基于传统分离培养和宏基因组测序分析不同产地小龙虾菌群的多样性

采用传统培养和宏基因组测序法研究浦口、太湖东山两产地小龙虾整体、表面、尾肉3个部位的初始菌群,解析其携带污染菌的差异。结果表明:浦口、太湖东山小龙虾的整体初始菌落总数差异不显著,分别为7.78 lg(CFU/g)和7.76 lg(CFU/g),而在选择性培养基上菌落数有明显差异,经16S rRNA序列鉴定,浦口小龙虾整体样品的优势菌为柠檬酸杆菌和气单胞菌,蜂房哈夫尼菌是太湖东山小龙虾整体样品的优势菌。在科水平上,宏基因组测序发现肠杆菌科肠杆菌是两产地小龙虾整体样品的优势菌;在属水平上,浦口小龙虾整体样品中的主要菌属为微小杆菌属和气单胞菌属,而太湖东山小龙虾整体样品的主要菌属为黄杆菌属、气单胞菌属和希瓦氏菌属。两产地小龙虾不同部位初始菌群的分析结果反映小龙虾潜在食品安全风险,并且不同产地的小龙虾污染菌群不同,为今后小龙虾保鲜、运输研究提供参考依据。     

基于高通量测序与培养基鉴定法分析不同省份不同养殖模式下小龙虾菌群的多样性

本研究以安徽霍邱、江苏盱眙、湖北荆州三地的小龙虾作为研究对象,在荆州另取稻虾互作和养殖塘两种模式的环境样本。利用高通量技术做菌相分析,利用培养基鉴定法进行分离纯化鉴定,验证优势菌种类和数量。结果表明:荆州两组小龙虾初始菌数略低于盱眙和霍邱小龙虾,选择培养基上差别较小。高通量测序结果表明,科水平上三地小龙虾的优势菌主要为气单胞菌科和肠杆菌科;稻虾塘土壤菌群丰度远高于养殖塘,水体菌群较相似。属水平上,荆州稻虾塘、养殖塘、盱眙和霍邱四组小龙虾样本菌群丰度存在差异,但气单胞菌属和不动杆菌属都占较高比例,依次为41.8%、1.8%,12.4%、11.4%,24.5%、27.5%,40.1%,13.0%。荆州稻虾塘小龙虾优势菌还包括乳球菌属和柠檬酸杆菌属,养殖塘样本存在哈夫尼亚菌属和乳球菌属,盱眙与霍邱小龙虾样本优势菌均有微小杆菌属和柠檬酸杆菌属。培养基结果表明三地小龙虾优势菌均主要为气单胞菌属、哈夫尼亚菌属和柠檬酸杆菌属,与高通量结果相符。     

超声波协同流水净化对克氏原螯虾中菌落总数及菌相构成的影响

目的:研究超声波协同流水净化对活体克氏原螯虾携带的细菌数量及菌相构成的影响。方法:测定了净化过程中克氏原螯虾壳+肉、腮部和肠道部位菌落总数变化,并应用随机扩增多态性DNA(random amplified polymorphic DNA,RAPD)指纹图谱结合16S rDNA测序鉴定分析龙虾在净化处理前后不同部位的菌相构成。结果:超声波协同流水处理能够显著减少虾壳+肉、腮和肠道部位的细菌载量,降低量分别达到2.18、2.23、1.01(lg(CFU/g))。挑取的218个单菌落中存在21种不同的RAPD谱型,不同谱型的细菌属于9个属18个种,其中气单胞菌属、黄杆菌属、嗜冷杆菌属、希瓦氏菌属和肠杆菌属细菌为虾壳肉和腮中的优势菌群,净化处理后虾中分布的细菌种群数降低为6个属9个种,其中温和气单胞菌(Aeromonas sobria)、阴沟肠杆菌(Enterobacter cloacae)、黄杆菌(Flavobacterium granuli)和腐败希瓦氏菌(Shewanella putrefaciens)是残留的优势细菌种群。结论:超声波协同流水净化对活体克氏原螯虾具有良好的减菌效果。     

基于培养基法和高通量测序法分析冷藏小龙虾优势腐败菌

为揭示4 ℃冷藏小龙虾贮藏期间微生物菌群多样性及优势腐败菌种类,以传统培养基法作为对照,采用高通量测序技术分别鉴定小龙虾样品在鲜样期、腐败中期、腐败末期的腐败菌属,探究贮藏期间微生物菌群变化趋势。2 种测序方法对比发现,高通量法检测到的菌属更具多样性,培养基法提取的腐败菌均包含在高通量测序菌属内。结果表明,培养基法提取优势腐败菌共11 株,其中气单胞菌（Aeromonas jandaei）致腐能力最强,弗氏柠檬酸杆菌（Citrobacter freundii）致腐能力最弱;此外,高通量测序法显示希瓦氏菌（Shewanella sp.）、肉杆菌属（Carnobacterium sp.）、环丝菌属（Brochothrix sp.）、嗜冷菌属（Psychrobacter sp.）、漫游球菌属（Vagococcus sp.）、不动杆菌属（Acinetobacter sp.）等在腐败末期时的物种丰度为90.57%。2 种方法比对可以确定,小龙虾的优势腐败菌有希瓦氏菌、肉食杆菌、环丝菌属、嗜冷菌属、漫游球菌属、不动杆菌属、气单胞菌、束毛球菌属（Trichococcus sp.）等。     

不同醇化卷烟原料表面微生物的群落结构及对大分子物质的降解功能

为探究醇化卷烟原料表面微生物的群落结构及对大分子物质的降解功能,采用宏基因组测序技术分析醇化2年的烤烟烟梗、香料烟和烤烟片烟样品的表面微生物群落结构,并对3种醇化卷烟原料中的果胶、纤维素、淀粉、蛋白质和木质素含量与表面微生物群落组成进行相关分析。结果表明,3种醇化卷烟原料中,醇化烤烟烟梗淀粉和蛋白质含量最低,醇化烤烟片烟果胶、纤维素和木质素含量最低。醇化烤烟烟梗的优势菌属为泛菌属（Pantoea）、不动杆菌属（Acinetobacter）、克雷伯氏菌属（Klebsiella）和假单胞菌属（Pseudomonas）,醇化香料烟的优势菌属为泛菌属（Pantoea）、假单胞菌属（Pseudomonas）和不动杆菌属（Acinetobacter）,醇化烤烟片烟的优势菌属为泛菌属（Pantoea）、芽孢杆菌属（Bacillus）和土地芽孢杆菌属（Terribacillus）。鞘氨醇单胞菌属（Sphingomonas）含有较多与淀粉降解相关的基因,其相对丰度与醇化样品淀粉含量显著负相关;鞘氨醇单胞菌属（Sphingomonas）、寡养单胞菌属（Stenotrophomonas）和克雷伯氏菌属（Kl...     

基于Illumina MiSeq测序技术分析大鲵肉冷藏过程中微生物菌群演替规律

为探究大鲵肉冷藏过程中菌相组成及特定腐败微生物,对托盘包装大鲵肉不同冷藏时间（4 ℃,0、2、4、6、8 d）的挥发性盐基氮和菌落总数进行评价,在此基础上采用Illumina MiSeq测序技术探究其微生物菌群变化与多样性。结果表明,大鲵肉在冷藏过程中菌落总数和挥发性盐基氮呈上升趋势,分别在第6天和第8天超标。高通量测序结果显示,大鲵肉中微生物丰度随着冷藏时间的延长呈降低趋势。在门水平上进行群落组成分析,细菌的优势菌门从冷藏前期（0、2 d）的拟杆菌门、厚壁菌门逐渐转变为中（4 d）、后期（6、8 d）的变形菌门。在属水平上细菌的优势菌属从冷藏前期主要的拟杆菌属、Faecalibacterium逐渐转变为中、后期的假单胞菌属、气单胞菌属、Hafnia-Obesumbacterium、沙雷氏菌属。主坐标分析显示0-2、4、6、8 d之间微生物菌群差异较大,2 个主坐标叠加解释度达80.92%;LEfSe分析表明,引起大鲵肉各冷藏期差异显著的菌门主要为变形菌门、放线菌门、拟杆菌门、纤维杆菌门、厚壁菌门,菌属主要为假黄单胞菌属、Bauldia、沙雷氏菌属、不动杆菌属、气单胞菌属、假单胞菌属、ambiguous_taxa、Hafnia-Obesumbacterium、Rikenellaceae_RC9_gut_group、Prevotella_9、拟杆菌属、纤维杆菌属、毛螺菌属、Faecalibacterium、Clostridium_sensu_stricto_1。进化分析表明大鲵肉冷藏过程中微生物菌群演替与冷藏时间具有较强相关性。综合分析,引起冷藏期间大鲵肉腐败变质的微生物主要为假单胞菌属、气单胞菌属、Hafnia-Obesumbacterium和沙雷氏菌属。该研究为今后大鲵肉冷藏过程中靶向抑菌及货架期延长提供了参考。     

基于高通量测序分析虾夷扇贝柱菌群结构及腐败优势菌

为揭示虾夷扇贝柱的菌群结构及腐败优势菌,通过对宏基因组DNA进行高通量测序,分析虾夷扇贝柱新鲜和腐败样品的菌群结构,同时对可培养细菌菌群基因组DNA进行高通量测序,分析新鲜和腐败样品可培养细菌菌群的结构特征。结果表明,对宏基因组测序后获得的新鲜虾夷扇贝柱中细菌菌群多样性丰富,其中相对丰度较高的有Candidatus kuenenia（10.73%）、弧菌属（Vibrio,8.15%）、别弧菌属（Aliivibrio,7.38%）、芽孢杆菌属（Bacillus,7.20%）和未分类菌（unclassified,16.08%）;4?℃的腐败优势菌为发光杆菌属（Photobacterium,46.91%）、别弧菌属（36.82%）和假交替单胞菌属（Pseudoalteromonas,11.01%）,15?℃的腐败优势菌为发光杆菌属（46.97%）和别弧菌属（43.33%）,25?℃的腐败优势菌为发光杆菌属（41.94%）、别弧菌属（23.10%）、梭杆菌属（Fusobacterium,18.61%）和乳酸菌属（Lactobacillus,10.60%）。对可培养细菌菌群基因组测序后发现,新鲜样品可培养细菌菌群多样性大大降低,大部分为假交替单胞菌属（89.46%）,在25?℃腐败后,可培养的腐败优势菌为弧菌属（50.98%）、希瓦氏菌属（Shewanella,17.43%）和乳酸菌属（10.68%）。本研究揭示了虾夷扇贝柱新鲜及腐败样品的菌群结构特征及腐败优势菌,为进一步研究微生物对虾夷扇贝柱品质劣化的作用机制提供一定参考。     

基于培养和宏基因组评价西瓜的保存方式

目的 基于培养和宏基因组评价日常西瓜的保存方式。方法 以市售纯品8424西瓜为实验材料,利用洁净菜刀处理样本,部分样本表面覆盖保鲜膜,分别置于室温(26℃)与冰箱(4℃)中,放置时长选择2、7和24 h几个不同时间点,测定西瓜表面菌落总数,用无菌棉签收集西瓜表面微生物进行宏基因组测序,分析不同保存方式下西瓜表面的菌落总数和微生物物种组成。结果 不同保存方式的西瓜表面菌落总数测定结果表明,随着保存时间的延长,菌落总数增加,低温能够有效抑制菌落总数生长,覆盖保鲜膜的样本表面菌落总数在保存7 h后显著增加,切除西瓜表面1 cm能够显著降低菌落总数;宏基因组测序分析结果表明,切开的西瓜表面有条件致病菌检出,并且存在假单胞菌属(Pseudomonas)、微小杆菌属(Exiguobacterium)以及欧文氏菌属(Erwinia)等多种较常见腐败菌。结论 切开后西瓜尽快放入冰箱可延长保存时间,24 h内食用并在食用前切除表面1 cm可降低致病风险。     

采样方法对冷鲜鸡表面细菌DNA提取及高通量测序结果的影响

目的:比较涂抹法和冲洗法对冷鲜鸡表面细菌DNA提取及高通量测序结果的影响。方法:将4只冷鲜鸡对半分开,分别采用涂抹法和冲洗法采集其表面微生物,提取基因组DNA,对细菌16S rRNA基因V3~V4区进行聚合酶链式反应扩增,通过Illumina Hiseq测序平台对扩增产物进行高通量测序,使用QIIME等软件对测序序列进行分析统计。结果:两种方法采集的样品在细菌基因组DNA提取、菌群丰富度、多样性及菌群结构等方面均无显著差异(P0.05)。高通量测序结果表明,冷鲜鸡表面细菌菌群主要分布于7个门,10个属。变形菌门为优势菌门,占70%以上;希瓦氏菌属、假单胞菌属、不动杆菌属、嗜冷杆菌属和环丝菌属为优势菌属,分别占10%~20%。结论:两种采样方法对冷鲜鸡表面细菌DNA提取及高通量测序没有明显影响,但冲洗法比涂抹法简单易行,且不易发生二次污染,因此更具有实用性。本实验同时也为冷鲜鸡表面细菌的研究提供了数据资料。     

贮藏温度对即食小龙虾品质及微生物菌群多样性的影响

先通过测定理化指标确定即食小龙虾货架期,再分别从4,25℃两种贮藏温度下中、末期的样品中提取即食小龙虾总DNA,通过高通量测序技术探究贮藏期间其微生物菌群变化。结果表明:随贮藏时间的延长,物种多样性逐渐降低;4℃贮藏条件下,末期优势菌群为海洋杆菌属(Oceanobacillus,81.522%)和希瓦氏菌属(Shewanella,3.625%);25℃贮藏条件下,末期优势菌群为哈撒韦氏菌属(Hathewaya,78.700%)、芽孢杆菌属(Bacillus,12.380%)和狭义梭菌属(Clostridium sensu stricto,8.707%)。     

中国粮油市场2005年2月份分析报告

<正>2月正值传统新春佳节,国内粮油市场购销活动清 淡,市场行情以稳为主,小幅波动。2月全国粮油批发价 格指数中粮食批发价格指数为128.85,比上月下跌 0.15％:食用油批发价格指数为88.61,比上月下跌 0.21％。     

基于聚类分析法和双指标分析法的淡菜红外指纹图谱比较研究

目的:寻找一种快速、有效鉴别淡菜产地来源的方法。方法:利用聚类分析法和双指标分析法,对不同产地的17份淡菜样品的红外指纹图谱进行比较分析。结果:1)不同产地淡菜的红外光谱基本一致,主要显示为多糖、蛋白质和不饱和脂肪酸特征峰,但在1800~800cm-1波段范围吸收峰的数目、形状和强度存在一定差异。2)应用SPSS11.5进行聚类分析,各样品红外光谱经归一化加一阶导数处理后聚类效果较为明显,但精确度相对较低;3)应用双指标序列法,共有峰率及变异峰率的计算繁琐,但可以用量化关系精确地表示各样品之间的关系。结论:本研究结果揭示红外光谱指纹图谱结合聚类分析或双指标序列法,可以快速、无损地鉴别不同产地的淡菜,为淡菜产地溯源提供1种切实可行的方法。     

流动注射分析在皮革分析中的应用

流动注射分析法作为一门分析技术,几十年来来发展迅速,并和多种检测手段进行联用.本文主要介绍一些流动注射分析法及与流动注射联用的一些主要检测方法,并主要综述其在皮革工业中的应用情况和发展前景.     

丝故障分析

有技术才有将来！“技术讲堂”与您分享专业技术资源。“技术讲堂”栏目,约请业界专家就大家关心的各种技术问题展开系列讲座。欢迎大家针对讲座内容或本企业生产实践来电、来函提出问题或发表意见。     

美国食品安全风险分析程序解析

本文阐述了美国食品药品监督管理局（FDA）和美国农业部（USDA）的食品安全风险分析程序,并介绍了相关风险分析团队及其职责,以期有助于国内食品安全管理部门风险分析程序的建立。     

基于关联分析的学生成绩分析应用

当今时代是信息时代,也是数据时代,这为教育改革发展提供有利条件.随着学校学生人数大幅增加,学生成绩等数据呈现出爆炸式的増长趋势,急迫需要利用技术促进教学进步.在大数据时代,本文将关联规则应用于实际,对学生成绩进行实际挖掘分析并得出结论,使教务管理更加便捷,科学安排课程,提高学生学习效率,达到教学目的.     

Ecotect Analysis软件采光模拟准确性分析

文章首先制作实体模型,将其置入人工天穹进行采光实验,改变天空照度及窗洞口位置,测量室内采光照度;再进行计算机建模,模型尺寸与实验模型一致,并基于Ecotect Analysis软件进行采光模拟实验;最后将两者数据进行对比,比较结果表明模拟数据与实验差异集中分布在20%附近,证明了Ecotect Analysis采光模拟数据具有可信性,可基于其进行建筑采光优化设计。