烟草基因组知识篇:4.结构基因组学

基因组学的研究可分为两方面：以基因组测序为目标的结构基因组学和以功能鉴定为目标的功能基因组。结构基因组学是在基因组学研究的早期阶段,着重进行基因作图、序列分析以研究基因组成、定位的科学。染色体不能直接用来测序,必须将基因组分解成容易操作的较小的结构,     

烟草基因组学研究方法篇:1.烟草突变体的创制及其在功能基因组学研究中的应用

从2000年6月26日参与"国际人类基因组计划"的美、英、日、法、德、中6个国家16个研究中心联合宣布人类基因组"工作框架图"开始,人类历史进入了一个崭新的时代即后基因组时代。其研究内容主要包括功能基因组学、转录物组学、蛋白质组学、代谢物组学、比较基因组学等,可在全基因组水平     

烟草基因组学研究方法篇:3.烟草功能基因组学中的功能缺失与功能获得策略

功能基因组学研究中,常常通过改变基因的表达水平,然后观察其生物学性状、环境适应性以及生理或代谢途径等方面的变化来研究基因相应的生物学功能。这种研究策略包括强制性地沉默或升高特定基因的表达水平,即功能缺失(loss of function)和功能获得(gain of function)策略。     

烟草基因组学研究方法篇:4.烟草分子标记技术及其应用

随着分子生物学的迅速发展,从DNA双螺旋结构的阐明,PCR技术的诞生,全基因组的测序,使分子标记技术从蛋白质水平向DNA分子水平逐步深化,DNA分子标记技术研究始于19世纪80年代,是指能够反映生物个体或种群间基因组中某种差异的特异性DNA片段,是DNA水平上遗传多态性的直接反映,是生物分类学、育种学、遗传学和物种起源与进化等研究的重要技术指标之一。     

烟草基因组学研究方法篇:5.烟草蛋白质组学研究方法和应用

蛋白质组(proteome)最初指细胞内全部蛋白质的存在及其活动方式,后引申指一个基因组编码的全部蛋白质。蛋白质组研究是生命科学研究进入后基因组时代的里程碑,也是后基因组时代生命科学研究的     

烟草基因组学研究方法篇:6.生物信息学在烟草基因组研究中的应用

生物信息学是随着基因组测序数据迅猛增加而产生的一门新兴学科。人类基因组计划的顺利完成和新一代测序技术的发展推动了更多动植物基因组测序计划的开展。所产生的海量生物学数据需要通过数据分析和处理得到有用的信息,揭示其所隐藏的生物学内涵。生物信息学正是为迎接这一严峻挑战而发展起来     

烟草基因组知识篇:1.基因组与烟草基因组计划

为配合国家烟草专卖局烟草基因组计划重大专项的实施,全面开展烟草基因组学研究,深入挖掘烟草功能基因,培育具有中国特色的烟草超级品种,本刊自本期起开辟烟草基因组专栏,着重介绍烟草基因组知识、基因组学研究方法、烟草重要性状基因及烟草基因组计划的重大进展等,欢迎广大作者踊跃投稿。     

烟草突变体筛选与鉴定方法篇:2.烟草抗主要病虫害突变体的筛选与鉴定

参照烟草品种抗病性鉴定标准GB/T 23224—2008,烟草基因组计划重大专项"烟草突变体创制、筛选与分析"建立了烟草抗病毒病、青枯病、黑胫病、赤星病、烟蚜的高通量筛选方法,将全面开展烟草抗主要病虫害突变体的大量筛选与鉴定工作。     

烟草突变体筛选与鉴定方法篇:1.烟草突变体的筛选与鉴定

烟草基因组计划重大专项2011年研究项目"烟草突变体库创制、筛选与分析"实施1年后,通过化学和生物方法创制并收获了15万份烟草突变二代种子;建立了2个序列筛选方法和10个表型筛选方法并进行了初步筛选。2012年始,该项目将全面开展烟草各种突变体的大量筛选及鉴定工作。     

烟草重要基因篇:14.烟草类黄酮合成相关基因

类黄酮是烟草中普遍存在的多酚化合物,是烟草重要的致香前体物质,其合成代谢是烟草香气物质形成的重要途径。对近年来烟草类黄酮合成相关基因的研究进展进行了综述,并展望了其在烟草中调控重要基因表达和提高烟叶品质中的应用潜力。     

烟草基因组知识篇:3.基因组注释

<正>在完成序列的拼接后,得到的是很长的DNA序列、甚至可能是整个基因组的序列。这些序列中包含许多未知的基因,将基因从这些序列中找出来是基因组注释的主要内容。基因组DNA序列可分为两大部分:基因及其相关序列、基因间序列。以起始密码子开始、终止密码子结束、称之为开放阅读框(open readingframe,ORF)的序列为基因序列,它们可编码蛋白质和RNA(非编码RNA),所以又称为编码序列;基因相关序列包括拟(假)基因(pseudogene)、基因片段、内含子、非翻译区(untranslated region,UTR)等[1]。基因间序列主要是一些重复序列,它们是所有基因组尤其是真核生物基因组共同的重要特征。     

烟草突变体筛选与鉴定方法篇:5.烟草耐低钾突变体的筛选与鉴定

烟草是喜钾作物。除了作为重要的营养元素发挥作用外,钾与烟草的抗逆性、抗病虫害能力密切相关;钾含量也是烟叶品质评价的重要指标之一。基于钾素的重要性和我国土壤普遍低钾的国情及国内烟叶钾含量低的现状,开展烟草钾营养基础研究、选育耐低钾/钾吸收高效型烟草品种等工作极为迫切[1]。     

烟草基因组知识篇：2．基因组测序

基因组计划的最终目标是获取所研究生物体的全部DNA序列,一般包括三个图谱,即遗传图谱、物理图谱和基因组全序列图谱,并将基因以及其他有意义的特征定位于DNA序列中.人以及模式生物的染色体都不能直接进行DNA测序,因此首先必须将它们随机地"敲碎"(通过限制性内切酶酶切或超声波处理或DNA酶Ⅰ降解)变成成千上万的小片段,构建成不同水平和类型的基因组文库,例如YAC(yeast artificial chromosome,酵母人工染色体)文库、BAC(bacterial artificial chromosome,细菌人工染色体)文库和cDNA文库等.然后对文库中的每个克隆片段进行DNA测序,再对所有测定的每条序列经过计算机程序处理装配成染色体上完整的DNA序列.     

烟草病毒病检测方法的研究现状

目前针对烟草花叶病毒病、烟草黄瓜花叶病毒病、马铃薯Y病毒病的检测方法主要有指示植物法、电镜诊断法、血清学检测法、核酸分子杂交技术、以PCR为基础的分子生物学技术等,通过阐述这些检测方法的原理,分析其优势及不足,为烟草病毒病检测技术的发展提供科学依据及理论参考。     

烟草突变体筛选与鉴定方法篇:3.烟草突变体的TILLING筛选与功能鉴定

TILLING(targeting induced local lesions in genomes,定向诱导基因组局部突变)是利用单核苷酸多态性筛选突变体的一种全新反向遗传学方法,该方法首先通过化学诱变产生高频率点突变,再利用点突变筛选技术如毛细管电泳(capillary electrophoresis,CE)、聚丙烯酰胺凝胶电泳(polyacrylamide gel electrophoresis,     

烟草突变体筛选与鉴定方法篇:4.烟草抗干旱突变体筛选与鉴定

烟草经甲基磺酸乙酯(EMS)诱变处理可以分离得到多种突变体,这些突变体的获得将为揭示烟草生长发育规律奠定基础。烟草突变体的筛选已成为许多重要理论问题得以解决的前体,而筛选方法是突变体筛选成败的关键。干旱是影响植物生长发育的主要环境因子之一[1]。烟草在生长过程中,特别是从团棵期进入旺长期常常遭遇干旱,干旱已经成为影响其营养生长的重要因素。利用突变体材料筛选烟草抗旱突变体,不仅可为     

烟草重要基因篇：1.烟草抗病相关基因

烟草是重要的经济作物之一,也是研究植物与病害互作的主要模式生物.烟草病害种类泛多,对烟草危害较为严重的病害有黑胫病、赤星病、青枯病、烟草普通花叶病、黄瓜花叶病、马铃薯Y病毒等.化学药剂防治会引起环境污染、农药残留、烟叶安全性等问题,而培育烟草抗病新品种是解决这些问题的根本途径.烟草抗病相关基因或分子标记的获得可高效靶向加快培育烟草抗病新品种的步伐.     

用血清学方法检测山东烟草病毒病流行趋势

用血清学方法对烟草病毒进行检测,同时进行生物学测定和电镜观察,研究结果表明:现山东烟区烟草病毒病的流行种类与以前的报道有较大改变。其流行趋势是马铃薯 Y 病毒病(PVY)由次要病害上升为主要病害,黄瓜花叶病(CMV)依然严重,且病毒的复合感染加重。烟草黄斑坏死病(PVY—T)和烟草脉带花叶病(TVBMV)在山东省首次发现。     

烟草转基因检测方法的研究

通过试验研究,提出了烟草转基因检测方法和标准,首先提取样品DNA采用260－280nm波长扫描测定提取物DNA浓度和纯度,并利用叶绿体不编码蛋白基因序列PCR扩增确定模板质量,同时进行35s启动于,NOS终止子的PCR扩增,对于未出现特异性扩增的样品进行35s和NOS的巢式PCR反应,对于出现目标长度片段扩增的样品再次提取DNA重复检测,并利用限制性内切酶酶切、巢式PCR、探针杂交和目的基因序列扩增进行验证,确定所转目的基因种类。并应用竞争性PCR测定样品中转基因阳性成分含量。     

基于高通量测序的烟草粉螟基因组初步研究

为研究烟草粉螟基因组信息,基于低深度高通量测序,利用Illumina测序平台对烟草粉螟基因组进行了分析,采用K-mer法预测烟草粉螟基因组大小、杂合度和重复序列等基因组特征,并使用SOAP de novo软件对烟草粉螟基因组进行了初步组装.研究表明:①烟草粉螟预估基因组大小为546.4 Mb,杂合度为1.93％,重复序...