一种基于投影聚类的无监督表型区分算法

高通量微阵列技术与手工表型标定方式间的矛盾导致了基因表达数据的获取与表型确定间的不平衡.然而,已有的表型区分方法大多是有监督的,并且通常忽略了基因间广泛存在的相互作用,根据单个基因的独立区分能力划分样本表型,选择相关基因.从新的视角,基于投影聚类的思想,提出一种考虑基因间相互关系的无监督表型区分算法USPD.通过将基因表达数据转化为具有负间隔约束的序列数据,强化了基因间的相互关系.利用设计的质量函数,采用深度优先方式遍历样本穷举树,无监督地生成样本表型划分.同时采用高效的削减策略,大大提高了算法的效率.通过将算法与现有的以基因表达数据分析为目的的代表性投影聚类算法HARP相比较,证明提出算法的高效性和有效性.     

基因表达数据的并行双向聚类算法

基因表达数据的双向聚类问题是生物信息学中的一个重要的问题,通过对基因在各种不同实验条件下的表达数据进行双向聚类,可以分析和识别同类基因所共同拥有的基因功能以及转录调控元件.本文对基因表达数据进行双向聚类的问题进行了深入的研究.提出一种并行算法.该算法根据数据集合的大小对双向聚类质量的反单调性,由最小的数据集合开始逐步添加行或列,最终找到所有满足条件的聚类.实验结果表明,该算法处理速度快,聚类质量高,性能明显优于其它同类算法.     

基因表达数据的聚类分析研究进展

基因表达数据的爆炸性增长迫切需求自动、有效的数据分析工具. 目前聚类分析已成为分析基因表达数据获取生物学信息的有力工具. 为了更好地挖掘基因表达数据, 近年来提出了许多改进的传统聚类算法和新聚类算法. 本文首先简单介绍了基因表达数据的获取和表示, 之后系统地介绍了近年来应用在基因表达数据分析中的聚类算法. 根据聚类目标的不同将算法分为基于基因的聚类、基于样本的聚类和两路聚类, 并对每类算法介绍了其生物学的含义及其难点, 详细讨论了各种算法的基本原理及优缺点. 最后总结了当前的基因表达数据的聚类分析方法,并对发展趋势作了进一步的展望.     

双层结构的基因表达数据聚类算法

本文提出了一种双层结构的基因表达数据聚类算法,该算法针对基因表达数据量庞大且已知功能的基因较少的特点,将聚类过程分为两个层次,快速分析层和精确聚类层。聚类结果采用信息熵方法进行评价。实验结果表明该聚类方法对于聚类基因表达数据非常有效。     

基于代表熵的基因表达数据聚类分析方法

针对基因表达数据样本少,维数高的特点,尤其是在样本分型缺乏先验知识的情况下,结合自组织特征映射的优点提出了基于代表熵的双向聚类算法。该算法首先通过自组织特征映射网络（SOM）对基因聚类,根据波动系数挑选特征基因。然后根据代表熵的大小判断基因聚类的好坏,并确定网络的神经元个数。最后采用FCM（Fuzzy C Means）聚类算法对挑选出的特征基因集进行样本分型。将该算法用于两组公开的基因表达数据集,实验结果表明该算法在降低特征维数的同时,得出了较高的聚类准确率。     

一种新聚类算法在基因表达数据分析中的应用

自组织特征映射神经网络与层次聚类算法是两种较经典的分析基因表达数据的聚类算法,但由于基因表达数据的复杂性与不稳定性,这两种算法都存在着自身的优劣。因此,在比较两种算法差异性的基础上,创造性地提出了一种新算法,即通过SOM算法对基因表达数据进行聚类,再用层次聚类将每个类对应的神经元权值二次聚类,并将此算法应用在酵母菌基因表达数据中,用实验证明改进算法克服了自组织算法的一些缺陷,提高了基因聚类的效能。     

DENGENE:一种高精度的基于密度的适用于基因表达数据的聚类算法

根据基因表达数据的特点,提出一种高精度的基于密度的聚类算法DENGENE.DENGENE通过定义一致性检测和引进峰点改进搜索方向,使得算法能够更好地处理基因表达数据.为了评价算法的性能,选取了两组广为使用的测试数据,即啤酒酵母基因表达数据集对算法来进行测试.实验结果表明,与基于模型的五种算法、CAST算法、K-均值聚类等相比,DENGENE在滤除噪声和聚类精度方面取得了显著的改善.     

基于计算智能的基因表达数据聚类分析研究进展

基因表达数据聚类是发现基因功能和确立基因调控网络的重要方法,计算智能在该领域的应用为分析 大量基因数据提供了新途径．本文根据基因表达数据的特点,提出了基因表达数据聚类领域的关键问题,探讨了基 于计算智能的基因表达数据聚类基本框架,综述了计算智能在基因数据聚类领域的应用现状,最后指出了在基因数 据聚类领域计算智能方法未来的发展方向．     

一种共调控基因C均值模糊聚类算法

聚类方法在基因表达数据分析中发挥着非常重要的作用,但基因表达数据相对其他领域的数据具有自身的特性,因此传统的数据距离定义和聚类方法已不能完全满足研究者对生物数据的分析要求。提出一种基于泊松分布的数据距离度量方式TransChisq,它以一种全新的视角定义了基因数据之间的距离,鉴于模糊聚类算法能够更加深刻地描述复杂的基因作用关系,将TransChisq距离与模糊聚类方法相结合对模糊C均值算法进行改进,并应用于真实基因表达数据分析。实验结果表明,该方法能够按照生物学的真实分类将基因表达数据聚类,并且可以发现更多的共调控基因,更加满足了基因表达数据分析的需要。     

从基因表达数据中挖掘最大的行常量双聚类*

双聚类方法是当前分析基因表达数据的一个重要研究方向,其挖掘目标是发现哪些基因在哪些实验条件下具有相似的表达水平或者关系密切.目前已提出了许多双聚类算法来挖掘不同类型的双聚类,然而其大部分挖掘效率不高.鉴于此,提出了一个新颖的挖掘算法——MRCluster,其主要是用来从原始的基因表达数据中挖掘最大的行常量双聚类模式.就其挖掘效率来说,它采用的是基于Apriori原则的基因扩展深度优先的挖掘策略,并且在挖掘过程中引入了一些新颖的剪枝技术来提高效率.将MRCluster和一个行常量双聚类模式挖掘方法RAP(range support pattern)算法进行比较,从实验结果上可以看出,相比RAP算法,MRCluster算法对在原始的基因表达数据中挖掘最大的行常量双聚类模式具有更好的效率.因此,MRCluster算法能够有效地从原始的基因表达数据中挖掘最大的行常量双聚类.     

浅谈反映人体测量学来源的人体比例理论

人体测量学并不是现代社会的产物。有着很长发展历史的人体比例理论中就包含了现代人体测量学的基本内容,尽管其还不够系统完整,但至少说明了在艺术创作中诞生的人体比例理论对现代人体测量学的影响。并随着时间的推移而不断的完善发展,为现代人体测量学的系统提出奠定了坚实的基础。     

FLASH教学中声音导入问题的浅析

目的:解决在FLASH中导入声音的问题.方法:对FLASH不支持的声音格式采取音频压缩的方法.结果:可成功将压缩后的声音文件导入到FLASH中.结论:在FLASH中使用声音可以使FLASH动画具有良好的动画效果.     

金属切削过程中的稳定性分析

本文对于金属切削这一生产过程中所出现的不稳定问题,利用频率特性法中的奈氏判据,对其进行分析,从而找出消除自激振荡和达到切削过程绝对稳定的条件     

Convergence,the university of the future and the future of the university

 The paper questions the ability of current university systems to respond appropriately to the complex demands of an Information Economy. It argues that new relationships between creative subjects and technology require new thinking about the nature and purpose of universities per se. In particular, attention is drawn to the growing involvement of the private sector in higher education. It is argued that it may not be appropriate to think of the `university of the future' in terms of current public sector and quasi public sector institutions, but rather in terms of an emporium, based on an international trade in educational services, and with the `University' as we now understand it occupying the functions of licensing, quality assurance and cultural custodianship. Accepted: 25 June 2002     

VMware的技术与应用探析

虚拟化技术是当今服务器技术的一个主流方向,也是一项在计算机领域具有革命性意义的技术.作为x86架构体系下虚拟化技术的领军者-VMware,在技术上有其独到之处.研究VMware的技术与应用,对探知其优秀的技术特点,了解其成熟的产品体系有着现实意义.     

Modelling the dynamics of the tilt-casting process and the effect of the mould design on the casting quality

All titanium alloys are highly reactive in the molten condition and so are usually melted in a water-cooled copper crucible to avoid contamination using processes such as Induction Skull Melting (ISM). These provide only limited superheat which, coupled with the surface turbulence inherent in most conventional mould filling processes, results in entrainment defects such as bubbles in the castings. To overcome these problems, a novel tilt-casting process has been developed in which the mould is attached directly to the ISM crucible holding the melt and the two are then rotated together to achieve a tranquil transfer of the metal into the mould. From the modelling point of view, this process involves complex three-phase flow, heat transfer and solidification. In this paper, the development of a numerical model of the tilt-casting process is presented featuring several novel algorithm developments introduced into a general CFD package (PHYSICA) to model the complex dynamic interaction of the liquid metal and melting atmosphere. These developments relate to the front tracking and heat transfer representations and to a casting-specific adaptation of the turbulence model to account for an advancing solid front. Calculations have been performed for a 0.4 m long turbine blade cast in a titanium aluminide alloy using different mould designs. It is shown that the feeder/basin configuration has a crucial influence on the casting quality. The computational results are validated against actual castings and are used to support an experimental programme. Although fluid flow and heat transfer are inseparable in a casting, the emphasis in this paper will be on the fluid dynamics of mould filling and its influence on cast quality rather than heat transfer and solidification which has been reported elsewhere.     

符号在品牌传播中的研究及其运用

从品牌战略管理的高度出发,阐述了品牌传播符号语意的重要作用、常用方法以及要注意的问题,并以哈雷摩托为例进行了分析。     

应用多媒体技术教学的优势及存在问题与对策

每一种媒体部有自身的长处，对某种特定的教学和学习有效。同样，每种媒体又不可避免地存在局限性，不利于某些教学和学习。因此，多媒体不是一种全能的媒体，也不可能代替传统媒体。现代媒体与传统媒体在教学中应相互补充，取长补短，相得益彰。     

DVB-C数据广播系统在宽带网络中的应用

介绍DVB数据广播系统的特性及相关知识，对于DVB系统组成以及在当前宽带网络中的应用进行了阐述。