环介导等温扩增法快速检测乳中阪崎肠杆菌

利用环介导等温扩增方法的快速、简便等优点,建立一种检测乳中阪崎肠杆菌的方法。以阪崎肠杆菌的OmpA序列为靶基因,设计特异性引物。优化并建立LAMP检测乳中阪崎肠杆菌的方法。结果表明,LAMP检测阪崎肠杆菌纯培养物的灵敏度为3.7×101cfu/mL,其灵敏度是PCR方法的10倍。人工污染阪崎肠杆菌灭菌乳的检测限为4.3×101cfu/mL。对23株致病菌进行特异性实验,特异性良好。该方法具有特异性强、灵敏度高、设备简便、耗时短等优点,在食品检测中具有良好的应用前景。      

环介导等温扩增技术快速检测椰毒假单胞菌的研究

建立环介导等温扩增技术(LAMP)快速检测椰毒假单胞菌的方法。根据公布的椰毒假单胞菌16S～23SrRNA基因序列设计引物,建立了LAMP反应体系,在此基础上检测了蜡样芽孢杆菌菌液和人工污染蜡样芽孢杆菌的银耳样品,并将LAMP法与PCR法进行比较。结果表明,LAMP检测方法具有较高的特异性和敏感性,椰毒假单胞菌的检出限为5.4CFU/mL,是PCR方法检测灵敏度的1000倍,人工污染银耳样品中的椰毒假单胞菌的检出限为76CFU/g,样品中椰毒假单胞菌的检测过程(包括DNA提取、LAMP和电泳)可在2h内完成,因此LAMP可以简便快速有效地检测食品中的椰毒假单胞菌。      

环介导等温扩增技术检测小肠结肠炎耶尔森氏菌的研究

采用环介导等温扩增技术(Loop-mediated isothermal amplification,LAMP)快速检测小肠结肠炎耶尔森氏菌(Yersinia enterocolitica)。以小肠结肠炎耶尔森氏菌(AY004311.1)Ail基因序列作为靶序列,设计内、外引物,通过肉眼观察沉淀判断检测结果。结果表明:LAMP检测小肠结肠炎耶尔森氏菌的灵敏度为6.3cfu/mL,人工污染鸡肉的检出限为340cfu/g。PCR检测小肠结肠炎耶尔森氏菌的灵敏度为630cfu/mL,人工污染鸡肉的检出限为3.4×104cfu/g。采用试剂盒法提取DNA,从样品处理到报告结果,LAMP方法耗时2h,PCR方法耗时3h。因此,LAMP检测小肠结肠炎耶尔森氏菌的灵敏度高,耗时短,特异性好,操作简便,无需特殊的仪器设备,适合在我国广大基层实验室开展应用,为快速检测食源性致病菌构建了一个新的技术平台。     

环介导恒温核酸扩增法的研究和技术方法

核酸扩增是生命科学领域最具价值的工具之一,在临床微生物检测、传染性疾病以及基因诊断方面具有独特的应用价值。传统的检测方法均存在一定的局限性,因此基于核酸扩增的检测方法具有广阔的应用前景。环介导恒温核酸扩增法（loop-mediatedisothermalamplificationofDNA,简称LAMP）是一种新型的核酸扩增方法,由于其特异性和灵敏度高、简便快捷且成本低廉,因此在可预见的将来,LAMP技术将在核酸扩增领域逐渐取代PCR反应,推动检测技术向更快捷简便,更精确廉价的方向发展。      

实时荧光环介导等温扩增检测铜绿假单胞菌

目的建立一种实时荧光与环介导等温扩增(loop-mediated isothermal amplification, LAMP)相结合的铜绿假单胞菌检测方法。方法利用铜绿假单胞菌的外毒素A基因(Pseudomonas aeruginosa exotoxin A, PEA)序列,设计LAMP引物,对该方法的特异性、灵敏度及其在人工污染矿泉水中的检出限进行评价。结果该方法与其他菌株无交叉反应,特异性强,对纯菌液和人工污染矿泉水的检出限均可达到5.2 CFU/mL。结论该方法快速、灵敏、操作简便,为水样中铜绿假单胞菌的检测提供了一种有效的手段。     

环介导等温扩增技术快速检测食品过敏原牡蛎成分

目的建立环介导等温扩增(loop-mediated isothermal amplification, LAMP)方法快速检测食品中的过敏原牡蛎成分。方法根据国家生物技术信息中心的牡蛎线粒体序列,通过Primer Explorer version 5.0软件设计引物并筛选出LAMP特异性扩增引物。并进一步对反应体系优化,对该方法的灵敏度、特异性以及稳定性进行验证。对10种牡蛎阳性样品、14种阴性样品、4类牡蛎相关食品进行检测。结果该方法可以检测出含牡蛎成分0.1%, DNA浓度为0.01 ng/μL的样品。在实验时间上大幅缩短,反应可在25～45 min内结束,并且可以在微量体系下完成,对于食品相关产品的检出率为100%。结论该方法操作简单、成本较低、特异性高、灵敏度好,适用于食品中过敏原牡蛎成分的检测。     

应用环介导等温扩增检测阪崎肠杆菌

建立环介导等温扩增检测阪崎肠杆菌的方法,通过肉眼可见的白色沉淀,判断检测结果。将阪崎肠杆菌(ATCC29544)的16S-23SrRNA间区序列作为靶基因,设计2对特异引物,优化反应条件,进行LAMP扩增。对产物进行酶切分析,与理论上的预期结果相一致。通过测序比对,与GenBank上报道的同源性达到99%。用25株食源性致病菌证实该引物特异性强。LAMP扩增20min,其灵敏度为4.3×102 fg/tube,结果表明,LAMP方法检测阪崎肠杆菌,灵敏度高、特异性强、耗时短、方法简便。     

聚合酶链式反应技术快速检测原料乳中荧光假单胞菌

目的 利用PCR（polymerase chain reaction）技术建立一种快速、准确检测原料乳中最常见有害嗜冷微生物——荧光假单胞菌的方法。方法 以荧光假单胞菌蛋白酶基因aprX为检测靶标,设计特异性PCR简并引物,建立原料乳中荧光假单胞菌PCR检测体系,对该体系的特异性及检测限进行评价。结果 筛选到特异性引物F3：5’-WSNGGNGGNGAYTTYCAYATGAC-3’;R3：5’-RTCRTTNCCNCCNCCRTCCC-3’,建立了最佳PCR检测体系：引物浓度0.5 μmol/L、Taq DNA聚合酶添加量0.4 μL、dNTPs浓度0.16 mmol/L、Mg²⁺浓度1.6 mmol/L,退火温度56.4 ℃,扩增35个循环。此检测方法对荧光假单胞菌具有特异性,检测限为2.57×10³ CFU/mL。结论 本方法操作简便,特异性强,检测限低,对快速检测原料乳中嗜冷菌,保障原料乳品质与安全具有一定参考意义。     

恒温实时荧光法快速检测简单异尖线虫方法的建立

为了快速鉴定简单异尖线虫,本研究建立了一套检测简单异尖线虫DNA的恒温实时荧光环介导等温扩增（loop-mediated isothermal amplification,LAMP）方法,根据LAMP方法原理,针对简单异尖线虫ITS2区域设计引物特异性识别靶标基因。进行了特异性、灵敏度、重复性和实际样品的测试,并与传统的PCR方法进行比较。结果表明,该方法能够特异性扩增简单异尖线虫DNA,对含有简单异尖线虫ITS2目的基因片段的质粒DNA检测限为1 fg/μL,灵敏度比传统的PCR方法高100倍,重复性良好,对实际样品进行检测,与传统的PCR测序方法结果相符。本研究建立的恒温实时荧光快速检测方法适用于特异性检测简单异尖线虫。      

环介导等温扩增技术在食品安全检测领域的应用研究进展

环介导等温扩增技术(Loop-mediated isothermal amplification,LAMP)是近年发展起来的一种新型核酸检测技术。其采用特异识别靶序列上6个位点的4条引物和一种具有链置换活性的DNA聚合酶,在等温条件下进行核酸扩增,与传统核酸检测技术(PCR法、实时荧光定量PCR法)相比,具有操作简单、特异性强、灵敏度高、可肉眼判读结果等优点。核酸检测是食品安全检测技术的一个重要手段,本文综述了LAMP技术在食品微生物检测、转基因成分检测、过敏原成分检测和动物源性成分检测领域的应用研究进展,探讨了LAMP技术在食品检测领域的发展前景,以期为食品快速、高通量检测技术建立提供参考。     

环介导等温扩增技术快速检测双歧杆菌属细菌

目的建立一种利用环介导等温扩增(LAMP)技术快速检测双歧杆菌属细菌的方法。方法针对双歧杆菌属细菌16S rDNA基因特异性区段设计LAMP引物,根据反应体系的颜色或浊度变化特异性地检测样品中双歧杆菌属细菌。结果对5株双岐杆菌属细菌和19株非双歧杆菌属细菌进行特异性和非特异检测,结果均为100%。该检测可在60 min内完成,双歧杆菌属细菌DNA的检测限为16.1±8.2 pg/μL,对双歧杆菌属细菌菌体的检测限为0.1 CFU/mL。结论LAMP方法可作为传统国家标准检测方法的辅助手段,有效检测食品、保健食品和药品中双歧杆菌属细菌DNA的存在。     

Technical note: Development of a closed-tube isothermal multiple self-matching-initiated amplification assay for visual detection of Staphylococcus aureus in milk samples

Staphylococcus aureus is one of the most common mastitis-causing bacteria in dairy cows. It is associated with reduced production performance in animals and with huge financial losses for the dairy industry worldwide. An accurate and sensitive method for the early diagnosis and identification of Staph. aureus in milk samples is essential. The present study aimed to establish a closed-tube isothermal multiple self-matching-initiated amplification (IMSA) technique for visual confirmation of the presence of Staph. aureus targeting the nuc conserved sequence gene. The specific primers successfully amplified the target sequence within 45 min at 63°C reaction temperature and using the optimal components of the reaction system. The positive amplicon showed bright green fluorescence under UV light when mixed with the chromogenic substrate SYBR Green I, and the negative samples remained orange in color. We observed fluorescence and a ladder-like pattern in the IMSA amplicon for all Staph. aureus strains, and we observed no significant change for the non–Staph. aureus strains. The IMSA assay had high specificity compared with loop-mediated isothermal amplification (LAMP): it confirmed the presence of all 7 Staph. aureus strains, and we found no false-positive results for the 12 non–Staph. aureus strains. The lower limit of detection for the IMSA assay was 1 × 10² cfu/mL, 10-fold more sensitive than the results obtained using LAMP. We also successfully applied the IMSA assay to confirm the presence of Staph. aureus in milk samples of cows with mastitis, and the results were consistent with those of LAMP and real-time PCR. The present study reports the use of IMSA to confirm the presence of Staph. aureus and provides a potentially useful method for rapid preliminary screening for Staph. aureus.     

Rapid detection of Listeria monocytogenes in raw milk with loop-mediated isothermal amplification and chemosensor

Loop-mediated isothermal amplification (LAMP) allows a rapid amplification of nucleic acids under isothermal conditions. It can be combined with a rhodamine-based dual chemosensor for much more efficient, field-friendly detection of Listeria monocytogenes. In this report, LAMP was performed at 63 °C for 10 min, followed by a rapid reaction of DNA amplification and the byproduct, pyrophosphate ion, with a rhodamine-based dual chemosensor and Cu(2+) is visualized as a disappearance of red color. The detection limit of L. monocytogenes by the LAMP-chemosensor was 8 to 10 cells per reaction tube, and the total assay time including 10 min for rapid DNA extraction was approximately 30 min. Data on naturally contaminated raw milk samples indicated that the LAMP method was highly specific and sensitive, giving 100% concordance with the ISO 10560 reference method. The results showed that the LAMP-chemosensor method has the advantages of better sensitivity and speed and less dependence on equipment than the standard Polymerase Chain Reaction for specifically detecting low levels of L. monocytogenes DNA, and this can be useful in the field as a routine diagnostic tool. PRACTICAL APPLICATION: The LAMP-chemosensor method reported here provided a powerful tool for detection of L. monocytogenes in raw milk samples due to its specificity, sensitivity, and rapidity.     

基于环介导等温扩增技术快速检测疣孢褐盘菌

目的 基于环介导等温扩增技术(loop-mediated isothermal amplification,LAMP)建立一种常见的有毒蘑菇(疣孢褐盘菌Peziza badia)的快速检测方法 。方法 使用疣孢褐盘菌的内部转录间隔区(internal transcribed spacer,ITS)作为目的 基因设计特异性的LAMP引物,使用可视化法和实时荧光法分别对LAMP扩增结果 进行判断,可视化法通过颜色即可判断结果 ,实时荧光法观察是否有扩增曲线,两种技术相互验证。结果 本研究设计的引物特异性强,与其他阴性样品无交叉反应,可视化法和实时荧光法的检测结果 一致。本方法 的检出限为0.8 ng/μL;将阴性和阳性样品按比例混合,并经过水煮和人工胃液消化后提取DNA,依然能检测到含量为1%的阳性样品。结论 本方法 对仪器要求低,检测速度快,操作和判断结果 简单,有利于方法 的传播,可用于疣孢褐盘菌的快速检测。     

小麦成分环介导等温扩增现场快速检测方法的建立和应用

目的建立环介导等温扩增(loop-mediated isothermal amplification,LAMP)方法现场快速检测小麦过敏原成分的分析方法,有助于食品安全突发事件现场和食品企业生产过程中的样品检测小麦成分。方法运用LAMP建立食品过敏原小麦成分LAMP现场快速检测方法,采用实时浊度仪和显色法进行结果判断,并进行反应条件优化。结果本方法特异性强,对35个对照样品无交叉反应;方法的灵敏度高,检测限可达到0.01%小麦;方法稳定性好,对0.1%和0.01%小麦样品重复检测结果稳定。通过对市场采集70份样品检测结果显示,该方法与食品标签标示的过敏原成分结果一致。结论本方法操作简单,检测时限短,结果判断准确,可用于过敏原小麦成分的快速检测。     

荧光定量环介导等温扩增法快速检测食品中沙门氏菌

目目的 建立一种快速简易检测食源性沙门氏菌的实时荧光定量环介导等温扩增（quantitative loop-mediated isothermal amplification, qLAMP）方法。方法 依据沙门菌属invA基因序列设计引物, 并结合短时间增菌构建沙门氏菌快速检测qLAMP法, 使用人工污染样品进行验证。结果 建立的qLAMP法最佳反应时间为40 min, 最佳反应温度是65 ℃, 最佳Mg2+浓度为6 mmol/L, Bst 2.0 WarmStart聚合酶的浓度为0.40 U/μL, 反应特异性良好, 纯培养实验表明方法检出限为100 CFU/mL。将沙门氏菌人工添加至鸡胸肉、果蔬沙拉、山泉水中, 经过7 h BPW有效增菌后所建立的qLAMP法在食品基质中的检出限达到5 CFU/25 g。结论 该方法准确、简单易行, 实验成本低, 可用于食品中沙门氏菌的快速检测。通过WarmStart Colorimetric LAMP试剂盒无需昂贵仪器即可快速检测,为沙门氏菌现场即时检测的场景提供技术支持。     

环介导等温扩增法快速检测感染性腹泻病例标本中的空肠弯曲菌

目的 建立环介导等温扩增法(loop-mediated isothermal amplification, LAMP)快速检测感染性腹泻病例标本中的空肠弯曲菌。方法 收集2017年苏州市辖区3家医院的感染性腹泻患者的粪便样品326件, 用LAMP法对空肠弯曲菌的DNA进行检测, 在DNA扩增试剂盒提供的反应体系加入引物和模板进行空肠弯曲菌的LAMP反应, 测定LAMP方法检测空肠弯曲菌菌液的灵敏度; 同时用滤膜法进行空肠弯曲菌的分离培养, 参照GB 4789.9-2014《食品安全国家标准 食品微生物学检验 空肠弯曲菌检验》分离鉴定空肠弯曲菌。结果 LAMP法检测空肠弯曲菌菌液的灵敏度是2.2 CFU/μL; 326件腹泻患者粪便中16件空肠弯曲菌LAMP检测为阳性, 阳性率为4.91%。共分离培养出14株空肠弯曲菌, 阳性率为4.29%。结论 针对感染性腹泻患者的粪便样本的空肠弯曲菌检测项目, 可以采用LAMP方法进行等温扩增初筛, 初筛阳性的样品再有针对性地进行后续的传统培养。     

实时荧光等温扩增法检测4种常见食源性致病菌

目的建立实时荧光等温扩增法(loop-mediated isothermal amplification,LAMP)检测金黄色葡萄球菌、沙门氏菌、副溶血性弧菌、单核细胞增生李斯特氏菌4种常见食源性致病菌的分析方法。方法根据4种致病菌特异性基因合成LAMP引物,在反应前加入荧光染料,在63℃条件下反应45 min;反应结果可以根据扩增曲线变化直接判断。并通过在实际样品中添加标准菌株菌液,测定了其在增菌0、6、24 h的检测灵敏度。结果金黄色葡萄球菌、沙门氏菌、单核细胞增生李斯特氏菌等基因组DNA的LAMP检测灵敏度为1 pg,副溶血性弧菌的检测灵敏度为10 pg;在样品加标实验中,其灵敏度在6 h分别可达到101、100、100、102 CFU/mL。结论该方法用于食源性致病菌的快速检测,具有可实时监控反应过程、反应快速,灵敏度和特异性高等优点,适合于基层食品安全监管领域现场快速检测。     

环介导等温扩增技术快速检测肉及肉制品中的牛源性成分

本文以牛源性线粒体细胞色素B(cyt B)基因为模板,采用软件Primer Explorer Version 4设计并筛选出LAMP特异性扩增引物,通过反应体系优化建立了肉及肉制品中牛源性成分的环介导等温扩增技术检测方法,对该方法的灵敏度、特异性以及稳定性进行了验证,同时采用国标方法和商品化检测试剂盒对市售的12种牛肉及牛肉制品进行对比检测。结果表明该检测方法具有高灵敏度、高特异性和高稳定性,适用于实际的生鲜肉制品及加工肉制品中牛源性成分的鉴定。