奶粉基因组DNA不同提取方法的比较

为选择适合奶粉材料进行分子标记检测的DNA提取方法,以市售奶粉为材料,采用6种不同的方法提取基因组DNA,并比较这6种方法的提取效果．结果表明,除异丙醇沉淀法和十二烷基硫酸钠法(SDS法)外,其他4种方法提取的基因组DNA均适用于聚合酶链式反应(PCR)检测．同时,结合基因组DNA的纯度和质量浓度,明确奶粉基因组DNA提取方法的优劣依次为:热解法、异硫氰酸胍法、高盐低pH法和十六烷基三甲基溴化铵法(CTAB法)．     

不同DNA提取方法对高通量测序检测沉积物微生物多样性的影响

高通量测序技术是目前沉积物中微生物多样性的主要检测方法,该技术受到不同方法提取基因组DNA质量的影响,然而,不同DNA提取方法应用于高通量测序对沉积物中微生物多样性的比较研究报道较少.通过常用的8种DNA提取方法对滇池沉积物样本进行基因组DNA提取,检测DNA浓度、纯度,选择出提取效果较好的4种方法,进行原核微生物16 S rRN A和真核微生物18 S rRN A扩增子测序,比较不同DNA提取方法的微生物群落特征.研究结果表明:S-MOBIO试剂盒法(商品化土壤DNA基因组提取试剂盒1,MOBIO DNeasy?PowerSoil?Kit,S-MOBIO)、S-OMEGA试剂盒法(商品化土壤DNA基因组提取试剂盒2,OMEGA E.Z.N.A?Soil DNA Kit,S-OMEGA)、蛋白酶K-SDS-PEG二次沉淀法(蛋白酶K-十二烷基硫酸钠-聚乙二醇二次沉淀法,S-SDS-PEG)、去腐剂-CTAB-蛋白酶K-试剂盒法(去腐剂-十六烷基三甲基溴化铵-蛋白酶K结合试剂盒法,S-CTAB)四种方法所提取的DNA质量及得率较高;16S/18S rRNA扩增子测序分析表明S-MOBIO试剂盒法(S-MOBIO)和蛋白酶K-SDS-PEG二次沉淀法(S-SDS-PEG)获得的OTU数量多,Alpha多样性指数高;Bate多样性分析中S-MOBIO试剂盒法(S-MOBIO)和蛋白酶K-SDS-PEG二次沉淀法(S-SDS-PEG)得到的物种组成结构相似度高;微生物群落特征分析在原核微生物的门水平和属水平上差异不大,S-MOBIO试剂盒法(S-MOBIO)和蛋白酶K-SDS-PEG二次沉淀法(S-SDS-PEG)获得的物种较多,物种组成相似度更高,在真核微生物门水平和属水平上,四种方法所得到的优势种群差异明显;综合比较,确定S-MOBIO试剂盒法(S-MOBIO)和蛋白酶K-SDS-PEG二次沉淀法(S-SDS-PEG)提取DNA是基于高通量测序探究云南滇池沉积物微生物多样性的较好方法.本研究可为湖泊沉积物微生物分子生态学研究奠定基础.     

一种快速提取小麦DNA的方法

以优质小麦豫麦47＃为原料，对小麦DNA的提取方法进行了探讨，研究了在不同液态氮的情况下，防止DNA降解的关键技术，对提取的小麦DNA进行紫外检测和琼脂糖凝胶电泳分析，结果表明提取的DNA相对分子质量大，浓度和纯度高，该法也适合提取其它植物分子DNA。     

一种微波快速提取可用于qPCR的酵母基因组DNA的方法

研究微波快速提取可用于qPCR分析的酵母基因组DNA的方法.在微波作用下分别采取干法和湿法制备酵母基因组DNA样品提取物与试剂盒法制备的提取物进行比较,通过紫外分光法、琼脂糖凝胶电泳、常规PCR及qPCR等方法检测提取物浓度与纯度.结果表明微波法提取物可用于常规PCR分析,其中微波干法提取物用于qPCR分析可获得准确的检测结果.     

几种海水经济贝类DNA提取方法探讨

以缢蛏、美人蛏、文蛤、扇贝和鲍鱼等几种经济贝类为研究对象，分别用苯酚／氯仿／异戊醇法，CTAB法，SDS法等不同方法提取其基因组DNA，寻找适宜于研究对象基因组DNA提取的方法，结果表明，3种方法均可以从目标材料中提取到DNA，但苯酚／氯仿／异戊醇法无论从数量和质量上都不理想，而SDS和CTAB可根据具体情况选择使用。即对纯度要求不高时均可选用SDS法，但为了分子生物学研究的应用。需要较高纯度，则缢蛏、美人蛏、文蛤和扇贝等瓣腮纲贝类推荐用SDS法，而鲍鱼等腹足纲贝类推荐用CTAB法。     

玉米须总DNA提取方法的建立

确定一种玉米须总DNA的提取方法.[方法]分别利用CTAB法和SDS法提取干燥和新鲜玉米须的总DNA,经过琼脂糖凝胶电泳进行定性检测,通过紫外分光光度法进行含量和纯度测定,确定适合玉米须DNA提取的方法.[结果]利用CTAB法和SDS法提取干燥玉米须的总DNA,产物呈淡黄色,经过琼脂糖凝胶电泳,几乎看不到明显的条带;利用上述两种方法提取新鲜玉米须的总DNA,电泳条带明显,CTAB法提取DNA浓度为11.5μg/m L,A_(260)/A_(280)为2.2,而SDS法提取DNA浓度为15.8μg/m L,A_(260)/A_(280)为1.9.[结论]新鲜玉米须中总DNA更容易提取;SDS法提取出的DNA浓度与纯度均优于CTAB法,更适宜用于新鲜玉米须DNA的提取.     

蓝绿藻基因组DNA提取方法的比较研究

分子生物学技术已广泛渗入微藻研究的各个领域,其中DNA的抽提和保存技术尤为重要．作者介绍了商业试剂盒、CTAB和Wizard3种具有代表性的DNA抽提方法,将其应用于绿色微囊藻和铜绿色微囊藻基因组DNA的抽提中,并对这3种方法的抽提有效性、纯度、数量、DNA完整性和PCR扩增能力进行了比较．结果显示：尽管CTAB和Wizard方法提取DNA质量和纯度较高,适合PCR扩增、克隆和酶切反应,但改进的CTAB法是最有效、最经济和最方便的DNA抽提方法．另一方面,我们发现用乙醇固定微囊藻细胞是比较好的策略,通过优化固定时间、固定剂浓度、固定温度可得到高质量的核苷酸用于进一步的分子生物学研究．     

牦牛乳中DNA提取方法的建立与优化

为加速牦牛重要基因的挖掘和功能鉴定,以牦牛乳作为试验材料,建立简便的牦牛基因组DNA提取方法.采用常规离心法,从牦牛乳中获得体细胞,进而提取基因组DNA.研究不同去除蛋白方法、不同DNA沉淀剂、不同贮藏条件对牦牛乳中DNA提取质量的影响.DNA质量通过PCR评价.结果表明:高盐法与酚/氯仿法去除蛋白效果相当.高盐法简便...     

芝麻油DNA高效提取方法的建立与优化

从植物油中提取高纯度DNA可为利用分子生物学技术检测油脂掺伪提供技术支撑。以芝麻油为材料优化了植物油DNA树脂提取法。在单因素试验的基础上,进行五因素四水平正交试验设计,以分光光度法测定提取DNA的浓度和纯度。得到芝麻油DNA提取的最优条件为:油样用量4 m L,去油液为4 m L氯仿,裂解液为2.5 m L 1.4 mol/L NaCl,摇匀时间50 min,摇匀速度25 r/min。在此条件下,DNA提取效果最佳。通过方差分析可知,摇匀速度对提取DNA浓度影响显著。     

一种快速提取小麦DNA的方法

以优质小麦豫麦 47# 为原料 ,对小麦DNA的提取方法进行了探讨 .研究了在不用液态氮的情况下 ,防止DNA降解的关键技术 .对提取的小麦DNA进行紫外检测和琼脂糖凝胶电泳分析 ,结果表明提取的DNA相对分子质量大 ,浓度和纯度高 .该法也适合提取其它植物分子DNA .     

白木香基因组DNA提取方法研究

在传统CTAB法的基础上加以改良,建立了一种适于白木香基因组DNA提取的方法.通过比较改良的CTAB法和试剂盒法,表明改良的CTAB法提取的白木香基因组DNA质量优于试剂盒法;使用改良的CTAB法提取的白木香基因组DNAOD260/OD280比值在1.8~2.0之间,DNA的得率约为172μg/100 mg干叶.酶切试验表明,改良的CTAB法提取的DNA能被限制性内切酶完全酶切,可以用于下游研究.改良的CTAB法更适于白木香基因组DNA的提取.     

荔枝离体培养物DNA提取方法的研究

采用十二烷基硫酸钠(SDS)并补加非水溶性聚乙烯吡咯烷酮法,提取荔枝胚性培养物基因组DNA,有效地去除了植物组织中所含的多酚、单宁、色素及多糖类物质,得到高质量的荔枝胚性培养物基因组DNA.此DNA适合作为PCR模板应用,能较好地用于RAPD分析,这是一种简便、快捷、经济的荔枝胚性培养物基因组DNA提取的方法.     

濒危植物白木香基因组DNA提取方法的研究

研究了濒危植物白木香基因组DNA的提取方法。结果表明，采用2％CTAB提取缓冲液（2％CTAB；2．5MNaCl；1％PVP-40；2％β-巯基乙醇（用前加入）；100mg／mL蛋白酶K；100mM Tris-HCl，pH8．0；20mM EDTA，pH8．0）提取的基因组DNA纯度高，OD260／0D28。比值在1．8～2．0之间，得率大约为172μg／每100mg干叶，所提取的DNA可以被限制性内切酶完全酶切，用于AFLP分析。     

荔枝离体培养物DNA提取方法的研究

采用十二烷基硫酸钠（SDS）并补加非水溶性聚乙烯吡咯烷酮法，提取荔枝胚性培养物基因组DNA，有效地去除了植物组织中所含的多酚、单宁、色素及多糖类物质，得到高质量的荔枝胚性培养物基因组DNA。此DNA适合作为PCR模板应用，能较好地用于RAPD分析，这是一种简便、快捷、经济的荔枝胚性培养物基因组DNA提取的方法。     

细菌质粒DNA的快速提取及检测

介绍一种质粒DNA的快速提取方法,所分离出的DNA纯度较好,全部操作仅在两只Eppendorf管中进行,含质粒DNA的上清液可直接点样走琼脂糖凝胶电泳。整个提取过程在较短时间内完成。该方法简便、快捷、效果好。     

DNA条形码技术在动物角制品鉴别中的应用

利用动物线粒体12 S rRNA和16 S rRNA基因序列片段对动物角制品进行种属鉴别,为DNA条形码技术在角制品分子鉴定提供有效方法.收集犀牛角、水牛角、黄牛角和山羊角作为研究材料,采用优化提取步骤的商业化提取试剂盒进行基因组DNA的提取,以提高基因组DNA的浓度及质量.采用PCR扩增及测序技术获得所有样本12 S...     

三种提取卤虫基因组DNA方法的比较

以盐生动物卤虫为材料,分别用氯化钠高盐沉淀法和两种酚/氯仿抽提法对卤虫基因组DNA进行了提取;并用紫外光分光光度计法、琼脂糖电泳法和PCR对所提取的DNA进行检测,将它们在DNA的产量、质量等方面的优缺点进行比较,通过三种方法的比较,认为改进的酚-氯仿法是卤虫基因组DNA的最佳提取方法.     

一种适用于地衣总DNA提取的改进方法

目的：针对地衣初生、次生代谢产物丰富的特点,提出了一种适于地衣总DNA的提取方法。方法：应用改良的CTAB法,对3种常见地衣进行了总DNA提取,经过琼脂糖电泳、紫外吸收分析DNA质量。结果：3个样本DNA的A260/A280值均在1.8～2.0之间,琼脂糖电泳图像清晰。结论：改良的CTAB法简便、省时、价廉,适合于地衣总DNA的提取,获得的DNA含量高,纯度好。     

从皂苷糖基水解酶产生菌sp.48g提取基因组DNA

采用试剂盒法、饱和酚抽提法、高盐沉淀法和氯化苄法从皂苷糖基水解酶产生菌sp.48g提取基因组DNA。经比色法和琼脂糖凝胶电泳分析检测。结果用氯化苄法提取的基因组DNA在质量上和得率上优于其他方法。A260/A280为1.7,DNA产量为0.11mg/g湿菌体。达到下部实验要求。     

玄参新鲜根和干燥根总DNA提取方法的比较研究

用十二烷基磺酸钠法分别提取玄参新鲜根及干燥根的DNA.电泳结果显示,从玄参新鲜根中可提取到完整DNA,而从＂发汗＂后的玄参干燥根中提取的DNA已降解.使用紫外分光光度法对新鲜根中提取的DNA进行纯度鉴定,A260/A280为1.83.结果表明,所采用的十二烷基磺酸钠法可经济高效地从玄参根部提取到高质量的DNA.