H5N1禽流感病毒蛋白对1F1TM基因家族转录的影响

干扰素诱导的跨膜蛋白(Interferon induced transmembrane protein,简称IFITM)通过抑制病毒进入细胞来保护细胞,使其免受多种病毒的感染。为了鉴定H5N1病毒本身和结构蛋白是否作为IFITM基因的新调节因子,通过试验探讨了H5N1病毒和结构蛋白对IFITM基因家族转录的影响。结果显示,H5N1病毒的NS1、M1、NP和PB2蛋白在A549细胞中增加了IFITM1、IFITM2和IFITM3表达,对HEK293T细胞没有影响,在HEK293T细胞和A549细胞上,没有发现H5N1病毒的HA和NA蛋白影响IFITM基因家族表达。即在H5N1禽流感病毒感染期间,NS1、M1、NP和PB2蛋白的过表达可以直接刺激IFITM1、IFITM2和IFITM3的上调,而呼吸系统的上皮细胞可能首先被影响,特别地,NP和NS1显示对IFITM基因家族的表达显示更显著的作用。     

一类H1N1型流行病模型的研究

建立了一类描述H1N1型流行病的常微分方程模型,利用常微分方程动力系统的理论,研究了所建立的模型,得出了该系统的奇点以及奇点的类型,得出结论,在H1N1流感的控制中,政府行为是控制疾病流行的重要的元素。     

基于小波核支持向量机的蛋白质二级结构预测

提出一种基于小波核支持向量机分类模型,将其用于SARS蛋白质二级结构预测.实验表明,该模型与其他同类方法相比,提高蛋白质二级结构预测的准确度达到1%～2%.     

甲型H1N1流感传播的SIR模型研究

建立了一个甲型H1N1流感传播的改进SIR模型,并用微分方程数值解中的四阶Runge-Kutta方法进行求解。用墨西哥的病例数据对模型验证表明,结果与真实数据基本吻合。SIR模型所得数据与GM(1,1)灰色预测模型数据及二次、四次曲线拟合数据作比较,可知SIR模型误差最小。     

甲型H1N1流感网络报道中的受众观

2009年3月底至4月中旬,墨西哥、美国等地接连爆发新型猪流感病毒疫情。国内各大网站针对疫情发展情况建立了专题,进行长时间、大规模、及时性的追踪报道,书写了网络新闻史上独特的篇章,报道中体现了网络新闻发展过程中的诸多新特点,其中最为显著的是网络报道中的受众观。     

针对目标机动的变结构制导参数设计

目标机动是影响导弹制导性能的重要因素.文章以变结构制导导弹为研究对象,以导弹与目标相对运动方程为依据,就目标机动和变结构制导项对视线角速度和弹道需用过载的影响做了理论分析,提出了一种针对目标机动的变结构制导参数设计方法.在此基础上,提出用模糊控制理论设计变结构制导项.仿真结果表明,所设计的模糊变结构制导律能够有效抑制目标机动对制导精度的影响.     

CNAS在防控甲型H1N1流感工作中积极发挥作用

中国合格评定国家认可中心（CNAS）积极发挥在实验室生物安全方面的技术专长和优势,在我国防控甲型H1N1流感工作中做出了应有的贡献。 按照国家认监委主任孙大伟的指示,CNAS组织专家对已认可的相关生物安全实验室进行专门核查或提前安排现场评审,及时向卫生、农业、检验检疫主管部门提供安全合格的生物安全三级实验室,为国家的防控工作提供了相关实验室的技术基础条件。     

基态自由基N_2H的结构与动力学特征

本文计算了基态自由基N_2H(~2A′)的平衡几何、离解能、偶极矩、力常数和振动频率。由此导出N_2H的分析势能函数,它正确地描述了反应N_2H→N_2 H和N_2H→NH N的动力学特征,其活化能分别为14.07和150.12Kcal/mole,逆反应的活化能分别为17.53和9.685Kcal/mole。N_2H中氢内迁移活化能为64.6Kcal/mole。发现了亚稳的氢键构型N—H…N。     

设计降雨特征的多变量分析方法

鉴于径流数据缺乏且难以长期监测,而降雨数据相对完整,通常假定降雨和径流同频率,以设计降雨作为前端输入进行水文分析.在重新定义设计降雨特征变量的基础上,针对目前普遍采用的基于单变量分析的暴雨强度公式法存在的不足,提出一种基于Copula函数的降雨特征多变量分析方法;并以广州1961—2012年历史降雨数据为例,分析了设计降雨量与降雨峰值组合风险概率.研究表明:基于Copula函数的降雨多变量分析能更加全面地反映降雨特征,有利于提高水文分析计算精度.该方法还可根据水文分析的需求进行2变量及以上的降雨特征量组合分析.     

出入境检验检疫部门口岸防控甲型H1N1流感有关工作情况

从2009年4月25日到7月5日下午18时,全国出入境检验检疫部门累计查验入境人员3084万人次,共发现发热、有症状并移送卫生部门8272人,确诊病例323人。累计查验航空器3．6万架次、船舶5万艘次、其他交通工具177万辆（列）。累计查验猪及其产品7．9万吨。累计查验入境人员携带物660万件次,截获禁止进境物品7万公斤,已作销毁处理;查验邮寄物150万件,截获禁止入境物品约1700公斤,已作销毁或退回处理。     

基于动态规划RNA二级结构的比较

从RNA的二级结构描述着手,建立基于向量的RNA二级结构树的描述方法,并以该种描述方法为基础,应用动态规划算法,以高致病性的H5N1病毒的NA片段为例,对RNA二级结构进行树状比较。比较结果发现,在时间复杂性上,该方法优于利用最小自由能的方法,并且致病性越强,该结构的相似性越高,对生物实验具有指导意义。     

三种启动子shRNA表达框的制备及其在筛选有效SiRNA中的应用

为能快速经济地获取小干扰核糖核酸 (small interfering RNA siRNA)，设计采用特异性延伸引
物和上游、下游两条通用引物，通过重叠延伸一步聚合酶链反应(PCR)法一次性快速、简捷地制备包含U6
+1、H1或tRNAVal在内的三种人小RNA多聚酶III启动子 小发夹状RNA（shRNA）表达框.用该方法制备的增
强型绿色荧光蛋白（EGFP）特异性三种启动子 shRNA表达框在转染HepG2细胞后有效地抑制了EGFP转基因
表达，其中以tRNAVal shRNA表达框抑制效果最显著，且未检测到干扰素应答基因2'5'OAS mRNA的表达，
表明该表达框可被有效转染并启动产生特异基因的RNA干扰效应，进而用于快速筛选最佳siRNA位点及其最
适搭配启动子.     

基于茎区的动态规划算法的核糖核酸二级结构预测

结合传统动态规划算法和组合优化算法在二级结构预测的优势,提出了一种以茎区为最小结构单元的新的动态规划算法。对于给定的RNA序列,首先得到所有可能的茎区集合,采用环依赖的方式计算二级结构的能量,通过茎区动态规划算法递归得到能量最优的二级结构,最后选取数据库中不同长度的已知二级结构的RNA序列进行测试。结果表明,该算法在特异性、敏感性和马休兹参数方面均优于遗传算法,在计算复杂性方面低于传统的动态规划算法。     

RNA二级结构预测SVMs模型研究

扩展NSSEL标签,对RNA分子中的stem-loop结构和伪结结构进行标记.将RNA分子序列中的碱基编码输入,经过支持向量机(support vector machines,SVMs)模型计算输出相应的结构标记.该模型经过训练后,待预测的RNA分子序列可得到对应的结构标识序列,这些标识序列可通过特定算法,唯一构建包括伪结在内的二级结构.实验结果表明,该算法在可接受的预测精度范围内具有较低的计算复杂度,克服了传统算法计算时间过长,无法在有限时间内得到有效结果的缺点.     

基于局部结构交互的RNA假结预测

基于RNA局部结构间的交互作用,提出一种含假结的RNA二级结构预测新方法LIFold。对给定的RNA序列,首先通过能量计算得到不含假结的能量最优结构,然后应用局部结构交互配对生成假结茎区,在已得到的最优结构基础上构建含假结的能量计算模型,最后通过优化算法得到含假结的RNA二级结构。应用该方法基于HotKnots测试数据的敏感性和阳性预测值(PPV)分别达到84%和80%,基于PseudoBase数据库测试数据的敏感性和阳性预测值分别达到78%和73%,与HotKnots、ILM、PknotsRG、IPknot及FlexStem等知名软件相比较,准确率均有所提高。     

GLP-1受体siRNA表达载体的构建

为了考察胰高血糖素样肽1受体在神经保护过程中的作用,设计并构建了胰高血糖素样肽1受体的干扰质粒,通过转染PCI2细胞,对其干扰效率进行了分析,获得了对glp—lr基因有较好干扰效率的siRNA质粒,为今后研究GLP一1受体的功能提供了实验材料．     

基于奇异值分解的RNA二级结构相似度计算方法

针对传统的核糖核酸(RNA)分子结构相似度计算方法存在复杂度高、未能充分考虑二级结构全局信息的缺点,基于一种7维序列编码方法，提出了一种利用矩阵奇异值分解提取RNA二级结构数据分布特征的算法，利用提取出的奇异值向量,基于向量距离进行RNA二级结构相似度比对.通过对Yeast tRNA phe、PSTV、poliovirus mutant 3种RNA分子二级结构构象的实验分析，表明了该方法的可行性和高效性.并将这种方法推广至任意两个RNA分子之间二级结构的相似度衡量，同样取得了不错的效果.     

包括假结的RNA二级结构茎区组合预测新算法

提出了RNA茎区组合最优能的概念,给出了RNA茎区相容定义,利用相容矩阵与迭代矩阵以求出具有全局最大最优能的RNA茎区组合,建立了一种能够预测带假结的RNA二级结构的新方法。通过选取PseudoBase中的RNA序列,将预测得到的RNA二级结构与数据库上提供的RNA二级结构进行比较,同时用pknotsRG软件运行同样的数据与本方法得到的RNA二级结构进行比较,NGF-L2和NGF-H1的最好的敏感性、特异性均达到100%。试验结果与分析数据表明,本方法可靠、有效,具有较高的准确率,可以预测假结结构,尤其是tRNA类型的序列执行起来速度较快。     

有序树的计数及其应用

利用分拆-组装算法,构造了含有k+1个内点的有序树与森林之间的双射,讨论了在某些参数限制条件下的有序树的计数,并在建立RNA二级结构与非标号有序树之间的双射基础上,给出了满足一定参数条件的RNA二级结构计数问题的显示闭公式.