通过DNA聚合剪切放大体系提高RNA的检测灵敏度

基于循环的DNA剪切循环放大分子机器构建了一个RNA传感器。该分子机器以RNA为输入,产生大量的DNA片段,并替换报告探针上的荧光DNA从而产生荧光信号,实现对靶RNA浓度的放大检测。本分子机器分为两部分,反应部分和报告部分。在反应部分,以靶RNA为输入条件,以一个特殊设计的探针为反应模板引发一个自发连续的DNA聚合-剪切反应网络,重复产生大量信号DNA链;这些信号DNA链进入报告部分,通过杂交替换反应从一个报告探针上替换下带有荧光DNA序列,释放到溶液中。这样通过剪切产生的大量DNA适体序列被释放到溶液中,并替换报告探针上的荧光DNA,实现信号的放大。     

水稻愈伤组织端粒酶催化特征检测

端粒是位于染色体末端富含鸟嘌呤的双链DNA结构.端粒酶以自身的一段RNA为模板,按照碱基互补配对的方式产生端粒重复序列以延伸端粒长度,维持染色体的稳定.以水稻愈伤组织为实验材料,分离、提取端粒酶,并以不同3'端的寡核苷酸作为前导引物对体外水稻端粒酶催化特征及不同引物对酶活性的影响进行了探究.结果显示:S水稻愈伤组织端粒酶提取液在延伸前导引物时,以催化合成的TAGGGTT末端百分比含量最高,表明在催化延伸寡核苷酸的过程中,倾向于优先催化合成TAGGGTT端粒重复序列.尤其在前导引物3'末端为TT碱基和GT碱基最突出,其次是TA碱基, 而AG碱基和GG碱基不明显,推测水稻端粒酶模板RNA与前导引物的结合位点为一个碱基,偏好性为T>A>G.这些特征、特性对尚未克隆的水稻端粒酶RNA,以及对深入研究端粒末端结构及染色体遗传稳定性具有重要意义.     

人端粒酶RNA突变对HeLa细胞作用

端粒存在于真核生物染色体末端,由特定的DNA重复序列及与之特异性结合的蛋白质构成。在正常人体细胞中,每一次细胞分裂,由于DNA复制时的方向必须是从5’到3’端,因而伴随着染色体末端的端粒逐渐缩短。当端粒缩短到一定程度时,细胞开始走向凋亡。同时,端粒能在端粒酶作用下延伸,利用自身的RNA为模板合成端粒DNA。文章通过突变端粒酶RNA靠近模板的序列碱基A^61 A^62／GG以及G^63 G^64／AA,构建穿梭质粒,转染HeLa细胞,研究端粒酶位点突变对细胞生长的影响。研究结果显示不同的突变位点对HeLa细胞分裂活性有明显影响,这为深入研究肿瘤的分子遗传机制提供参考。     

具抗肿瘤活性的G-四链体核酸研究进展

G-四链体(G-quadruplex,G4)是由富含串联重复的鸟嘌呤碱基(G)的DNA或RNA链折叠形成的一种特殊的核酸二级结构.可形成G4结构的核酸序列在基因组和人端粒中广泛存在,对生理和病理过程起重要的调节作用.近年来研究发现,一些化学合成的G4核酸具有选择性的抗肿瘤增殖活性;其中AS1411是一个26个碱基的G4序列核酸,目前已作为抗癌药物进入二期临床研究.对G4核酸的结构和功能,抗癌活性及分子机理研究进行综合评述,并简要介绍G4核酸在相关领域的应用研究.     

时间分辨荧光检测组合式DNA芯片

研究了时间分辨荧光标记与检测组合式DNA芯片的方法。首先在薄玻璃片上原位合成寡核苷酸的序列片段，然后将之裁成小片，随后将带有不同DNA片段序列的小片拼接组合成组合式DNA芯片。利用4，7-二氯磺酰苯基．1，10-菲罗啉-2，9-二羧酸（BCPDA）多重标记的亲和素-生物素放大效应，建立了时间分辨荧光检测组合式DNA芯片的方法：芯片上的DNA序列经过杂交后，其互补序列末端的生物素可将多重BCPDA标记的亲和素联接，然后由BCPDA对铕离子（Eu^3＋）捕获与解离来实现杂交信号差别，并可实现对正配、单碱基错配、二及三碱基错配的时间分辨荧光信号差别的检测。对BCPDA标记的系列化合物进行了荧光性能表征，并对时间分辨荧光检测与传统荧光检测模式作了比较。     

PCR法制备地高辛标记探针斑点杂交检测鳗弧菌

以鳗弧菌(Vibrio anguillarum)toxR基因内366~571 bp之间的基因序列为靶序列,采用PCR法制备对鳗弧菌特异性的地高辛标记DNA探针,探针长度为206 bp。选取2株鳗弧菌和8株与鳗弧菌亲缘关系非常接近的常见水产动物致病弧菌,通过斑点杂交法对制备的探针进行特异性检测,结果显示该探针对鳗弧菌杂交阳性,而与弧菌属的其它8株细菌均无交叉反应。这表明该地高辛标记探针具有很强的特异性,它能够很好地对鳗弧菌感染进行检测。     

RNA二级结构预测SVMs模型研究

扩展NSSEL标签,对RNA分子中的stem-loop结构和伪结结构进行标记.将RNA分子序列中的碱基编码输入,经过支持向量机(support vector machines,SVMs)模型计算输出相应的结构标记.该模型经过训练后,待预测的RNA分子序列可得到对应的结构标识序列,这些标识序列可通过特定算法,唯一构建包括伪结在内的二级结构.实验结果表明,该算法在可接受的预测精度范围内具有较低的计算复杂度,克服了传统算法计算时间过长,无法在有限时间内得到有效结果的缺点.     

真菌产人参皂苷葡萄糖苷酶基因的调取

根据已知的人参皂苷糖苷酶(GluGF)的N端氨基酸序列设计简并引物,从Absidia Sp.R84g菌株的总RNA出发,应用RACE技术,快速扩增测序得到cDNA3′末端与cDNA5′末端的未知序列,利用扩增测序所得到的cDNA5′末端和cDNA3′末端的序列设计引物,进行二次RT-PCR扩增并测序得到GluGF基因的全序列。回收PCR产物测序,得到GluGF基因的序列全长为2149 bp,其中5′UTR长度为82 bp,3′UTR长度为114 bp,GluGF的CDS区序列全长为1 923 bp,所编码的氨基酸序列的长度为640个氨基酸。     

真菌产人参皂苷葡萄糖苷酶基因的调取

根据已知的人参皂苷糖苷酶(GluGF)的N端氨基酸序列设计简并引物,从Absidia Sp.R84g菌株的总RNA出发,应用RACE技术,快速扩增测序得到cDNA3′末端与cDNA5′末端的未知序列,利用扩增测序所得到的cDNA5′末端和cDNA3′末端的序列设计引物,进行二次RT-PCR扩增并测序得到GluGF基因的...     

基于基因表达谱芯片的人参对衰老脑组织作用研究

应用生物芯片技术诠释中药抗衰老作用基因机理的研究日益得到人们的重视。针对D-半乳糖造成的小鼠亚急性衰老模型,采用Cy3和Cy5 2种不同的荧光染料,通过逆转录反应将实验组和对照组的小鼠脑组织细胞mRNA分别标记成2种探针,混合后与小鼠基因表达谱芯片杂交,借助计算机分析扫描芯片荧光信号图像,寻找出经人参作用后表达有显著差异的基因,并对这些基因进行了生物信息学分析。研究表明人参水煎剂对衰老小鼠脑组织的基因表达谱具有显著影响,其中N ckap1基因及A tp5a1基因可能是人参抗衰老作用的靶基因。     

基于调制光谱研究GaN的光学特性

利用调制光谱技术研究了以分子束磊晶法成长于GaAs基板上的GaN薄膜的光学特性。结果表明,在PR、CER及PzR谱线中均可观察到激子跃迁信号En与旋轨道分裂信号（E0＋△0）,且分裂量△0约为22meV。在15～300K的温度范围内均可观测到激子跃迁信号E0、自旋轨道分裂信号（E0＋△0）及DA-Pair信号;但温度在400K和500K时谱线中只存在激子跃迁信号E0与DA—Pair信号,而观察不到信号（E0＋△0）。随着温度的升高,样品的跃迁信号E0与自旋轨道分裂信号（E0＋△0）逐渐向低能量反方向移动。     

一类p-Laplacian椭圆抛物型偏微分方程解的存在性

研究一类定义在区域(0,T)×Ω上的p-Laplacian椭圆抛物型偏微分方程pt(u)-▽·(|▽u|p-2▽u)=f(t,x)的解的存在性,Ω是RN的一个有界区域(N≥1),边界Ω是C2光滑的,其中p≥2,p(u(0,x))=p0.基于将原方程变形为次微分的形式pt(u(t))+φt(u(t))■f(t),利用两次逼近证明了解的存在性。     

同分布条件下局部次指数随机变量和的有界性

记s△为局部次指数分布族,F、G是s△中两个不同的局部次指数分布,Gn＊表示的是G自身的n重卷积,在上述条件下,Asmussen（2003）介绍了Gn＊（x＋△）/F（x＋△）的相关界。本文所研究的是把上式中Gn＊换成Fn＊,考虑在同分布条件下Fn＊（x＋△）/F（x＋△）的相关界,其中Fn＊是分布F自身的n重卷积。     

△（G）=6时的Halin图的可区别数

结合n阶圈Cn可区别数的证明,得证了△（G）=6时n阶以上Halin图G的可区别数分别2,△（G）表示图G的最大顶点度.     

利用菲涅尔圆孔衍射探测三元化合物超导配对对称性

提出了一个特殊菲涅尔圆孔衍射实验,核心由正常金属/绝缘层/超导体多层膜构成,用来精确探测超导配对对称性。理论分析表明,对于超导层是s波配对,△（-k）=△（k）,且满足k·r=nπ的情况下,那么衍射图样的零阶为暗纹,其中k为波矢,n为整数。反之,如果△（-k）=-△（k）,且在其他条件不变的情况下,那么零阶衍射图样为明纹。从而可以利用这种简单易行的实验途径,对超导电子的配对对称性进行无模棱两可的判定。最后把这套装置应用到最近发现的AFeSe三元化合物超导体,给出了可能的具体实验方案,来探测这种多费米面复杂的电子配对对称性。     

5’-溴水杨基荧光酮-钼（Ⅵ）配合物与蛋白质相互作用及应用

用吸光光度法研究5’-溴水杨基荧光酮-钼（Ⅵ）配合物作为光谱探针与人血清（HSA）和牛血清（BSA）蛋白质作用的光谱性质、反应条件和影响因素,建立了利用金属配合物作为探针测定痕量蛋白质的方法．结果表明,在pH=3．6的HCl-NaAc缓冲溶液中,5％OP介质可以显著增强体系的灵敏度．在528nm处有一个增强的吸收峰,且强度与BSA的质量浓度在一定范围内呈良好线性关系．HSA,BSA质量浓度的线性范围均为2-50．0ug／mL;线性方程△A：0．0021p＋0．4161,△A=0．0024p＋0．4065,相关系数r=0．995,0．994;表观摩尔吸光系数e=3．02×10^6,2．93×10^4L／（mol·cm）;回收率为98．4％～96．6％,相对标准偏差为1．8％～1．1％．该方法用于人血清中蛋白质的测定灵敏度好,线性范围宽,稳定性好．该方法可直接用于人血清中蛋白质质量含量的测定．     

二溴-苯基荧光酮-Mo（Ⅵ）配合物与蛋白质相互作用及应用

研究了二溴-苯基荧光酮-Mo（Ⅵ）配合物与人血清（HSA）和牛血清（BSA）蛋白作用的光谱性质、反应条件和影响因素,建立了利用金属配合物作为探针测定微量蛋白质的方法.在pH=3.8的条件下,二溴-苯基荧光酮-Mo（Ⅵ）配合物与BSA体系在530nm处有一个增强的吸收峰,且强度与BSA的质量浓度呈线性关系.在实验优化的条件下,BSA,HSA质量浓度的线性范围为2～30.0,2～25.0μg/mL;线性方程△A=0.0202ρ＋0.3987,△A=0.0249ρ＋0.1962,相关系数r=0.994,0.986;摩尔吸光系数ε=4.08×106,3.07×106L（/mol·cm）.该方法用于HSA样品中蛋白质的测定,操作简单、灵敏度好、线性范围宽、稳定性好。     

点可区别全色数的一个上界

设G是简单图,f是从V（G）UE（G）到{1,2,…,k）的一个映射．对每个u∈y（G）,令c（u）={f（u）}v∈V（G）,uv∈ E（G）}．如果,是k-正常全染色,且对任意u,v∈V（G）（u≠v）,有c（u）≠c（v）,那么称f为图G的k-点可区别全染色（简记为k-VDTC）．数χvt（G）=min{k｜G-有k—VDTC}称为图G的点可区别全色数．通过应用概率方法,证明了对任意最大度A≥2的图G,χvt（G）≤32（△＋1）．     

Electrochemical determination of Gibbs free energy of formation of magnesium ferrite

The standard Gibbs free energy of formation of magnesium ferrite was determined by means of two types of solid state electrochemical cells: one using MgZr4(PO4)6 (MZP) as the solid electrolyte and the other using CaF2 as the solid electrolyte. The first cell was operated in the range of 950 to 1100 K. The second cell was operated in the range of 1125 to 1200 K. The reversibility of the cell EMFs was confirmed by microcoulometric titration. The Gibbs energy changes of magnesium ferrite relative to component oxides were calculated based on EMF measurements and are given by following expressions, respectively: △G(o)Ⅰ = -3579-15 T (J/mol) and △G(o)Ⅱ =6258-24.3 T (J/mol). The results obtained from two different cells are consistent with each other. The results also are in agreement with Rao's and Tretjakov's data in the measured temperature range. When the Gibbs free energies of formation of MgO and Fe2O3 were substituted in the reaction, the Gibbs free energies of formation of MgFe2O4 was obtained in two temperature ranges and the formations are shown as follows: △G(o)Ⅰ Formation = -1427394 360.5 T (J/mol) and △G(o)Ⅱ Formation = -1417557 351.2 T (J/mol).     

一类非线性双曲方程整体强解的渐近行为

研究一类四阶强阻尼非线性双曲方程ut-△ut-△utt-△utt=f（u）的初边值问题整体强解的渐近行为,其中非线性项f满足临界指数增长条件．结合能量估计得到了该问题整体强解的唯一性和一致有界性,并且证明了整体强解在D（A）×D（A）是一致稳定的,改进了已有的结果．