应用LAMP实时浊度法检测转基因大豆

DNA环介导等温扩增(Loop Mediated Isothermal Amplification,LAMP)方法是一种新型的核酸扩增检测方法,该方法操作简便、所需时间短、灵敏度高、特异性强.实时浊度法可以实时检测反应过程中所产生的白色沉淀,从而实现对LAMP整个反应过程的实时监控.本研究以抗草甘膦转基因大豆为研究对象...     

LAMP实时浊度法快速检测转基因玉米MON810

LAMP实时浊度法是采用环介导等温扩增（Loop Mediated Isothermal Amplification,LAMP）技术通过实时浊度仪实时检测反应过程中所产生的白色沉淀,从而实现对扩增全过程的监控,弥补了显色法只能观看反应终点的缺陷,使引物筛选和反应体系的优化有数据可依。本研究以转基因玉米MON810为研究对象,针对外源基因苏云金芽孢杆菌杀虫毒蛋白CryIA(b)与内源基因边界序列设计6条特异性引物,通过实时浊度法在63 ℃的恒温条件下完成检测,对检测的灵敏度、特异性、稳定性进行了评价。建立了转基因玉米MON810的LAMP实时浊度检测方法,该方法最低检出限为0.5%,与LAMP显色法和实时荧光PCR法进行结果比对,符合率为100%,经评价具有特异性高、稳定性强、准确简便等优点,非常适合转基因玉米MON810的快速检测,有较好的应用价值。     

LAMP实时浊度法快速检测肠出血性大肠杆菌O157的研究

采用环介导等温扩增(Loop Mediated Isothermal Amplification,LAMP)技术,利用实时浊度仪实时检测LAMP反应过程中所产生的焦磷酸镁白色沉淀,实现对扩增反应全过程的监控,建立食品中肠出血性大肠杆菌(Enterohemorrhagic Escherichia coli,EHEC)O157的LAMP实时浊度法快速检测方法。针对EHEC O157抗原基因rfbE的序列设计4条特异性LAMP引物。通过实时浊度仪在恒温63℃下1小时完成检测,对方法的特异性、灵敏度、稳定性进行了评价,并进行了食品样品添加试验以评价其应用于实际样品的效果。结果显示,经优化后,该方法的最低检出限为2.8×103 CFU/mL,与PCR法灵敏度比较高100倍。样品添加试验能检出的最低添加菌量为2.8×102 CFU/25 g(或mL)。LAMP实时浊度法具有快速、灵敏、特异性高、操作简便的优势,为食源致病菌快速筛查提供了一种良好的检测模式。     

转基因玉米GA21品系LAMP检测引物的筛选及方法的建立

根据转基因玉米GA21品系的特异序列设计了3套环介导等温扩增(LAMP)引物。通过反应温度优化、特异性测定,筛选到1套特异性好的LAMP引物,包括内引物、外引物和环引物各1对。在LAMP反应体系中加入SYBR Green I荧光染料,在实时荧光定量PCR仪上进行实时监测,对筛选到的LAMP引物进行反应条件、反应体系的优化,建立了转基因玉米GA21品系LAMP检测方法。对该方法的特异性、灵敏度、稳定性进行评价,结果表明建立的LAMP检测方法能特异、灵敏、稳定地检测转基因玉米GA21品系,检测限达到0.05%。将建立的LAMP检测方法应用于玉米及其制品中GA21品系的检测,检测结果与实时荧光PCR法的结果完全一致。     

可视化LAMP法快速检测转基因苜蓿草J101品系

目的建立我国农业部未颁发农业转基因生物安全证书的转基因苜蓿草J101品系特异性环介导等温扩增(loop–mediated isothermal amplification,LAMP)检测方法。方法根据转基因苜蓿草品系J101 3’端外源插入片段与苜蓿草基因组DNA之间的邻接区序列设计6条引物,建立转基因苜蓿草J101品系特异性LAMP检测方法,并对本方法的特异性、灵敏度进行了测定。结果建立的检测方法特异于转基因苜蓿草J101成分检测,检测最低DNA浓度为(1imit of detection,LOD)为16 pg,相当于10拷贝转基因苜蓿草J101基因组DNA。结论本研究建立的转基因苜蓿草J101品系特异性LAMP检测方法特异性好,灵敏度高,能够快速、准确、稳定地对转基因苜蓿草J101成分进行检测分析。     

转基因玉米Bt176品系特异性环介导等温扩增检测方法的研究

根据转基因玉米品系Bt176外源插入片段与玉米基因组序列设计和筛选品系特异性引物,并对反应体系和反应条件进行优化,最终建立转基因玉米品系Bt176的品系特异性LAMP检测方法.对该方法进行了灵敏度、特异性和稳定性评价.评价结果表明:该方法定性检测低限为0.5％,特异性和稳定性均达到100％.     

转基因油菜Ms8品系的LAMP检测

目的 建立一种快速敏感的转基因油菜籽Ms8品系应用环介导等温扩增技术检测方法。方法 针对转基因油菜籽Ms8品系外源基因与内源基因结合处序列设计1组特异性引物, 对反应体系进行优化。 结果 LAMP检测方法反应速度快, 在60 min内即可完成扩增, 检测结果易于观察, 通过肉眼观察染色情况即可分辨, 该方法灵敏度高, 检测限可达到65.12 pg/?L, 并且具有良好的特异性。结论 LAMP检测方法快速、灵敏、特异性强, 适用于转基因油菜籽Ms8品系基层和现场检测。     

转基因玉米Bt176品系特异性环介导等温扩增检测方法的研究

根据转基因玉米品系Bt176外源插入片段与玉米基因组序列设计和筛选品系特异性引物,并对反应体系和反应条件进行优化,最终建立转基因玉米品系Bt176的品系特异性LAMP检测方法。对该方法进行了灵敏度、特异性和稳定性评价。评价结果表明:该方法定性检测低限为0.5%,特异性和稳定性均达到100%。      

猪瘟病毒实时荧光LAMP检测方法的建立

为做好猪瘟的早期诊断和及时预防,建立一种快速检测猪瘟病毒(Classical swine fever virus,CSFV)的实时荧光环介导等温扩增方法。试验利用Primer Explorer version 4针对CSFV的5`UTR非编码区设计4组引物,筛选出最佳引物后建立CSFV的实时荧光环介导等温扩增检测方法,并对该方法的特异性、灵敏度以及适用性进行验证。结果显示,本试验建立的实时荧光环介导等温扩增方法对128份临床样本和22份猪瘟活疫苗人工干扰样本的检测结果与实时荧光聚合酶链式反应检测方法一致。该方法仅对猪瘟病毒有扩增反应,且最低检测浓度为10 fg/μL,对猪伪狂犬病毒、高致病性高致病型猪繁殖与呼吸综合征病毒、猪圆环病毒2型等8种病原无扩增反应。本试验建立的实时荧光环介导等温扩增方法特异性强、灵敏度高,检测效果好,操作简单,适用于CSFV临床样本的快速检测。     

实时LAMP法快速检测食用植物油中的转基因成分CaMV-35S

环介导等温扩增技术(Loop-mediated isothermal amplification,LAMP)是一项新的DNA扩增技术,近年来已被成功应用于转基因作物中外源基因的检测分析。本文针对花椰菜花叶病毒35 S启动子(CaMV-35S)设计引物以及有效提取目标DNA后,首次建立了食用植物油中CaMV-35S启动子的LAMP检测方法。通过在DNA提取过程中加入正己烷乳化和加入共沉淀剂,获得了可以进行LAMP扩增的DNA片段,采用LAMP实时浊度法和染色法对扩增产物进行比较分析。着重对FIP/BIP引物、甜菜碱和Mg2+浓度等反应参数进行了优化。结果表明,LAMP方法能够在56 min内特异性地检测到CaMV-35S启动子,检测灵敏度比常规PCR高10倍,而且不需要特别的仪器设备,扩增产物可通过观察实时浊度曲线或通过SYBR Green I染色后借助肉眼对检测结果进行判断。该方法快速高效、操作简便、灵敏度高、检测结果准确,适合食用植物油中转基因成分的快速检测。     

Development and application of a rapid and simple loop-mediated isothermal amplification method for food-borne Salmonella detection

Food Science and Biotechnology - A loop-mediated isothermal amplification (LAMP) method for rapid detection of the food-borne Salmonella strains had been developed and evaluated in this study. The...     

恒温实时荧光法快速检测简单异尖线虫方法的建立

为了快速鉴定简单异尖线虫,本研究建立了一套检测简单异尖线虫DNA的恒温实时荧光环介导等温扩增（loop-mediated isothermal amplification,LAMP）方法,根据LAMP方法原理,针对简单异尖线虫ITS2区域设计引物特异性识别靶标基因。进行了特异性、灵敏度、重复性和实际样品的测试,并与传统的PCR方法进行比较。结果表明,该方法能够特异性扩增简单异尖线虫DNA,对含有简单异尖线虫ITS2目的基因片段的质粒DNA检测限为1 fg/μL,灵敏度比传统的PCR方法高100倍,重复性良好,对实际样品进行检测,与传统的PCR测序方法结果相符。本研究建立的恒温实时荧光快速检测方法适用于特异性检测简单异尖线虫。      

环介导等温扩增法检测转基因玉米MIR604

根据转基因玉米品系MIR604外源插入片段与玉米基因组序列设计和筛选品系特异性引物,并对反应体系和反应条件进行优化,最终建立转基因玉米品系MIR604的品系特异性LAMP检测方法。对该方法进行了灵敏度、特异性和稳定性评价,评价结果表明:该方法定性检测低限为0.5%,特异性和稳定性均达到100%。     

改良LAMP法检测转基因作物

目的 建立简易的可视化环介导等温扩增(LAMP)检测转基因作物的方法。方法 通过一对特异的能识别一段正义链和一段反义链的内引物和一对链置换引物, 在Bst DNA聚合酶作用下, 以等温条件实现对外源转基因成分的扩增, 反应液和高浓度的显色液SYBR GREENⅠ同时置于特殊设计的反应管中, 反应后可实现闭管可视化检测。结果 对转基因作物中常见的外源基因元件胭脂碱合成酶终止子(T-NOS)和烟草花叶病毒35S启动子(P-CaMV35S)进行了LAMP检测。T-NOS LAMP对大米品系BT63, 玉米品系BT11, MON810, 大豆品系GTS40-3-2的检测结果呈阳性, P-CaMV35S LAMP对大米品系BT63, 玉米品系BT11, MON810, MON863, 大豆品系GTS40-3-2的检测结果呈阳性, 二者对非转基因大米, 玉米, 大豆的检测结果均呈阴性。上述结果表明, 本文中建立的T-NOS 和P-CaMV35S LAMP检测方法特异性高。另外, 通过对大豆品系GTS40-3-2模拟样品的检测, 证明T-NOS LAMP能检出转基因成分含量为0.5%的样品, P-CaMV35S LAMP能检出转基因成分含量为0.1%的样品, 检测灵敏度较高。结论 改良LAMP法灵敏度高, 特异性好, 能用于快速初筛转基因作物。     

小麦成分环介导等温扩增现场快速检测方法的建立和应用

目的建立环介导等温扩增(loop-mediated isothermal amplification,LAMP)方法现场快速检测小麦过敏原成分的分析方法,有助于食品安全突发事件现场和食品企业生产过程中的样品检测小麦成分。方法运用LAMP建立食品过敏原小麦成分LAMP现场快速检测方法,采用实时浊度仪和显色法进行结果判断,并进行反应条件优化。结果本方法特异性强,对35个对照样品无交叉反应;方法的灵敏度高,检测限可达到0.01%小麦;方法稳定性好,对0.1%和0.01%小麦样品重复检测结果稳定。通过对市场采集70份样品检测结果显示,该方法与食品标签标示的过敏原成分结果一致。结论本方法操作简单,检测时限短,结果判断准确,可用于过敏原小麦成分的快速检测。     

Development and evaluation of a loop-mediated isothermal amplification assay for rapid and sensitive detection of Vibrio parahaemolyticus

Loop-mediated isothermal amplification (LAMP) assays targeting the rpoD and toxR genes were developed to detect Vibrio parahaemolyticus. All 78 tested V. parahaemolyticus strains yielded positive results within 40 min, while negative results were obtained for 69 strains of other organisms even at 60 min. For V. parahaemolyticus ATCC 17802 in pure culture, the detection limits of LAMP assays targeting rpoD and toxR were 3.7 and 450 CFU per test, respectively. Due to the higher sensitivity of rpoD-LAMP, it was further evaluated for the ability to detect V. parahaemolyticus in seafood samples. V. parahaemolyticus populations spiked in short-necked clams were enumerated by the most-probable-number (MPN) method combined with the rpoD-LAMP assay and the MPN method with a culture method using agar medium. The MPN-rpoD-LAMP method had better sensitivity and was more rapid than the conventional method. These results indicate that the MPN-LAMP assay targeting the rpoD gene is a specific, sensitive, and rapid method to enumerate V. parahaemolyticus organisms.     

Sensitive and rapid detection of Alicyclobacillus acidoterrestris using loop-mediated isothermal amplification

BACKGROUND: A loop‐mediated isothermal amplification (LAMP) assay was developed for the rapid detection (within 2 h) of Alicyclobacillus acidoterrestris. The assay detected the species‐specific DNA sequence of the 16S–23S rRNA internal transcribed spacer. RESULTS: The eight strains of A. acidoterrestris were successfully amplified, but six strains of other bacillus Acidocaldarius and 13 bacterial species other than bacillus Acidocaldarius were not. The sensitivity of the LAMP assay was at 4.50 × 10^?2 cfu per tube. This sensitivity is greater than that obtained by polymerase chain reaction (PCR) assay. The LAMP assay was examined further for its ability to detect A. acidoterrestris in juice samples. The results were compared with those of conventional PCR detection. CONCLUSION: Results indicate that the proposed LAMP assay is a rapid, specific and sensitive method for detecting A. acidoterrestris. As the amplification has been conducted under isothermal conditions, only a water bath or heating block is needed to maintain the required temperature. Thus, the method can be generalised and popularised easily in the future. Copyright © 2011 Society of Chemical Industry