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相似性模型在化学诸多领域的广泛应用激发了许多研究者努力探讨分子相似性更中肯的计算方法。我们根据语义模型定义了一种新的分子相似性指数。这种方法首先将分子结构安某种方式拆分,得到可以表征分子结构特征的结构碎片(子结构),它们构成了描述分子结构相似性的度量空间,再根据这些碎片的语义关系定义了分子相似。通过16个含5个碳的醇之间的分子相似性的计算举例说明这个新方法。 相似文献
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为了指导新药探索,减少耗费过高的实验次数,需要有一个准确、快速的分子相似性判定方法来选择待比较的分子.为此提出一种蛋白质结构相似性比较方法,使用空间球极坐标3个分量划分蛋白质所在区域,得到蛋白质基本组成元素的空间密度特征,进而判定2个蛋白质结构的相似性.实验结果表明,该方法可作为各种结构蛋白质相似性比较的辅助手段,不仅能较好地反映蛋白质分子的空间结构特征,而且还有令人满意的时间复杂性,对大分子的相似性比较及进一步分类将有重要意义. 相似文献
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基于BFS树的XML文档图结构相似性计算 总被引:2,自引:1,他引:1
可扩展链接语言将XML文档从树状结构扩展到图状结构,其结构相似性比较对文档查询、聚类意义重大.现存的比较XML树状结构相似性以及比较图结构相似性的方法忽视了文档结构特点,比较的结果与实际存在较大差异.基于BFS树的XML文档图结构相似性计算方法运用广度优先搜索算法找到最小代码树,重新定义了编辑距离的概念.比较结果表明,该方法更符合实际文档相似程度,因此在比较XML文档图结构相似性上有很大的可行性. 相似文献
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提出了非线性组合系统的相似性结构定义,讨论了这类具有相似结构的非线性组合系统的若干分散控制问题.利用系统的相似性结果,给出了相应控制器的设计方案.所得结果表明,复杂系统的相似性结构有助于简化系统的分析与设计. 相似文献
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针对复杂网络结构划分过程复杂、准确性差的问题,定义了节点全局和局部相似性衡量指标,并构建节点的相似性矩阵,提出一种基于节点相似性度量的社团结构划分算法.其基本思路是将节点(或社团)按相似性合并条件划分到同一个社团中,如果合并后的节点(或社团)仍然满足相似性合并条件,则继续合并,直到所有节点都得到准确的社团划分.实验结果表明,所提算法能成功正确地划分出真实网络中的社团结构, 性能比标签传播算法(LPA)、GN(Girvan-Newman)、CNM(Clauset-Newman-Moore)等算法优秀,能有效提高结果的准确性和鲁棒性. 相似文献
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蛋白质三维结构相似性比较方法综述 总被引:1,自引:0,他引:1
蛋白质空间结构的相似性比较是生物信息学领域的一个研究热点,近年来出现了不少蛋白质三维结构相似性比较方法.文中以蛋白质三维结构的表示为线索,对目前已有的蛋白质三维结构相似性比较的典型方法进行分类,分析并归纳了各种方法的适用性. 相似文献
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多准则框架下的蛋白质三维结构相似性检索 总被引:1,自引:0,他引:1
蛋白质三维结构与功能的关系问题是当前生命科学领域的一个重大科学问题,蛋白质三维结构相似性比较则是探索蛋白质结构与功能关系的一种重要手段.文中就蛋白质结构在空间分布的特殊性提出了一种多准则框架下的蛋白质三维结构相似性检索模型.在该模型下,通过三种蛋白质空间旋转与平移不变特征的获取,实现了蛋白质骨架空间走向函数的一致性、蛋白质骨架距离直方图的一致性以及蛋白质距离矩阵数据分布一致性的多准则相似性检索策略.作者对实际的27804个蛋白质样本数据库进行实验,结果表明该文所提出的检索模式以及相似性准则的设计是实现大规模蛋白质三维结构相似性检索的一种有效方法. 相似文献
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范例推理结构相似性研究 总被引:2,自引:0,他引:2
本文将范例的结构相似性问题提炼为结构图的相似问题,改变了将范例属性线性地映射到区间的方式,建立以关键节点为特征的分层模型,来进行范例结构图比较,并得到一个可以计算的合理的相似度数值,可以较为方便地解决结构相似性度量的问题,为复杂范例的多种类型的带偏序的属性的综合比较提供了基础。最后本文提供了一个例子,对相似性模型作了说明。 相似文献
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基于X结构的词义选择利用单词所在的X结构,并与词典的用法部分的X结构相比较,通过比较结构及结构中其它词的相似性来决定单词的含义,单词间的相似性利用WordNet来实现.这一方法只要较少的学习例子,可以避免传统的基于单词同现的方法中需要大量的语料库及数据稀少等问题。 相似文献
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本文提出一种基于像素邻域结构信息相似性的混合噪音线性滤波算法(GLMF)。该算法是对线性混合滤波器(LMF)的一种改进,它利用图像中存在着大量冗余信息的特性,恢复被混合噪音染污的像素,在判断邻域内像素的相似性时,除考虑像素灰度值的相似性之外,又考虑了像素邻域结构的相似性,用像素灰度值的梯度来表示邻域结构信息。仿真实验证明,用GLMF去噪的视觉效果和峰值信噪比(PSNR)均优于已知的同类滤波器。该算法适用于恢复被高斯噪音和随机脉冲噪音混合污染的数字图像。 相似文献
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多聚类中心近邻传播聚类算法(MEAP),在处理任意形状具有流形分布结构的数据时,往往得不到理想的聚类结果。为此,基于流形学习的思想,设计了一种全新的相似性度量,该相似性度量能够扩大位于同一流形中数据点间的相似性,同时缩小处于不同流形上数据点间的相似性,从而使得相似性矩阵能够准确地反映数据集内在的流形分布结构。将该相似性度量与MEAP相结合,提出基于流形结构的多聚类中心近邻传播聚类算法MS-MEAP(Manifold Structure based Multi-Exemplar Affinity Propagation),从而有效地拓展了算法处理任意形状具有流形分布结构数据集的能力,同时提高了算法的运行效率。在人工数据集与USPS手写体数据集上进行了实验,仿真实验结果及算法有效性分析证明,MS-MEAP算法相比于原算法在处理任意形状具有流形分布结构的数据时,具有更好的聚类性能。 相似文献
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图形相似的基本原理、方法及其在结构模式识别中的应用 总被引:14,自引:0,他引:14
将相似的有关思想和方法引入到图形识别和理解中,系统地讨论了图形相似的基本原理和方法。首先分析了图形的相似性特征、相似性的内涵以及相似性的性质,同时给出了图形相似度的计算方法;其次,借助图的方式对图形的各相似性特征进行描述,并提出了统一的图形特征编码方式,以此实现图形由“形”到“数”的转换;而且,提出了一种具有层次性的、以图形特征编码为基础、以相似度为依据的图形相似性判别算法;最后,将该方法应用于基于二维的结构模式识别中,以一个实际零件中的非相交基元体的识别为例说明了该方法的具体应用。实验结果表明,与传统的识别方法相比较,该方法在模式的识别范围、模式的搜索以及模式的匹配速度等几个方面取得了较大进展,并且这种基于多个相似性特征的图形识别方法具有更大的灵活性和可靠性。 相似文献
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Web页面相似性是Web页面聚类和Web会话聚类的基础,其准确性直接影响聚类的质量。本文在分析基于URL结构的静态Web页面相似性度量的基础上,提出了将URL结构和页面访问时间结合起来度量Web页面对之间的相似性并给出了度量标准。实验证明,采用我们提出的度量标准得到的结果准确性更高,更接近于用户浏览兴趣。 相似文献
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图卷积网络(GCN)能够适应不同结构的图,但多数基于GCN的方法难以有效地捕获网络的高阶相似性。简单添加卷积层将导致输出特征过度平滑并使它们难以区分,而且深层神经网络更难训练。本文选择将网络的多粒度结构和图卷积网络结合起来用于学习网络的节点特征表示,提出基于多粒度结构的网络表示学习方法Multi-GS。首先,基于模块度聚类和粒计算思想,用分层递阶的多粒度空间替代原始的单层网络拓扑空间;然后,利用GCN模型学习不同粗细粒度空间中粒的表示;最后,由粗到细将不同粒的表示组合为原始空间中节点的表示。实验结果表明:Multi-GS能够捕获多种结构信息,包括一阶和二阶相似性、社团内相似性(高阶结构)和社团间相似性(全局结构)。在绝大多数情况下,使用多粒度的结构可改善节点分类任务的分类效果。 相似文献
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