DNA条形码技术对鱼子酱物种溯源及鉴定

为探讨DNA条形码技术在鱼子酱物种鉴定中的适用性，利用细胞色素b（Cytochrome b，Cyt b）和细胞色素氧化酶I亚单位I（Cytochrome Oxidase I，COI）作为DNA条形码对鱼子酱样品进行DNA提取、聚合酶链式反应（Polymerase Chain Reaction，PCR）、测序、利用NCBI网站和BOLD鉴定系统进行基因比较分析，构建系统发育树，鉴定鱼子酱物种，对我国鱼子酱产品物种标签符合性情况进行检查。购买的40份样品，一致性鲟鱼物种基因序列相似性均在99%以上，涉及5个鲟鱼种，其中杂交种占比75%、西伯利亚鲟、施氏鲟、欧鳇、俄罗斯鲟占25%。说明Cyt b、COI作为DNA条形码可以对鱼子酱进行物种鉴定，检测的鱼子酱产品均为鲟鱼子酱，无造假，但是45%产品标签物种替代或物种标识不清。加强对产品物种标识重视及鉴定技术的开发，有助于我国鱼子酱对外贸易发展，保障我国鲟鱼产业可持续性健康发展。     

基于DNA条形码技术的海参物种鉴定

DNA条形码技术(DNA barcoding)是一种新型高效的物种鉴别方法。本研究基于DNA条形码技术,以线粒体细胞色素氧化酶I基因(COI)和16S核糖体RNA(16S rRNA)基因作为靶基因对海参物种进行鉴别,结果表明COI基因或16S rRNA基因均能实现大部分海参的物种鉴定,部分样品需结合两个靶基因鉴定出来。将所建立的DNA条形码方法用于市售海参样品的物种鉴定,24份市售海参样品中10份市售海参样品的物种鉴定结果与标签名称相符,6份样品与标签名称不符,存在将低价海参品种标为高价海参的现象;其余8份样品的标签只有商品名但没有明确的物种信息,利用DNA条形码技术对其鉴定可得到明确的海参种名。本研究结果证实DNA条形码技术可应用于市售海参的物种鉴定,为海参的监管提供技术支撑。     

FINS方法鉴定鱼翅和鲨鱼软骨的鲨鱼种类

鱼翅一般来自于青鲨等常见鲨鱼,但少数不法分子也从濒危鲨鱼上采集鱼翅。为更好地保护濒危鲨鱼,建立了一种鲨鱼种类的基因鉴定方法——FINS法。根据基因库中虎鲨、条纹斑竹鲨、角鲨、猫鲨、白斑星鲨等线粒体细胞色素氧化酶亚基I(Cytochrome Oxidase subunit I,COI)序列设计合成了简并引物,采用Touchdown温度循环程序扩增COX I的5’端序列。PCR产物纯化后进行双向测序,将未知样品的COI基因序列与基因库中的鲨COI基因序列进行比对,根据相互间的遗传距离确定样品的种属。用FINS方法共对126份鱼翅和鲨鱼软骨样品进行了鉴定,结果发现供试样品大部分来自青鲨(82个样品),鼠鲨、尖吻鲭鲨、长鳍鲭鲨、加勒比斜锯牙鲨、尖吻斜锯牙鲨、澳洲半沙条鲨、舒氏星鲨、路氏双髻鲨以及犁头鳐、叶吻银鲛和兔银鲛等软骨鱼类,未发现来自受国际濒危动植物贸易公约保护的大白鲨、姥鲨、鲸鲨等鲨鱼的鱼翅和鱼骨。     

鹿茸物种来源DNA条形码鉴定技术研究

目的 受经济利益驱动,鹿茸标签不符情况时有发生,损害消费者利益的同时,也给产业的发展带来了负面影响,探究鹿茸的鹿种鉴定方法为鹿茸市场监管提供技术支持。方法 本研究以线粒体细胞色素氧化酶I基因（Cytochrome oxidase I gene, COI）和线粒体细胞色素b基因（Cytochrome b gene , Cytb）为靶基因对鹿茸样品进行鉴定,并对两种基因的鉴别能力进行了比较。结果 发现COI存在无法鉴别梅花鹿和马鹿的情况,而Cytb可以将所有鹿茸鉴定至种水平。并将Cytb作为目标片段,建立了鹿茸中物种来源鉴定的DNA条形码方法。并利用该方法对市场上销售的53份鹿茸样品进行标签符合性鉴定。结论 进一步证实了使用Cytb的DNA条形码方法可以有效鉴定出市售鹿茸样品的物种来源。收集到的53份市售鹿茸样品中,仅有21份样品与标签标识物种相符;25份样品存在将低价鹿茸标为高价鹿茸的现象;7份样品缺少明确的物种信息。本研究结果可以为监管部门规范鹿茸产品标签标识提供技术支撑。     

多基因DNA条形码鉴定6 个鳗鱼物种

建立6?种鳗鱼的物种多基因DNA条形码精准鉴定方法。以鳗鱼DNA为模板,采用3?对通用引物对6?种鳗鱼的3?个基因（16S rRNA、Cyt b、COⅠ）部分DNA片段进行聚合酶链式反应扩增、测序,结果6?种鳗鱼各获得3?条16S rDNA（638～643?bp）、Cyt?b（464～466?bp）、COⅠ（705～707?bp）基因部分DNA序列,从中选取各物种序列同源的片段设计3 对新引物对6 种鳗鱼的16S rRNA、Cyt b、COⅠ基因部分DNA片段进行PCR扩增,其产物大小分别为504～507、400、609?bp,再从各片段中筛选出具有6?种鳗鱼物种特异性强的、碱基数分别为262、280、300?bp的3?条DNA片段序列,作为6?种鳗鱼物种的3?个基因的标准DNA条形码,应用DNAMAN?V6软件进行同源性分析,并通过GenBank数据库的比对验证,制定了供检测实践用的同源率判别指标,建立鳗鱼物种的多基因条形码检测方法。应用该方法对30?个待检鳗鱼样品进行检测,结果表明,各样品基于3?个基因DNA条形码的比对,符合同源率指标,物种判别结果互相吻合,从而精准判别样品的所属物种。该方法稳定、精准、易于操作,可应用于6?种鳗鱼的物种鉴定,值得推广。     

不同品种鲨鱼肝脂质组成特征分析

本研究对分布于东太平洋海域的深海长尾鲨(Alopias superciliosus)、大青鲨(Prionace glauca)、路氏双髻鲨(Sphyrna lewini)、镰状真鲨(Carcharhinus falciformis)四种鲨鱼的鱼肝脂质组成特征进行了系统对比分析。结果显示,不同品种鲨鱼肝总脂质含量差异较大,路氏双髻鲨(S. lewini)鱼肝的总脂含量最高,达到60.42%±1.89%;大青鲨(P. glauca)和镰状真鲨(C. falciformis)鱼肝的总脂含量次之;深海长尾鲨(A. superciliosus)鱼肝的总脂含量最低,为7.20%±0.33%。不同品种鲨鱼鱼肝脂质含量和组成差异明显,其中,深海长尾鲨(A. superciliosus)鱼肝的EPA+DHA含量最高,达到总脂肪酸含量的37.27%;路氏双髻鲨(S. lewini)鱼肝磷脂(21.20%±0.18%)、角鲨烯(330.51±4.96 mg/kg)、烷氧基甘油(207.47±6.50 mg/g)含量均为四种鲨鱼中最高。鲨鱼肝富含磷脂、n-3系列多不饱和脂肪酸、角鲨烯、烷氧基甘油等海洋活性脂质,具有极高的营养价值。在满足资源保护要求的前提下,对鲨鱼鱼肝资源进行开发时应当结合鱼肝自身特征进行定向利用。本研究可为鲨鱼鱼肝脂质资源的高值精准利用提供科学指导。     

DNA条形码技术在牛肉干鉴定中的应用

食品的物种来源关系食品的营养价值、市场价格和安全性。研究采集了贵阳、昆明两地不同品牌、不同类型的71份牛肉干样品,通过对线粒体细胞色素氧化酶I基因(COI)和16S核糖体基因(16S)的DNA条形码测序,成功对其中的60份样品进行了鉴定。其中,39份样品(65%)来自水牛、马、骆驼等物种,在营养价值和经济上损害了消费者的权益。此外,一些样品混入了黑熊等保护动物肉品,可能涉及对保护动物的盗猎。研究证实DNA条形码对深加工肉制品物种来源鉴定的可行性,展示了该技术在食品安全领域应用的广阔前景。     

COI及cytb基因对河鲀鱼鱼种鉴定的适用性研究

目的建立河鲀鱼DNA条形码鉴定方法,探讨细胞色素氧化酶亚基I(COI)及细胞色素b(cytb)基因对我国常见东方鲀属、兔头鲀属河鲀鱼鱼种鉴定的适用性。方法野捕河鲀鱼经形态学鉴定后,钓取COI及cytb基因序列并测序。从Gen Bank下载已有河鲀鱼参考序列,分别构建COI及cytb基因分子进化树,确定样品种属并与形态学鉴定比对。应用所建方法对中毒样品进行河鲀成分鉴定。结果 COI和cytb基因分子进化树将57份样品聚类到东方鲀属和兔头鲀属的9个鱼种,除棕斑兔头鲀和暗鳍兔头鲀(COI进化树)、暗纹东方鲀和晕环东方鲀(cytb进化树)外,2种条形码均能对其余鱼种进行有效区分。中毒样品经鉴定均含有月兔头鲀。结论所建立的DNA条形码方法可有效鉴定河鲀鱼鱼种,弥补形态学鉴定的缺陷。     

应用DNA条形码技术对深圳市售花胶鱼种鉴定与分析

目的 采用基于DNA条形码技术对深圳市售花胶鱼种进行鉴定与分析。方法 以细胞色素C氧化酶Ⅰ(cytochrome c oxidase, COⅠ)基因为目标基因,应用DNA条形码技术鉴别深圳各药房和超市零售花胶的种类来源。结果 94份花胶样品均扩增出特异性条带。根据BOLD系统鉴定结果统计,深圳地区市售花胶94份样品中,按来源鱼种区分,基原鱼种(鉴定到属)为尼罗尖吻鲈和尖吻鲈属占比29.79%,其次为苏里南犬牙石首鱼占比15.96%,以及双棘原黄姑鱼/褐毛鲿占比8.5%。按来源鱼种所属的科区分,石首鱼科共计41个,占比43.62%;尖吻鲈科共计28个,占比29.79%;鳕科共计7个,占比7.45%。结论 目前我国花胶基原鱼种以石首鱼科为主,外来基原鱼种增多。深圳市售花胶存在真伪混淆现象,DNA条形码技术可用于花胶的来源物种鉴定。     

DNA条形码技术在鲑科鱼类真伪鉴别中的应用

本研究建立了基于DNA条形码技术的鲑科鱼类特异性检测方法,并用此方法对17种市售鲑科鱼进行物种检测。先从样品中扩增得到DNA细胞色素C氧化酶I(COI)和16S核糖体RNA(16S rRNA)的基因片段,然后进行一代测序,对测序结果进行比对,验证样品的真实属性。结果表明,以COI为靶标、16S r RNA为辅助靶标,可实现对由单一物种组成的鲑鱼制品的物种鉴定。本研究结果证实DNA条形码技术可用于鲑科鱼类的物种鉴别,为鲑科鱼的市场监管提供技术支撑。     

DNA条形码技术在肉品防欺诈鉴别中的应用

以DNA条形码技术鉴别进出口监督抽检的鱼肉等水产制品的种类来源,用以判别其与申报或产品标签是否相符.分别提取鱼肉等样品的基因组DNA,以目前国际上比较公认的动物线粒体细胞色素氧化酶COⅠ基因通用引物进行PCR扩增.PCR产物经测序分析后,将得到的扩增片段序列与Genbank数据库进行序列比对,同时提交Barcoding Life DNA条形码数据库(BOLD)进行鉴定分析.本批次监督抽检的16份鱼肉、鱼丸等水产制品中除1份样品未能成功获得鱼肉COⅠPCR扩增外,其余15份样品均顺利得到种类来源鉴定,鉴定结果约有31.25％的样品与产品标签标示不符.作为一种简单、快速、有效的分子鉴定技术,DNA条形码可以直接应用于鱼肉等动物源性食品的种类鉴定.     

基于DNA条形码技术对常见石首鱼科鱼胶的物种鉴定

摘　要：目的　运用DNA条形码技术对常见石首鱼鱼胶进行物种鉴定。方法　通过对26份鱼胶样品基因组DNA提取，PCR扩增COI基因、测序，用BOLD物种鉴定系统，与数据库中已有鱼类序列进行比对分析，鉴定出各鱼胶的物种；根据Kimura双参数模型计算样品序列遗传距离，并将所得序列构建NJ和MP系统发育树，进行聚类分析。结果　26份鱼胶样品通过鉴定引物“Fish-F”、“Fish-R”均可实现扩增，条带清晰单一，扩增和测序成功率均为100%；BOLD鉴定结果显示，26份鱼胶样品中23份能够确定物种来源（相似性达98%以上），包括石首鱼科12属15种鱼类，且多数为外来物种，另外3份鱼胶可推测其近缘物种。此外，系统发育树聚类分析结果与物种鉴定结果一致。结论　目前石首鱼类鱼胶来源物种较多，且多为外来基原鱼种。DNA条形码技术与BOLD鉴定系统相结合，可对大部分鱼胶进行准确的物种鉴定。     

DNA条形码技术在深圳鱼肉制品鉴定中的应用

以线粒体细胞色素氧化酶亚基Ⅰ（COⅠ ）基因为目标基因,应用DNA条形码技术鉴别深圳批发市场和超市零售鱼肉制品的种类来源,判别其产品标签是否正确。本研究调查的77 份鱼肉制品均能扩增出特异性条带,28 份样品与产品标签标示不符,“错贴”率高达36.36%,其中所有标示“龙俐鱼”的商品都是低价的“巴丁鱼”（Pangasianodon hypophthalmus）。DNA条形码技术可用于鱼肉制品的来源物种鉴定。     

Detection and identification of marine fish mislabeling in Guangzhou's supermarkets and sushi restaurants using DNA barcoding

In this study, DNA barcoding was applied to identify the distinct species of fish products in Guangzhou supermarkets and sushi restaurants in order to confirm whether products were correctly labeled. Samples were analyzed using mitochondrial cytochrome C oxidase subunit I (CO I) gene as the target. Our results showed that the CO I gene of all 139 samples examined was successfully amplified by PCR. When sequenced, 30 samples (21.58%) were mislabeled as the wrong species, 11 samples had insufficient information provided on the label to determine if the labeling was correct (7.91%), and four samples failed sequencing (2.88%). We also found that the use of proper labels for fish products in sushi restaurants was higher than that in supermarkets. As a simple, rapid, and efficient technology, DNA barcoding can be widely used for species identification of fish products. Our work shows that regulation of the labeling of fish products, as we evaluated in Guangzhou and other markets in China, is needed on a global scale.     

利用线粒体DNA Cyt b基因PCR-RFLP分析方法鉴别羊肉和鸭肉

建立了一种利用线粒体DNA(mtDNA) Cyt b基因PCR-RFLP分析来鉴别羊肉和鸭肉的方法。采用一对通用引物扩增绵羊、山羊和鸭的mtDNACytb基因,并对扩增产物用DNA限制性内切酶Bsu36I和SpeI进行酶切,电泳分析酶切产物的变化。结果表明通用引物可扩增羊和鸭472bp的PCR产物,经两种内切酶酶切后,绵羊、山羊和鸭的PCR产物分别被切为大小不同的片段,其中绵羊和山羊被SpeI切为213bp和259bp,而鸭则被Bsu36I切为95bp和377bp。利用PCR-RFLP分析mtDNA Cyt b基因的方法操作简单,是一种快速鉴别羊肉和鸭肉的可靠方法。     

Applicability of DNA barcode for identification of fish species

DNA barcoding is a species identification technique, which uses a very short DNA sequence from a region of approximately 650 base-pairs in the 5'-end of the mitochondrial cytochrome c oxidase subunit I gene as a marker to identify species of mammals and fishes. The applicability of DNA barcoding for identification of fish species consumed in Japan was studied. Among thirty-one fresh or processed fishes were obtained from the market, two samples could not be identified due to lack of data in the Barcode of Life Data (BOLD) database. However, BLAST-search of 16S rRNA genes in the National Center for Biotechnology Information (NCBI) database and the PCR-RFLP method published by the Food and Agricultural Materials Inspection Center (FAMIC) were found to be applicable to identify these 2 fishes. The results show that the DNA barcoding technique is potentially useful as a tool for confirming the proper labeling of fish species in the Japanese market.     

DNA barcoding for the species identification of commercially important fishery products in Indonesian markets

The DNA barcoding approach was used for the species identification of 44 Indonesian commercial fishery products. Additionally, the intronless nuclear rhodopsin gene fragment (RH1) was added to the analysis to enable the identification of species not yet barcoded and possible hybrids. The 655‐bp cytochrome C oxidase subunit I (COI) gene fragment marker was successfully amplified and used to identify 86% of the total fish samples at the species level using the BOLD and BLAST public databases. Moreover, the RH1 marker was used to complete COI analysis. For a number of fish species, the COI sequences (six species) and RH1 sequences (eight species) were the first entries submitted to GenBank. This study demonstrated that COI barcoding is a promising tool for Indonesian fishery products and confirmed that it could be adopted in the future for regular seafood control as part of the Indonesian integrated food traceability system.