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利用分子对接技术筛选探究红毛七中的抗炎化学成分。选取红毛七中23个化学成分作为配体,采用Sybyl软件对小分子与炎症密切相关的9个靶蛋白进行分子对接筛选出活性成分,采用Discovery Studio、Pymol软件分析蛋白复合体的相互作用力。通过分子对接虚拟筛选,选出具有较好结合活性的化合物8个,蛋白复合体的分析结果显示,氢键、疏水作用力在对接中发挥着重要作用。 相似文献
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介绍了发展超分子化学药物的优势、应用及新进展。重点综述了:①超分子金属药物配合物的合成;②抗菌、抗癌超分子药物的合成;③超分子包结药物的合成及分子识别。展望了其广阔的应用前景,期望能在医药学、生命科学、材料科学及生物化学的应用上更有意义。 相似文献
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在药学本科生的药物设计学课程中,以细菌RNA聚合酶抑制剂的虚拟筛选为例,利用AutoDockvina软件对小分子化合物库进行分子对接虚拟筛选,用Py MOL和LigPlot软件进行结果分析。该教学案例的设计可以帮助学生理解基于分子对接的药物虚拟筛选方法,认识小分子抑制剂与靶蛋白的作用机制,帮助学生更好理解药物分子设计,有效调动学生的学习积极性,达到了提高教学质量的目的。 相似文献
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药物化学是一门实验性很强的学科,实验教学在整个教学中起着举足轻重的作用。本文对目前宁夏医科大学药学院药物化学实验教学中存在的问题进行分析,并且依据本科药物化学教学大纲和药学类本科专业认证对药物化学实验的要求,提出进行创新型、应用型人才培养,以"一体化、四层次"的实验教学体系为载体,以能力为本的多元化的教学模式为手段,培养高素质的创新型应用型药学人才。 相似文献
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目的:对栀子苷衍生物的合理设计。方法:采用Autodock分子对接模块对栀子苷与芳酸类非甾体抗炎药酯化的结构衍生物同受体蛋白作用的精确模型进行研究。通过构象全局搜索方法和Total-Score评分函数筛选对接结果。结果:最佳药效作用构象模型:配体中葡萄糖基上21位,22位,23位,24位上氢同受体ARG131,THR68,THR141和HOH1205形成氢键,栀子苷与芳酸类非甾体抗炎药新形成的酯键与受体SER329形成氢键,原栀子苷吡喃环上的氧与LYS267形成氢键。GN2分子对接结果分数最高。结论:本构象模型和评分函数的结果给栀子苷衍生物结构改造提供了一些改良建议并为其抗炎机制的探讨奠定了一定基础。 相似文献
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以盐酸沙格雷酯的制备为例,探索将科学研究项目开发设计为创新药物化学综合实验。通过氯代反应、Wittig-Horner反应、催化氢化反应等反应类型进行多步合成,利用薄层色谱监测反应进程,利用萃取、重结晶等方法分离提纯产品,借助核磁共振手段对产品进行结构表征。通过该实验项目,拓展学生对当今药物化学前沿的视野,调动学生对于药物化学及其科学研究的兴趣,锻炼独立思考问题以及分析解决问题的能力,提高实践动手能力,加强团队合作意识,培养全面的药学综合实验素质,为即将到来的本科毕业论文设计以及今后从事相关研究工作打下坚实基础。 相似文献
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首先概述活性子概念的进展 ,列举了生物大分子及药物中常见的活性子的化学结构以及分子中活性子之间的距离 ,这对设计新药物与新的生物大分子 ,均有重要的参考价值。 相似文献
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本科的药物化学实验教材虽然提供了化学反应方程式,但是化学反应方程式不完整或未配平。作为实验教材,配平的化学反应方程式不仅展示了反应物、生成物和反应条件,还清晰表明了反应物与生成物的化学计量数,更好地表示化学反应的“生成”与“质量守恒”的含义,提供更多的药物合成反应信息,是研究药物合成反应机理、设计工艺优化方案的基础。本文提倡在药物化学实验及其他药学实验或化学类实验教材及教学中使用配平的化学反应方程式,以相转移催化法合成扁桃酸的实验为例,在药物化学实验课的授课过程中,以配平的合成扁桃酸的反应方程式为起点和核心展开讲解,通过深刻剖析配平的化学反应方程式,加深学生对合成反应、反应机理、工艺优化的理解。 相似文献
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目的:利用网络药理学及分子对接技术,探索保元汤治疗冠心病和心力衰竭的作用机制。方法:通过数据库并结合文献检索汇总保元汤的成分信息;在数据库查询冠心病和心力衰竭相关靶点,利用String找出关键靶点;在Metascapehe进行KEGG通路和GO通路富集分析;用Autodock进行分子对接。结果:筛选出保元汤、冠心病、心力衰竭的作用靶点数分别为773、927、829,保元汤和冠心病共同基因、心力衰竭、冠心病与心衰的共同基因分别为161、111、99。GO分析结果,保元汤和冠心病涉及生物过程的基因群主要集中在激酶和细胞凋亡的正调控等;保元汤和心力衰竭涉及生物过程的基因群主要集中在腺体发育、血液循环等;保元汤和冠心病、心力衰竭涉及生物过程的基因群主要集中在血液循环、上皮细胞增殖等。KEGG通路富集分析,主要集中于HIF-1信号通路、Rap1信号通路等;保元汤和心力衰竭共同靶点主要集中于PI3K-AKT信号通路、Rap1信号通路等;保元汤和心力衰竭共同靶点主要集中于Ras信号通路、cGMP-PKG信号通路等;分子对接结果显示,异鼠李素与EGFR靶点具有较好的结合活性;山萘酚、菜豆异黄酮与ESR... 相似文献
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目的:利用网络药理学分子对接技术探讨清肝颗粒治疗慢性肝炎的作用机制。方法:首先利用TCMSP数据库收集清肝颗粒的中的化学成分以及靶点,利用OB、DL筛选候选活性化合物成分,然后通过CTD数据库、TTD数据库筛选出慢性肝炎相关的靶点;通过DAVID数据库对靶点进行GO富集分析和KEGG通路分析。运用Cytoscape3.6.1构建化合物-靶点、靶点-通路网络图;慢性肝炎通路整合与分析,最后通过AutoDock软件对主要活性成分及核心作用靶点进行分子对接验证。结果:检索得到清肝颗粒的化合物成分487个、靶点466个;筛选得到候选活性成分101个、慢性肝炎相关靶点115个,GO富集分析得到GOCC、GOMF、GOBP条目(p≤0.05)分别46、49、207个;KEGG通路富集筛选得到相关的通路23条,涉及钙信号通路、非酒精性脂肪肝、T细胞受体信号通路等。构建“慢性肝炎通路”,揭示了清肝颗粒在通路水平上协同发挥治疗慢性肝炎的效果,分子对接结果显示潜在的活性成分与核心靶点PTGS2、PPARG和NOS2均有较好的结合。结论:该研究通过运用网络药理学的研究方法发现清肝颗粒治疗慢性肝炎具有多成分、... 相似文献