富锗木耳对小鼠肠道菌群的影响

通过荧光定量PCR方法,测定了喂饲富锗木耳菌丝体小鼠肠道内大肠杆菌和乳酸杆菌的16s rDNA数量,探讨了富锗木耳菌丝体对小鼠肠道菌群的影响.实验结果表明,喂饲富锗木耳菌丝体小鼠肠道内大肠杆菌数量未见明显变化(p＞0.05),乳酸杆菌数量显著增加(P＜0.01),富锗木耳对肠道菌大肠杆菌无明显的调节作用,对乳酸杆菌的生长繁殖有促进作用.     

富锗木耳对小鼠肠道菌群的影响

通过荧光定量PCR方法,测定了喂饲富锗木耳菌丝体小鼠肠道内大肠杆菌和乳酸杆菌的16srDNA数量,探讨了富锗木耳菌丝体对小鼠肠道菌群的影响。实验结果表明,喂饲富锗木耳菌丝体小鼠肠道内大肠杆菌数量未见明显变化(p>0.05),乳酸杆菌数量显著增加(p<0.01),富锗木耳对肠道菌大肠杆菌无明显的调节作用,对乳酸杆菌的生长繁殖有促进作用。      

基于IPTW法筛选高脂血症人群的差异肠道菌群

目的：研究高脂血症患者与非高脂血症人群肠道菌群的差异。方法：采用Illumina HiSeq二代测序技术分析肠道菌群组成和丰度,利用逆处理概率加权法（IPTW）校正混杂因素,通过QIIME2 ANCOM筛选高脂血症的差异菌群,运用R Tax4Fun包进行功能预测。结果：高脂血症组和非高脂血症组共有7个差异扩增序列变体（ASVs）（ASV_232、ASV_63、ASV_173、ASV_46、ASV_393、ASV_283、ASV_41）;甘油三酯组和非甘油三酯组（TG组与非TG组）只有1个差异ASV（ASV_422）;高密度脂蛋白胆固醇组与非高密度脂蛋白胆固醇组（HDL-C组和非HDL-C组）共有18个差异ASVs（ASV_9、ASV_15、ASV_28、ASV_36、ASV_50、ASV_56、ASV_80、ASV_99、ASV_153、ASV_45、ASV_636、ASV_243、ASV_109、ASV_516、 ASV_13、ASV_74、ASV_96、ASV_259）。功能预测结果显示：高脂血症组与非高脂血症组样本菌群功能组成高度相似,没有发现显著差异,大多数功能基因与能量代谢有关。结论：高脂血症患者与非高脂血症人群的差异肠道菌群为毛螺菌科、疣微菌科,双歧杆菌属、粪杆菌属、拟杆菌属、瘤胃菌属_UCG-013、Agathobacter、Subdoligranulum、Lachnoclostridium、Lachnospiraceae_UCG-010属,该结果说明碳水化合物代谢和氨基酸代谢所占比例较大。     

婴儿肠道菌群中乳酸菌的分离鉴定及其多样性分析

结合传统培养方法与基于PacBio Sequel平台的单分子实时(Single-molecule real-time,SMRT)三代测序技术,对中国婴儿肠道菌群中的乳酸菌进行分离鉴定并分析其多样性,同时探究抗生素治疗对婴儿肠道乳酸菌多样性的影响。采用稀释涂布法培养分离粪便样品菌落,运用生理生化试验及16S rDNA序列比对鉴定菌株,并分析不同菌株间的系统发育关系。同时提取整体粪便样品的基因组DNA进行16S rDNA全长SMRT测序,利用QIIME、Mothur等生物信息学分析软件进行细菌群落结构和多样性分析。结果表明:中国婴儿肠道菌群中乳酸菌丰度及多样性普遍较低,传统培养方法分离出7种共32株乳酸菌,经鉴定为Lactobacillus rhamnosus、Enterococcus faecalis、L. gasseri、L. plantarum、L. casei、Pediococcus pentosaceus与Bifidobacterium longum;SMRT测序技术共获得11种乳酸菌,分别为L. rhamnosus、E. faecalis、L. gasseri、L. casei、P. pentosaceus、L. paracasei、L. salivarius、L. paraplantarum、L. porcinae、B. pseudocatenulatum、B. longum。其中,抗生素组仅分离检测到2种乳酸菌,分别为L. porcinae和E. faecalis。传统培养方法与SMRT测序技术对婴儿肠道菌群中乳酸菌多样性的分析存在差异,且抗生素的使用会降低婴儿肠道菌群中乳酸菌的多样性。     

黄酒对高脂血症模型大鼠血脂及肠道菌群的影响

该实验研究了黄酒对高脂血症模型大鼠血脂及肠道菌群的影响。 结果表明,黄酒高、中、低剂量组的大鼠体质量增量、肝脏 指数显著低于高脂模型组（P＜0.05）;血清总胆固醇（TC）、甘油三酯（TG）、高密度脂蛋白胆固醇（HDL-C）和低密度脂蛋白胆固醇（LDL-C）含量与高脂模型组相比差异不显著（P＞0.05）。高通量测序结果显示,黄酒能有效抑制高脂饲料引起的大鼠肠道菌群中厚壁菌门（Firmicutes）的上升和拟杆菌门（Bacteroidetes）的下降,使二者的含量和比值更接近于空白对照组,改善并提高了高脂大鼠 肠道内艾克曼菌属（Akkermansia）和拟杆菌属（Bacteroides）的组成比例。 在实验周期内,黄酒改善了高脂饲料引发的大鼠肠道菌群结 构的改变以及体质量和肝脏指数的升高,对高脂大鼠的降血脂作用不明显。     

基于16S rRNA技术分析当归超微粉对小鼠肠道菌群多样性的影响

研究不同剂量当归超微粉对小鼠肠道菌群多样性、肠道生理结构的作用。将C57BL/6小鼠分为当归超微粉高剂量组(2.0g/kg)、中剂量组(1.0 g/kg)、低剂量组(0.5 g/kg)、传统饮片组(2.0 g/kg)、传统粉末组(2.0 g/kg)和空白组,灌胃给药15 d,记录体重,在灌喂第15 d时无菌取结肠内容物,扩增肠道菌群16S rRNA基因的V3+V4区,采用高通量测序分析β多样性和α多样性、分析门水平和属水平的物种组成,HE染色法观察胃肠道病理变化。结果显示,C57BL/6小鼠体重正常生长,当归超微粉饮片高剂量组的对小鼠肠道微生物的疣微菌门(Verrucomicrobia)含量显著增加(p<0.05),放线菌门(Actinobacteria)含量减少(p<0.01)。另外,当归超微粉饮片中剂量组拟杆菌门(Bacteroidetes)含量降低最为显著,厚壁菌门(Firmicutes)增加最为显著;在属水平中剂量Faecalibaculum增加最明显(p<0.05),故超微粉的中剂量为最佳实验剂量。各处理组小鼠胃肠道无病理变化。本实验可为当归以超微粉的使用方式,对人体保健或治疗使用的科学用量和安全性,提供理论依据。另外,可为以肠道菌群相关的有效性提供技术支持。     

基于16S rDNA测序研究白酒对大鼠肠道菌群的影响

为探究浓香型白酒对SD大鼠肠道微生态的影响,通过连续8周灌胃适当剂量乙醇,建立SD大鼠慢性酒精性肝损伤模型,同时,灌胃相同剂量的白酒,考察白酒和乙醇对SD大鼠血脂、肝脏指标的影响及造成的肠道菌群变化。结果显示,连续8周灌胃乙醇造成SD大鼠一定程度的酒精性肝损伤,而白酒组的肝损伤程度显著低于乙醇组。多样性分析表明乙醇组SD大鼠肠道菌群丰富度和多样性降低,而白酒的摄入可以回调这种现象。菌群结构分析表明乙醇干预和白酒干预之间存在显著差异,其中白酒干预组物种组成与对照组更加接近。差异性分析筛选出白酒组和乙醇组的3个潜在差异微生物标志物,分别为g＿Eubacterium＿rumminantium＿group、g＿U29-B03和g＿unclassified＿f＿Oscillospiraceae。该研究结果表明白酒可能通过调节肠道微生态来减轻乙醇诱导的轻度肝损伤。     

合生元制剂对小鼠抗氧化能力和肠道菌群的影响

为研究合生元制剂对小鼠抗氧化能力、细胞因子和肠道菌群的影响,随机将48只BALB/c小鼠分为对照组、低剂量组(L)、中剂量组(M)和高剂量组(H),并灌胃生理盐水和不同剂量合生元制剂,14 d后收集小鼠粪便进行菌落计数和16S rDNA高通量测序,测定小鼠肝脏、小肠组织中抗氧化指标,检测血清中细胞因子白介素-6(int...     

黄酒对便秘模型小鼠通便及肠道菌群的影响

研究黄酒对小鼠通便功能作用及便秘小鼠肠道菌群的影响。 体质量、小肠墨汁推进率、首粒黑便排出时间、粪便质量实验结 果表明,高剂量黄酒能够延缓小鼠体质量增长,黄酒未能显著促进便秘小鼠肠道蠕动、缩短首粒黑便排出时间,未能显著增加便秘小 鼠粪便质量。16S rDNA测序分析结果显示,高剂量和中剂量组在物种丰富度上显著高于模型对照组（P＜0.05）;高剂量黄酒能够上调 Akkermansia muciniphila、乳杆菌的比例;下调拟杆菌（Bacteroides）、肠球菌（Enterococcus）、梭菌（Clostridium）和变形杆菌（Proteus）的 比例。 在实验剂量下,未见黄酒具有明显的通便功能作用,黄酒对便秘小鼠肠道菌群结构有调节作用。     

婴儿配方乳粉原辅料中细菌的分离鉴定北大核心CSCD

利用传统可培养方法对采集自婴儿配方乳粉加工厂的14类、42份原辅料样品进行细菌的分离,并采用16S rDNA基因测序技术对分离的细菌进行分子鉴定。结果表明:乳糖、氯化钾、维生素、低聚果糖、棕榈油和乳铁蛋白共6类原辅料中没有发现细菌,其他8类原辅料中共分离出36株细菌,包含了6个属10个种。原料乳和乳清粉是主要的细菌分离来源,共分离到11株和8株细菌,分别占总分离菌株的30.6%和22.2%。肺炎克雷伯菌和格氏乳球菌是优势菌株,共占总分离菌株的52.7%。     

Diversity of bacterial population of table olives assessed by PCR-DGGE analysis

Nocellara Etnea and Geracese table olives are produced according to traditional process, in which lactic acid bacteria (LAB) and yeasts are the dominant microorganisms. With the aim to evaluate the effect of selected starter cultures on dynamics of bacterial population during fermentation and on growth/survival of Listeria spp. artificially inoculated into the olive brine, a polyphasic approach based on the combination of culturing and PCR-DGGE analysis was applied. Plating results showed a different concentration of the major bacterial groups considered among cultivars and the beneficial effect of LAB starters, which clearly inhibited Enterobacteriaceae. Moreover, results indicated that the brine conditions applied did not support the growth/survival of Listeria monocytogenes strain, artificially inoculated, highlighting the importance of selecting right fermentation parameters for assuring microbiological safety of the final products. Comparison of DGGE profile of Nocellara Etnea and Geracese table olives, displayed a great difference among cultivars, revealing a wide biodiversity within Lactobacillus population during Geracese olives fermentation. Based on cloning and sequencing of the most dominant amplicons, the presence, among others, of Lactobacillus paracollinoides and Lactobacillus coryniformis in Geracese table olives was revealed in table olives for the first time.     

PCR-DGGE法研究泡菜中微生物群落结构的多样性

运用聚合酶链式反应(PCR)技术,以泡菜发酵液中抽提到的细菌总DNA为模板,对细菌16SrDNA的V3可变区进行扩增,并对扩增产物进行DE指纹图谱分析,以研究泡菜的微生物群落结构.试验结果表明,PCR-DGGE法是研究传统发酵食品中微生物组成的可行方法.     

北京地区不同喂养方式婴幼儿肠道菌群多样性分析

目的 探讨不同喂养方式对0~3岁婴幼儿肠道微生物的影响,以及喂养方式引起的肠道菌群变化与婴幼儿的年龄和分娩方式之间的相关性。方法 选取221例0~3岁北京地区健康婴幼儿肠道粪便样品,按照哺乳方式,将这些样品分为4组：纯母乳组（B）、纯奶粉组（F）、以母乳为主,奶粉和辅食为辅组（BP）、以奶粉为主,辅食为辅（NB）。其中B组44例、F组29例、BP组108例、NB组40例。利用16s微生物多样性测序技术分析了不同喂养方式对婴幼儿肠道微生物的丰度影响。结果 在物种组成上,没有摄入母乳的NB组,门水平上优势菌的含量变化明显。厚壁菌门、变形菌门、放线菌门和拟杆菌门四大优势菌的总含量明显低于B组、BP组和F组。在属水平上B组、BP组和F组相互比较,F组双歧杆菌属和拟杆菌属的含量显著下降,但粪杆菌属、罕见小球菌属等厌氧菌的含量升高。主成分分析的结果表明,NB组和B组的距离最远,F组与BP组的距离最近。F组与B组的差异要大于BP组与B组的差异,说明,与纯母乳喂养的婴幼儿相比,奶粉喂养的婴幼儿其肠道微生物的变化要大于辅以母乳摄入的婴幼儿。同时,关联性分析表明,分娩方式与喂养方式和婴幼儿年龄在影响肠道菌群的丰富度上密切相关。结论 出生前3年的饮食组成和模式会显著影响肠道微生物群的多样性,这种多样性变化与婴幼儿的年龄和分娩方式均具有密切的相关性。     

用DGGE技术分析植物乳杆菌对小鼠肠道菌群失调的影响

采用PCR-DGGE方法研究植物乳杆菌对小鼠肠道失调菌群微生态的影响。选用昆明雌性小鼠建立小鼠抗生素相关性菌群失调模型,灌服植物乳杆菌菌液（109CFU/mL）5d,分离提取小鼠粪便中微生物群落的DNA,通过PCR-DGGE技术分析植物乳杆菌调节过程微生物群落结构与多样性的影响。PCR-DGGE图谱显示,随着植物乳杆菌饲喂时间的延长,小鼠肠道菌群丰富度呈现逐渐增加的演替过程。植物乳杆菌灌胃第4d小鼠肠道菌群的丰富度指数（18）与多样性指数（2.75）与正常小鼠基本一致,DGGE图谱的测序结果表明,植物乳杆菌调节小鼠肠道菌群失调主要表现在两个方面:选择性地增加有益菌如Bacteroides stercoris、Bacteroides uniformis strain等的量;抑制致病菌如Clostridium clostridioforme、Pseudomonas stutzeri等的生长。说明植物乳杆菌对头孢地尼引起的肠道菌群失调具有调整作用;建立PCR-DGGE法监测肠道菌群动态变化的分析方法,为进一步研究益生菌对肠道菌群的作用机制奠定基础。      

应用PCR-DGGE方法研究甜酒曲中真菌多样性

提取6种甜酒酒曲的总DNA,利用真菌18S rRNA基因片段的通用引物NS1、Fung-GC,采用变性梯度凝胶电泳（PCR-DGGE）方法,进行不同甜酒酒曲中真菌多样性的分析。结果表明,6种甜酒酒曲中共分离出3属真菌和不可培养真菌,湖南韶山的甜酒曲中主要是扣囊复膜酵母属和根霉属的菌株;湖南湘潭甜酒曲中的真菌为酿酒酵母属、扣囊复膜酵母属和根霉属;湖南祁东、福建福州和浙江丽水甜酒曲中的真菌均为酿酒酵母属、扣囊复膜酵母属、根霉属和不可培养真菌;浙江兰溪甜酒曲中的真菌为根霉属和不可培养真菌。在传统的酒曲中的真菌主要是酿酒酵母属和扣囊复膜酵母属,此外不可培养真菌在甜酒酒曲中也起到非常重要的作用。     

Stress and intestinal microflora

In this overview the actual international knowledge regarding phenomenons and their proven or speculated mechanisms of adaptative microecological, hormonal and immunological responses to neuroemotional stress conditions including space-flights is represented. In most cases a decreased stability of the intestinal microflora provokes further reactions of the body. The necessity to predict the various possible disorders and to find optimal measures for their prophylaxis and elimination is emphasized.     

PCR-DGGE技术分析腌制麻竹笋中微生物多样性

采用聚合酶链式反应-变性梯度凝胶电泳（polymerase chain reaction-denaturing gradient gel electrophoresis,PCR-DGGE）技术对盐质量浓度5 g/100 mL和19 g/100 mL腌制麻竹笋的微生物区系进行研究。结果表明,经DNA提取、巢式PCR、DGGE电泳和克隆测序后,从低盐质量浓度（5 g/100 mL）腌制笋中分离出4 条明显的亮带,经鉴定分别为食窦魏斯氏菌（Weissella cibaria）、乳球菌属（Lactococcus sp.）、魏斯氏菌属（Weissella sp.）和乳酸乳球菌（Lactococcus lactis）;从高盐质量浓度（19 g/100 mL）腌制笋中分离出5 条明显的亮带,经鉴定分别为绿色气球菌（Aerococcus viridans）、赖氨酸芽孢杆菌属（Lysinibacillus sp.）、未得到培养的细菌（unculturedbacterium）、厌氧芽孢杆菌属（Anoxybacillus sp.）和芽孢杆菌属（Bacillus sp.）;低盐腌制笋的优势菌多为益生菌,而高盐腌制笋的优势菌则多为抗性较强的菌。基于16S rDNA的PCR-DGGE技术为分析腌制麻竹笋中微生物多样性提供了一条可靠、快速的有效途径。     

PCR-DGGE分析天源酱园豆酱发酵过程中微生物多样性

以天源酱园生产豆酱为研究对象,通过PCR-DGGE指纹图谱技术分析豆酱发酵过程中微生物群落动态变化。结果表明:豆酱发酵过程中的优势细菌为地衣芽孢杆菌(Bacillus licheniformis,相似率98%)和未培养明串珠菌克隆(uncultured Leuconostoc sp.clone,相似率100%)的近缘种,其中芽孢杆菌协助真菌分解原料中蛋白质和淀粉,明串珠菌有助于豆酱风味物质的形成;豆酱发酵过程中主要真菌为米曲霉(Aspergillus oryzae,相似率99%)的近缘种,在豆酱发酵前期分解原料中蛋白质和淀粉。     

Effect of fructo-oligosaccharides on intestinal microflora

Fructo-oligosaccharides are widely distributed in plants such as onions, asparagus, wheat etc., and obtained from sucrose by the action of fructosyltransferase. They are not hydrolyzed by human digestive enzymes, but are utilized by intestinal bacteria such as bifidobacteria. Bacteroides fragilis group, peptostreptococci and klebsiellae. In the experiment with 23 patients (73 +/- 9 years old), improvement of fecal microflora was observed by oral administration of fructo-oligosaccharides 8 g per day for two weeks: the population of bifidobacteria in feces increased about 10 times compared before the administration; average pH of stool showed 0.3 lower than that before administration.