硫酸盐还原菌Anaerofilum Pentosovorans A9鉴定及其生长因子研究

应用Hungate厌氧技术,从大庆油田常规水驱采出液中分离到一株硫酸盐还原功能菌株A9,进行形态、生理生化、16S rDNA以及16S-23S rDNA间隔区序列鉴定以及生长因子研究.该菌株为G ,短杆状,能运动,具有硫酸盐还原功能,产H2S,兼性厌氧;能以水溶性聚丙烯酰胺为唯一碳源;A9菌株与Anaerofilum pentosovorans(AP716816S)的相似性水平达98%,初步鉴定可能为Anaerofilum属的新种,暂时命名为Anaerofilum pentosovoransA9.生长因子及其正交试验结果表明,pH、温度都达到极显著的水平,聚合物影响达到显著水平;菌株最适生长pH为8.0,喜中性偏碱环境;最适温度为40℃,属于嗜中温菌;聚合物质量浓度为600 mg/L生长较好,菌株对降低聚合物黏度效果明显;总矿化度最适生长范围为1.5×103-2.5×104mg/L.     

基于末端产物和基因序列的SRB菌系统发育分析

为实现细菌的多相分类,应用Hungate厌氧技术,从大庆油田采出液中分离到8株硫酸盐还原菌.通过对菌株的气相色谱末端产物测定,16S rDNA、16S～23S rDNA间隔区(ISR)序列克隆进行菌株的系统发育分析.结果表明:8株菌分别属于Salmonella(D2、I7)、Clostridium(F4、D10、H1)、Anaerofilum(A8、A18)、Enterobacter(E1).聚类分析表明,菌株的ISR序列长度差异较大,包含的tRNA种类和数目不同,间隔区序列可以作为16S rDNA序列系统发育分类的一个有力的补充;气相色谱末端产物相似的菌株,亲源关系比较接近,可以作为细菌鉴定的依据;其中16S rDNA序列作为细菌分类的主要依据,对存在争议的菌株,应该结合形态、生理生化特征和ISR序列以及气相色谱末端产物等综合对其进行系统分类.     

聚丙烯酰胺降解菌筛选与分子生物学鉴定

从大庆油田聚驱后油藏采出水中筛选出一株降解聚丙烯酰胺的细菌菌株——QSJU001.该菌株能在以聚丙烯酰胺为惟一碳源的无机盐培养基中生长.对该菌进行16SrDNA序列的分子生物学鉴定,测得的16SrDNA序列与GenBank中最相近的前10个菌株的相似性均为99%.利用该菌属与最相近的前10个菌株构建该菌种的系统发育树,结果显示该菌株与Acinetobacter baumannii strain KK14菌株的碱基差别最小.该菌的形态特征观察、生理生化特征检测、16SrDNA分子生物学鉴定结果表明,菌株QSJU001与Acinetobacter baumannii strain KK14亲缘关系最近,属于不动杆菌属.降解率实验结果表明,菌株QSJU001对聚丙烯酰胺降解率基本稳定在33%左右,对聚丙烯酰胺的降解效果较好.     

山药分子分类研究

提取山药基因组和叶绿体DNA作为模板,分别扩增山药核糖体18S rDNA和叶绿体核糖体16S rDNA片段.测序获得1646bp的山药核糖体18S rDNA和1351bp的山药叶绿体核糖体16S rDNA,GenBank登录号分别是JF703101和JF703100.将以上两个基因片段分别与GenBank中的一些物种的相关序列进行序列对比,结果表明,18S rDNA序列相似度较大,物种间差异较小.而叶绿体16S rDNA序列在分析不同科的物种演化关系上有较高的分辨率,为分子水平上山药资源的研究提供了资料.     

高效产氢新菌种的分离鉴定与16S rDNA全序列

为快速确定分离细菌的分类地位和获得高效产氢细菌,从生物制氢反应器活性污泥中,分离到一株高效产氢细菌.分离菌株能利用糖蜜废水生产氢气.分离菌株Rennanqilyfl的16S rDNA碱基为1517 bp,登记注册号为AY332397.为革兰氏阳性,杆菌,菌体端生2根鞭毛,鞭毛较长,无芽孢.菌株R1为中温嗜中性偏酸产氢菌,最佳生长代时为7.8 h.最佳生长温度为38℃;最佳生长pH为4.5;严格厌氧.单位体积产氢量(YH2)为1902.8 ml/L,每克干细胞最大产氢速率(QH2)为12.9 mmol/(g·h).该菌株的16S rDNA序列在GenBank中比较得出的最为接近的种分别来自Clostridium等5个菌属,其中与纤维素梭状菌亲缘关系最近,16S rDNA同源性为91%,其他则为89%-90%.新分离菌株Rennanqilyfl是一个与其最近的梭状菌属各成员都不相同的新种,暂命名为生物制氢菌属Biohydrogenbacterium Gen.Nov.Sp.Nov.     

16S rDNA测序快速鉴定废水生物处理系统目标细菌

在废水生物处理系统中建立分子生物学技术快速鉴定有关微生物,具有十分重要的意义．以发酵法生物制氢系统的活性污泥分离培养的厌氧发酵细菌为研究对象,采用16S rDNA碱基测序分子生物学技术,通过生物信息学数据库NCBI将DNA序列输入、比对,可以直接鉴定从废水生物处理系统中分离培养的细菌进行种属科的系统发育学地位的判定,从而简化了细菌鉴定程序．通过16S rDNA测序技术,进行了分离产氢细菌的分子生物学鉴定,发现生物制氢厌氧活性污泥中所分离的细菌可能存在的菌属有：Lactobacillus,Clostridium,Klebsiella,Pmpionibacterium和可能新发现的1个新属Biohydrogenbacterium等5个菌属的菌种,其中新属Biohydrogenbacterium的菌种都以利用碳水化合物生产氢气为其主要特征．16S rDNA测序技术为废水生物处理系统的细菌学研究提供了方便、准确和经济的技术基础．     

砂箱中柴油降解菌株的分离鉴定

以0#柴油为唯一碳源,从模拟生物修复柴油污染土壤的砂箱中筛选出4株柴油降解菌株B-1、B-2、B-3和B-4,根据形态学观察及16S rDNA序列比对分析,4株菌株分别属于微杆菌属（Microbacterium sp.）、短波单胞菌属（Brevundimonas sp.）、Tetrathiobacter kashmirensis、假单胞菌属（Pseudomonas sp.）,且菌株B-3是2005年在克什米尔某处果园土壤中新分离出来的柴油降解菌株。此外,通过比较各菌株的生长曲线,菌株B-3和菌株B-4较其他两株菌优先进入对数生长期,对加快柴油的生物降解意义重大。     

嗜盐菌AB3中细菌视紫红质和系统发育研究

为了研究分析嗜盐古生菌物种与细菌视紫红质(BR)蛋白基因资源,分离纯化得到极端嗜盐古生菌AB3. 采用聚合酶链式反应(PCR)方法对其编码螺旋C至螺旋G的蛋白基因片断和16S rRNA基因进行了扩增,并测定了基因的核苷酸序列. 翻译出的氨基酸序列与已报道的相应片断进行对比,AB3中的螺旋C至螺旋G蛋白与其他菌株差异显著.基于BR蛋白和16S rDNA序列的同源性比较以及系统发育学研究表明,AB3是Natrinema属中的新成员. 菌株AB3的16S rDNA序列已被GenBank数据库收录,其序列号为AY277583.     

海参肠道菌HS-A38的鉴定

对一株编号为HS-A38的分离自大连海域野生海刺参样品的细菌进行鉴定和抗菌活性研究.采用传统的分类学方法观察菌株HS-A38的形态,结合16S rDNA序列分析在GenBank上进行比对确立其进化地位.利用金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)、枯草芽孢杆菌(Bacillus subtili)、溶...     

一株生孢噬纤维细菌的16S rDNA 基因序列分析

利用双层平板法从土壤中分离获得了一株能够降解纤维素的好氧性滑动细菌--生孢噬纤维细菌Sporocytophaga sp.JL02,通过菌株基因组DNA的提取、16S r DNA的PCR扩增及克隆、16S r DNA的全序列分析等手段,对该菌株的16S rDNA的基因序列进行了研究.通过扩增,得到了一长度为1560bp的16S rDNA的基因,并对其基因序列进行了分析.     

木聚糖酶产生菌的分离筛选及酶学性质

利用透明圈法从云南腾冲温泉出水口土样中粗筛出12株木聚糖酶产生菌,其中Xylan-12菌活力较高,对其进行了16S rDNA部分序列测定,经BLAST同源性分析确定其为Bacillus flavothermus。对Xylan-12产生的木聚糖酶进行了酶学性质的初步研究,结果表明,该酶的最适pH为6,最适温度为65℃。     

利用16SrDNA序列分析和Biolog快速鉴定方法鉴定产脂肪酶菌株

采用16S r DNA序列分析和Biolog快速鉴定两种方法对分离得到的7株产脂肪酶菌株进行了分类鉴定.16S rDNA序列分析结果表明,7株产脂肪酶菌株中TCCC 11087、TCCC 11167、TCCC 11170、TCCC 11180,TCCC 11181属于不动杆菌属,株TCCC 11092、TCCC 11168属于假单胞菌属.Biolog快速鉴定结果显示,TCCC 11087、TCCC 11167、TCCC 11170.TCCC 11180、TCCC 11181 属于溶血不动杆菌,TCCC 11092属于假单胞菌属,TCCC 11168属于荧光假单胞菌.说明两种鉴定方法得到的结果一致,但16S rDNA序列分析方法只能鉴定到属,而Bioiog快速鉴定方法能对多数菌株鉴定到种.     

产絮凝剂微生物的分离与鉴定及其絮凝剂特性

从污水处理厂活性污泥中经富集、分离得到一株产絮凝剂的细菌Z-052,其发酵液对高岭土的絮凝效果达90%以上。采用16S rDNA序列分析法对该株菌进行鉴定,其核苷酸序列与Dia-phorobacter nitroreducens的同源性为98%,登录号AB076856.1,在细菌系统发育分类学上属于Diaphorobacter属。Zn2+离子对絮凝的促进作用效果最好,絮凝剂在100℃沸水中加热35 min絮凝活性下降小于5%。Z-052絮凝剂对活性炭、土壤、酵母等固体颗粒悬液的絮凝活性分别达到95.1%、80.4%和72.4%。     

一株耐盐菌EC51的生长特性及其系统发育分析

从大连市普兰店盐场盐池底部的淤泥中筛选出一株耐盐菌EC51,研究了分离菌株的形态和生长特性,该菌株为革兰氏阳性杆状菌。以其16S rDNA序列相似性为基础构建系统发育树。结果表明,EC51与Bacillus Pumilus的相似性达到99%。耐盐菌EC51的渗透压补偿溶质(Ec-toine)生成情况实验表明,用含2 mol/L NaCl的肉汤培养基,在30℃条件下培养48 h,诱导生成Ectoine为197.8 mg/L。     

一支产纤维素酶菌株的鉴定及产酶特性初步研究

本文对从皖南地区采集的森林腐木样本中,筛选获得TZT-01菌株进行鉴定.通过培养,观察菌落和个体染色形态,对其进行16SrDNA序列同源性分析,鉴定为枯草芽孢杆菌（Bacillus subtilis sp.）.对添加诱导物产纤维素酶的特性进行初步研究.     

一株Ectoine生成菌DL031的分离及特性研究

从大连普兰店盐场盐池土壤中分离到一株产渗透压补偿溶质Ectoine的菌株DL031,通过16SrDNA序列分析,菌株DL031与Halomonas marina相似性为99%.菌株DL031可在含有0～200 g/LNaCl培养基中生长,生长最适NaCl浓度为100 g/L.DL031菌株在含有NaCl的培养基中诱导能合成Ectoine;在含3 mol/L NaCl的培养基,30℃诱导培养48 h,Ectoine的合成量为98.8 mg/L.