高抑菌活性的金银花内生真菌的ITS序列分析法鉴定

采用分子生物学方法,对金银花中分离的2株具有高抑菌活性的内生真菌JY2和JY9的rDNA中的ITS序列进行了测序和分析.结果表明:JY2与镰刀菌属的同源性达到99%以上,判定为镰刀菌属;JY9与现有相似序列的同源性都不高,只能推测其可能为子囊菌门,与原形态学鉴定的赤霉属有差别.     

基于高通量测序分析结肠息肉患者肠道细菌群落结构

结直肠癌是胃肠道中最常见的恶性肿瘤,而结肠息肉尤其是腺瘤性息肉是结肠癌前病变的指征之一.作者采用基于16S rRNA基因的高通量测序技术,对收集自云南省第一人民医院结肠息肉患者粪便样品的细菌群落结构进行分析研究.不同患者粪便样品微生物群落存在较大差异,其中拟杆菌门、厚壁菌门以及变形菌门在7个样品中所占序列比例较高;在科的水平上,拟杆菌科、毛螺菌科、瘤胃菌科以及肠杆菌科为主;在属的水平上,所占序列比例较高的菌属为拟杆菌属(Bacteroides)、Clostridium Xl Va、Lachnospiracea科未分类属以及粪杆菌属(Faecalibacterium).部分结肠息肉患者肠道细菌组成与健康人群存在较大差异,分析结肠息肉患者肠道微生物群落组成,有利于发现早期癌症病变指征,为建立无创早期肿瘤诊断方法提供依据.     

三七种植前后土壤细菌群落结构与多样性分析

三七是我国特有的中药材,因存在严重的连作障碍,导致三七产量与品质下降.基于Illumina Mi Seq测序平台采用16S r DNA分析技术对三七种植前土壤、种植3年根际土壤、三七收后1年和3年土壤4种类型土壤中的细菌群落多样性进行了分析.结果表明:三七植株的种植对土壤细菌群落组成在门的分类水平上具有显著的影响,三七种植前后变形菌门(Proteobacteria)、蓝藻门(Cyanobacteria)和放线菌门(Actinobacteria)为调查土壤中的的优势细菌门;三七种植使红游动菌属(Rhodoplanes)明显减少而假单胞菌属(Pseudomonas)增加明显;种植三七前后土壤细菌群落多样性指数和丰富度指数的变化规律基本一致,表现出未种植空白对照CK三七收后3年三七收后1年三年生三七根际.     

冬季农田不同深度土层及小麦根际土壤细菌群落结构和共现网络分析

为探究冬季农田不同深度土层及小麦根际土壤细菌的多样性和群落结构,采集不同深度的农田土壤(0≤FG-A≤5 cm、5+₄-N和TOC含量呈负相关。样本聚类显示GJ、FG-A和FG-B相互聚类。共现网络分析表明,变形菌门、酸杆菌门、拟杆菌门(Bacteroides)在网络中共现性较高,不同模块之间的细菌组成以及相互作用均具有独特性。     

29株淡水真菌固体发酵提取物的抑菌活性研究

对29株淡水真菌进行固态发酵,用牛津杯法和滤纸片法分别筛选固态发酵提取物对6种食源性病原细菌(金黄色葡萄球菌、李斯特菌、枯草芽孢杆菌、大肠杆菌、志贺菌、沙门氏菌)和3种植物病原真菌(尖孢镰刀菌、灰葡萄孢菌、水稻枯纹菌)的抑菌活性.研究结果表明,29株淡水真菌(分布于13个目中)均对供试食源性病原细菌有抑制作用,其中6株对所有供试病原细菌均具有抑制作用.17株淡水真菌(分布于9个目中)能够抑制植物病原真菌,其中Pseudoasteromassaria spadicea MFLUCC 15-0973对3种病原真菌都具有抑菌活性.具有抑菌活性的淡水真菌数量最多的3个目分别为Tubeufia-les、Pleosporales和Pleurotheciales.本研究首次报道了Atractosporales、Chaetothyriales、Distoseptisporales和Sporidesmiales目的 抑菌活性,并在现有研究的基础上,增加了4个目真菌对金黄色葡萄球菌的抑菌活性,5个目真菌对枯草芽孢杆菌的抑菌活性,10个目真菌对志贺菌的抑菌活性,4个目真菌对大肠杆菌的抑菌活性和9个目真菌对沙门氏菌的抑菌活性,以及3个目真菌对尖孢镰刀菌的抑菌活性,4个目真菌对灰葡萄孢菌的抑菌活性和2个目真菌对水稻枯纹菌的抑菌活性.本研究不仅为淡水真菌的抑菌活性研究补充了可靠数据,丰富了淡水真菌抑菌活性的分布,也初步总结了具有抑菌活性的淡水真菌在不同菌目的 大致分布和抑菌规律,增加了对淡水真菌的认识,对淡水真菌研究具有重要意义.     

基于高通量测序技术的盐地碱蓬根际细菌群落多样性分析

碱蓬(Suaeda glauca Bunge)是盐碱性土壤的先锋植物,了解碱蓬根际的微生物,对理解碱蓬适应碱性土壤的生活习性,进一步开发盐地碱蓬具有一定意义。利用Miseq测序平台对采自辽宁红海滩的4个碱蓬样品进行细菌DNA V3+V4序列测定,并分析该植株根际土壤的细菌群落结构及多样性。结果显示,在这4个样品中共检测到143041条有效序列,1346个OTU,涉及27个门类、60个纲类、104个目类、193个科类、355个属类和408个种类;基于OTU数量进行样品间和样品内的多样性分析的结果显示:陆地的盐地碱蓬的根际土壤与水洼附近盐地碱蓬的根际土壤的细菌组成相似,其中陆地样品细菌群落多样性最高;门水平中占比最多的三个门类分别为变形菌门(Proteobacteria)、蓝细菌门(Cyanobacteria)、拟杆菌门(Bacteroidetes);属水平上,20个优势菌属中变形菌门的细菌属占比接近50%。该结果对了解盐地碱蓬根系微生物组成,探寻碱蓬的生长特性提供了线索,也为寻找和筛选资源微生物提供研究思路。     

基于高通量测序的寒地沼气池微生物群落解析

为实现寒地沼气发酵系统高效、稳定运行,应建立基于沼气发酵微生物群落的复合调控策略．本研究耦合454高通量测序和PCR-DGGE分析方法,对北方规模最大的海林农场沼气池内细菌及产甲烷古菌群落结构进行解析．取沼气池稳定运行期沼液样品,分析系统内微生物群落多样性．结果显示,共获得1 297条高质量微生物序列,在属和种的分类水平上,至少存在581个细菌属和666个细菌种．优势菌群有Firmicutes、 Bacteroidetes 及Proteobacteria,相对丰度分别为46.39％、21.41％和18.98％．优势属(相对丰度>5.0％)包括Proteiniphilum、Spirochaeta和Wolinella．DGGE分析结果表明,产甲烷古菌包括Methanocorpusculum sp.、Methanosaeta sp.、Methanobacterium sp.及Methanosarcina sp.．,表明沼气池的产甲烷途径以乙酸代谢类型为主,水解、酸化过程主要由来自动物消化系统内的细菌完成．     

浓香型白酒糟醅中真菌菌群的多样性分析

为了弄清中国浓香型白酒发酵糟醅真菌微生物优势菌群的系统发育规律,对不同发酵时间糟醅样品的微生物18S rDNA进行了PCR克隆分析和同源性比较。研究发现糟醅中心样品以Issatchenkia、Talaromyces、Aspergillus和Eurotium等4属的真菌为主要优势菌,分别占全部真菌DNA克隆数的28.6%、16.9%、14.3%、26.0%;Issatchenkia属酵母菌主要出现在发酵前中期,Talaromyces属霉菌主要出现在发酵前期且在发酵过程中保持一定数量的存在,Aspergillus属霉菌则从发酵中期开始数量逐渐增多,Eurotium属霉菌在发酵中后期在数量上占有绝对多数。主要优势真菌的菌群变化及生物学特征说明其代谢活动与浓香型白酒糟醅发酵中大分子物质的降解及白酒风味物质的形成密切相关。     

PCR技术对浓香型白酒糟醅细菌菌群的解析

为探索中国浓香型白酒发酵糟醅中细菌类微生物区系的形成和演变规律，通过发酵全过程跟踪取样和借助PCR扩增技术，对窖池中心糟醅样品进行了DGGE分析和16SrDNA同源性比较。研究发现，发酵初期表现出明显的微生物多样性分布，共检出Erwinoa、Kozakia、Acetobacter、Bacilllus、Staphylococcus、Lactobacillus、Granulicatella、Arthrobacter、Microbacterivm、Shewanella、Clostridium以及未分类Clostidales等11个以上的细菌分类属；随着发酵的进行，Lactobacillus属细菌成为主要优势菌，检出的有效克隆达到全部克隆的56．1％，并全部为Lac．Acetotolerans（98％）菌株。主要细菌菌群的数量分布及变化趋势揭示，在浓香型白酒糟醅发酵过程中，Lactobacillus属细菌可能充当着重要的角色。     

仙鹤草内生真菌的分离鉴定与抗菌活性

植物内生真菌代谢产物丰富, 作为一种寻找开发药物的重要资源已受到人们的日益关注.本 实验对中药仙鹤草内生真菌进行分离, 获得30 株内生真菌, 其中由根中分离得到17 株, 茎中分离 得到7 株, 叶中分离得到6 株.并采用形态学观察方法, 对分离得到的内生真菌菌株进行初步鉴定, 其分别归属于青霉属, 顶孢霉属, 镰孢霉属, 根霉属, 酵母属, 珠网霉属, 毛霉属和核盘菌属等8 个真 菌属.采用平板对峙法, 研究各菌株对金黄色葡萄球菌的抗菌作用, 通过初步筛选, 共计9 株表现抑 菌活性.再进一步用内生真菌发酵萃取液做抑菌活性, 发现仅3 株菌株有抗菌活性, 都属于镰孢霉 属.为后续的活性物质分离奠定了基础.     

干浆米线的变质微生物及其污染源分析

以某米线生产企业生产的变质干浆米线为研究对象,对其进行变质微生物检测及其污染源分析。研究表明:4份样品的微生物数量非常高,细菌总数在106—108cfu/g,霉菌数量在104cfu/g,酵母为103—104cfu/g。从微生物组成来看,细菌则主要是葡萄球菌属(Staphylococcus spp.),为凝固酶阴性,其可能来自操作人员体表或设备。霉菌主要是拟青霉(Paecilomyces spp.)、毛霉(Mucor spp.)、白地霉(Geotrichum candidum)和交链孢霉(Alternaria spp.);菌相组成与空气中主要的霉菌菌相一致,显示该污染的源头可能是空气。干浆米线虽经干燥,但水分活度不够低,易染菌,保质期短;在保鲜、干燥工艺上还待研究和改进。     

aadA叶绿体转化烟草对根际微土壤生物的影响

为研究叶绿体转基因烟草对土壤根际微生物的影响,以aadA叶绿体转基因烟草和对照烟草为实验材料,对苗期、花期、成熟期烟草根际细菌、放线菌及真菌的菌落数进行统计,利用Biolog法分析微生物群落功能多样性．结果表明:在相同生育期,aadA叶绿体转基因烟草与对照烟草相比,根际土壤细菌、放线菌及真菌数量均无显著差异;根际土壤微生物群落的代谢相似,转基因烟草对微生物群落功能的影响不显著．aadA叶绿体转基因烟草没有对土壤微生物数量和功能多样性产生显著的影响．     

长白山湿地细菌群落结构分析及优势菌株鉴定

对长白山北坡和西坡不同湿地的土壤细菌的群落结构及优势菌株进行了总体研究.采用PCR-DGGE分子生物学技术,对湿地土壤样品中总DNA的16S rDNA的V3区进行PCR扩增,通过变性梯度凝胶电泳(DGGE)对扩增产物进行分离.回收了26个清晰的条带,对其中19个特征性条带进行了测序,除了条带12、13、16为可培养的微生物外,其他16个条带都是不可培养微生物.通过传统培养法,利用MIDI微生物鉴定系统,对8种可培养的最优势菌株进行了分析,各菌种分别为Bacillus sp., Bacillus licheniformis, Virgibacillus pantothenticus, Bacillus cereus, Micrococcus luteus, Paenibacillus alginolyticus, 优势菌株间的相似性水平较低.     

降解聚丁二酸丁二醇酯(PBS)微生物菌种的筛选及降解性的研究

为了获取土壤中能降解聚丁二酸丁二醇酯(PBS)的微生物菌种,并研究其对PBS的降解效果,以陕西花园土壤为介质,对其中的细菌、真菌和放线菌分别进行了驯化和筛选.选取活性强的几种菌种对PBS进行了生物降解实验,并且研究了降解前后PBS的表面形态、质量损失和力学性能的变化.研究结果表明:在陕西花园土壤中降解PBS最快的菌为真菌,经上述菌种侵蚀后的PBS晶体均受到一定程度的破坏,力学性能随降解时间的延长逐步降低.     

舟山市区空气中微生物数量变化动态初报

用平皿自然沉降法于2006年至2007年间分别对舟山市市区5个测定点作了12次空气微生物测定,调查了舟山市区主要功能区（居民区、沿海区、公园区、校园区、交通区）大气中细菌、放线菌和真菌类的数量变化动态。结果表明：全年空气中细菌的数量均远远高于真菌及放线菌的数量,真菌和放线菌数量变化相一致,其中真菌数略高于放线菌数量。细菌总数在冬季达到最高值,春季下降,至夏季最低与秋季基本持平;真菌与放线菌数量在春季达到最高峰,夏季急剧下降,秋季达最低,显示出舟山市空气微生物含量变化不全同于我国一些内陆城市的海岛特征。     

中国不同地区蜂胶的抑菌性研究

蜂胶具有显著的抑菌性,常被做成药品或保健品.为了解中国蜂胶的抑菌性,本实验以采自中国23个省的29种蜂胶（根据采集地气候区域分为5类）为研究对象,分别提取获得蜂胶醇提物（EEP）,并测定了EEP对枯草杆菌、金黄色葡萄球菌、产气杆菌、大肠杆菌、变形杆菌、毛霉、青霉、曲霉、根霉的抑菌圈大小和最小抑菌浓度,比较不同气候区域蜂胶的抑菌性差异.结果表明,EEP对革兰氏阳性菌、革兰氏阴性菌和真菌均有明显的抑菌性,平均抑菌圈直径分别为：9.88mm±1.47 mm、8.75 mm±1.56 mm和10.01 mm±0.65 mm,EEP对真菌的抑菌性最强,其次为革兰氏阳性菌,最弱为革兰氏阴性菌;9个菌种中,EEP对变形杆菌的抑菌性最差,对根霉的抑菌性最好;不同气候区域蜂胶的EEP抑菌性没有显著差异.     

红毛七中三萜皂苷类化学成分生物活性研究

采用96孔板微量稀释法,以大肠杆菌、金黄色葡萄球菌、乳链球菌、枯草芽孢杆菌、小麦赤霉病菌、白菜黑斑病菌、西瓜枯萎病菌、葡萄炭疽病菌等为指示菌,对红毛七中分离纯化得到的化合物进行抑菌活性评价．结果表明：三萜皂苷化合物对测试的8种菌均有抑制作用,其中16α-羟基-齐墩果-12-烯-28-酸-3-O-α-L-阿拉伯吡喃糖苷、葳严仙皂苷元-3-O-α-L-阿拉伯吡喃糖苷显示出很强的抑细菌活性,MIC值为3．9μg／mL;采用二甲苯致小鼠耳肿胀方法和热板法对分离得到的三萜皂苷化合物常春藤皂苷元-3-O-α-L-阿拉伯吡喃糖苷,常春藤皂苷元-3-O-β-D-葡萄吡喃糖-（1→2）-α-L-阿拉伯吡喃糖苷等进行了抗炎和镇痛作用研究．结果表明：2种三萜皂苷化合物对小鼠的抗炎、镇痛效果与剂量成依赖关系．在注射化合物30min后,镇痛效果达到最大．     

PBS降解产物对土壤微生物生理特性的影响研究

以陕西的花园土为供试土壤,采用室内模拟,在土壤中添加一定量的聚丁二酸丁二醇酯（PBS）,研究不同分子质量的PBS降解产物对土壤呼吸强度和微生物（细菌、真菌、放线菌和微生物总量）数量的影响．研究结果表明：PBS1（Mn为1．60×10^4）和PBS2（Mn为3．00×10^）处理组均有利于土壤呼吸强度的增加,其中PBS2处理组的促进作用更加明显;PBS1和PBS2处理组在浓度较高时均有利于细菌、真菌、放线菌、微生物总量等数量的增加,但是两者在浓度较低时作用不明显．     

药用植物辣木内生真菌的分离及其抗菌活性分析

从新鲜植株辣木的茎和叶中分离出内生真菌35株。以金黄色葡萄球菌、藤黄八叠球菌、大肠杆菌、绿脓杆菌、白色念株菌、掷孢酵母为受试菌株,对其进行抗菌活性筛选。结果表明,共有29株内生真菌对1株或1株以上的受试菌株有抗菌活性,其中平板抑菌圈直径大于15mm的菌株有1株。研究结果表明,辣木内生真菌具有良好的潜在应用价值,值得做进一步研究。     

六种观赏植物根际土壤微生物菌群结构分析

[目的]探讨校园环境中不同观赏植物生长和根际土壤微生物数量、种群结构与代谢功能多样性的关系,以及它们之间的相似性和差异性.[方法]以校园生境为基础,收集校园日本樱花、石楠、枫杨、银杏、夹竹桃、紫楠六种植物根系土壤,进行菌种资源调查,并运用现代高通量测序技术对根际土壤微生物群落结构进行分析.[结果]分离培养出86个优势微生物样株,分别为放线菌38株、细菌27株、真菌21株.由宏基因组分析结果可知,六种植物根系土壤中菌种多数属于放线菌门(Actinobacteria)、变形菌门(Proteobacteria)、酸杆菌门(Acidobacteria),其中在日本樱花和夹竹桃土壤样本中这三个优势菌门数超过50％.奇古菌门(Thaumarchaeota)只存在于枫杨和石楠的根际土壤中,石楠和枫杨根际土壤细菌群落结构具有较大的相似性,而日本樱花与其他观赏树木土壤样本中根际土壤微生物群落结构差距较大.在日本樱花、石楠、枫杨和夹竹桃根际四种土壤样品微生物菌群中含糖苷水解酶、糖基转移酶、糖类酯解酶相关基因所占序列数较多.[结论]同一环境不同植物根际土壤微生物菌群结构不同,为进一步揭示根际土壤微生物与植物之间的关系提供理论基础.