转录组学在抑菌机制中的应用研究进展

微生物是导致食品腐败变质和引起食源性疾病的主要因素,如何抑制微生物的生长是食品及医药领域的一个重要研究方向,因此,对抑菌物质抑菌机制的研究也已成为目前国内外研究的热点问题。利用转录组学技术可以从转录组水平上揭示各种抑菌物质抑制微生物生长的分子机制。文中综述了转录组学主要的研究方法,介绍了目前应用最多的RNA测序技术(RNA sequencing,RNA-seq)的技术特点以及转录组学在抑菌机制研究中的国内外研究现状。随着高通量测序技术的迅速发展,转录组学在抑菌机制研究中将具有更广阔的应用前景。     

转录组学在储粮害虫研究中的进展

转录组测序技术能将组织或细胞在不同生理条件下的差异基因量化,是探索基因功能和揭示特定生物学过程中分子机理的必要手段。储粮害虫是严重危害储藏粮食的一类害虫,从转录组水平揭示储粮害虫生长发育、关键基因功能、抗药性分子机制等成为研究热点,极大促进了对储粮害虫特别是无参考基因组信息的害虫的研究。因此,本文系统性从生长发育相关基因的挖掘、组织特异性基因、与微生物互作机制、对环境胁迫的响应机制、磷化氢抗性机理和植物精油杀虫机理研究六个方面综述了转录组学在储粮害虫研究中的应用,旨在为储粮害虫的深入研究提供参考,对进一步进行储粮害虫防治技术开发提供理论依据。     

代谢组学在发酵食品研究中的应用

由于发酵过程复杂,常规的研究手段难以探究影响发酵食品营养和风味的因素和机制。代谢组学技术作为一门新兴起的技术,可对生物体内所有代谢物进行定性定量分析,并寻找代谢物与目标物质变化的相对关系,十分适合研究食品发酵过程中底物、营养、风味等方面的变化机制。该文从代谢组学技术的主要分析方法（高效液相色谱法、液相色谱-质谱法、气相色谱-质谱法等）,以及其在发酵食品中的应用进展展开综述,为发酵食品的生产应用提供理论依据。     

组学技术在茶叶研究中的应用进展

组学是一门新兴并具有广阔应用前景的技术,包括转录组学、蛋白组学、代谢组学和脂质组学等,具有高灵敏度、高通量的优势.介绍各组学对茶叶的研究,为组学在茶树研究中的应用进展作出展望,有助于在组学水平上提高茶叶研究深度,并为茶学科学及其他行业研究者提供方法和思路.     

基于cDNA 微阵列数据对乳酸菌生长及应激代谢转录组特征的研究

应用本实验室编写的perl 程序包将GEO 数据库中乳酸菌生长、应激代谢相关实验数据和相应的基因组数据整合,构建易于本地查询和访问的MySQL 数据库,利用该数据库研究乳酸菌在生长、衰亡及应对不利环境(如胆盐、过氧化氢、碳氮源饥饿)时的转录组特征,并利用MEME 软件寻找到了各种情况下部分协同表达基因前导序列的共有motif,即潜在的调控蛋白作用位点。结果表明：除了胆汁和草酸铵对嗜酸乳杆菌细胞代谢特征的影响具有较高的一致性外,面对其他压力环境乳酸菌细胞的应激模式具有较大的差异,有着各自受到特异性诱导表达或抑制的基因群,但在各种情况下翻译(J)、脂类运输和代谢(I)、细胞内运输和分泌(U)相关因的转录水平变化都比较显著,特别是蛋白质翻译相关基因变化最为明显,说明细胞主要通过调控蛋白质翻译相关基因的种类和表达量来对细胞的状态进行调整。     

代谢组学在营养学研究中的应用

代谢组学能从整体水平定量地考察饮食、生活习惯、生物活性物质、肠道菌群等对机体代谢造成的细微动态变化,并有望为营养需要量的研究、营养流行病学和营养相关疾病的研究提供新的策略。本文简要综述代谢组学在营养学研究中的应用进展。     

代谢组学在食品品质研究中的应用进展

随着经济的快速发展和生活水平的不断提高,食品的营养价值、品质安全受到人们的广泛关注。代谢组学是继基因组学、转录组学和蛋白质组学后的一门新兴组学,日益成为食品科学研究中一种重要的分析技术。代谢处于生命活动调控的末端,相较于其他组学,代谢组学更接近表型。作为一种新型研究手段,代谢组学从整体水平上研究生命体代谢活动和状态,对生物体系中的小分子化合物进行定性定量研究,具有高通量、高灵敏性和高准确性等特点,可以有效克服传统方法的局限性。本文概述了代谢组学的概念、研究方法、分析技术,并介绍了近年来国内外对代谢组学在食品营养、食品安全、食品加工、食品溯源及转基因食品等方面的应用与研究进展,为后续研究提供参考。     

脂质组学在肉品中的研究进展

脂质是生物组成中十分重要的一部分,通过质谱等技术能够对脂质的种类、结构和数量进行全面研究和分析,进而确定不同脂质在肉制品中的作用。在现代化技术的支持下,脂质组学在肉品研究中的影响力也逐渐增加,通过脂质组学能够更加直观了解脂质对肉品品质和风味的影响,并通过确定标志性脂质的方式对不同加工处理的肉品质量进行研究和分析,这一方式在当前研究中的占比增加,具有很好的现实意义和研究意义。本文通过分析不同食品中脂质的成分和含量,说明不同状态下食品中脂质的基本情况,进而通过这一指标分析食品的状态;阐述脂质组学在肉品中的应用情况,说明脂质组学当前的应用和研究意义。     

转录组测序分析3 种不同链长脂肪酸对酿酒酵母基因转录水平的影响

将不同链长的脂肪酸己酸（C6）、十二烷酸（C12）及十六烷酸（C16）添加到对数期酿酒酵母中,通过转录组测序分析其对酿酒酵母基因转录水平的影响。结果表明,在不同链长脂肪酸存在条件下,酿酒酵母基因的转录数量、基因转录水平均有所差异,其中短链脂肪酸C6对酵母基因转录水平的影响最为显著,C16对酿酒酵母的影响最小。此外,通过转录组测序数据分析对不同脂肪酸存在时的转录因子及转运蛋白进行预测,其中包括17 条转录因子及40 条转运蛋白基因。最后分析不同链长脂肪酸存在对脂肪酸合成途径的关键酶基因转录水平的影响,为进一步分析酿酒酵母中脂肪酸生物合成过程中的基因表达及调控机制提供支持。     

高通量转录组测序技术在克罗诺杆菌毒力基因研究中的应用进展

克罗诺杆菌(Cronobacter)是一种兼性厌氧的革兰氏阴性菌, 会引起婴幼儿脑膜炎等多种疾病, 严重危害人类健康。高通量转录组测序技术是一种具体测定各基因表达量的测序方法, 不仅可以全面研究全新研究全新的转录本, 还能获得更准确、详细的研究结果。本文综述了近年来高通量转录组测序技术在克罗诺杆菌新毒力因子相关基因的发现、毒力基因表达量与菌株毒力间的变化关系, 以及不同时间段上毒力基因表达量的差异方面的研究成果, 并展望该技术在克罗诺杆菌毒力研究中的应用前景, 以期为克罗诺杆菌的研究方法、防控防治和临床治疗提供意见和建议。     

乳酸菌的生物拮抗作用

论述了乳酸菌的生物拮抗作用,包括对致病菌和乳酸菌之间的拮抗。并简要论述了产生拮抗作用的可能因素或机理,为乳酸菌进一步开发提供一种理论依据。     

乳酸菌发酵在谷物产品中的应用及研究进展

谷物食品是人类能量摄入的主要来源之一,随着人们生活水平的提高,谷物食品的营养价值和食用品质受到了广泛关注。发酵是改善食品性质、功能及营养缺陷的重要方法,也是谷物加工的重要手段。乳酸菌能够利用碳水化合物进行生长代谢,在食品工业中被广泛应用于各种发酵制品,其发酵产生的代谢产物有许多重要的生理功能,包括调节肠道菌群平衡、提高免疫力、抗菌和抗肿瘤等。因此,乳酸菌发酵在谷物食品中的研究与应用,对提升食品品质具有重要意义。本文综述了乳酸菌发酵对谷物营养成分、生物功能和结构、理化性质的影响,总结了乳酸菌发酵谷物产品的优势以及乳酸菌发酵在多种谷物产品中的应用,分析了乳酸菌发酵谷物食品目前研究的不足及可能的发展方向, 拟为乳酸菌发酵在谷物中的研究与开发提供参考。     

乳酸菌在酱油酿造工业及蔬菜加工中的应用

该文扼要地介绍了乳酸菌的分类、生理特性和保藏方法，较详细地介绍了乳酸菌在酱油酿造、蔬菜加工中的应用概况。指出了乳酸菌参与酱油酿造有不同程度的增香效果；应用于蔬菜加工中，不仅改善了产品的风味，而且提高了营养价值。     

乳酸菌分类鉴定方法的研究进展

对目前使用的乳酸菌表型特征鉴定和基因型特征鉴定方法的优缺点进行了综述。依据表型的常规生理生化特征进行乳酸菌的分类鉴定不仅费时,有时甚至难以完成。随着分子生物技术的发展和基因数据库的建立,将分子标记技术、新兴鉴定技术与常规方法结合使用,将使乳酸菌的分类、鉴定更为准确和便捷。     

乳酸菌的分类鉴定及在食品工业中的应用

乳酸菌是一类革兰氏阳性杆菌或球菌、可収酵乳糖或葡萄糖产生大量乳酸的细菌的通称,将乳酸菌应用到食品中具有提高其营养价值,改善食品风味,抑制食品中腐败菌的生长,延长食品保质期等作用。因其独特的生理特性,近年来国内外学者对乳酸菌的研究逐渐增多。本文主要论述了乳酸菌的分类和鉴定技术,介绍了传统鉴定斱法和分子生物学鉴定斱法的优缺点以及乳酸菌在食品工业(乳制品、肉制品、果蔬制品、食品保鲜)中的应用,为提高乳酸菌的鉴定效率以及乳酸菌在食品工业、饲料生产和临床医疗上的迚一步应用提供参考。     

乳酸菌在青方腐乳中的应用研究

对从青方腐乳中分离的植物乳杆菌（Lactobacillus plantarum）、短小奇异菌（Atopobium parvulus）和片球菌（Pediococcus）在青方腐乳中的应用进行了研究。结果表明，这3株乳酸菌对青方腐乳的成熟和风味均有一定的促进作用，其中，片球菌对青方腐乳风味的作用效果最好，改变了腐乳中游离氨基酸的含量和呈味特点，并促进大豆蛋白质的水解，降低了腐乳的硬度、坚实性、粘度和黏附性，使腐乳的感官品质得到改善，是改进青方腐乳风味的协同菌株。     

分子生物学技术在乳酸菌鉴定中的应用

介绍了几种分子生物学技术在乳酸菌鉴定中的应用,并对这些方法的优缺点进行了简单的阐述,并对该技术今后的发展方向做了明确的讨论。分子生物学技术在乳酸菌的分类鉴定过程中必将成为一种主导因素,也会发挥其快速简便的优点。     

自制蛋白胨在乳酸菌培养中的应用

为了提高乳酸菌培养过程中的活菌总数,利用自制蛋白胨取代对照培养基中的氮源对乳酸菌进行培养。采用微生物菌液浊度测定法和微生物活菌计数法对培养结果进行测定。结果表明,用自制蛋白胨作为氮源取代对照培养基中的部分氮源培养植物乳杆菌、干酪乳杆菌、嗜热链球菌、双歧杆菌时的菌液浊度和活菌总数均高于对照培养基,但在培养保加利亚乳杆菌时的培养效果不如对照培养基。自制蛋白胨作为氮源培养大部分乳酸菌时的培养结果要优于对照培养基,自制蛋白胨可以取代对照培养基中的部分氮源制作新的培养基,并降低培养基的制作成本。      

腌菜中细菌多样性研究及乳酸菌分离鉴定

以恩施地区采集的腌菜为研究对象,采用高通量测序技术（HTS）与变性梯度凝胶电泳（DGGE）技术相结合的方法对其中所 含细菌和乳酸菌多样性进行研究,并采用平板稀释涂布法对乳酸菌进行分离鉴定。结果表明,腌菜样品中含量最高的优势细菌门 为硬壁菌门（Firmicutes）,其平均相对含量高达97.09%。优势细菌属为Lactobacillus、Weissella、Leuconostoc、Vibrio、Pseudomonas、 Psychrobacter和Flavobacterium,其中Lactobacillus的平均相对含量高达82.37%;通过变性梯度凝胶电泳技术从样品中检测出的乳酸 菌 有 Lactobacillus sakei、Lactobacillus insicii、Lactobacillus plantarum subsp. argentoratensis、Lactobacillus plantarum subsp. plantarum 和 Lactobacillus acetotolerans;分离鉴定及保藏的乳酸菌中有L. plantarum 7株,L. alimentarius 2株,L. curvatus和L. brevis各1株以及L. sakei 4株。 由此可见,虽然Lactobacillus为腌菜样品中的优势菌,但乳酸杆菌的构成在样品间存在一定的差异。     

酸奶中乳酸菌稳定性的研究

以酸奶中乳酸菌为研究对象,研究在酸奶的加工贮藏过程中温度、pH值等环境因素对乳酸菌稳定性的影响.研究发现,酸奶加工过程中可加入1%的食盐和5%的海藻糖,并且可适当提高脂类和蛋白质的含量,在酸奶装罐前应将其pH值调至4.0左右,将成品贮藏在2℃～7℃环境下,以求最大限度的保持酸奶中活乳酸菌的数目.