高通量测序分析紫萍内生细菌多样性

[目的]研究紫萍内生细菌群落特征,为揭示其生态功能提供全面的遗传信息.[方法]以宿州市新汴河中的紫萍为研究对象,采用Illumina MiSeq高通量测序技术测定紫萍内生细菌16S rDNA的V5～V7变异区序列,使用FLASH、UCHIME和UPARSE等软件整理和统计样品序列数目和操作分类单元(OTUs)数量.[结...     

根围促生细菌对大棚辣椒连作障碍的防治效果

在总结国内外有关土传病害、连作障碍研究的基础上,将5种生防细菌菌株复配,制成PGPR复合菌剂,应用于连作6年的大棚辣椒生产中.结果表明,PGPR复合菌剂可明显改善辣椒生长性状,减轻辣椒青枯病发病率,提高产量,降低土壤EC值,减轻土壤盐渍化程度.     

三七内生菌的分离及其产皂苷发酵条件的优化

从三七的种子和根等部位分离三七内生菌,分离纯化后共获得三七内生菌11株。用薄层层析法对发酵液中皂苷类活性物质进行定性检测,并采用香草醛-硫酸显色法定量分析发酵液中皂苷的含量,筛选出一株可以产皂苷的内生菌株N3。生理生化鉴定和16SrDNA基因序列同源性比对分析结果表明,此株菌为肠杆菌属(Enterobacter)。通过单因素试验,确定内生菌株N3最适发酵条件为以蔗糖为碳源,牛肉膏为氮源,pH 7.0,温度28℃。     

中药黄芪有效成分对益生菌的促生作用

为了解黄芪对肠道内益生菌的促生作用,采用黄芪提取液对保加利亚乳酸杆菌、乳酸链球菌、三种混合菌(保加利亚乳酸杆菌、双歧杆菌和嗜热乳酸链球菌)进行体外实验,测定菌体在不同黄芪浓度的MRS液体培养基中的吸光度值(OD值)。结果表明,保加利亚乳酸杆菌、乳酸链球菌、三种混合菌(保加利亚乳酸杆菌,双歧杆菌和嗜热乳酸链球菌)的OD值随着添加黄芪浓度的增加而增大,到达8μg/mL以后,OD值基本不发生变化。一定浓度的黄芪提取液对乳酸菌的生长能起到促生作用。     

中药黄芪有效成分对益生菌的促生作用

为了解黄芪对肠道内益生菌的促生作用,采用黄芪提取液对保加利亚乳酸杆菌、乳酸链球菌、三种混合菌（保加利亚乳酸杆菌、双歧杆菌和嗜热乳酸链球菌）进行体外实验,测定菌体在不同黄芪浓度的MRS液体培养基中的吸光度值（OD值）.结果表明,保加利亚乳酸杆菌、乳酸链球菌、三种混合菌（保加利亚乳酸杆菌,双歧杆菌和嗜热乳酸链球菌）的OD值随着添加黄芪浓度的增加而增大,到达8 μg/mL以后, OD值基本不发生变化.一定浓度的黄芪提取液对乳酸菌的生长能起到促生作用.     

三七种植前后土壤细菌群落结构与多样性分析

三七是我国特有的中药材,因存在严重的连作障碍,导致三七产量与品质下降.基于Illumina Mi Seq测序平台采用16S r DNA分析技术对三七种植前土壤、种植3年根际土壤、三七收后1年和3年土壤4种类型土壤中的细菌群落多样性进行了分析.结果表明:三七植株的种植对土壤细菌群落组成在门的分类水平上具有显著的影响,三七种植前后变形菌门(Proteobacteria)、蓝藻门(Cyanobacteria)和放线菌门(Actinobacteria)为调查土壤中的的优势细菌门;三七种植使红游动菌属(Rhodoplanes)明显减少而假单胞菌属(Pseudomonas)增加明显;种植三七前后土壤细菌群落多样性指数和丰富度指数的变化规律基本一致,表现出未种植空白对照CK三七收后3年三七收后1年三年生三七根际.     

离子型稀土矿植物根际促生芽孢杆菌的筛选与鉴定

以离子型稀土废弃矿修复植物的根际土壤为研究对象,采用稀释涂布法从土壤样品中筛选出具有植物根际促生作用,以及能够在高浓度稀土离子条件下生长的芽孢杆菌菌株,并对菌株的促生能力和稀土离子耐受性进行测试。试验结果表明,筛选得到的芽孢杆菌菌株中具有产吲哚乙酸(IAA)能力的有14株,其中同时具有产铁载体和NH3能力的共有5株。菌株Y18-3不仅具有较好的促生特性,而且对稀土离子铥和铽表现出较强的耐受性,半抑制浓度(IC50)分别为2.22和2.29 mmol/L,经16S rRNA基因序列分析法鉴定菌属为纺锤形赖氨酸芽孢杆菌(Lysinibacillus)。     

樟树根际和内生细菌群落结构差异研究

以芳樟醇型樟树根际土壤、根、茎、叶和果为材料,通过16S rRNA扩增子测序评估根际土壤细菌及不同组织器官内生细菌群落的多样性。结果表明,樟树根际土壤细菌群落结构主要由γ-变形菌纲、α-变形菌纲、放线菌纲、嗜热油菌纲、芽孢杆菌纲、酸杆菌纲等组成,而γ-变形菌纲是樟树主要的内生细菌。细菌多样性表现出依赖于植物器官的现象,证实了樟树根际土壤及不同组织器官内生细菌群落的生态位分化,确定了樟树根际土壤和不同组织器官的核心细菌。研究结果对园林绿化用樟树的新品种创制、栽培养护和樟树相关微生物的开发利用具有重要意义。     

两株海南红树植物内生真菌的生物活性成分

红树植物内生真菌是新型天然产物先导药物的重要来源之一．为获得具有新颖结构的化合物,对两株红树内生真菌Phomopsis sp. DHS11和Aspergillus fumigatus JRJ111048的代谢产物进行研究．综合利用正/反相硅胶柱、Sephadex LH20凝胶柱和HPLC高效液相色谱法,从发酵提取物中分离得到9种化合物,分别记为化合物1～9．利用高分辨电喷雾质谱（high resolution electrospray ionization mass spectroscopy,HRESIMS）、核磁共振波谱（nuclear magnetic resonance spectroscopy,NMR）、旋光、紫外和红外光谱等技术,鉴定化合物1～9依次为norpestaphthalide C(1)、norpestaphthalide A(2-a)、norpestaphthalide B (2-b)、7-hydroxy-3-(2-hydroxy-propyl)-5-methyl-isochromen-1-one(3)、alternaroside B(4)、细胞松驰素B(5)、啤酒...     

凡口铅锌矿废弃地植物促生长内生真菌的筛选

以粤北凡口铅锌矿废弃地优势植物香蒲(Typhaorientalis presl)、苦楝(Melia azedarach)、苎麻(Boehmeria nivea)和蓖麻(Ricinus communis)中分离筛选出的具有抗重金属铅、锌能力的45株内生真菌为研究材料,利用CAS检测液显色反应、钼锑抗比色法和Salkowski法,分别筛选出具有促进植物生长的产铁载体菌株30株、溶磷菌株3株和产吲哚乙酸(IAA)菌株18株。并选取具有产铁载体、溶磷或产IAA能力较强的菌株作为代表菌株进行形态学鉴定和ITS序列分析,鉴定结果显示：WB-21为曲霉属(Aspergillus)、BM3为旋孢腔菌属(Cochliobolus)、BM5为链格孢属(Alternaria)、菌株XP3.21为刺盘孢属(Colletotrichum)、ZMP5-3为篮状菌属(Talaromyces)。     

氯化苦土壤消毒对三七种植后细菌群落多样性及烤烟轮作的影响

三七为我国特有的名贵中药材,其土壤连作障碍问题十分突出.目前,氯化苦土壤消毒是防治三七土传病害的有效措施.在本研究中,作者采用基于Illumina MiSeq测序平台的16S rDNA宏基因组测序技术,对氯化苦土壤消毒后三七种植地中细菌群落的多样性、组成及后续烤烟轮作生长情况进行了分析.研究发现,氯化苦消毒处理对土壤细菌群落结构和组成具有显著的影响.氯化苦消毒后,常见的主要三七致病菌假单胞菌属(Pseudomonas)和鞘脂单胞菌属(Sphingomonas)细菌占比均出现极大的下降,它们分别从消毒前的2%和14.87%下降到消毒后的0.3%和4.08%;与之相反,对三七生长有益的伯克氏菌属(Burkholderia)和节杆菌属(Arthrobacter)细菌占比则出现相对增高,并且发现,采用氯化苦消毒,可以极大地促进三七种植后轮作作物烤烟的生长,这些结果表明氯化苦消毒有助于三七连作障碍的防治及三七种植后土地的自然修复,可以提高当前三七种植后土地的利用率.     

米糠中植物脂多糖和细菌脂多糖的分离鉴定

对米糠中细菌的计量和革兰氏阴性菌的分离，培养及其脂多糖的提取等研究表明：尽管米糠含有众多革兰氏阴性菌，但细菌脂多糖占米糠脂多糖总量的比例不足１‰，证实了米糠脂多糖为植物脂多糖而非细菌脂多糖。     

三七花提取物对小鼠NK细胞活性的增强作用

为研究三七花提取物的免疫调节功能, 开发三七花类功能食品, 以求更好地利用三七花资源, 本文采用水提冻干法获得三七花提取物, 并通过乳酸脱氢酶(LDH)测定法研究其对小鼠NK细胞活性的影响, 进而研究三七花提取物的免疫调节功能。结果显示:三七花提取物中可溶性多糖含量为75.48%, 总皂苷含量为5.35%;提取物在62.5~1 000 μg/mL质量浓度范围内能提高小鼠NK细胞活性, 在质量浓度高于250 μg/mL时, 其增强作用更加显著。研究表明三七花提取物具有潜在的免疫调节功能, 可广泛用于功能性食品的开发。     

郑州地区植物上冰核活性细菌的分离和鉴定

从郑州地区的９种植物上分离到１０株冰核活性细菌，经鉴定后，确定属于２个属６个种或变种，即：１．ＰｓｅｕｄｏｍｏｎａｓｆｌｕｏｒｅｓｃｅｎｓｂｉｏｖａｖⅡ；２．Ｐｓｓｙｒｉｎｇａｅ；３．Ｐｓｓｔｕｔｚｅｒｉ；４．Ｐｓｃｅｐａｃｉａ；５．Ｐｓｐｓｅｕｄｏａｌｃａｌｉｇｅｎｅｓ；６．Ｅｒｗｉｎａｈｅｒｂｉｃｏｌａ．这６个种在国内均有报道。在这１０株ＩＮＡ细菌中，Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ群占７０％，为优势种群。不同株间的冰核活性强弱存在差异     

郑州地区植物上冰核活性细菌的分离和鉴定

从郑州地区的９种植物上分离到１０株冰核活性细菌，经鉴定后，确定属于２个属６个种或变种，即：１．Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ ｆｌｕｏｒｅｓｃｅｎｓ ｂｉｏｖａｖⅡ；２．Ｐｓ ｓｙｒｉｎｇａｅ；３．Ｐｓ ｓｔｕｔｚｅｒｉ；４．Ｐｓｃｅｐａｃｉａ；５．Ｐｓ ｐｓｅｕｄｏａｌｃａｌｉｇｅｎｅｓ；６．Ｅｒｗｉｎａ ｈｅｒｂｉｃｏｌａ．这６个种在国内均有报道。     

5种植物内生菌的分离及其拮抗月季黑斑病菌的筛选

[目的]获得高效拮抗菌株,防治月季黑斑病.[方法]采用常规方法分离月季、银杏、钩腾、黑老虎、山苍子5种植物内生菌,以月季黑斑病菌作为指示菌,采用平板对峙培养法进行初筛,并对拮抗圈大于5mm的内生菌进行复筛.[结果]5种植物共分离出内生菌69株,其中37株细菌,3株放线菌和29株真菌;初筛出20株菌对月季黑斑病菌有拮抗效果,拮抗圈大于5mm的有8株,其中细菌7株,放线菌1株;复筛表明菌株YJX2与菌株YXF1抑菌效果较好.[结论]研究表明,菌株YJX2与菌株YXF1可作为月季黑斑病生物防治备选菌株.     

三七茎叶皂苷对大鼠离体心肌凋亡的保护作用

为了研究三七茎叶皂苷(Pn GL)对大鼠离体心脏缺血/再灌注损伤模型心肌细胞凋亡的保护作用机制,采用TUNEL和免疫印迹(Western blot)蛋白方法检测细胞凋亡及凋亡基因蛋白Bcl-2、Bax、ERK1/2等相关凋亡通路,观察Pn GL对心脏缺血/再灌注损伤后心肌细胞凋亡的保护作用机制。TUNEL结果显示,正常细胞核形态大小较为一致、荧光较弱,而凋亡细胞核呈高亮;空白对照组可见少量TUNEL阳性细胞;模型组阳性细胞显著增加;给予PnGL后凋亡细胞所占比例随着药物浓度的增加而明显下降。Western blot实验结果显示,与空白对照组比较,缺血/再灌注组中心肌细胞Bcl-2表达明显降低,Bax表达明显增加,ERK1/2和p-ERK1/2表达明显降低;给予PnGL后,Bcl-2表达明显升高,Bax表达明显降低,ERK1/2和p-ERK1/2表达明显升高。因此,Pn GL对缺血再灌注诱导的心肌细胞凋亡具有保护作用,其保护作用可能与激活ERK1/2细胞凋亡保护通路、从而调节Bcl-2和Bax的表达有关。     

光合细菌促进黄瓜幼苗生长作用的研究

采用光合细菌中的泥生绿菌(Chlorobium limicola)菌株Ⅰ-2和沼泽红假单胞菌(Rhodop-seudomonas palustris)菌株Ⅳ-3,分别以107个/mL、108个/mL及109个/mL三种浓度菌悬液根灌处理黄瓜幼苗,考查光合细菌对黄瓜的促生效果.研究结果表明,菌株Ⅳ-3在以108个/mL浓度处理黄瓜时,可使幼苗株高增高、茎粗增粗、增加鲜质量干质量、提高叶片叶绿素和类胡萝卜素含量,促进生长效果显著,是最佳处理菌株的浓度;Ⅳ-3在以107个/mL浓度处理黄瓜时有相同趋势,只是促进效果次之;Ⅰ-2以109个/mL浓度处理黄瓜时,幼苗的株高、茎粗、鲜质量干质量均显著增加.     

氢氧化细菌胞内糖原的生成和作用

Ｈｙｄｒｏｇｅｎｏｖｉｂｒｉｏ ｍａｒｉｎｕｓ胞内糖原随其细胞的高密度培养而积累。在细胞高密度培养后的各种不同条件下，通过停止提供碳源和洗涤细胞二次培养法，观察海洋专性化能自养氢氧化细菌胞内糖原和胞内葡萄糖磷酸酶的活性变化，发现这株自养细胞内的糖原起能量储存物质的作用。最大的糖原降解发生在碳源和能源饥饿的有氧状态下，降解量为７６．５％。     

四株植物根际促生菌对农田土壤N2O排放的影响

农田土壤是温室气体氧化亚氮(N₂O)最重要的人为排放源之一.本文以四株植物根际促生菌：白色芽孢杆菌Bacillus albus Lv5A、枯草芽孢杆菌枯草亚种Bacillus subtilis sp.subtilis NRCB002、施氏假单胞菌Pseudomonas stutzeri NRCB010和暹罗芽孢杆菌Bacillus siamensis NRCB026为研究对象,采用温室盆栽试验、土壤微宇宙试验及田间原位试验等方法,探究接种植物根际促生菌对农田土壤N₂O排放的影响.结果表明,在温室盆栽条件下,接种四株植物根际促生菌的土壤N₂O累积排放量从高到低依次为NRCB002> Lv5A> NRCB026> NRCB010,与未接种的对照相比分别减少了2.3%、33.1%、34.2%和40.0%.选择NRCB010和NRCB026菌株进一步开展土壤微宇宙试验和田间原位试验.与未接种的对照相比,在土壤微宇宙条件下接种NRCB010和NRCB026的土壤N₂O累积排放量分别减少了21...