧柏核糖体失活蛋白失活核糖体的分子机制.     

基于双注意力CrossViT的微表情识别方法

微表情是人们试图隐藏自己真实情绪时不由自主泄露出来的面部表情，是近年来情感计算领域的热点研究领域.微表情是一种细微的面部运动，难以捕捉其细微变化的特征.本文基于交叉注意力多尺度ViT （CrossViT）在图像分类领域的优异性能以及能够捕捉细微特征信息的能力，将CrossViT作为主干网络，对网络中的交叉注意力机制进行改进，提出了DA模块（Dual Attention）以扩展传统交叉注意力机制，确定注意力结果之间的相关性，从而提升了微表情识别精度.本网络从三个光流特征（即光学应变、水平和垂直光流场）中学习，这些特征是由每个微表情序列的起始帧和峰值帧计算得出，最后通过Softmax进行微表情分类.在微表情融合数据集上，UF1和UAR分别达到了0.727 5和0.727 2，识别精度优于微表情领域的主流算法，验证了本文提出网络的有效性.     

磷酸化调节的膜蛋白结构及其功能研究进展

磷酸化修饰是膜蛋白翻译后修饰的重要类型之一，由蛋白激酶和磷酸酶共同调节而保持一种动态平衡,在正常生命活动乃至肿瘤发生中发挥调控作用。磷酸化修饰诱导膜蛋白结构变化可调节蛋白之间结合活力，而关键磷酸化位点突变可破坏蛋白结合并解除相关信号传导的调节。与其他蛋白不同，膜蛋白需要以质膜为介质发挥功能作用，由于膜组成复杂性和不对称性，磷酸化修饰对膜蛋白的质膜定位以及表面贴附至关重要。膜蛋白磷酸化还调节周围磷脂分子的热力学性质和动力学特性，从而加剧对磷脂双分子层有序度的影响。本文重点阐述了膜蛋白磷酸化的分子特征及调控机制，包括磷酸化位点分布，磷酸化修饰对膜蛋白结构调控以及特异膜环境依赖性；系统总结了膜蛋白磷酸化引发的结构变化在各种生物过程中的功能作用，旨在为膜蛋白磷酸化及相关靶向干预研究提供参考。     

利用生物软件检索大鼠硒蛋白基因

UGA密码子通常作为蛋白质合成的终止密码子,当mRNA链的3’-非翻译区(3’-UTR)出现硒代半胱氨酸插入元件(SECIS)时,UGA密码子就成为硒代半胱氨酸(Sec)的插入码.利用生物软件在基因组数据库中通过识别SECIS元件检索硒蛋白基因是一种重要的方法.分别采用Genetool、SECISearch、RNADraw和DNAssist等软件,对大鼠基因组进行检索、折叠和同源性比对,得到了符合SECIS茎-环结构特征的硒蛋白基因.     

DNA序列与剪接位点的关联性分析

为了进一步研究剪接位点识别算法,提高预测准确率,利用人工神经网络识别方法,选取不同的剪接序列样本进行试验,分析了供体位点邻近序列对于基因剪接的影响,对DNA序列与剪接的关联性进行了深入的研究．研究发现,剪接位点区别于伪剪接位点的特征信息同时存在于剪接位点邻近两侧大约50个碱基范围内的外显子和内含子中,且内含子相对于外显子包含了更多的特征信息．     

储存mRNA在大豆胚根萌发过程的作用

为研究种子是否能完全依靠储存的mRNA或储存的蛋白质完成萌发过程,分别利用转录抑制剂α-鹅膏蕈碱(α-amanitin)和制剂放线菌酮处理大豆胚根,抑制新的mRNA或新的蛋白质的合成,观察大豆胚根的萌发情况.结果发现,在转录抑制的条件下,大豆胚根能够完成萌发,种子萌发后,种苗生长停止;在翻译被抑制的条件下,大豆胚根不能完成萌发.说明大豆胚根萌发能够依赖发育过程合成并贮存在干种子中的mRNA;但种苗的发育不能完全依赖储存的RNA,需要新合成的mRNA参与.大豆胚根不能依赖储存蛋白质完成萌发过程.对大豆胚根细胞内容物进行超速离心并对不同组分中mRNA含量进行定量分析发现,干种子中的mRNA主要存在于多核糖体之外的细胞结构中,而在萌发过程中,mRNA主要存在于多核糖体中.这表明干种子中的mRNA主要以储存状态存在于mRNA的储存结构中,萌发过程大部分mRNA从储存结构中转移到多核糖体中变为活跃的翻译状态.不同萌发时期多核糖体的特征曲线也体现mRNA在细胞内存在位置的这种变化.     

利用生物软件检索大鼠硒蛋白基因

UGA密码子通常作为蛋白质合成的终止密码子,当mRNA链的3'-非翻译区(3'-UTR)出现硒代半胱氨酸插入元件(SECIS)时,UGA密码子就成为硒代半胱氨酸(Sec)的插入码.利用生物软件在基因组数据库中通过识别SECIS元件检索硒蛋白基因是一种重要的方法.分别采用Genetool、SECISearch、RNADraw和DNAssist等软件,对大鼠基因组进行检索、折叠和同源性比对,得到了符合SECIS茎-环结构特征的硒蛋白基因.     

狭义语法化在翻译过程中的解释力——以《聊斋志异》英译本为例

语法化理论是语法研究的一个热点，在理论研究上引发了广泛而深入的探讨。研究表明：狭义语法化与语义虚化以古汉语中副词与助动词的翻译最为显著，突出体现于转化式虚化、省略式虚化、关联式虚化。因此，狭义语法化理论对翻译过程具有解释力。在此基础上，从语法化的理论机制入手，结合《聊斋志异》的翻译，并提供一定的分析理据，进一步探讨认知方式对翻译语言形式差异的影响，有望为语法化理论及翻译理论研究提供新的理论视角。     

俯冲起始的机制、地质记录及其研究意义

板块俯冲起始是固体地球科学的重大前沿领域之一,是板块构造理论发展的关键和新方向,主要包括俯冲起始时间和机制两个关键科学问题。目前,关于俯冲起始机制存在多种模型,但根据其驱动力的来源不同,可以分为自发俯冲起始和诱发俯冲起始两类,前者包括转换断层塌陷、被动陆缘塌陷和地幔柱头周缘垮塌,后者包括俯冲传递和极性反转。不论是自发还是诱发俯冲起始过程,均会产生相应的地质记录,主要包括俯冲带(SSZ)型蛇绿岩、前弧玄武岩、玻安岩和变质底板。深入研究俯冲起始的地质记录是解开俯冲起始机制的基础,更是检验俯冲起始机制最直接、最有效的手段。另外,通过俯冲起始的地质记录研究,可对地幔属性提供制约,揭示不同源区对大陆地壳增生的贡献,并有效恢复古大洋及相关构造单元的演化历史,进而对其动力过程提供制约。虽然地质记录是解决板块俯冲起始问题的关键,但这些记录具有碎片化、非系统性的特征。在今后的研究中,应将这些地质记录进行横向、大面积对比,从而形成系统性约束; 另外,需要注意现有的地质记录和俯冲起始可能并不是一一对应的关系,即没有地质记录的地方不一定就没有俯冲起始。但无论如何,通过俯冲起始研究,可以深入理解特定板块的几何学、运动学及动力学过程,并预测板块行为。同时,对比类地行星(如火星等)的演化过程,将有助于揭开地球独特性和宜居性等未解之谜。     

八氢番茄红素脱氢酶(PDS)基因分子进化特征

对来自蓝藻、绿藻和高等植物中的pds基因用最大似然法进行了系统发育分析,来估算pds基因在进化过程中的正选择位点。通过位点模型和分支-位点模型分别对PDS不同位点和不同分支中的位点进行正选择作用的估算。结果发现,pds基因的适应性进化主要发生在系统发育树的不同分支上。在绿藻分支中,有7.9%位点受到正选择作用;在高等植物分支中,有6.1%位点受到正选择作用;在蓝藻分支中,有2.6%位点受到正选择作用。这些正选择位点的识别,可以为PDS活性研究提供重要的线索。     

基于霍夫变换理论的图形识别

图形识别是模式识别和计算机视觉的基础，而直线、矩形、圆的识别又是图形识别的基础。本文以霍夫变换理论为基础，利用其投票机制结合各种几何图形的特点，实现了图形的正确识别，并准确地检测出了他们的几何参数。     

英汉翻译偏误刍议

分析翻译偏误成因,指出必须在深层次上认识误译的严重后果.认为翻译研究应该与实践紧密相连,杜绝学院气,倡导严谨求实的译风,同时应引入监控机制及准入机制,提高翻译的质量.     

翻译实践中语篇连贯的重构

语篇翻译的过程实际上就是语篇连贯的识别与重构的过程,原文语篇中的连贯性能否再现直接关系到译文的交际功能能否实现以及译者所要采取的翻译策略。本文从语篇视点的角度出发,对翻译实践进行重新审视,并从语境、文体、逻辑连贯等方面来探讨语篇连贯在翻译中的重构。