基于网络药理学的车前子治疗高脂血症作用机制研究

借助TCMSP、GeneCards和Drugbank等数据库筛选车前子活性化合物及相应靶点,与高脂血症靶点取交集,确定核心基因,利用核心基因构建PPI并进行GO和KEGG富集分析。结果显示,车前子与高脂血症相关的7个潜在活性成分和134个潜在有效靶点及脂多糖应答、对细菌来源分子的反应、对类固醇激素的反应等生物学过程。初步探讨车前子治疗高血脂症的作用机制,为其进一步实验探究和临床应用提供参考。     

基于网络药理学的天麻抗缺血性脑中风作用机制研究

使用SciFinder、CNKI、Pubchem、SwissADME及Swiss Target Prediction数据库得到天麻活性成分及靶点;利用Genecards、TTD及Drugbank数据库获得缺血性脑中风的潜在靶标;通过Venny在线软件平台得到天麻与疾病的交集靶点,并将其导入Cytoscape软件构建“成分-靶点”网络图;利用String数据库及Cytoscape软件构建PPI网络与核心靶点筛选;通过Metascape平台进行GO和KEGG富集分析。通过筛选获得天麻活性成分35个、天麻靶点498个;缺血性脑中风相关靶点1031个;天麻与疾病共同靶点170个;GO富集分析得到1914条生物过程、111条细胞组分表达过程、190个与分子功能相关的过程;KEGG富集分析得到306条信号通路。天麻可能通过酚性化合物作用于关键靶点GAPDH、CASP3、STAT3、AKT1、MAPK3及MAPK8,发挥对cGMP-PKG、HIF-1、cAMP、AMPK等信号通路调节作用,干预细胞凋亡、血管再生、炎症反应、氧化应激反应及能量代谢障碍等机制防治缺血性脑中风。     

基于网络药理学探究银杏叶提取物治疗脑血管痉挛的作用机制

基于网络药理学方法预测银杏叶提取物治疗脑血管痉挛的潜在靶点及信号通路,阐述其作用机制。利用TCMSP平台筛选银杏叶中生物利用度(OB)≥30%和类药性(DL)≥0.18的活性成分,GeneCards和Swiss Target Prediction数据库检索脑血管痉挛疾病相关蛋白靶点和活性成分的相关靶点,并用Venny平台获取活性成分与脑血管痉挛疾病之间的共有靶点,STRING数据库构建靶蛋白之间的相互作用网络图(PPI),进行GO生物功能模块分析、KEGG通路富集分析,并采用Cytoscape软件构建可视化的"活性成分-潜在靶点"网络图。从银杏叶中筛选出27个活性成分,脑血管疾病和活性成分共有82个靶点,银杏叶提取物治疗脑血管痉挛疾病涉及到EDNRA、APOB、EGFR、EGF、EDN1等多个靶点,以及HIF-1信号通路、肿瘤坏死因子信号通路、类风湿性关节炎等相关通路。银杏叶提取物具有治疗脑血管痉挛疾病的功效可能是由多个活性成分作用于多个相关靶点,通过调节多个通路的共同结果。     

基于网络药理学的苦地丁治疗肠炎的作用机制研究

目的：基于网络药理学分析苦地丁作用于肠炎的活性成分、靶点和信号通路,探讨苦地丁治疗肠炎的作用机制。方法：使用TCMSP平台获取苦地丁的主要化学成分及对应的基因靶点,再用Uniprot数据库将靶点信息标准化。通过Gene Cards数据库搜索筛选肠炎靶点。使用Venny2.1取药物-疾病靶基因的交集,用Cytoscape3.7.2软件构建苦地丁治疗肠炎的活性成分-靶点网络,通过String数据库分析共同基因的蛋白质间相互作用程度,构建蛋白质相互作用(PPI)网络,使用Metascape数据库对共同基因进行基因本体(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析。结果：筛选得到苦地丁22个活性成分,71个相应靶点,得到2539个肠炎相关靶点,其中有34个苦地丁治疗肠炎的潜在靶点。富集分析显示苦地丁治疗肠炎主要作用的信号通路有癌症途径、cAMP信号通路、VEGF信号通路、cGMP-PKG信号通路等47个。结论：苦地丁可以通过多成分、多靶点、多通路发挥治疗肠炎的作用。     

基于网络药理学探讨盐酸雷洛昔芬治疗绝经后骨质疏松症的作用机制

目的：运用网络药理学研究盐酸雷洛昔芬治疗绝经后骨质疏松症潜在的作用靶点和作用机制。方法：通过GeneCards数据库收集盐酸雷洛昔芬与绝经后骨质疏松症的靶点,共同靶点的交集通过Venny 2.1工具获得,采用STRING数据库构建共同靶点的PPI(Protein-Protein Interation,PPI),使用可视化软件Cytoscape 3.9.1的McCreight算法（MCC）对PPI进行分析,筛选出排名前10的中枢基因（Hub genes）,通过DAVID生物信息学资源数据库进行GO生物功能、KEGG通路富集分析。结果：筛选出药物与疾病有168个共同靶点;关键靶点涉及STAT3、SRC、MAPK1、ESR1、JUN、PIK3R1、FOS、SP1、MAPK14和MYC等。盐酸雷洛昔芬可能通过调节STAT3、SRC、MAPK1、ESR1和JUN等关键基因,内分泌抵抗通路、糖尿病并发症晚期糖基化终末产物受体（AGE-RAGE）信号通路、脂质与动脉粥样硬化通路、与磷脂酰肌醇相关的PI3K-Akt信号通路等治疗绝经后骨质疏松症。结论：本文预测了盐酸雷洛昔芬治疗绝经后骨质疏松症的作用靶...     

基于网络药理学探究泽泻的治疗潜能和作用机制

目的:基于网络药理学探究泽泻的治疗潜能和作用机制.方法:查找大量泽泻的相关文献,从中筛选并整理出了泽泻的化学成分.利用Pubchem数据库下载有效成分的2D结构,通过Swiss Target Prediction数据库预测其成分的相关靶点,在Probability＞0.5条件下筛选有效成分及靶点,随后去重.去重后的靶点...     

基于网络药理学探究栀子保肝的作用机制

目的：基于网络药理学方法探究栀子保肝的作用机制。方法：检索中药系统药理学数据库(TCMSP数据库),筛选栀子的活性成分及靶点,利用Uniprot数据库对栀子靶点信息进行标准化,通过GeneCards数据库获取肝病相关疾病靶点,在Venny2.1在线平台上制作Venny图,获得栀子与疾病的共同靶点,通过Cytoscape软件构建药物-活性化合物-靶点-疾病网络,通过String数据库构建PPI网络,利用Metascape数据库对交集靶点进行富集分析。结果：筛选得到栀子保肝的核心成分为槲皮素、山奈酚与β-谷甾醇,核心靶点包括AKT1、TP53、TNF、IL6、Jun等。栀子保肝涉及的主要通路有癌症途径、脂质与动脉粥样硬化、乙型肝炎、AGE-RAGE信号通路、MAPK信号通路、PI3K-Akt信号通路等。结论：栀子的保肝作用具有多成分、多靶点、多通路的特点,为深入研究栀子保肝的作用机制奠定基础。     

黄芪治疗2型糖尿病的网络药理学研究

探索黄芪治疗2型糖尿病的分子机制,为中药单体成分治疗2型糖尿病药物的研发提供参考.采用网络药理学的方法筛选出黄芪关键活性成分8个,预测获得与2型糖尿病相关靶点204个,筛选出关键靶点35个,包括AKT1、IL6、VEGFA、TP53和EGF等.黄芪治疗2型糖尿瘸主要与细胞增殖、分化、凋亡、炎症等生物学过程有关.黄苠通过...     

基于网络药理学的小儿肺热咳喘颗粒治疗肺炎的作用机制探讨

目的：利用网络药理学探究小儿肺热咳喘颗粒(XFKP)治疗肺炎的作用机制。方法：利用TCMSP、TCMID、Symmap数据库筛选XFKP中活性成分及其作用靶点,通过Genecards、Drugbank、Pharmgkb等数据库收集肺炎疾病靶点。提取成分与疾病靶点的交集靶点,借助STRING数据库绘制共同靶点相互作用网络,并以中位值筛选靶点。对所筛选靶点进行GO分析和KEGG信号通路富集分析。结果：共获得XFKP潜在活性成分239个和对应靶点269个,成分与疾病的共同靶点136个,以中位值筛选出核心靶点24个。以此靶点进行分析获取GO生物过程条目1782个,细胞组成条目45个,分子功能条目111个,KEGG通路139条。Cytoscape软件构建有效成分-靶点-疾病-信号通路网络图,以平均度值筛选核心成分10个,靶点23个。结论：XFKP可能通过关键有效成分槲皮素、木樨草素、柚皮素等,靶向核心靶点EGF、MMP9、PPARG等,从而调节IL-17、MAPK、TNF等信号通路作用于肺炎。     

基于网络药理学探讨蒲公英对甲状腺结节的作用机制研究

目的：通过网络药理学方法研究蒲公英对甲状腺结节的作用机制。方法：利用TCMID数据库及Uniprot数据库筛选得到蒲公英的活性成分及标准化的靶点信息,通过Genecard数据库搜索得到甲状腺结节的靶点信息,用Venny2.1网站获得甲状腺结节与蒲公英的交集基因。使用Cytoscape软件建立蒲公英活性成分-靶点网络信息,采用String数据库建立PPI网络。通过Metascape数据库进行GO分析和KEGG富集分析。结果：共筛选出8个核心成分,31个核心靶点,346个生物学途径,173条KEGG通路。结论：蒲公英可能作用于癌症途径、脂质与动脉粥样硬化、PI3K-Akt信号通路、AGE-RAGE信号通路、MAPK信号通路等相关靶点及通路,以多成分-多靶点-多通路的特点作用于甲状腺结节。     

基于网络药理学分析金英黄归汤治疗乳腺炎的作用机制

构建金英黄归汤干预乳腺炎的"中药-活性成分-靶点-炎症通路"网络关系,预测其治疗乳腺炎的靶点及机制.采用网络药理学方法,通过数据库收集金英黄归汤中化合物,以口服利用度(OB)和类药性(DL)作为限定条件筛选活性成分,收集其作用靶点,并应用Cytoscape软件拓补分析主要靶点,利用GeneCards等数据库获取乳腺炎疾...     

基于网络药理学研究追风伞治疗骨关节炎物质基础及作用机制

目的:探讨追风伞(Lysimachia paridiformis Franch)治疗骨关节炎(OA)的物质基础和作用机制.方法:通过液相色谱-质谱(LC-MS)预测追风伞的主要有效成分,用Pubchem下载成分的2D结构随后使用SwissTargetPrediction数据库预测成分的靶点.使用TTD、GeneCard...     

基于网络药理学探究罗布麻治疗非酒精性脂肪肝的作用机制

目的：基于网络药理学方法探究罗布麻治疗非酒精性脂肪肝的作用机制。方法：检索中药系统药理学数据库及文献获取罗布麻活性成分及靶点,通过GeneCards、OMIM、TTD等数据库获取非酒精性脂肪肝病相关靶点。借用String数据库对罗布麻与疾病的共同靶点构建PPI网络;利用Cytoscape软件对共同靶点进行分析以得到罗布麻治疗非酒精性脂肪肝核心作用靶点,再利用DAVID数据库对共同靶点进行富集分析。结果：筛选得到罗布麻治疗非酒精性脂肪肝核心成分20个,核心靶点包括TP53、SRC、HSP90AA1等45个,涉及癌症、脂质和动脉粥样硬化、前列腺癌、乙型肝炎、AGE-RAGE等信号通路。结论：揭示了罗布麻治疗非酒精性脂肪肝的多成分、多靶点、多通路作用特点,为深入研究罗布麻缓解非酒精性脂肪肝病的作用机制奠定基础。     

基于网络药理学分析中药半夏的药理作用分子机制

基于网络药理学方法探讨中药半夏主要活性成分的药理活性,预测和分析其潜在的分子作用机制。首先使用TCMSP数据库筛选半夏的有效活性成分及作用靶点,并用Uniprot数据库将作用于人源靶点转成相应的基因名,而后运用STRING平台结合Cytoscape软件构建蛋白互作网络,再利用DAVID数据库进行GO生物学过程分析和KEGG信号通路富集分析,最后构建主要活性成分-靶点-通路可视化网络图。结果表明,半夏有12种主要有效成分作用于169个人源靶点,其中半夏的主要活性成分为黄芩素、β-谷甾醇、豆甾醇、松柏苷等。它们主要通过调控核心基因AKT1、FOS、JUN、TP53、VEGFA、MMP9、ESR1、CASP3、HSP90AA1、AR、PTGS2、RELA、PPARG、CYCS和PGR及关键基因PIK3CG、PRKACA、BCL2、ADRA1A,ADRA1B和ADRB2等靶点,经钙信号、激酶信号等途径,在治疗癌症、神经性疾病、内分泌代谢性疾病等方面发挥较强的作用。中药半夏具有多成分、多靶点、多途径的药理作用特点,为进一步对其药理药效作用机制的研究奠定了基础。     

基于网络药理学研究川芎防治偏头痛的物质基础及作用机制

目的:运用网络药理学技术探讨川芎(Ligusticum chuanxiong Hort.)治疗偏头痛的药效物质基础及作用机制.方法:通过TCMSP获得川芎化学成分,其中OB≥30％,DL≥0.18.用Chemicalbook和Pubchem下载各成分的2D结构,随后使用Wiss Target Prediction数据库...     

白术-白芍活性成分治疗肠易激综合征的网络药理学研究

基于网络药理学的方法预测白术-白芍中活性成分治疗肠易激综合征的作用靶点、信号通路、分子机制.检索TCMSP数据库查找白术、白芍活性成分及其作用靶点.检索OMIM、Genecard和Drugbank数据库富集疾病靶点并筛查交集靶点.采用String数据库与Cytoscape软件进行蛋白相互作用分析、靶点网络构建.通过Me...     

基于网络药理学探究西洋参治疗2型糖尿病机制

检索TCMSP数据库获取西洋参活性成分,借助SwissTargetPrediction、Targetnet平台预测和筛选西洋参成分的作用靶点。通过TTD、DrugBank数据库获取T2DM相关靶点。利用String数据库和Cytoscape3.7.1构建其相互作用网络关系图。运用Metascape进行GO、KEGG富集分析。西洋参治疗T2DM的潜在活性成分有10个,与42个潜在靶点及MAPK级联反应调控、血糖稳态调控、葡萄糖跨膜运输等生物学过程有关。     

基于网络药理学和分子对接的高根二醇抗溃疡性结肠炎的作用机制研究

运用网络药理学研究方法,对高根二醇作用潜在靶点与机制进行整合与分析,探究高根二醇抗溃疡性结肠炎(UC)作用机制.利用PharmMapper、uniprot对筛选出高根二醇的224个作用靶点,利用OMlM、Genecards数据库检索并筛选出608个疾病作用靶点,整合筛选出高根二醇和溃疡性结肠炎的共同靶点48个.使用Cy...     

基于网络药理学探讨半夏-麻黄的潜在有效成分及药理机制

目的：采用网络药理学方法探讨“半夏-麻黄”的有效成分及作用机制。方法：本研究利用TCMSP、UniProt、BATMAN、CTD数据库检索“半夏-麻黄”的化学成分、靶点、疾病,采用Cytoscape绘制半夏麻黄丸化合物-靶点、靶点-疾病网络图。结果：共获得25种候选化合物,筛选出285个靶蛋白,涉及32类疾病。结论：本研究系统地预测了半夏麻黄丸在癌症、心血管疾病、神经系统、消化系统等疾病上不同的治疗价值,为麻黄半夏丸的临床应用与研究提供了思路。     

基于网络药理学探索安宫牛黄丸中化学成分治疗新型冠状病毒肺炎的潜在机制

目的：本研究采用网络药理学的方法,探索安宫牛黄丸中化学成分防治新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的潜在作用机制。方法：使用TCMSP数据库检索安宫牛黄丸中各中药组分的化学成分及其作用靶点,通过Genecards检索COVID-19的疾病作用靶点,将得到的两部分靶点取交集后导入Cytoscape构建“中药-化学成分-靶点”图,通过DAVID数据库进行GO和KEGG分析。结果：通过筛选分析,得出安宫牛黄丸主要化学成分44个,作用靶点基因62个,主要靶点包括PTGS2、PTGS1、NOS2、CALM1、DPP4、PIK3CG、NOS3、F10、PPARG、CDK2等。GO和KEGG富集分析共得到444个GO富集条目和117个KEGG富集条目,涉及病毒、细菌、寄生虫的感染、免疫、炎症反应等相关通路。结论：安宫牛黄丸可能通过调控多靶点、多通路,发挥抗病毒、抗炎、调节免疫等作用,从而起到防治COVID-19的作用。