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成熟人红细胞膜骨架是由膜下多种蛋白组成的三角晶格网状结构,在维持红细胞形态、变形性、运动和代谢等功能方面扮演着重要角色。单分子定位超分辨成像(SMLM)技术在解析骨架超微结构方面展现出了强大的能力,但分辨率的提升对成像分析手段提出了更高要求。作为一种常用的空间分析方法,Vorono?分割在SMLM图像聚类分析中已被广泛应用。笔者利用自主搭建的SMLM超分辨成像系统获得红细胞膜蛋白和骨架蛋白的超分辨点簇图像,对点簇质心进行Vorono?分割,并对Vorono?多边形面积分布进行伽马函数拟合,发现自由膜蛋白CD59的伽马分布峰值对应的x轴坐标xpeak为0.78。结合模拟结果,验证了自由膜蛋白CD59呈随机分布。进一步,肌动蛋白、血影蛋白N端和原肌球蛋白的Vorono?分析结果显示它们的xpeak均为0.86,而锚蛋白的xpeak为0.84,说明骨架膜蛋白呈相对均匀的分布状态,但锚蛋白较其他骨架蛋白更具随机性。Vorono?方法可助力阐释红细胞膜骨架蛋白的空间分布特性,同时也为点簇状SMLM超分辨图像数据的深入提取提供了新思... 相似文献
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核孔复合物(NPC)是细胞核膜上由多种蛋白组装而成的复杂结构,在细胞核质交换和信息传递中起着关键作用。单分子定位超分辨成像(SMLM)以其特异性和高成像分辨率成为研究NPC超微结构的主要方法之一。然而,由于抗体标记不完全等因素导致的数据丢失,给后续分析带来了困难。笔者使用SMLM提供的定位信息,结合基于密度的空间聚类算法(DBSCAN)和层次聚类算法进行数据的提取和分类,建立了NPC筛选和定位的分析流程,并采用该处理流程得到了缺失较少且形貌比较均匀的核孔。进一步,基于最小二乘法原理对筛选得到的大量NPC进行质心对齐的重构处理,成功复现出了其经典的八重对称结构,并揭示了核孔蛋白Nup133与Nup98的精确相对位置关系。本研究通过建立核孔筛选和重构的标准流程,填补了SMLM数据的缺失。采用该流程对多种核孔蛋白进行分析,揭示它们的结构特性。所建流程为理解核孔的复杂结构提供了一种高通量的定量分析方法。 相似文献
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提出一种适用于道路障碍物识别检测的聚类算法,该算法用来处理各向异性分布的激光点云数据。算法的基本思想是:针对点云空间分布的实时变化,提出在线学习合并阈值的层次聚类算法,以确定聚类数搜索范围上界和初始聚类中心的待选点集;然后提出距离乘积最大化方法,对待选点集进行初始化排序,既结合点云的空间密度分布改善了聚类结果,又克服了传统K-means算法初始聚类中心难确定的问题;最后选取Silhouette和距离评价函数为聚类有效性指标分析算法的聚类效果,确定最佳聚类数。用以上自适应、在线学习的算法对2.5D激光雷达采集的点云数据进行聚类,并与其他两种聚类算法进行实际试验比较发现,本算法可以正确分割大多数空间分布各异且相互连接的障碍物。 相似文献
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针对已有的无线入侵检测方法训练时间长和检测精度低的问题,提出一种基于调整后的BIRCH——MBIRCH算法的无线Mesh网络入侵检测算法。该算法首先一次性扫描数据集获得CF(聚类特征),然后自底向上地计算不同层次的聚类有效指标,主要是考虑数据集的几何结构,即通过度量簇内数据点分布的紧凑度以及簇间的相似度,并保持二者之间的平衡,根据此指标确定CF树的簇结点,直到得到最佳聚类结果,将最佳聚类结果作为训练样本指定判别函数,对网络数据定位。实验结果表明,该算法不仅明显减少样本训练时间,同时提高了算法检测精度,符合无线Mesh网络的入侵检测需要。 相似文献
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图像分割能将一幅数字图像分成多个的不同区域,是计算机视觉的主要研究领域之一。文中在系统性研究DBSCAN算法的基础上,提出了一种改进型DBSCAN图像分割方法。该方法首先计算图像中每个像素点的局部密度,然后通过寻找局部密度峰值点来确定核心点,同时将邻域内的像素点加入同一簇中,来处理不同密度区域和噪声点的影响。实验结果表明,该算法对参数敏感度较低,能有效处理不同密度区域和噪声点,相比标准DBSCAN图像分割方法,其在聚类正确率、精度和效率等方面的表现更优秀。 相似文献
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密度峰值聚类算法(DPC)通过决策图直观地找到类簇中心进而完成聚类,是一种简单高效的聚类算法。然而,DPC算法的截断距离和类簇中心都是人为确定的,受主观影响较大,具有不确定性。针对上述问题,提出一种基于类簇合并的无参数密度峰值聚类算法(NDPCCM)。首先根据样本点两两之间的相似度的分布特征将其分为类内相似度和类间相似度两种类型,并利用类内相似度自动确定截断相似度,避免了人为设置参数;接着根据簇中心权值的下降趋势自动选择初始类簇中心,得到初始类簇;最后通过合并初始类簇对初步聚类结果进行优化,提高了聚类的准确性。在人工数据集和UCI真实数据集上,将所提算法与DPC、DBSCAN、K-means算法进行对比实验。结果表明所提算法无需输入参数就能够自动得到类簇,且聚类性能优于其他算法。 相似文献
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针对传统模糊C-均值(FCM)聚类算法计算复杂度高、无法自动确定聚类数目的问题,提出了一种快速自动FCM聚类彩色图像分割算法。首先通过改进的简单线性迭代聚类(SLIC)超像素算法预分割图像,将传统基于单个像素的聚类转化为基于超像素区域的聚类,降低FCM计算复杂度;其次利用改进的密度峰值算法自动确定聚类数目,提高算法灵活性;最后,对超像素图像进行基于直方图的FCM聚类,完成图像分割。为验证所提算法的有效性,采用BSDS500、AID和MSRC公共数据库作为实验数据集,并与其他4种FCM分割算法进行了比较。实验结果表明,所提分割算法在分割精准度、模糊分割系数、模糊分割熵和视觉效果等方面均优于其他几种比较算法。 相似文献
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为了提高医学图像分割性能,针对传统模糊聚类算法存在的缺陷,提出了一种改进模糊均值聚类算法的医学图像分割方法。首先采用粒子群算法选择模糊均值聚类算法的聚类中心,然后利用空间邻域信息设定聚类样本空间,最后采用具体的医学图像数据进行仿真实验,测试其有效性。仿真结果表明,相对于传统模糊聚类算法,本文算法不仅提高了医学图像分割精度,而且提高了医学图像分割效率。 相似文献
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针对激光雷达在检测道路障碍物的过程中,由点云数据密度不均而导致障碍物检测准确率低和实时性差的问题,提出一种优化的密度噪声空间聚类(DBSCAN)算法以提高道路障碍物的聚类效果。首先依据点云数据的反射强度信息对车道线进行检测,提取感兴趣区域;然后使用射线坡度阈值地面分割算法进行地面分割,实现对斜坡地面的彻底分割;最后提出一种自适应的DBSCAN算法,选取代表性的核心点以及自适应聚类半径,实现对不同距离密集障碍物的快速准确聚类。实验结果表明:所提算法能够对不同距离的密集障碍物准确聚类;与传统算法相比,所提算法的正检率提高24.07个百分点,平均耗时减少1.18 s。 相似文献
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基于激光雷达传感器,提出了一种道路路锥识别方法。首先,在传统DBSCAN聚类算法的基础上改进算法搜寻核心点的方式,对雷达所采集的数据进行快速地分割、聚类。接着,分析类簇,对每帧数据的类簇进行特征采样并赋予标签值。最后,通过支持向量机(SVM)训练样本数据,利用网格化搜索与交叉验证法优化SVM参数,得到类簇分类模型,用于识别路锥。实验结果表明,改进后的DBSCAN算法计算效率有了显著提升,并且对点云的聚类更具有针对性。经过多次随机数据集检测,分类模型的准确率保持在93以上,实现了对路锥的有效识别。 相似文献
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针对复杂红外图像分割问题,将非均匀Potts模型的热力学聚集运动看作是数据聚类,提出了基于超顺磁聚类的分割新算法.算法首先要指定控制系统的哈密尔顿函数,然后通过测量磁化率随温度变化的曲线来识别系统的不同相位,最后在超顺磁相位测量相邻自旋子的相关函数来将图像分割成子类.结合SW算法和Metropolis算法给出了一种新的产生马尔科夫过程的方法,该过程能够快速收敛于Boltzmann分布,从而降低超顺磁聚类方法的计算量.在复杂红外图像上的分割实验表明,新算法在收敛速度和分割效果方面都明显优于经典的SW算法. 相似文献
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为了解决传统聚类算法对聚类表征特征量的依赖性以及定义的不完备性,结合遥感图像的数据的空间位置关系提出了一种结合多元信息聚类与空间约束的遥感图像分割方法。针对某一聚类数据,以若干数据点(多元)组合的方式遍历其所有数据点,并定义多元组合的互信息,以表征该聚类的类内相似性;通过计算类外像素对类内多元组合的互信息,刻画类间的非相似性。在此基础上建立类内相似性和类间差异性,然后结合两者之间的平衡关系建立目标函数,并将Potts模型扩展到目标函数以加入空间约束,最后通过最大化目标函数实现图像分割。对模拟及真实全色遥感影像分割结果的定性、定量分析表明:结合多元信息聚类与空间约束的遥感影像分割方法可以避免聚类表征特征量的定义,从根本上消除其对图像分割的影响,并充分考虑遥感数据的空间位置关系。 相似文献
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图像分割是一种重要的图像技术,在理论研究和实际应用中都得到了人们的广泛重视。图像分割的方法和种类很多,有些分割运算可直接应用于任何图像,而另一些只能适用于特殊类别的图像。目前,图像分割的方法层出不穷。其中,最具代表性的图像分割算法是基于FCM聚类算法的图像分割方法。然而FCM聚类算法从理论上来说存在着聚类数目无法自动确定及运算的开销太大的缺点,因而限制了这种方法的应用。针对其不足,本文将FCM聚类算法引入到图像分割方法中。数值实验结果显示:新方法分割图像的效果是良好的。 相似文献
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截集式可能性C-均值(C-PCM)聚类算法将截集概念引入可能性C-均值(PCM)聚类算法中,明显改善了PCM的聚类中心重合问题,并能够对噪声和奇异点的数据进行有效聚类,但该聚类算法对小目标数据聚类时仍然存在聚类中心偏移的问题.针对此问题,该文将半监督学习机制引入C-PCM的目标函数中,通过部分先验信息来指导聚类过程,提出半监督截集式可能性C-均值(SS-C-PCM)聚类算法.为了提高彩色图像的分割效率和分割准确率,将差分进化超像素(DES)算法获得的图像空间邻域信息融入SS-C-PCM目标函数中,并利用彩色直方图重构目标函数,以降低算法的计算复杂度,进而提出基于差分进化超像素的半监督截集式可能性C-均值(desSS-C-PCM)聚类算法.通过人造数据和彩色图像分割的仿真并与多种相关算法进行对比,表明该文算法能够有效改善小目标数据的聚类效果,提高算法的执行效率. 相似文献
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截集式可能性C-均值(C-PCM)聚类算法将截集概念引入可能性C-均值(PCM)聚类算法中,明显改善了PCM的聚类中心重合问题,并能够对噪声和奇异点的数据进行有效聚类,但该聚类算法对小目标数据聚类时仍然存在聚类中心偏移的问题。针对此问题,该文将半监督学习机制引入C-PCM的目标函数中,通过部分先验信息来指导聚类过程,提出半监督截集式可能性C-均值(SS-C-PCM)聚类算法。为了提高彩色图像的分割效率和分割准确率,将差分进化超像素(DES)算法获得的图像空间邻域信息融入SS-C-PCM目标函数中,并利用彩色直方图重构目标函数,以降低算法的计算复杂度,进而提出基于差分进化超像素的半监督截集式可能性C-均值(desSS-C-PCM)聚类算法。通过人造数据和彩色图像分割的仿真并与多种相关算法进行对比,表明该文算法能够有效改善小目标数据的聚类效果,提高算法的执行效率。 相似文献
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针对传统K-Means聚类算法的不足,提出一种新的对孤立点不敏感的K-Means聚类算法。首先,采用孤立点移除算法消除数据集中存在的孤立点;然后,对不包含孤立点的数据集进行传统K-Means聚类,再引入轮廓系数并选择轮廓系数最大值对应的簇类数作为数据集中簇的最优选择数目K;最后,通过自定义的聚类有效性评价函数评估聚类效果。实验结果表明,相对于传统K-Means聚类算法,对孤立点不敏感的新的K-Means聚类算法能够消除孤立点对数据集整体的影响,并优化了聚类中心的选择。 相似文献
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提出一种数据聚类方法:MATS,该方法受蚁群算法启发,同时应用存在性技术,例如密度概念和聚类有效性指数(DB-指数)。MATS可以自动根据一些与数据集不直接相关的参数找到簇。实验结果证明了MATS可以识别不规则簇并能有效应用于图像分割,在图像分割速度和效果方面比传统聚类算法(如FCM算法)有明显提高。 相似文献
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毫米波雷达具有体积小、分辨率高,可在风、雨、雾等恶劣条件下工作的优点,但由于场景的复杂性在实际工作中会出现点云过分割、虚警等问题。因此,本文提出一种基于马氏距离与欧氏距离结合的自适应DBSCAN聚类算法,依据点云的距离选取相似度度量方法,在密度较大处选择马氏距离,在密度较小处选择欧氏距离,依据“属于同一目标点云,位置、速度、强度接近”这一规律进行筛选。聚类完成后,采用非参数核密度估计算法获取点簇内点云密度,根据点云分布特点估计目标位置,并依据最小二乘法完成多普勒速度分解,估计目标横纵向速度。最后,通过实际道路场景(隧道、公路)测试数据对本文算法的可靠性与稳定性进行验证。 相似文献