microRNA作用靶基因的预测

microRNA(miRNA)是一类约20-25个核苷酸长的非编码小分子RNA,广泛存在于动植物细胞中,通过与靶基因的3′UTR区结合而裂解mRNA或抑制翻译的起始。大多数miRNA基因以单拷贝、多拷贝或基因簇的形式存在于基因组。它的发现主要有cDNA克隆测序和计算发现两条途径,目前已证实miRNA在生物体生长、发育和疾病发生等过程中发挥着重要的作用。本文主要介绍了miRNA的特征、miRNA的功能、作用机制,miRNA基因的鉴定和检测方法与结合研究进展对靶基因进行预测。     

烟草烟碱相关miRNA筛选及验证

为挖掘烟草中可能参与烟碱调控相关的miRNA,利用生物信息学方法,进行了烟草全基因组水平的miRNA鉴定,筛选出烟碱相关的miRNA,并利用qPCR和GC-MS技术对相关过表达miRNA材料开展了功能验证.结果显示,利用红花大金元3个时期5个不同组织(根、茎、叶、花和腋芽)共39个样品的miRNA测序数据,共鉴定出了2...     

花生蛋白质含量的主基因加多基因遗传分析

以郑8903×豫花4号构建的包含215个家系的重组自交系群体为材料,在海南三亚和河南原阳两个环境下种植,采用凯氏定氮仪测定蛋白质含量,运用数量性状主基因加多基因混合遗传模型分析方法,开展了花生蛋白质含量的遗传模型分析。结果表明,两个环境条件下家系间蛋白质含量均存在广泛变异,表现超亲遗传现象,其频数分布图呈正态分布特征。在两个环境中蛋白质含量的遗传均符合多基因遗传模型（C模型）,即受多基因效应和环境作用,其多基因遗传率分别为29.63%和18.77%;环境引起的变异分别为46.05%和54.08%。     

miRNA398调控烟草Cu/Zn-SOD基因的表达

模式植物miRNA398可以抑制靶基因Cu/Zn-SOD的表达。为揭示烟草miRNA398的生物学功能,采用荧光定量PCR技术分析了烟草品种CB-1和B37在干旱胁迫条件下miRNA398和Cu/Zn-SOD基因的表达量,并预测了烟草miRNA398结合Cu/Zn-SOD基因的位点。结果表明:烟草miRNA398与Cu/Zn-SOD基因5非翻译区的21个碱基序列互补,从而抑制该基因的表达;在干旱胁迫条件下,CB-1的miRNA398表达水平上升,B37的miRNA398表达水平下降,Cu/Zn-SOD基因表现出与miRNA398相反的表达趋势,说明抗旱能力存在差异的两个品种中miRNA398均可抑制Cu/Zn-SOD基因表达,并且对干旱胁迫响应具有两种不同的方式。     

转基因花生外源基因田间漂移风险初步研究

用含花生条纹病毒壳蛋白（cp）基因和潮霉素筛选基因（hyg’）的转基因花生品系为材料,田间试验表明转基因花生中的hyg’基因可在短距离范围内随花粉漂移,离转基因花生种植区边缘1．0m和3．0m范围内漂移频率分别为4．4％和5．0％;3．0m以外范围内,没有检测到hyg’基因随花粉发生漂移。各距离范围内均没有检测到cp基因随花粉漂移现象。因此认为,转基因花生外源基因漂移距离在3．0m以内。     

高油酸花生种质油酸亚油酸含量的主基因＋多基因遗传

应用植物数量性状主基因＋多基因混合遗传模型对杂交组合8-153×粤油13的P1、F1、P2、F2世代和F2∶3家系的油酸、亚油酸含量进行多世代联合分析,结果表明：在该组合中,花生油酸含量遗传由2对加性-显性主基因＋多基因控制;F2、F2∶3群体主基因遗传率分别为77.28%和55.00%,多基因遗传率分别为13.34%和32.13%;两对主基因的加性效应值分别为8.8172和4.0397,显性效应值分别为-10.2475和-9.0420。亚油酸含量遗传由2对加性-显性-上位性主基因控制;F2、F2∶3群体主基因遗传率分别为88.30%和79.84%;两对主基因的加性效应值（da、db）分别为-7.3949和-6.9568,显性效应值（ha、hb）分别为1.3879和1.5438;da与db、da与hb、db与ha以及ha与hb间的互作效应分别为-4.5216、-1.7688、-1.9808和-1.1172。ol基因的多效性以及油酸、亚油酸含量和O/L比值的遗传均受两对主基因控制的结果暗示相同的两对主基因可能同时控制油酸与亚油酸含量,它们对油酸、亚油酸含量的作用效应相反。     

食源性致病菌PCR检测中常用的靶基因及其参考引物

PCR方法检测食源性致病菌在敏感性、特异性与速度上都具有很大优势,在其应用过程中,选择的靶基因和由此设计的引物序列直接影响方法的特异性和灵敏性。综述了大肠杆菌、沙门氏菌、金黄色葡萄球菌、志贺氏菌及其他常见的食源性致病菌在PCR检测中常用的靶基因及其参考引物,以供相关研究者借鉴。      

食源性致病菌PCR检测中常用的靶基因及其参考引物

PCR方法检测食源性致病菌在敏感性、特异性与速度上都具有很大优势,在其应用过程中,选择的靶基因和由此设计的引物序列直接影响方法的特异性和灵敏性。综述了大肠杆菌、沙门氏菌、金黄色葡萄球菌、志贺氏菌及其他常见的食源性致病菌在PCR检测中常用的靶基因及其参考引物,以供相关研究者借鉴。     

花生生长素原初响应基因PNIAAs的表达模式分析

Aux/IAA基因能够在生长素诱导的早期做出响应。本研究通过筛选花生未成熟种子的cDNA文库,分离并获得了4个可能的Aux/IAA基因,分别命名为PNIAA1、PNIAA2、PNIAA3和PNIAA4。RT-PCR对表达模式的研究显示,四个基因在花生各组织中为组成型表达,且具有不同的时空表达模式和特征,PNIAA1、PNIAA2和PNIAA4主要在叶中表达,而PNIAA3在种子中表达量较高,推测其可能在种子发育过程中行使功能;IAA对花生诱导表达模式分析显示,四个基因经IAA诱导后在根部的表达模式均有变化,其中PNIAA1、PNIAA2和PNIAA3能被生长素迅速诱导。     

应用多重PCR检测食品中SARS病毒靶基因的初步研究

以分子生物学方法——聚合酶链式反应(PCR)技术为基础,初步探讨了食品中SARS病毒靶基因片段的多重PCR检测技术。根据GenBank公开发表的SARS病毒基因组cDNA序列,人工合成克隆特异性靶基因DNA片段,以此片段作为阳性对照,并将其添加到罐装蘑菇、牛肉干、大豆、鱼干等食品的cDNA中作为阳性样品,再根据世界卫生组织推荐的引物序列合成引物,进行单PCR与多重PCR检测分析。结果表明:以单PCR法获得了121bp、182bp及302bp3条靶基因片段;以二重PCR法获得了121bp+182bp、121bp+302bp与182bp+302bp的靶基因片段组合;以三重PCR法获得了121bp+182bp+302bp的靶基因片段组合。检测灵敏度的实验表明:182bp片段的模板DNA量在0.003ng以上时,单PCR都能扩出清晰的条带,而121bp的靶基因片段只有模板DNA量在0.03ng以上时,单PCR才能扩出清晰的条带。它们的二重PCR分析的灵敏度与相应的单PCR分析灵敏度相同。     

微波辅助碱液提取花生壳黄酮工艺

采用微波辅助碱液提取花生（Arachis hypogaea L.）壳黄酮,通过酸沉技术得到黄酮粗品。以黄酮提取得率作评价指标,利用单因素实验探索各因素对黄酮提取得率的影响,继以正交实验优化工艺参数。得到最适工艺条件：提取溶剂pH12.0、液料比30∶1 mL/g、提取温度80℃、酸沉pH4.0和提取时间17 min。在优化后的工艺中,黄酮提取得率达（1.113±0.010）%,纯度为（16.90±0.13）%。该工艺操作简单、便捷,可用于花生壳黄酮的提取。     

花生发根培养条件的优化

利用单因素实验和正交设计研究了培养基中激素、碳源、氮源、磷酸盐、初始pH等对鲁花11号花生发根生长的影响。结果表明,花生发根的最适基本液体培养基为无激素的MS培养基;培养基中加入NAA、6-BA、IBA等三种激素,在不同程度上抑制发根的生长;花生发根培养最适条件为:碳源为1.5%蔗糖、氮源含量与标准MS培养基相同、磷酸盐为3.75mmol/L、初始pH为6.1。100μmol/L水杨酸（SA）可以提高花生发根白藜芦醇苷合成分泌以及白藜芦醇的合成。      

Proximate,Fatty Acid and Sterol Compositions of Aboriginal Peanut (Arachis hypogaea L) Seeds from Bolivia

Oil, protein, ash, carbohydrate, iodine value, fatty acid and sterol compositions were studied in 46 aboriginal Arachis hypogaea cultivars originating from Bolivia. The oil and protein contents varied between 440 and 547 g kg^-1 and 242 and 547 g kg^-1, respectively. Results showed a lower protein content in the variety hypogaea (264·4 g kg^-1) than in the varieties fastigiata (299·7 g kg^-1) and peruviana (294 g kg^-1). The carbohydrate content ranged between 86 and 216 g kg^-1. The principal fatty acids were oleic (358–536 g kg^-1) and linoleic (250–462 g kg^-1). The variety hypogaea exhibited higher concentrations of oleic acid (449·0 g kg^-1). The sterol composition showed higher concentration of β-sitosterol (554–632 g kg^-1) following by campesterol (139–180 g kg^-1), stigmasterol (82–130 g kg^-1) and Δ⁵-avenasterol (86–138 g kg^-1). © 1997 SCI.     

采用计算机模拟技术评估花生蛋白作为新冠疫情期间营养补充剂的潜力

该研究探讨了花生蛋白作为新冠疫情期间营养补充剂的潜力。首先,对花生蛋白的分类进行简要综述,筛选出花生中含有的代表性蛋白（Ara h1、Ara h2、Ara h3、Ara h6、伴花生球蛋白A和伴花生球蛋白B）,同时通过计算机模拟胃肠道蛋白酶对上述6种花生蛋白进行水解,得到了大量的活性肽,然后,将活性肽与SARS-CoV-2 Mpro进行对接,从而评估上述6种花生蛋白与SARS-CoV-2 Mpro的结合能力。结果表明,上述6种花生蛋白的水解度均在34.97%~38.11%,其中Arah2与SARS-CoV-2 Mpro的结合效果最佳（F值>6.67%）,其次是Ara h6（F=4.73%）;此外,寡肽PCAQR、CQSQL、PCEQH、IQQGR与SARS-CoV-2 Mpro的结合效果较好（对接分数≤-140）。综上所述,在疫情期间补充花生蛋白可能对新冠病毒潜在感染者有帮助,所鉴定的寡肽有潜力成为新冠病毒的抑制剂。     

响应面法优化花生茎叶黄酮的提取工艺及其抗氧化活性研究

本实验研究了花生茎叶黄酮的乙醇提取工艺及其抗氧化活性。以乙醇浓度、提取时间、提取温度和液料比为自变量,以花生茎叶黄酮提取量为响应值,采用四因素三水平的Box-Behnken响应面实验设计优化黄酮提取工艺。通过分析各因素的显著性和交互作用,优化得到花生茎叶黄酮最佳提取工艺条件为:乙醇浓度为49%、液料比为10∶1、提取温度为67℃、提取时间为2.4 h,此条件下黄酮提取率为(37.32±0.12)mg/g;花生茎叶黄酮浓度为500μg/m L时,其对DPPH自由基和羟自由基的清除活性分别为83.2%和99.9%,说明了花生茎叶黄酮具有较好的抗氧化活性。     

花生种子发育过程几丁质内切酶、外切酶与抗黄曲霉侵染的关系研究

用1mmol/L和0.1mmol/L茉莉酸甲酯(Methyljasmonate,MJ)处理花生“湛秋48”和“粤油5号”结荚早期植株,再进行干旱处理,于干旱处理两周后接种黄曲霉菌。取种子测定几丁质外切酶、几丁质内切酶活性。结果表明种子在发育过程中,MJ可以诱导花生荚果内几丁质内切酶和外切酶活性升高,并且高浓度MJ处理比低浓度处理效果好。     

花生种子中凝集素的凝集活性及性质研究

利用血凝实验及糖抑制实验测定花生种子中凝集素的凝血活性及糖抑制专一性,同时进行热稳定性及pH影响实验。结果显示：花生种子的凝集素粗提液不能凝集人的A、B、O型血细胞,但是可以凝聚唾液酸酶处理后的A、B、O型血细胞。凝集素对红细胞的凝集可被乳糖、蜜二糖、棉籽糖和D-半乳糖四种糖所抑制,在pH为5.0～11.0范围内较稳定,经55℃保温10min后,活性完全消失。在检测的6个不同品种的花生中,河北高油的种子中凝集素活性最强。在花生的生长初期,这种凝集素的存在部位是子叶和根。     

花生（Arachis hypogaea L.）发芽过程中含氮物质的变化

研究花生品种“百日红”（Arachis hypogaea L.）96 h发芽过程中主要含氮物质的变化。结果表明：发芽96 h,蛋白酶活性与干种子相比增加了53.82 倍,蛋白质水解度达到15.01%;十二烷基硫酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳（sodium dodecylsulfate polyacrylamide gel electrophoresis,SDS-PAGE）显示,部分伴花生球蛋白（50～66 kD）和花生球蛋白酸性亚基（38～49.9 kD）条带消失,同时大量低分子质量蛋白（＜18 kD）条带出现;发芽对花生总氮含量没有显著影响,96 h后蛋白氮含量下降15.88%,非蛋白氮（肽氮＋氨基氮）含量显著增加（从2.84 mg/g增加为9.20 mg/g）;蛋白质中色氨酸和缬氨酸等限制性氨基酸的含量随着发芽时间的延长而增加,必需氨基酸和含硫氨基酸比例增加,必需氨基酸指数（essential amino acid index,EAAI）提高,表明发芽对花生蛋白的质量有明显的增强。     

Aspergillus and aflatoxin in groundnut (Arachis hypogaea L.) and groundnut cake in Eastern Ethiopia

This study was conducted to assess major Aspergillus species and aflatoxins associated with groundnut seeds and cake in Eastern Ethiopia and evaluate growers’ management practices. A total of 160 groundnut seed samples from farmers’ stores and 50 groundnut cake samples from cafe and restaurants were collected. Fungal isolation was done from groundnut seed samples. Aspergillus flavus was the dominant species followed by Aspergillus parasiticus. Aflatoxin analyses of groundnut seed samples were performed using ultra performance liquid chromatography; 22.5% and 41.3% of samples were positive, with total aflatoxin concentrations of 786 and 3135 ng g^?1 from 2013/2014 and 2014/2015 samples, respectively. The level of specific aflatoxin concentration varied between 0.1 and 2526 ng g^?1 for B₂ and B₁, respectively. Among contaminated samples of groundnut cake, 68% exhibited aflatoxin concentration below 20 ng g^?1, while as high as 158 ng g^?1 aflatoxin B₁ was recorded. The study confirms high contamination of groundnut products in East Ethiopia.