长链非编码RNA及其在斑马鱼中的研究进展

随着测序技术的不断发展和完善,在人类和其他模式生物中,发现了一类具有重要调控功能的RNA,即长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)。长链非编码RNA是一类在生物体内大量存在且无编码功能的RNA,主要参与基础转录、特异基因的转录调控、转录后调控、翻译调控和表观遗传学调控等。本文中综述了长链非编码RNA及其在水生动物斑马鱼中的研究进展,可为水产养殖动物的遗传育种和健康养殖提供参考。     

长链非编码RNA的研究现状

长链非编码RNA(lncRNA)是一类长度大于200bp的非编码RNA,无蛋白质编码功能,物种间保守性差,具有较强的组织特异性和时空特异性。研究表明ncRNA具有广泛的生物学功能,如参与RNA的生成与加工、转录调控、染色质重塑等,且作用机制复杂,如能通过绑定特点蛋白质参与转录调节或作为ceRNA参与转录后调控。但lncRNA的结构复杂,功能研究进展缓慢,目前仍难以对其细致分类。从基本特征、分类、功能、数据库、研究工具及其与癌症之间的关系等方面对lncRNA的研究进展进行综述,以期为lncRNA后续研究提供参考。     

长链非编码RNA

<正>长链非编码RNA(Long non-coding RNA,lncRNA)是指长度大于200bp非编码RNA,主要存在核内,研究表明,LncRNA参与了基因调控的基本过程,包括染色质修饰和直接的转录调控,同时也调控转录后事件,如剪接、编辑、定位、翻译和降解。最近根据lncRNA功能和涉及的分子机制可将其分为四类:一、信号分子:作为转录活性的信号分子。二、诱饵分子:与其它调控的RNA或蛋白结合来进行调控。三、引导分子:指导核糖核蛋白复合物定位到特定的目标。四、支架分子:作为相关分子元件     

长链非编码RNA及其在胃癌中的作用

人类基因组DNA中约93%被转录为RNA，其中仅有2%的核酸序列用于编码蛋白质，其余98%的核酸序列均为编码能力极低甚至无编码功能的非编码RNA（noncoding RNA，ncRNA），其中绝大多数被转录成长度大于200个碱基的所谓“长链非编码RNA（long noncoding RNA，lncRNA）”[1]。长期以来，这些不具有蛋白编码潜能的基因组序列被一度认为是基因组在进化过程中积累的无功能的“垃圾序列”而未受重视。近年来，随着高通量测序等技术的广泛应用，越来越多的研究数据显示，lncRNA在包括表观遗传学调控、转录和转录后调控等在内的多个层面上，参与机体多种生理和病理过程的调节。本文结合近年针对lncRNA的研究现状，对其结构、分类、调控机制以及与胃恶性肿瘤的关系进行综述。     

基因印记与lncRNA

基因印记是一种表观遗传调控机制,在二倍体哺乳动物的发育过程中,基因印记可以调控来自亲代的等位基因差异表达。非编码RNA是不编码蛋白质的RNA,它在RNA水平调控基因表达。研究表明大多数印记基因中存在长非编码RNA(长度>200nt的非编码RNA)的转录,长非编码RNA主要通过顺式的转录干扰作用来实现基因印记。同时基因印记及其相关的长非编码RNA异常表达与许多先天疾病相关,迄今已发现数十种人类遗传疾病与基因印记有关,而lncRNA引起的基因印记在疾病的发生和治疗中起着重要作用。     

长链非编码RNA H19对骨关节炎的影响

长链非编码RNA (long noncoding RNAs,lncRNAs)是一种广泛分布在人类基因组中没有蛋白编码功能的核糖核酸(ribonucleic acid,RNA),lncRNAs的改变能够使基因出现异常表达进而导致各种疾病状态和生物功能紊乱。最近研究显示lncRNA H19可能在转录前后通过产生小分子RNA (microRNA,miRNA)或者争夺有限的miRNA结合位点等方式发挥功能,进而调控骨关节炎病理变化,但是具体调控机制尚不明确。LncRNA H19在进化过程中具有高度保守性,lncRNA H19可能作为一种骨关节炎潜在的分子标记物并且成为新的治疗靶点。本文总结近年来有关lncRNA H19与骨关节炎相关的文献,阐述目前已知和可能存在的信号通路,为lncRNA H19调控骨关节炎的机制研究以及用于诊断和防治骨关节炎的潜在可能提供理论基础。     

microRNA在急性冠脉综合征中的作用

microRNA(miRNA)是一类小非编码RNA,在基因表达过程中,通过与靶基因m RNA的3’非编码区结合,从而在转录后调控靶基因表达,miRNA可以调节多达30%的人类基因和控制多种细胞的代谢活动。有研究表明,miRNA在心血管疾病中有重要的调节作用,且miRNA可能成为心血管疾病的重要的生物标记物和药物靶点。急性冠脉综合征(ACS)是心血管疾病中的常见病,本文就miRNA在急性冠脉综合征中的作用做一综述。     

长链非编码RNA及其与肿瘤关系

人类基因组DNA信息分析显示,基因组中编码序列不超过2%,其余为非编码序列,其中能够稳定转录的部分称之为非编码RNA(noncoding RNA,ncRNA)基因。依据ncRNA长度将其分为长非编码RNA(lncRNA,碱基数>200nt)和短非编码RNA(sncRNA)。在人体内,lncRNAs分布广泛,数目众多,并且大多数是由RNA聚合酶II转录的,且有5'端帽子结构以及3'端的多聚腺苷酸。就lncRNA的特征及其在肿瘤细胞中的功能进行阐述。     

转录因子KLF5在恶性肿瘤发生中作用的研究进展

Krüppel样因子5(KLF5)是一种能与DNA结合的锌指转录调节因子,其在乳腺癌、前列腺癌、结直肠癌和肺癌等多种恶性肿瘤中的作用具有环境依赖性。微RNA和长链非编码RNA可以调控KLF5的表达。同时KLF5也可以调控众多的下游靶基因的表达。本文主要介绍了KLF5在恶性肿瘤中的作用,也分析了在不同的细胞状态下通过调节KLF5蛋白的水平而影响下游基因表达的机制差异。深入研究这些差异性或能进一步揭示KLF5在肿瘤发生发展中的作用规律。     

细菌sRNA与抗菌药物的药理作用及耐药性

<正>非编码微小RNA即microRNA在细胞生长、增殖、分化、凋亡等生命过程中起重要的调控作用,几乎参与所有疾病的病理生理过程,为近年研究的热点课题。原核细胞也存在非编码RNA,称为小RNA(small non-coding RNA,sRNA)。sRNA作为一种应答元件,通过与靶mRNA碱基互补配对抑制靶基因mRNA翻译或(和)降解mRNA,在转录后水平调控细菌多种功能,影响细菌生长与繁殖[1,2]。虽然sRNA的发现(1967年)早于microRNA(1993年),但