利用简并引物检测金黄色葡萄球菌肠毒素A、B基因

通过设计简并引物建立一种PCR技术同步快速检测金黄色葡萄球菌肠毒素A和B基因的方法。根据金黄色葡萄球菌肠毒素A、B基因编码序列,设计一对特异性简并引物SEAB来扩增靶基因片段,长度分别为105bp和135bp,通过对金黄色葡萄球菌肠毒素A、B菌株和4株对照菌株进行PCR检测,评价该引物的特异性;对金黄色葡萄球菌肠毒素B的DNA系列10倍稀释,对其灵敏性进行PCR检测。结果显示,金黄色葡萄球菌肠毒素A和B菌株的DNA检测结果呈阳性,4株对照菌株的检测结果呈阴性,通过基因测序证实了PCR产物的特异性,SEB的DNA最低检测浓度为3.58ng,整个检测过程不超过20h。建立了一个特异、快速灵敏的在同一条件下,金黄色葡萄球菌肠毒素A、B基因的PCR检测方法。     

PCR检测食品中金黄色葡萄球菌肠毒素基因

目的:检测食品中金黄色葡萄球菌肠毒素基因谱携带情况,探讨与食物中毒发病相关的金黄色葡萄球菌基因类型。方法:取食品中检出的金黄色葡萄球菌进行分离培养鉴定,通过PCR技术检测样本18种不同型的肠毒素基因的携带情况,并进行统计学分析。结果:食品中检出的金黄色葡萄球菌肠毒素基因有较高的阳性检出率,主要检出sea、seb、sei、seg、sel、sem、sen等基因,其中sea基因检出率最高,达到77.27%;sei、seg、sem、sen基因具有相关性,检出率为9.09%;seb、sel基因的检出率为4.55%。结论:在食品中主要检出金黄色葡萄球菌肠毒素sea、sei、seg、sem、sen、seb、sel等基因,其中,sei、seg、sem、sen基因的相关性还有待进一步深入研究。     

多重PCR检测金黄色葡萄球菌六型肠毒素基因的研究

目的:为了建立一种简单、快速检测金黄色葡萄球菌六型肠毒素基因的多重PCR方法。方法:根据相关文献和Genebank报道的编码金黄色葡萄球菌肠毒素A、B、C、D、E、H的基因序列,选择合成了6对特异性引物,建立多重PCR体系,并对反应条件进行了优化。结果:6对引物能同时特异地扩增出120、478、257、319、170、375bp的目的片段,表明6对引物具有良好的特异性。结论:成功地建立了一种同时检测金黄色葡萄球菌六型肠毒素基因的多重PCR方法,在金黄色葡萄球菌肠毒素快速筛查方面具有良好的应用前景。     

应用通用引物PCR法对葡萄球菌B、C1、C2、C3型肠毒素基因的鉴定与分型研究

本实验采用通用引物P1、P2聚合酶链反应(PCR)法对产肠毒素葡萄球菌的entB、entC1、entC2、entC3基因进行了扩增,结果表明,含有这四种肠毒素基因的葡萄球菌都可以产生595bp的特异性扩增片段,其余菌扩增均为阴性;扩增产物分别用在产物内部只有单一识别位点的限制酶HinfⅠ、BclⅠ、MboⅡ和MboⅡ酶切后产生大小不同的片段,因而可以达到酶切分型的目的。经敏感性试验表明,该方法可以检出10~0个细菌。     

PCR法检测原料乳中金黄色葡萄球菌肠毒素A基因型

通过建立PCR方法来检测原料乳中金黄色葡萄球菌肠毒素A基因型,优化其退火温度并验证了其敏感性、特异性.结果表明此方法在退火温度为58.7℃时扩增效果较为理想;灵敏度为1.357 pg/μL;以大肠杆菌、枯草芽孢杆菌、嗜热链球菌、志贺氏菌、沙门氏菌的基因组DNA为模板作为特异性检测对照组并分别进行PCR扩增反应,结果为阴性.同时对采集的乳样进行检测,乳房炎乳样中检测出了金葡菌肠毒素A基因,正常乳中没有检测出金葡菌,初步判断乳房炎是由金葡菌引起的.     

金黄色葡萄球菌B型肠毒素基因的克隆与测序

本文利用聚合酶链反应扩增出１６９ｂｐ的金黄色葡萄球菌Ｂ肠毒素基因片段,经过纯化后,通过Ｔ载体进行连接,转化,克隆出所需的质粒并进行测序,证明了ＰＣＲ扩增片段序列的正确性,为开展ＳＥＢ的研究和检测打下基础。     

基于qPCR检测金黄色葡萄球菌3种肠毒素基因的方法研究

目的建立同时检测3种可引起食物中毒金黄色葡萄球菌肠毒素sea、seb、sec基因的方法。方法对GenBank中公布的sea、seb、sec基因序列进行分析,针对3种肠毒素基因分别设计3对特异性引物和探针,通过条件优化建立检测肠毒素sea、seb、sec基因的三重qPCR方法。结果该方法可以特异性检测到sea、seb、sec基因,而与其他病原菌或肠毒素基因无交叉反应;对肠毒素sea、seb、sec基因的最低检测量分别为10.2、1.63、9.4 copies/μL;组内和组间的变异系数均小于5%。结论该方法快速灵敏、准确可靠,为金黄色葡萄球菌肠毒素的快速检测及多重qPCR试剂盒的开发奠定基础。     

葡萄球菌肠毒素基因分型PCR检测技术的研究

通过生物信息学分析,设计了不同基因型肠毒素检测引物;应用含溶菌酶的碱裂解法提取葡萄球菌DNA及梯度PCR方法提高了肠毒素检出率和特异性.从国内28株葡萄球菌分离株中共检测出14种不同型的肠毒素基因(sea-see、tsst-1、seg-sel、sek-sel、sen-seo、seq-ser和seu),未检测到sei和sem基因.毒素基因携带率为16.67%,同时携带4种及以上毒素基因的菌株有11株,占39.29%,其中sek、seq和sea毒素基因在所研究菌株中分布最广,分别占到15.50%、14.30%和10.70%.结果表明不同葡萄球菌菌株间毒素型的关联度不同,sek与seq,seb和sed,sec、sei、sen和seu基因型呈现密切相关,各型肠毒素的分布还与菌株分离来源有着密切联系.所建立的PCR方法可用于金黄色葡萄球菌肠毒素基因分型和分布的研究.     

TaqMan探针荧光定量PCR检测金黄色葡萄球菌肠毒素D

建立了检测乳中产肠毒素D的金黄色葡萄球菌的荧光定量PCR方法,以SED基因为肠毒素D的检测靶序列,设计荧光定量PCR引物和Taq Man探针,将构建的重组质粒作为阳性对照,建立了对产肠毒素D金黄色葡萄球菌快速检测的Taq Man探针荧光定量PCR方法,并评价该方法的特异性、灵敏性和重复性。结果显示,Taq Man探针实时荧光定量PCR检测金黄色葡萄球菌肠毒素D的方法具有极强的特异性,标准曲线的相关系数为0.999,最低可检测到40copies/m L的阳性质粒,检测乳中产肠毒素D金黄色葡萄球菌的灵敏度为1.0×102CFU/m L。该检测方法具有较好的特异性和灵敏性,在产肠毒素D金黄色葡萄球菌快速筛查方面具有良好的应用前景。     

免疫捕捉通用引物PCR检测食品中沙门氏菌

利用免疫吸附富集结合经典PCR 技术建立免疫捕捉通用引物PCR(IC-UPPCR)检测食品中沙门氏菌。采用细菌16S rRNA 基因保守区设计特异性引物,建立通用引物PCR 技术是可行的,该IC-UPPCR 检测沙门氏菌的灵敏度最低,能检测到2 × 102CFU/ml,检测沙门氏菌属和非沙门氏菌属标准株的特异性为100%,无假阳性和假阴性出现。结果表明该方法具有简单、快速、特异性好和敏感性高等特点,并可满足大批样品沙门氏菌筛选检测的要求,适用于食品卫生监管、商品检验检疫以及临床诊断等领域。     

Selection of Universal Primers for PCR Quantification of Total Bacteria Associated With Fish Fillets

An optimal universal primer pair DG74/RW01 for quantitative PCR detection of the mixed bacterial flora from fish fillets was selected from five pairs of primers. The minimum detection limits with GelStar™ and ethidium bromide (EB) used as agarose stains for DNA bands with these primers were found to be 5 and 1 × 10² CFU/PCR, respectively. The liner range of DNA amplification was from 50 to 1 × 10⁵ with GelStar™ and from 5 × 10² to 1 × 10⁵ with EB.     

Selection of Universal Primers for PCR Quantification of Total Bacteria Associated With Fish Fillets

An optimal universal primer pair DG74/RW01 for quantitative PCR detection of the mixed bacterial flora from fish fillets was selected from five pairs of primers. The minimum detection limits with GelStar? and ethidium bromide (EB) used as agarose stains for DNA bands with these primers were found to be 5 and 1 × 10² CFU/PCR, respectively. The liner range of DNA amplification was from 50 to 1 × 10⁵ with GelStar? and from 5 × 10² to 1 × 10⁵ with EB.     

用通用引物扩增细胞色素b基因进行牦牛肉的鉴定

本研究的目的是建立牦牛和黄牛肉的基因水平鉴定方法。从牦牛、黄牛和四川几个地方黑山羊品种的肉中提取基因组DNA,采用一对通用引物扩增细胞色素b基因中一段长度为421bp的序列,并进行了克隆测序。结果显示,通用引物能很好地扩增不同动物细胞色素b基因,扩增片段序列在牦牛与黄牛之间存在差异较大,能用于这两种肉的鉴定;而在金堂黑山羊、白玉黑山羊和美姑黑山羊之间差异非常小。本研究建立了PCR-RFLP方法鉴定牦牛和黄牛肉,这对于动物保护以及来源不明的肉类产品的区分具有实际应用价值。     

通用多重不对称PCR结合寡核苷酸芯片检测7种食源性致病菌

应用通用多重不对称聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)和寡核酸芯片技术建立一种同时检测7种常见食源性致病菌的方法。每种致病菌上游或下游引物5’端连接一段异源的共有序列。以荧光标记的该共有序列作为通用引物,与限制性特异引物经一步多重不对称PCR同时获得所有目标菌的单链标记靶序列,可被芯片上固定的特异性寡核苷酸探针捕获。通过芯片扫描、分析荧光信号完成检测。标准菌株检测结果证实,该方法可特异地检测单一和混合感染的目标菌,基因组DNA的检测灵敏度为0.1~1 pg。95份模拟污染和零售食品样本芯片检测结果与常规的分离与生化鉴定及荧光定量PCR结果一致。建立的寡核苷酸芯片方法可为快速、特异、灵敏及高通量地鉴定食源性致病菌提供一种有效的检测手段。     

啤酒污染乳酸菌PCR引物的设计与验证

根据细菌16SrDNA序列的特点,对啤酒中常见污染乳酸菌16SrDNA序列进行分析,设计合成了针对啤酒污染乳酸菌的特征引物。并用该引物对从啤酒厂分离到的7种乳酸菌进行了检测,PCR结果表明该引物能够准确检测到啤酒中常见的乳酸菌。     

Primers for Amplifying an Alanine Racemase Gene Fragment to Detect E. coli Strains in Foods

Specific oligonucleotide primers for detecting Escherichia coli in various foods were designed based upon the conserved sequences of the E. coli air gene from positions 322 to 345 and from 664 to 687. Bacteria and food samples were treated at 100°C for 10 min in 1% Tween 20 containing 5% NaCl and 1 mM EDTA, then used as templates for polymerase chain reaction (PCR). The oligonucleotide primers were specific to E. coli, except for Shigella species, when tested with 67 strains of E. coli, including such serotypes as O157:H7 and O111, and 32 strains of non-E. coli species. The oligonucleotide primers could prove useful for detecting E. coli in beef, chicken, pork, tomato, soybean, potato, cow's milk, and egg.     

通用型酵母菌实时荧光PCR检测方法的建立

为建立一种快速检测鉴定食品中酵母污染菌实时荧光PCR法,根据酵母基因序列设计出通用型探针和引物,建立了运用实时荧光PCR法检测酵母的反应体系和反应条件,进而对该方法进行特异性验证,灵敏度分析及稳定性评价,并应用于产品样本的检测。特异性试验表明,酵母菌检测结果均为阳性,而细菌、霉菌均为阴性,荧光PCR检测结果的特异性为100%。灵敏度试验表明,酵母菌检出限在760 cfu/m L。稳定性试验表明,酵母菌组内实验CV在0.62~0.81%之间波动,而组间实验在0.43~0.77%之间波动。通过样品增菌检测发现在培养12 h后能检出阳性。本研究所建立的实时荧光PCR法特异性好、灵敏度高、稳定性好,具有快速、简便的特点,为快速检测食品中酵母污染提供新的方法和途径,具有很好的研究价值和应用前景。     

食源性致病菌焦磷酸通用引物测序方法的建立

建立一种利用焦磷酸测序技术检测和鉴定沙门氏菌(Salmonellla)、单核细胞增生李斯特菌(Listeria monocytogenes)、金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)和志贺氏菌(Shigella)的方法。通过对4种菌16SrRNA的保守序列可变区的同源性分析,设计出一套适合焦磷酸测序的扩增引物和测序引物,通过可变区位点差异,利用一套通用引物同时鉴别4种食源性致病菌,测序结果与数据库比对判断细菌种属。结果表明:建立的检测方法可在4 h内完成对4种菌的鉴定,测序鉴定结果与国标的传统生化方法完全一致,焦磷酸测序技术可用于食源性致病菌的检测和鉴定。     

公共引物介导的多重定量PCR技术在转基因大豆检测中的应用研究

目的 建立公共引物介导的多重定量PCR法检测我国农业农村部允许进口的6种转基因大豆(包括:MON87701、DP356043、CV-127、MON87769、MON87705、MON87708)的方法.方法 设计并筛选出针对本研究涉及的6种转基因大豆对特异性引物,在每对特异性引物的5'端均加上一段公共引物,形成特异性嵌...