利用正交设计优化茄子的SRAP体系

以Solanum melongena自交系01为试验材料,利用正交设计L16(45)在5因素4水平上对茄子SRAP反应体系稳定性的Mg~(2+)、d NTPs、引物、Taq酶及模板DNA等外部条件进行了优化试验,并对所稳定的体系进行验证。得出最佳的体系的引物的浓度为0.4 mmol/L、d NTPs的浓度为0.2 mmol/L、Mg~(2+)浓度为2.0 mmol/L、模板DNA为40 ng、Taq酶浓度为0.25U/μL。     

金莲花ISSR-PCR反应体系的建立与优化

为了建立金莲花ISSR-PCR最佳反应体系，本研究以内蒙古自治区境内野生金莲花为试验材料，采用L_(16)(4~(5))正交实验设计，对影响ISSR-PCR扩增结果的dNTPs，Taq DNA聚合酶，DNA模板，Mg~(2+)、引物五个因素进行优化筛选，对反应程序进行优化。其结果为，每个因素都具有极显著差异，影响最大的为dNTPs，其余依次为Taq DNA聚合酶、DNA模板、引物，影响最小的为Mg~(2+)浓度。最佳反应体系为：DNA模板30 ng，引物0.2 μmol/L，Taq DNA聚合酶0.075 U/20 μL，dNTPs 0.15 mmol/L，Mg~(2+ )1.0 mmol/L， 反应总体积20 μL。最佳扩增程序为：94 ℃预变性5 min，94 ℃变性30 s，52 ℃退火1 min，72 ℃延伸100 s，最后72 ℃延伸7 min，共38个循环，4 ℃保存。采用优化后的体系对金莲花不同居群进行验证，证明优化后体系扩增出明亮清晰的条带且重复性好，可用于后续金莲花遗传多样性分析。     

机动车排放PM_(2.5)对EA.hy926细胞DNA甲基化效应研究

目的探讨机动车排放PM2.5对EA.hy926细胞(人脐静脉内皮细胞和人肺腺癌细胞株A549融合的细胞株)增殖功能、DNA甲基化及凋亡的影响。方法机动车排放PM2.5对EA.hy926细胞染毒24 h。采用MTS法测定机动车排放PM2.5对细胞增殖功能的影响;DNA甲基化定量检测试剂盒(比色法)测定机动车排放PM2.5对细胞DNA甲基化的影响;Annexin V-FITC/PI染色,流式细胞仪测定机动车排放PM2.5对细胞凋亡的影响。结果机动车排放PM2.5染毒24 h可抑制细胞增殖功能,当染毒质量浓度为200μg/m L时,与PBS对照组比较差异有统计学意义(P<0.05);随着染毒质量浓度的增加细胞DNA甲基化率(5-m C%)下降,在染毒质量浓度为50μg/m L和200μg/m L时,与PBS对照组比较差异有统计学意义(P<0.05);随染毒质量浓度升高细胞诱导凋亡率逐渐升高。结论机动车尾气排放PM2.5可以抑制EA.hy926细胞的增殖功能,改变EA.hy926细胞的DNA甲基化率,对EA.hy926细胞产生诱导凋亡作用。此外DNA甲基化可能是细胞增殖和凋亡的机制,定点基因的甲基化仍需要进一步研究。     

副猪嗜血杆菌环介导等温扩增快速检测方法的建立

为了建立一种简便、快速、灵敏、特异的副猪嗜血杆菌(Hps)检测方法,以Hps的16S rRNA保守区域片段为靶序列,选择6个特异性区域,设计4条特异性引物F3、B3、FIP和BIP。经优化反应体系、检测灵敏性和特异性,建立Hps的环介导等温扩增(LAMP)快速检测方法。研究结果表明:该方法的最优反应体系是引物c(F3)∶c(FIP)或c(B3)∶c(BIP)为1∶4、Mg~(2+)浓度为2 mmol/L、d NTPs浓度为6 mmol/L,最低检出量为0.241pg/μL DNA。该方法灵敏度是PCR法的100倍,且能够特异性检测出Hps,不能检测出猪链球菌、沙门氏菌、大肠杆菌、枯草芽孢杆菌、胸膜肺炎放线杆菌和金黄色葡萄球菌。     

杂交三倍体泥鳅GISH技术反应体系的建立及应用

为研究杂交三倍体泥鳅Misgurnus anguillicaudatus的形成机制,探寻其产业化生产的有效途径,通过对GISH的多项试验参数进行优化,建立杂交三倍体泥鳅GISH技术反应体系,并对天然四倍体泥鳅(4n=100)与大鳞副泥鳅Paramisgurnus dabryanus(2n=48)正、反杂交后代进行GISH分析。结果表明:杂交三倍体泥鳅GISH技术反应体系中,探针DNA在温度为105℃、持续时间为2 min时,片段化后探针DNA片段长度为500¹000 bp;封阻DNA在温度为110℃、持续时间为10 min时,片段长度为1001000 bp;封阻DNA在温度为110℃、持续时间为10 min时,片段长度为100⁵00bp;标记后的探针DNA与片段化后的封阻DNA混合比(P/B)在1∶25和1∶50时均可以得到较好的杂交信号;以大鳞副泥鳅全基因组DNA为探针DNA、天然四倍体泥鳅全基因组DNA为封阻DNA,与二者正、反交后代进行基因组原位杂交试验,结果显示,来源于亲本大鳞副泥鳅24条染色体在着丝点处均有杂交信号,无杂交信号染色体50条,来源于亲本泥鳅。该研究结果不仅为杂交三倍体泥鳅后代的鉴定提供了最直观的证据,也为中国天然四倍体泥鳅是含有四套染色体组的遗传四倍体并能产生2n的配子提供了分子细胞遗传学基础数据,对泥鳅三倍体育种研究具有一定的指导意义。     

杂交三倍体泥鳅GISH技术反应体系的建立及应用

为研究杂交三倍体泥鳅Misgurnus anguillicaudatus的形成机制,探寻其产业化生产的有效途径,通过对GISH的多项试验参数进行优化,建立杂交三倍体泥鳅GISH技术反应体系,并对天然四倍体泥鳅(4n=100)与大鳞副泥鳅Paramisgurnus dabryanus(2n=48)正、反杂交后代进行GISH分析。结果表明:杂交三倍体泥鳅GISH技术反应体系中,探针DNA在温度为105℃、持续时间为2 min时,片段化后探针DNA片段长度为500~1000 bp;封阻DNA在温度为110℃、持续时间为10 min时,片段长度为100~500bp;标记后的探针DNA与片段化后的封阻DNA混合比(P/B)在1∶25和1∶50时均可以得到较好的杂交信号;以大鳞副泥鳅全基因组DNA为探针DNA、天然四倍体泥鳅全基因组DNA为封阻DNA,与二者正、反交后代进行基因组原位杂交试验,结果显示,来源于亲本大鳞副泥鳅24条染色体在着丝点处均有杂交信号,无杂交信号染色体50条,来源于亲本泥鳅。该研究结果不仅为杂交三倍体泥鳅后代的鉴定提供了最直观的证据,也为中国天然四倍体泥鳅是含有四套染色体组的遗传四倍体并能产生2n的配子提供了分子细胞遗传学基础数据,对泥鳅三倍体育种研究具有一定的指导意义。     

不同倍性泥鳅鳍细胞培养及染色体标本制备方法的研究

以天然二倍体、杂交三倍体(4n♀×2n♂)和天然四倍体泥鳅Misgurnus anguillicaudatus的鳍组织为材料,对短期培养的消毒方法、秋水仙素的浓度(1.0、1.5、2.0μg/mL)与处理时间(2、3、4 h)和低渗处理时间(30、40、50 min)等细胞培养技术,及染色体标本制备方法进行了研究。结果表明:选择100 g/L的碘伏溶液杀菌效果良好,对于细胞生长影响较小,尤以处理15 min时的效果最明显,细胞迁出迅速;在终止培养前3 h加入秋水仙素至终浓度为1.5μg/mL,天然二倍体、杂交三倍体和天然四倍体泥鳅鳍细胞中期分裂相染色体众数最高,分别为93.33%、90.00%、70.00%;25℃下低渗处理40 min时,可以获得大量图像清晰、长度适中、分散良好、染色体数目完整的染色体中期分裂相。本研究中初步建立了以鳍组织培养法作为材料来源快速制备不同倍性泥鳅染色体标本的方法。     

4种扇贝AFLP分析体系的建立

构建了4种扇贝扩增片段长度多态性(AFLP)的分析体系,对DNA提取、双酶切反应、连接反应、预扩增反应、选择性扩增反应和银染等条件进行了优化。结果表明:用EcoRⅠ/MseⅠ双酶切,核心序列加3个选择性碱基的选择性扩增引物,E32-M49和E32-M62两个引物组合,以及20μL选择性扩增体积,可得到十分稳定的结果。所得产物经电泳和银染后可获得条带清晰、背景干扰小的图像。该体系的构建为AFLP技术在扇贝相关研究中的应用提供了依据。     

姜黄素对鼻咽癌细胞RECK基因甲基化以及MMP-9表达与活性的影响

目的探讨姜黄素对鼻咽癌细胞回复引导半胱氨酸丰富蛋白含kazal基元(RECK)基因甲基化以及基质金属蛋白酶9(MMP-9)表达的影响。方法体外培养鼻咽癌细胞系CNE-1,用1、10、30μmol/L姜黄素处理后,采用Western blot和实时定量PCR分别检测RECK、MMP-9蛋白和mRNA表达;高效液相色谱-电喷雾质谱检测RECK甲基化;MTT法检测CNE-1细胞的增殖。同时采用明胶酶谱实验观察姜黄素处理前后MMP-9酶活性变化。结果 CNE-1细胞未刺激时RECK表达水平较低,而经1~30μmol/L姜黄素处理后,能显著增强RECK蛋白和mRNA的表达。高效液相色谱-电喷雾质谱结果显示,30μmol/L姜黄素处理后,RECK启动子、全基因组以及细胞核内甲基化水平分别降低为(69.04±10.62)%、(61.13±7.08)%、2.80±1.32。同时,姜黄素能显著降低CNE-1细胞中MMP-9蛋白和mRNA表达以及MMP-9的酶活性。结论姜黄素可能通过能上调RECK基因表达,降低细胞内甲基化水平,从而抑制MMP-9的表达与活性而发挥对CNE-1细胞生长抑制作用。     

脑胶质瘤IDH2基因突变HRM检测方法的初步建立

异柠檬酸脱氢酶2(IDH2)基因突变常常发生于WHOⅡ-Ⅲ级的星形细胞瘤,少突胶质细胞瘤,和大部分继发性胶质母细胞瘤中。在临床上,IDH2突变已经显示对胶质瘤患者有诊断和预后意义。拟通过提取胶质瘤石蜡包埋组织DNA,优化PCR反应条件,初步建立IDH2基因突变高分辨率熔解曲线(high resolution melting,HRM)检测方法。并与直接测序法对比,观察反应体系的检测灵敏度和稳定性。响应面分析结果证明20μl HRM反应体系中,引物浓度0.6μmol/L,模板量45ng,Mg⁽²⁺⁾浓度2.75mmol/L,退火温度52.5℃为最佳。HRM检测IDH2基因突变的结果和直接测序法一致,但灵敏度更高。表明所建立HRM方法简单,特异性强,准确可靠,可为IDH2突变检测的临床应用提供借鉴和依据。