一种提取真菌基因组DNA的新方法

真菌基因组高通量测序对DNA纯度和含量要求较高,通过月桂酸钠法、CTAB法和酶裂解法分别提取真菌基因组DNA,然后进行琼脂糖凝胶电泳和Nanodrop 1000测定DNA浓度和纯度,结果证明月桂酸钠法提取的真菌基因组总DNA更适合应用于真菌基因组高通量测序。     

浅谈芒果基因组DNA的提取

芒果是重要的经济果树之一,富含多酚、多糖、单宁等其他次生代谢干扰物质,因此其基因组DNA的获取和纯化较为困难。笔者对芒果基因组DNA提取方法进行了探讨,常用的获取方法有SDS法、CTAB法和试剂盒法,而CTAB法提取效果较好。     

九孔鲍不同器官DNA相对含量与细胞周期的分析

应用流式细胞术测定了30只九孔鲍Haliotisdiversicolorsupertexte不同器官DNA的相对含量,比较了各器官的细胞周期差异。结果表明,相同条件下生长的2龄九孔鲍足、上足触手、上足、头触角、外套膜、鳃和眼柄组织的DNA含量存在差异,其中头触角的DNA含量较外套膜组织低15 19%。从各器官细胞周期的时相比例分析看,九孔鲍各器官细胞的同步性较好,G1期时相比例都高于80%,其中鳃G1期比例最高,达到88 62%,头触角中G2/M期时相比例最高,达到11 18%,不同器官各细胞时相的比例存在差异。     

血液基因组 DNA 提取方法的改良

目的：探讨改良血液样品基因组 DNA 的提取方法,制备纯化的高分子量 DNA。方法将312份新鲜血液样品随机分为2组：A 组（90份）和 B 组（222份）。A 组采用常规基因组 DNA 提取方法。B 组采用改良的基因组 DNA提取方法,其基因组 DNA 提取方法改良之处：1）在血液样品中加入细胞裂解液 CL 后采用手工震荡,并离心2 min 40 s;2）震荡混匀后将样品分装成3管,然后将缓冲液 GS 加入第1管吹打溶解后吸取上清,并加入第2管,再吹打溶解后吸取上清加入第3管,继续吹打溶解;3）加入缓冲液 GB 后再58℃水浴过夜16 h。结果改良的血液样品 DNA 提取方法能够提高产率,提高纯度,获取更多高分子量的 DNA,相对于常规基因组 DNA 提取方法有显著提高。结论改良的血液基因组 DNA 提取方法操作简便,能有效地避免操作导致 DNA 链断裂,提高 DNA 的完整性及纯度。     

Bst DNA聚合酶大片段在全基因组扩增中的应用

Bst DNA聚合酶大片段作为一种常用的DNA聚合酶,因其独特的特点:能引发链置换反应、高保真、耐高温等,而成为一种重要的DNA多重置换扩增酶。目的:为减少成本,设计一种高产,方便且扩增活性高的Bst DNA聚合酶大片段表达体系;探究该酶应用于胃癌石蜡包埋组织基因组DNA的扩增条件。方法:采用p TWIN1质粒作为载体克隆表达Bst DNA聚合酶大片段,应用几丁质亲和层析柱纯化该酶,使用该酶对人类基因组DNA进行不同温度下扩增,探究其最适反应温度,并据此对胃癌石蜡包埋组织基因组DNA进行扩增。结果:由此得到的Bst DNA聚合酶大片段能运用于胃癌石蜡包埋组织基因组DNA的扩增,扩增效率可达200倍,并能应用于a CGH芯片。结论:扩增得到保真性高,覆盖基因组范围大的DNA扩增产物。该应用与a CGH结合,使得对少量的癌症石蜡包埋组织DNA样本进行全基因组扩增,并进行其基因拷贝数变异研究成为可能。     

DNA甲基化与基因表达调控研究进展

表观遗传修饰是指不改变DNA序列的、可遗传的对碱基和组蛋白的化学修饰,主要包括DNA甲基化、组蛋白修饰、染色质重塑以及非编码RNA等。表观遗传修饰是更高层次的基因表达调控手段。DNA甲基化是一种重要的表观遗传修饰,参与基因表达调控、基因印记、转座子沉默、X染色体失活以及癌症发生等重要生物学过程。近年来随着研究方法和技术的进步,全基因组DNA甲基化的研究广泛兴起,多个物种全基因组甲基化图谱被破译,全局水平对DNA甲基化的研究不仅利于在宏观层面上了解DNA甲基化的特性与规律,同时也为深入分析DNA甲基化的生物学功能与调控奠定了基础。结合最新研究进展综述DNA甲基化在基因组中的分布模式、规律以及和基因转录的关系等。     

总氨、亚硝酸氮及养鲍污水对皱纹盘鲍生长的影响

单因子总氨氮(TNH3-N)、亚硝酸氮(NO-2-N)试验表明,当养鲍用水中非离子氨氮(NH3-N)为0 035mg/L以下或NO-2-N为0 8mg/L以下时,对皱纹盘鲍HaliotisdiscushannaiIno幼鲍的生长不产生明显影响;NH3-N对幼鲍生长产生影响的EC5(引起幼鲍生长速度减慢5%的浓度)为0 103mg/L,不产生影响的最大浓度为0 045mg/L。双因素试验结果表明,水中TNH3-N、NO-2-N对幼鲍生长的影响没有交互作用,只是简单的相加作用。经回归表明,养鲍自污染水中,NH3-N是影响幼鲍生长的主要因子,它对幼鲍生长产生影响的EC5为0 022mg/L,不产生影响的最大浓度为0 01mg/L,均比单因子试验结果显著降低。     

广西白裤瑶线粒体DNA HVRⅠ区多态性分析

目的:通过对白裤瑶族线粒体DNA D-Loop HVRⅠ区序列碱基的测定,了解其遗传多态性。方法:应用PCR扩增产物及直接测序法,对31名白裤瑶无血缘关系健康个体mt DNA HVRⅠ区进序列检测及分析。结果:与Anderson相应序列比对,白裤瑶群体mt DNA HVRⅠ区发现了88处突变,界定了3种单倍型,基因差异度分别为1.00,偶合概率为0.25。结论:广西白裤瑶线粒体DNA HVRⅠ区多态性有一定的本民族特点。     

鲍罗米公式的推导及试配分析

通过配制各种强度等级砼并据此推导鲍罗米公式,为工程上砼配比提供设计依据;并对试配调整分析提出看法。     

基于mtDNA Cyt b基因全序列探讨岩扇贝与3种扇贝的遗传变异水平及其亲缘关系

为探讨新引进种岩扇贝Crassadoma gigantea与国内3种主要经济扇贝(虾夷扇贝Patinopecten yessoensis、栉孔扇贝Chlamys farreri和海湾扇贝Argopecten irradians)的遗传变异水平及其之间的亲缘关系,通过PCR扩增及测序获得4种扇贝的mtDNA Cyt b基因全序列,并对其序列组成、遗传多样性、遗传距离和系统发育等进行了分析。结果表明:4种扇贝的单倍型数、多态性位点数、单倍型多样性指数、核苷酸多样性指数和平均核苷酸差异数,分别在3~4、2~15、0.545~0.800、0.001 00~0.005 72和0.788~6.545之间,表现出较低的遗传变异水平;4种扇贝的种间遗传距离为0.255~0.429,其中,岩扇贝与虾夷扇贝的遗传距离最近(0.255),与海湾扇贝的遗传距离最远(0.429);系统进化树分析显示,岩扇贝与虾夷扇贝独自聚为一支,表明二者之间的亲缘关系较近。本研究结果将为岩扇贝的引种与养殖以及今后的遗传育种研究工作提供基础信息。     

某铁路工程投标中三种评标办法的比较

以某铁路招投标项目为例,从含义及适用范围、优越性、分值构成、报价方案四方面对三种评标办法进行了分析比较,指出了各自的优缺点,以期对施工企业投标过程中采取正确报价方案提供帮助。     

对柯布西耶设计的修道院中的非理性场景解析

通过对柯布西耶的Sainte Marie de La Tourette修道院中提取的三个建筑场景的分析,揭示了柯布西耶在修道院这类具有理性空间的建筑类型中的非理性操作,以提升人们对柯布西耶作品的认识。     

关于火灾在建筑之间蔓延的分析

通过对火灾在相邻建筑物之间蔓延的分析 ,提出了相应的措施 ,以及如何更合理的确定建筑物之间的防火间距。     

辐射顶板换热性能测试标准的比较

详细比较了ASHRAE 138-2013,EN 14240和JG/T 403—2013三种辐射板换热性能测试标准,并分析了不同标准在实际应用中的优缺点与难点,提出了将标准中的内热源法与外热源法相结合的测试形式。针对国内辐射板测试,提出了一些建议。     

Simplified formulas for evaluation of wind-induced interference effects among three tall buildings

The base-bending moment (BBM) response and the mean BBM of grouped high-rise buildings are studied by a series of wind tunnel tests on typical tall building models using the high-frequency force balance technique. Interference excitations of two upwind buildings with various heights in different upwind terrains are considered. An effective method is proposed to represent the distribution of the envelope interference factor (EIF) among three tall buildings. The results show that two upstream buildings cause more adverse dynamic effects on the downstream building than a single upstream building does. Significant correlations are found in the distributions of the interference factors of different configurations and upwind terrains. Relevant regression equations are proposed to simplify the complexity of the multi-parameter wind-induced mean and dynamic interference effects among three tall buildings. Finally, an example of how to use the data provided in this paper and the proposed methodology is presented.     

变压器Dy和Yy结线对抑制三次谐波的比较

通过对三相变压器不同结线组别的磁势、电势波形分析，指出利用Dyn11结线三相变压器原绕组作三角形联结，有利干抑制三次谐波，改善电压、电流波形。     

DGGE with genomic DNA: suitable for detection of numerically important organisms but not for identification of the most abundant organisms

Identification of all important community members as well as of the numerically dominant members of a community are key aspects of microbial community analysis of bioreactor samples. A systematic study was conducted with artificial consortia to test whether denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE) is a reliable technique to obtain such community data under conditions where results would not be affected by differences in DNA extraction efficiency from cells. A total of 27 consortia were established by mixing DNA extracted from Escherichia coli K12, Burkholderia cepacia and Stenotrophomonas maltophilia in different proportions. Concentrations of DNA of single organisms in the consortia were either 0.04, 0.4 or 4 ng/μl. DGGE-PCR of genomic DNA with primer sets targeted at the V3 and V6-V8 regions of the 16S rDNA failed to detect the three community members in only 7% of consortia, but provided incorrect information about dominance or co-dominance for 85% and 89% of consortia with the primer sets for the V6-V8 and V3 regions, respectively. The high failure rate in detection of dominant B. cepacia with the primers for the V6-V8 region was attributable to a single nucleotide primer mismatch in the target sequences of both, the forward and reverse primer. Amplification bias in PCR of E. coli and S. maltophilia for the V6-V8 region and for all three organisms for the V3 region occurred due to interference of genomic DNA in PCR-DGGE, since a nested PCR approach, where PCR-DGGE was started from mixtures of 16S rRNA genes of the organisms, provided correct information about the relative abundance of original DNA in the sample. Multiple bands were not observed in pure culture amplicons produced with the V6-V8 primer pair, but pure culture V3 DGGE profiles of E. coli, S. maltophilia and B. cepacia contained 5, 3 and 3 bands, respectively. These results demonstrate DGGE was suitable for identification of all important community members in the three-membered artificial consortium, but not for identification of the dominant organisms in this small community. Multiple DGGE bands obtained for single organisms with the V3 primer pair could greatly confound interpretation of DGGE profiles.     

三种复合墙体构造的热工性能分析

鉴于夏热冬冷地区的气候特点．针对外保温、内保温和复合墙板的保温三种不同的保温形式,计算墙体构造特性,建立ANSYS有限元模型对比分析不同构造墙体的热工性能。模拟结果表明：外保温墙体的温度波衰减度大,延迟时间更长,抵抗室外温度波变化能力强,热稳定性更好。     

思南乌江三桥伸缩缝施工技术探析

指出公路桥梁伸缩装置的合理选择及安装质量好坏直接影响到桥梁的使用寿命及公路的经济性。针对公路桥梁伸缩缝的施工技术,以思南乌江三桥为背景,介绍了伸缩装置选择、技术要求、施工关键技术及效果,确保伸缩缝的施工质量。     

三种消毒剂的灭活效果及其消毒副产物分析

选择次氯酸钠、高锰酸钾和单过硫酸氢钾饮用水消毒粉作为消毒剂,考察了三种消毒剂的灭活效果及其消毒副产物的产生情况.结果表明,次氯酸钠对细菌的灭活效果明显,用量少,但产生的消毒副产物种类多、含量高,且会产生大量的氯仿;单过硫酸氢钾的灭活效果比较明显,用量比次氯酸钠多,但产生的消毒副产物种类少、含量低;高锰酸钾对细菌有一定的灭活效果,用量明显比前两种消毒剂多,但无消毒副产物生成.在实际应用时,应根据具体水质特点和不同场合合理使用三种消毒剂.