黑龙江省种植大豆品种遗传多样性分析及与性状关联SSR标记筛选

为从分子水平鉴定黑龙江省种植大豆品种的遗传多样性,并筛选与蛋白质、脂肪、百粒重和水分等大豆主要性状显著关联的SSR分子标记,利用18对SSR引物,采用荧光毛细管电泳法分析黑龙江省75个种植大豆品种遗传多样性,并与性状进行关联分析.结果 表明:18个SSR标记中的10个标记可以实现单对引物准确鉴别42个大豆品种,18个S...     

白菜SSR分子标记的研究进展

简述了SSR分子标记的基本原理和特点,从白菜种质资源遗传多样性分析、SRR指纹图谱的构建、杂交种纯度的鉴定、遗传图谱构建和分子标记在辅助育种上的应用等几个方面介绍了近年来白菜研究中SSR分子标记的研究进展及应用前景。     

花生SSR分子标记的开发与利用

主要介绍了基因组SSR、EST—SSR分子标记的开发及其在花生遗传图谱的构建、花生性状及相关基因的定位、遗传多样性研究及种质资源的鉴定等方面的应用,同时对SSR标记在花生中的应用前景进行了展望,以期为花生分子育种提供参考。     

谷子SSR分子标记的研究进展

谷子作为一种在中国杂粮作物中占据重要地位的粮食作物,其全基因组测序的完成极大地促进了谷子分子标记技术的发展。SSR作为第二代分子标记,具有操作简单、重复性好、结果可靠等优势,现已被广泛应用于作物遗传多样性、遗传连锁图谱构建、数量性状分析、品种鉴定等研究。文章对SSR标记技术在谷子遗传多样性、遗传连锁图谱等方面的研究进行综述,以期为中国谷子SSR标记技术发展提供参考与借鉴。     

SSR与SRAP分子标记在烤后烟叶中的应用及烤烟遗传多样性分析

为筛选出适合烤后烟叶的分子标记并用于烤烟遗传多样性分析,以烤后烟叶为材料,利用毛细管电泳技术检测SRAP与SSR标记在烤后烟叶中的多态性和稳定性,并基于稳定性较好的SSR分子标记分析了云烟87、云烟97、云烟116、翠碧1号、红花大金元、中烟100、K326、KRK26、NC297等9个烤烟品种的遗传多样性。结果表明:与新鲜烟叶相比,烤后烟叶DNA降解较为严重,其降解主要发生在烘烤过程中干筋期的中后期。与SRAP相比,SSR标记在烤后烟叶中扩增稳定性更好,但多态性略差。此外,NTGS66290、NTGS66292、NTGS66295、PT30008、PT30169、PT30361、PT30403和PT30424等8对SSR引物能将9个烤烟品种进行有效区分,其遗传相似系数为0.250～0.900,平均值为0.622。     

烟草糖酯SSR分子标记筛选及辅助育种应用

为明确与糖酯紧密连锁的SSR分子标记在烟草实际育种工作中的可用性,加快烤烟糖酯遗传改良进程,本研究利用聚丙烯酰胺凝胶电泳技术和GC-MS检测技术,以不同遗传背景的5个烟草种质以及192份重组自交系遗传群体为试验材料,对5个SSR分子标记开展了筛选和验证研究。结果表明,5个分子标记中,PT20315、PT30354两个分子标记在不同遗传背景中多态性稳定,并且其多态性条带与糖酯表型差异的对应性较好;在重组自交系群体中,两个分子标记鉴定的基因型与糖酯表型的一致率分别为93.75%和90.58%,可用于高糖酯烟草分子辅助育种中。目前,利用两个分子标记辅助选择,已经定向改良获得高糖酯K326等新品系材料。     

国外主要葡萄种质资源数据库简介

本文对国际葡萄品种名录、欧洲葡萄数据库、意大利葡萄数据库、法国农业科学研究院附属网、德国Reben基因库、美国植物遗传资源网、美国戴维斯国家无性种质资源库、瑞士葡萄SSR分子标记数据库、意大利葡萄SSR分子标记数据库、德国葡萄栽培与酿酒文摘数据库等的构建背景、主要功能及特点进行了介绍,以供葡萄种质资源工作者、育种工作者和生产者参考.     

SSR和ISSR标记技术应用进展

介绍了SSR和ISSR标记的原理和特点,综述了这两种技术在种质遗传多样性、基因定位及分子标记辅助育种、遗传图构建及种子纯度和真伪鉴定等研究中的应用进展,并提出了在烟草遗传育种中应用的建议。     

基于高通量测序技术分析3种羊肉混合基因组序列的短片段重复序列

为研究易混淆绵羊品种的种内多态性与遗传多样性,甄别滩羊、小尾寒羊和滩寒杂交羊,采用宏基因组学的方法,以混合羊肉样品(滩羊、小尾寒羊、滩寒杂交羊)为试验对象,通过高通量测序技术对混合样本全基因组进行测序。利用MISA查找拼接序列SSR位点,分析SSR序列特征并使用PRIMER3 Input(version 2.3.7)设计荧光标记引物,以多态性SSR分子标记分析滩羊、小尾寒羊、滩寒杂交羊群体遗传多样性。结果显示,SSR位点分布结果广泛,多态率为46%,平均PIC值为0.358,表明多态性水平处于中等水平。绵羊属3种羊肉以及混合羊肉样本分别聚为一类,呈单系性,STR峰图分型清晰,表明可实现3种绵羊的区分。成功建立了3种绵羊的SSR分子身份证。通过SSR序列多态性可对3种绵羊及其混合样本进行鉴定,为混合绵羊肉的基源鉴定提供新思路和技术指导,对绵羊全基因组工程研究,绵羊种属间的分子标记开发和种质资源鉴定保护具有一定参考价值。     

同科植物SSR引物在烟草遗传差异分析中的应用研究

为丰富分子标记类型,加速烟草种质资源遗传多样性的研究利用,从番茄、辣椒的SSR引物中选择22对SSR引物,用遗传差异较大的14个烟草材料筛选引物,应用筛选出的引物对24份烤烟材料进行扩增,分析其遗传差异性。22对SSR引物中筛选出8对重复性好、多态性高的引物。8对引物在24份烤烟材料中共检测到98条遗传多态性带,引物多态信息量变化范围为0.451～1,平均0.646。品种间的遗传相异系数变异范围为0.3445～0.8626,平均0.6052。引物9扩增的谱带可把24个品种完全区分开。在遗传距离为0.62水平可将24份材料聚为四大类,其聚类结果与实际亲缘关系基本一致。因此,同科植物的SSR引物能较好地从分子水平上揭示烟草种质资源遗传背景和亲缘关系,可以应用于烟草品种资源的遗传差异分析。     

Simple Sequence Repeat Markers in Genetic Divergence and Marker-Assisted Selection of Rice Cultivars: A Review

Sequencing of rice genome has facilitated the understanding of rice evolution and has been utilized extensively for mining of DNA markers to facilitate marker-assisted breeding. Simple sequence repeat (SSR) markers that are tandemly repeated nucleotide sequence motifs flanked by unique sequences are presently the maker of choice in rice improvement due to their abundance, co-dominant inheritance, high levels of allelic diversity, and simple reproducible assay. The current level of genome coverage by SSR markers in rice is sufficient to employ them for genotype identification and marker-assisted selection in breeding for mapping of genes and quantitative trait loci analysis. This review provides comprehensive information on the mapping and applications of SSR markers in investigation of rice cultivars to study their genetic divergence and marker-assisted selection of important agronomic traits.     

甘蔗种质遗传多态性的ISSR分析

本研究以30个甘蔗栽培种或原种为材料,用ISSR标记方法进行了遗传多态性分析。结果表明：供试30份甘蔗种质材料的遗传相似性系数在0．375～1．000之间,其中,甘蔗栽培种与热带种的遗传相似性系数在0．850～0．950之间,说明这些甘蔗栽培种与热带种的血缘关系近;甘蔗栽培种与割手密之间遗传相似性系数在0．525～0．675之间,说明这些甘蔗栽培种与割手密有一定的血缘关系;甘蔗栽培种与斑茅的遗传相似性系数为在0．375—0．525之间,表明这些甘蔗栽培品种与斑茅的血缘关系较远（实质上参试的甘蔗品种都不是斑茅的后代）;参试的23份栽培种之间的遗传相似性系数关系在0．725～1．000之间,说明这些甘蔗栽培种之间的血缘关系较近,种质血缘窄,应加强含有多个野生种质的杂交后代的选育。同时,聚类分析结果表明,在遗传相似性系数为0．720水平上可将30份供试甘蔗种质材料分为3个类群,其中3个热带种和23个栽培种聚为一类,3个割手密聚为一类,斑茅单独聚为一类。     

分子标记技术及其在植物育种中的应用

概述各种常用分子标记技术RFLP,RAPD,AFLP,SSR,ISSR,SCAR,STS,CAPs的原理,并从种质资源的鉴别、基因定位、基因累加、异源目的基因的筛选、遗传图谱的构建等方面综述了分子标记技术在植物育种中的应用。     

分子标记技术及其在植物育种中的应用

概述各种常用分子标记技术RFLP，RAPD，AFLP，SSR，ISSR，SCAR，STS，CAPs的原理，并从种质资源的鉴别、基因定位、基因累加、异源目的基因的筛选、遗传图谱的构建等方面综述了分子标记技术在植物育种中的应用。     

烟草种质材料TSNA含量的关联分析

摘要:利用分布于烟草24个染色体的具多态性的SSR标记和MFLP标记,分析24份烟草种质材料的遗传多样性,在此基础上对烟叶中烟草特有亚硝胺（TSNA）含量的表型变异与标记多态性进行关联分析。结果显示,33对MFLP引物和28对SSR引物在24份烟草材料中共发现188个多态位点;群体结构分析将24份烟草材料分为3个亚群,且亚群划分与烟草类型（烤烟、晾晒烟和白肋烟）基本一致;关联分析发现1个SSR位点和6个MFLP位点至少与1种TSNA含量的相关性在P<0.01水平上显著,其中标记MFLP26与烤后烟叶中NNN含量的相关性极显著（P<0.001）,表型变异解释率最高（R2=0.5831）。因此,这些显著关联的分子标记可为筛选低TSNA含量的烟草材料提供参考。      

分子标记及其在甘蔗育种中的应用

本文综述了几种分子标记在甘蔗育种上的应用，以及对提高甘蔗育种的研究水平和促进甘蔗生产所具有的重要意义。     

烟草种质的SSR标记遗传多样性及青枯病抗性的关联分析

烟草青枯病是影响烟草产质量的主要病害之一,开发出与烟草青枯病抗病性密切相关的优异等位基因,可加速抗病品种的选育进程。据此,本研究选用94份烟草种质材料作为研究对象,运用236个SSR标记对这些材料进行基因分型和群体结构分析,开展基于连锁不平衡的关联分析探测与青枯病抗性相关的分子标记。结果表明,236个SSR标记在94份烟草种质中检测到904个等位变异位点,平均每个SSR标记为3.83个位点;这些SSR标记的多态性信息量（PIC）值在0.1361~0.8760之间,平均为0.5136。基于SSR基因分型数据,构建了126个标记单倍型;在此基础上进行群体结构分析,将94份种质划分为2个类群,表明本研究烟草种质的群体结构简单,有利于减少伪关联。二年田间抗病性数据与单倍型的关联分析发现7个单倍型与青枯病抗病性密切相关,其中有3个单倍型在二年的田间试验中均表现出与青枯病抗性密切相关,平均解释率超过10%。研究结果可为烟草青枯病抗病材料的分子标记辅助筛选提供参考。      

我国旱地甘蔗育种的若干问题

旱地是我国甘蔗生产的重要基地。旱地甘蔗育种要针对旱地的生态特点及甘蔗生物规律来确定育种的方向与目标，积极收集、引进国内外甘蔗种质，进一步开展远缘杂交与亲本创新，充分利用我国丰富的野生蔗资源及新引进的国外优良种质，拓宽我国甘蔗的遗传背景，提高甘蔗生活力和抗逆性，开展抗病育种，改革育种程序，是提高我国旱地甘蔗育种成效的技术关键。