Search for Highly Divergent Tandem Repeats in Amino Acid Sequences

We report a Method to Search for Highly Divergent Tandem Repeats (MSHDTR) in protein sequences which considers pairwise correlations between adjacent residues. MSHDTR was compared with some previously developed methods for searching for tandem repeats (TRs) in amino acid sequences, such as T-REKS and XSTREAM, which focus on the identification of TRs with significant sequence similarity, whereas MSHDTR detects repeats that significantly diverged during evolution, accumulating deletions, insertions, and substitutions. The application of MSHDTR to a search of the Swiss-Prot databank revealed over 15 thousand TR-containing amino acid sequences that were difficult to find using the other methods. Among the detected TRs, the most representative were those with consensus lengths of two and seven residues; these TRs were subjected to cluster analysis and the classes of patterns were identified. All TRs detected in this study have been combined into a databank accessible over the WWW.     

极性氨基酸甲酯盐酸盐合成新方法

以四种极性氨基酸、二氯亚砜和HCl的甲醇溶液为原料合成了L-酪氨酸甲酯盐酸盐,L-蛋氨酸甲酯盐酸盐,L-丝氨酸甲酯盐酸盐,L-赖氨酸甲酯盐酸盐四种稳定的氨基酸甲酯盐酸盐,并通过元素分析、红外光谱对化合物的组成和结构进行了表征。反应条件温和,产率较高,产率高达95.4%~97.5%;同时也讨论了影响反应的因素。     

用分子结构特征分析法研究氨基酸甜味产生原因

采用全略微分重叠法（ＣＮＤＯ法）对１３种呈味氨基酸的分子结构特征进行了计算，并对其与甜味间的关系进行了相关分析，结果表明：氨基酸α－Ｈ、羰基－Ｏ以及氨基上的一个氢原子与甜度极显著相关（Ｐ〈０．０１）。氨基酸可能以氢供给基（α－Ｈ）和氢接受基（羰基－Ｏ），与甜味接受体上的氢接受基（Ｂ）、氢供给基（ＡＨ）结合形成氢键；氨基上的一个氢原子与甜味接受体上第三点结合形成氢键，其强度决定甜味的强弱。     

氨基酸振荡反应的研究进展

氨基酸振荡反应的研究对探讨生物体内广泛存在的振荡现象具有重要意义,主要包括获取振荡反应的E-t图、考察温度对振荡反应诱导期(tin)和振荡周期(tp)的影响、获得振荡反应模型.较为系统地总结了氨基酸振荡反应的研究现状,并对其前景进行了展望.     

光学纯氨基酸的研究进展

氨基酸能参与多种多样的生命活动,此外它还是合成多种药物的重要中间体。大多数氨基酸都有一个或一个以上的手性中心,手性不同其生物活性也不同。因为生命活动对不同的氨基酸会有立体选择性,所以光学纯氨基酸在制药与食品行业有着非常重要的应用。本文综述了近些年国内外光学纯氨基酸的研究进展。     

微生物资源与氨基酸的生产和应用

微生物资源具有多样性、易变性、生长快等特征，与动、植物资源相比存在许多未知数。对微生物生产氨基酸进行了概述．提出了应积极研究、开发和利用产氨基酸的微生物资源，拓展氨基酸产品，重组具特殊优良性能的氨基酸的生产菌种，大力发展有特色的氨基酸试剂。     

A Simple and Efficient Method for the Substrate Identification of Amino Acid Decarboxylases

Amino acid decarboxylases convert amino acids into different biogenic amines which regulate diverse biological processes. Therefore, identifying the substrates of amino acid decarboxylases is critical for investigating the function of the decarboxylases, especially for the new genes predicted to be amino acid decarboxylases. In the present work, we have established a simple and efficient method to identify the substrates and enzymatic activity of amino acid decarboxylases based on LC-MS methods. We chose GAD65 and AADC as models to validate our method. GAD65 and AADC were expressed in HEK 293T cells and purified through immunoprecipitation. The purified amino acid decarboxylases were subjected to enzymatic reaction with different substrate mixtures in vitro. LC-MS analysis of the reaction mixture identified depleted or accumulated metabolites, which corresponded to candidate enzyme substrates and products, respectively. Our method successfully identified the substrates and products of known amino acid decarboxylases. In summary, our method can efficiently identify the substrates and products of amino acid decarboxylases, which will facilitate future amino acid decarboxylase studies.     

复合氨基酸微量元素螯合肥的制备及应用研究

以动物蛋白废弃物水解而成的复合氨基酸为原料,研究其与微量元素锰、锌、铜螯合的最佳工艺条件。结果表明:制备复合氨基酸微量元素螯合肥的最佳pH值范围为6.0~7.0;反应温度为80℃;反应时间为60 min。在此条件下,产品螯合率可达95%以上,且产品质量稳定。田间试验表明:在同等使用剂量下,复合氨基酸微量元素螯合肥对作物的增产效果明显优于无机微量元素肥料,差异达到显著水平。     

一种新氨基酸描述子用于ACE抑制肽QSAR研究

从20种天然氨基酸的41个分子轮廓指数(randic molecular profiles,R)、44个分子特征值指数(eigenvalue based indices,E)和47个分子运转路径数目(walk and path counts,W)分别进行主成分分析,得出1种新的氨基酸描述符(scores vector of R,E,W-SVREW)。将其应用于血管紧张素转化酶(ACE)抑制二肽、三肽、四肽、九肽结构表征,应用多元线性回归建立定量构效关系模型,同时采用内部与外部双重验证的方法验证模型的稳定性。所建ACE抑制二肽、三肽、四肽、九肽的模型复相关系数(R_(cum)~2)、留一法(LOO)交互校验复相关系数(R_(cv)~2)和外部样本校验相关系数(Q_(ext)~2)分别为:0.907、0.791、0.633;0.831、0.603、0.723;0.834、0.668、0.718;0.964、0.853、0.948。经研究表明:SVREW描述符应用于ACE抑制肽结构表征所建模型稳定性与预测能力均较好。     

复合氨基酸微量元素螯合物饲料添加剂的应用与开发

介绍了复合氨基酸微量元素螯合物代替无机盐作为饲料添加剂在饲料行业应用研究的情况和生产工艺改进所取得的成果。分析了推广该产品的关键在于改进生产工艺 ,选择最佳工艺路线 ,合理开发利用废弃的蛋白质资源 ,获取廉价的复合氨基酸微量元素螯合物。     

氨基酸生物合成中除草剂靶酶研究进展

氨基酸在植物的生长过程中起着至关重要的作用,以氨基酸生物合成过程中的酶作为靶标,是研发除草剂的一个重要方向和热点。ALS、EPSPS等是非常成功的除草剂靶酶。随着植物生理和生物化学的发展,氨基酸生物合成中的除草剂靶酶的研究有了新的进展,开发出新的潜在的除草剂靶酶和具有一定除草效果的潜在抑制剂。     

柱前衍生化高效液相色谱法测定百合中的氨基酸含量

建立了反相高效液相色谱法测定百合中氨基酸含量的方法。采用HypersilODS2C18色谱柱(4.6mm×250mm,5μm),流动相A乙酸钠+四氢呋喃+三乙胺;流动相B:乙酸钠+甲醇+乙腈,柱温35℃,检测波长330nm。梯度洗脱程序为(t(梯度洗脱时间),B(流动相B)%)为(22,40);(23,60);(23.6,60);(26,65);(26.1,70);(26.6,80);(31.9,90);(32,95);(39,100);(40,0)。测定结果表明,在此实验条件下能使百合中13种氨基酸在40min内得到较好的分离,特别是脯氨酸能得到很好的分离。除trp、gly外,其他氨基酸具有较好的线性(相关系数为0.8985～0.9997)和重复性(相对标准偏差≤5.0%)。该方法简便实用,实际样品分析结果令人满意。     

新型氨基酸肥料的研究与肥效试验

分析了我国现阶段市场上供应的氨基酸肥料的作用机理及应用效果,提出了开发新型氨基酸肥料的创新理念。通过大量的盆栽肥效试验,肯定了中浓度、多功能、高效益的新型氨基酸肥料研发方向,为肥料企业转型升级提供了新的思路。     

复合氨基酸微量元素螯合物饲料添加剂的应用与开发

介绍了复合氨基酸微量元素鳌合物代替无机盐作为饲料添加剂在饲料行业应用研究的情况和生产工艺改进所取得的成果。推广该产品的关键在于改进生产工艺 ,选择最佳工艺路线 ,合理开发利用废弃的蛋白资源 ,获取廉价的复合氨基酸微量元素鳌合物。     

碳钢/盐酸体系中氨基酸的缓蚀作用研究

运用极化曲线、电化学阻抗谱测试技术,研究了蛋氨酸、半胱氨酸和胱氨酸三种氨基酸作为缓蚀剂在盐酸介质中对20#碳钢的缓蚀性能;确定了缓蚀效率最高的氨基酸复配配方.结果表明:氨基酸在盐酸中对碳钢的缓蚀率随着它们浓度的增加而增加,胱氨酸在低浓度时的缓蚀效率更好;半胱氨酸、蛋氨酸在浓度为10 mmol/L时,缓蚀效果更好;浓度为...     

壳聚糖改性纸层析分离氨基酸

用壳聚糖及经戊二醛交联的壳聚糖涂覆层析滤纸分离氨基酸,可以快速简便地将混合氨基酸加以分离,其分离效果较一般滤纸要好。     

复合氨基酸微量元素螯合物饲料添加剂的应用与开发

介绍了复合氨基酸微量元素螯合物代替无机盐作为饲料添加剂在饲料行业应用研究的情况和生产工艺改进所取得的成果。分析了推广该产品的关键在于改进生产工艺,选择最佳工艺路线,合理开发利用废弃的蛋白资源,获取廉价的复合氨基酸微量元素螯合物。     

氨基酸型氟碳表面活性剂的合成及应用

以全氟辛基磺酰氟、乙二胺和丙烯酸甲酯为主要原料,合成了N-(2-全氟辛基磺酰胺基乙基)-β,β′-亚氨基二丙酸二钠氨基酸型氟碳表面活性剂,通过酸碱滴定、核磁共振和红外光谱对其分子结构进行了表征。测试结果表明,所合成表面活性剂的临界表面张力为16.5 mN/m(20℃),临界胶束浓度为1.0×10-4mol/L,具有良好的表面活性。在水成膜泡沫灭火剂中应用,能显著提高泡沫灭火剂的灭火性能和抗烧性能,灭火时间由45.8 s降到24.6 s,抗烧时间由4.7 min提高到7.8 min。500 L放大实验产品经检测,灭火性能达到GB 17427—1998的ⅠA级。     

Synthesis of Chiral Amino Acid Anilides by Ligand‐Free Copper‐Catalyzed Selective N‐Arylation of Amino Acid Amides

An atom‐economic, practical and cost‐effective protocol for synthesis of chiral amino acid anilides via ligand‐free copper‐catalyzed selective C N cross coupling of chiral amino acid amides and aryl halides, hetereoaryl halides and a vinyl bromide has been developed. No racemization occurred during the C N coupling. A plausible mechanism is proposed.     

Vero细胞批式培养中的氨基酸代谢

用高效液相色谱(HPLC)测定了批式培养的Vero细胞培养液中氨基酸的变化,结果表明Vero细胞在生长过程中需要消耗12种氨基酸,同时生成4种氨基酸, Vero细胞在生长期吸收Leu,Thr,Ile,Lys,Phe和Tyr较多,而在静止期这些氨基酸却消耗较少.