群体遗传学AI模型在我国弯曲杆菌感染散发病例归因中的初探与应用

目的 探索群体遗传学模型在食源性疾病归因分析中的应用,定量识别导致我国弯曲杆菌感染散发病例的主要宿主来源。方法 利用PubMLST公共数据库获得我国弯曲杆菌MLST数据,采用群体遗传学AI模型（AIM）对弯曲杆菌病例进行归因分析。结果 弯曲杆菌感染散发病例归因于鸡的贡献比例最高,为50.49%,其次为鸭鹅、牛和猪,分别为22.56%、18.36%和4.52%,归因于环境和野生鸟类的贡献比例较低,分别为0.78%和0.66%。结论 本研究采用AIM方法,实现了结合微生物分子分型数据和统计学建模的归因方法在我国食源性疾病中的实践应用,定量获得了不同来源对我国弯曲杆菌感染散发病例的贡献,并为下阶段归因工作提供了方向和思路。     

广州市非伤寒沙门菌感染流行病学负担分析

评估广州市非伤寒沙门菌感染流行病学负担,提出食源性疾病监测策略。方法 在广州市6区设9家食源性疾病主动监测医院,调查12个月腹泻病例采样率、沙门菌检测率、实验室检测敏感度,进而推算全市医疗机构相应数据;在广州市3区开展人群腹泻随机抽样入户调查,调查腹泻病例就诊率;通过传染病报告信息管理系统获得监测医院和全市医疗机构沙门菌感染性腹泻报告率;利用食源性疾病流行病学负担金字塔模型,通过倍数校正和不确定性分析估计沙门菌感染实际发病数,比较食源性疾病主、被动监测数据用于疾病负担分析的优劣。结果 监测医院12个月腹泻病例平均采样率38.34%,沙门菌检测率28.24%,实验室检测敏感度87.5%,人群腹泻病例就诊率23.91%,沙门菌感染性腹泻报告率42.98%;全市医疗机构推算采样率38.34%,检测率28.24%,实验室检测敏感度47.5%,报告率20.94%,估计广州市沙门菌感染病例64 586例(95%CI:44 136～101 921),年发病率508.5/10万(95%CI:347.5～802.5/10万),全年全市被动报告病例仅171例,报告年发病率1.3/10万;经估算5岁以下年龄组(3 583.2/10万)年发病率最高,15～24岁年龄组(23.5/10万)最低。结论 首次验证疾病负担金字塔模型在我国食源性疾病负担研究领域的适用性;表明主动监测一定程度上提升了食源性疾病尤其是特定病原体感染采样率、检测率、实验室检测敏感度和报告率,有助于对负担作出更准确和积极有效的估计;结果提示广州市非伤寒沙门菌感染负担较重,5岁以下年龄组人群负担水平尤其显著。     

上海市非伤寒沙门菌感染的流行病学负担概率估计

目的概率评估上海市非伤寒沙门菌(以下简称\"沙门菌\")感染的流行病学负担,为上海市食源性疾病的防控提供决策依据。方法随机抽取上海市60个街道/乡镇,通过入户问卷调查获得居民急性胃肠炎的人年发病及就诊情况。随机抽取上海市23家监测医院,获得患者采样率、检测率、阳性率等数据。从国家\"传染病报告信息管理系统\"中获得沙门菌感染病例的报告率。根据疾病发病与报告金字塔建立模型,采用蒙特卡洛模拟,从主动监测和被动报告两种方法估计上海市沙门菌流行病学负担。结果上海市居民急性胃肠炎人群调查获得年发生率为23 261例/10万,患者就诊率为20.47%(26/127)。监测医院腹泻病例的粪便采样率为21.66%(5 974/27 587),沙门菌阳性率为3.53%(211/5 974)。沙门菌阳性的报告率为81.04%(171/211)。根据被动报告病例直接计算的年发病率仅为5例/10万。被动报告概率估计的上海市沙门菌年发病率为270例/10万[95%可信区间(95%CI):185~399],估计每年发病人数6.21万(95%CI:4.25~9.18),总低估系数为60∶1。主动监测估计沙门菌感染年发病率为686例/10万(95%CI:549~843),估计每年发病人数为15.78万(95%CI:12.64~19.42),总低估系数为154∶1。经过比较,主动监测估计结果为被动报告估计结果的2.54倍。沙门菌感染具有较明显季节性,每年5~8月是沙门菌感染的高发期。结论食源性疾病主动监测估算沙门菌感染年发病率远高于被动报告估算的年发病率,说明主动监测在掌握疾病发病、就诊和流行病学负担估计方面具有较好的优势,同时发现患者就诊率是影响沙门菌感染总病例数估计的最大因素。本研究进一步证明疾病负担金字塔模型在我国食源性疾病单病种疾病负担领域的可行性。     

2018年上海市非伤寒沙门菌感染流行病学特征分析

目的 了解上海市非伤寒沙门菌(以下简称“沙门菌”)感染的流行病学特征,为沙门菌感染的预防和控制提供科学依据。方法 应用描述流行病学的方法,对上海市26家食源性疾病监测哨点医院感染性腹泻病例的流行病学信息和沙门菌检测结果进行统计分析。结果 收集到5 580例感染性腹泻病例和其标本,沙门菌检出率为4.19%(234/5 580),其血清型以肠炎沙门菌和鼠伤寒沙门菌为主。不同性别、年龄和职业人群的沙门菌检出率差异无统计学意义(P＞0.05),春夏季节是沙门菌检出的高发季节。有发热症状或者发生水样便的病例,其沙门菌检出率高于无发热症状和无水样便的病例。餐饮服务业和单位食堂的病例中沙门菌检出率相对较高。结论 上海市沙门菌感染的血清型以肠炎沙门菌和鼠伤寒沙门菌为主,感染高峰出现在春夏季节。考虑到餐饮服务业和单位食堂的风险相对较高,食品安全监督管理部门应加强对其卫生监管。     

2006—2021年温州地区沙门菌感染流行病学特征分析

目的 分析2006—2021年温州地区沙门菌感染流行病学特征,为沙门菌感染的防控提供科学依据。方法 对沙门菌进行鉴定确认和血清学分型,并对流行病学特征进行深入分析。结果 2006—2021年在温州地区42 300份食源性疾病腹泻患者中,共分离出沙门菌1 232株,总分离率为2.91%,共鉴定出90个血清型（14个血清群）,其中菌群以O：4（B）、O：9（D1）、O：3,10（E1）、O：8（C2-C3）、O：7（C1）为主;血清型以鼠伤寒沙门菌、肠炎沙门菌、伦敦沙门菌和德尔卑沙门菌为主;18～60岁、61岁以上和小于２岁婴幼儿是感染的主要人群;春、夏、秋季易感,具有明显的季节性;5～11月是食源性沙门菌检出的高峰期。结论 温州地区沙门菌感染在季节分布、人群分布等方面具有明显的流行病学特征,应该继续加强食源性疾病监测,进一步提高食品安全隐患的早期识别、预警与防控能力。     

黑龙江省食源性非伤寒沙门菌急性胃肠炎疾病负担估计

目的 估计黑龙江省非伤寒沙门菌导致的食源性急性胃肠炎的疾病负担,为食源性疾病的管理和监测提供依据。方法 通过黑龙江省急性胃肠炎疾病负担人群调查获得急性胃肠炎的就诊率;通过食源性疾病监测系统获得黑龙江省的监测数据,从而计算非伤寒沙门菌的采样率、检测率及报告病例数。利用上述两部分数据构建金字塔模型,并估计黑龙江省由非伤寒沙门菌导致的急性胃肠炎的病例数量及发病率。利用@Risk8.2软件对非伤寒沙门菌导致的急性胃肠炎的发病数据进行概率估计以及不确定性分析,并进一步估计由非伤寒沙门菌导致的食源性急性胃肠炎发病情况。结果 估计黑龙江省由非伤寒沙门菌导致的食源性急性胃肠炎76 224人次（95%CI:60 203～96 626）,年发病率202.0/10万（95%CI:159.6/10万～256.1/10万）。结论 非伤寒沙门菌给黑龙江省造成了较大的食源性疾病负担,老年人和婴幼儿的疾病负担尤为显著。     

一起山西省临汾市尧都区农村自办宴席鼠伤寒沙门菌引起的食源性疾病暴发事件调查

目的 对一起农村自办宴席中因进食被鼠伤寒沙门菌污染的食物而引起的食源性疾病暴发事件进行调查分析,为今后处置类似事件提供依据。方法 采用描述性流行病学方法和分析性流行病学结合病原学检测,对2019年4月山西省临汾市尧都区一起农村自办宴席由鼠伤寒沙门菌引起的食源性疾病暴发事件进行数据分析。结果 共出现病例41例,患病率14.64%（41／280）。主要临床表现为腹痛（95.12%）、腹泻（92.68%）、恶心（34.15%）、头晕（31.71%）;流行曲线显示点源暴露,经过病例对照和单因素结果分析显示可疑食物为凉拌猪头肉（OR=3.85,95%CI：1.52~9.75）;3名患者的大便样本中检出鼠伤寒沙门菌,与患者的临床症状及潜伏期符合。结论 本次事件是一起因进食受鼠伤寒沙门菌污染的凉拌猪头肉导致的食源性疾病暴发事件。     

山东省生猪屠宰环节非伤寒沙门菌污染情况及耐药特征分析

目的 了解生猪屠宰过程中非伤寒沙门菌（NTS）的污染情况和耐药特征。方法 于2021年5月和8月分别从山东省两个规模化生猪屠宰场采集共170份胴体和环境样品。对分离的NTS运用全基因组测序（WGS）技术结合生物信息学技术进行数据分析。结果 从29份样品中检出NTS,检出率为17.1%。血清型预测显示鼠伤寒沙门菌为优势血清型,占58.6%（17/29）。药敏结果显示29株NTS呈现15种耐药谱,四环素耐药率最高（100.0%,29/29）,其次为氨苄西林和氯霉素（79.3%,23/29）,多重耐药率达86.2%（25/29）。多位点序列分型（MLST）结果显示ST19为主要型别,占48.3%（14/29）。耐药基因分析表明主要携带tet（A）、tet（B）、tet（M）、bla_TEM-1B、bla_CMY-97、floR、cmlA1等。结论 山东省部分生猪屠宰场屠宰环节存在NTS污染现象,且NTS对多类抗生素表现出多重耐药性,提示应重视生猪屠宰环节中NTS的污染与防控。     

基于全基因组测序的鼠伤寒沙门菌食源性疾病暴发事件分离株分子特征研究

目的 分析一起鼠伤寒沙门菌引起的食源性疾病暴发事件,通过实验室检测和相似性分析研究病原菌的分子特征,为临床诊疗、事件溯源和防控提供科学依据。方法 对采集样本采用FilmArray多重PCR系统筛查检测,利用质谱鉴定、血清分型鉴定病原菌;对分离菌株进行抗生素药敏试验、脉冲场凝胶电泳（PFGE）分析、全基因组测序;比对沙门菌MLST获得序列型别（ST）、cgMLST、rMLST并进行聚类分析;分析分离株的耐药基因和毒力因子。结果 共分离沙门菌15株,其中可疑食物来源3株,病人粪便来源12株,血清型鉴定结果均为鼠伤寒沙门菌;PFGE指纹图谱呈两种带型,病人粪便来源12株与可疑食物来源株2株为同一带型,相似度为100%,另1株可疑食物来源株带型与其他带型相似度为88.89%;15株分离株MLST均为ST19型,rST-138396（new）型,cgMLST核心基因组位点差异为1~15个,wgMLST核心基因组位点差异为1~395个;15株分离菌耐药谱为：氨苄西林-氨苄西林/舒巴坦-头孢唑啉-头孢替坦-阿米卡星-庆大霉素-妥布霉素-左氧氟沙星-呋喃妥英-链霉素-萘啶酸-四环素-氯霉素;菌株基因组携带13种相关耐药基因、271种已知的毒力基因。结论 本次食源性疾病暴发事件由共同来源的、具有相同分子分型特征的鼠伤寒沙门菌污染食物引起。该事件分离的菌株能够产生超广谱β-内酰胺酶,对13种抗菌药物耐药,为严重的多重耐药鼠伤寒沙门菌。     

北京市食源性非伤寒沙门菌的分子分型和耐药性研究

目的了解北京市食源性非伤寒沙门菌的分子特征及耐药情况。方法对2004—2010年北京市食源性致病菌监测网收集的100株沙门菌进行脉冲场凝胶电泳(PFGE)分型和抗生素敏感性检测。结果 100株非伤寒沙门菌通过PFGE分型分为62个不同的带型,每个带型包含1~11株菌。抗生素敏感性结果显示,100株菌中有55株菌表现为对至少1种抗生素耐药,其中多重耐药菌株15株。菌株对各抗生素的耐药率为萘啶酸40%、四环素30%、氯霉素15%、庆大霉素10%、甲氧苄啶/磺胺甲恶唑10%、环丙沙星9%、头孢西丁1%、头孢噻肟0%。结论沙门菌PFGE带型和耐药谱均与血清型存在很高的一致性。提示北京市食源性非伤寒沙门菌的耐药情况比较严重,开展对该菌分子分型与耐药特征分析的联合监测意义重大。     

Animal Feed Production and Contamination by Foodborne Salmonella

Animal feeds can potentially become contaminated with foodborne Salmonella either during harvesting, processing at the feed mill or during storage. Any environment that comes in contact with feed during these stages that also harbors Salmonella can theoretically contaminate the feed. This also holds true for ingredients that are combined with feeds as they are being mixed at the feed mill. Animal feeds are also potential reservoirs for cross contamination from Salmonella containing vectors and environmental sources while being fed to animals. Although several factors may determine the extent of contamination, the potential for infection in animals these have not been well characterized. In addition, certain animal management and feeding programs can lead to animals becoming more susceptible to Salmonella colonization and invasion. Control measures to limit Salmonella contamination of feed include agents that directly reduce or destroy the organism in feed. Antimicrobial compounds and management strategies have also been developed for preventing colonization and eliminating Salmonella colonized in the gastrointestinal tract. The future prospects for minimizing Salmonella contaminated feed will probably involve combining more efficient monitoring and sampling approaches with more rapid and sensitive detection technologies.

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Zusammenfassung (Redaktion). Futtermittel k?nnen schon bei der Ernte der Futterpflanzen sowie w?hrend der Futter-Herstellung oder -Lagerung von Salmonellen kontaminiert werden; grunds?tzlich kann dies überall dort passieren, wo Futtermittel mit der Au?enwelt (mit Salmonellen) in Kontakt kommen. Dies gilt ebenso für Zusatzstoffe, die den Futtermitteln in Futtermühlen beigemengt werden. Futtermittel sind auch potenzielle Reservoire für die Kontamination mit Salmonellen w?hrend des Fütterns von Tieren. Obwohl das Ausma? einer solchen Kontamination mit Salmonellen von etlichen Faktoren bestimmt wird, sind die Umst?nde, die zur Infektion der Tiere führen k?nnen, noch nicht ausreichend charakterisiert worden. Au?erdem k?nnen bestimmte Tierhaltungs- und Fütterungsverfahren eine Infektion von Tieren durch Salmonella sogar begünstigen. Um dieses zu verhindern, k?nnen Wirkstoffe eingesetzt werden, welche die Salmonella-Populationen im Futter reduzieren oder zerst?ren. Es wurden ebenso Verfahren mit antimikrobiell wirksamen Stoffen entwickelt, um eine Besiedlung des Gastrointestinaltraktes durch Salmonella zu verhindern bzw. dort bereits vorhandene Samonellen abzut?ten. Zukünftig mu? ein effektiveres Monitoring- und Probenahme-Verfahren mit schnelleren und empfi ndlicheren Nachweisverfahren kombiniert werden, um eine eventuelle Kontamination von Futtermitteln durch Salmonella zu minimieren.

     

2017—2021年安徽省食源性腹泻病例病原学分析

目的 分析安徽省2017—2021年食源性腹泻病例病原学特征,为制定相关防控措施提供依据。方法采用横断面研究方法,收集2017—2021年安徽省22家食源性疾病病原学监测医院上报被采集肛拭子/粪便的腹泻病例信息,并按要求对采集的患者标本开展病原学检测。分类资料采用χ_趋势²或χ²进行组间比较。结果 2017—2021年共采集标本15 484份,病原体总检出率为23.75%(3 678/15 484)。其中,诺如病毒检出率最高,为10.01%(1 550/15 484);其次是沙门菌(6.16%,954/15 484)、致泻大肠埃希菌(6.10%,944/15 484)、副溶血性弧菌(1.66%,257/15 484)、志贺菌(1.00%,155/15 484)。不同年份(χ_趋势²=11.249,P<0.05)和不同季度(χ_趋势²=146.119,P<0.05)病原体的检出率,均差异有统计学意义。各年龄段人群中,年龄<1...     

婴幼儿食品中肠杆菌科重点致病菌污染风险及对我国标准修订的启示

婴幼儿食品因微生物污染而导致食源性疾病的问题通常会引起国际关注,由于婴幼儿人群的特殊性使得婴幼儿食品需要特殊且严格的食品安全要求。本文对近年来国内外婴幼儿食品中肠杆菌科所属的沙门菌和克罗诺杆菌（阪崎肠杆菌）污染情况与疾病风险进展进行了综述,并通过对国内与国际婴幼儿食品产品及生产过程中微生物限量标准比对分析,为我国婴幼儿食品国家标准的修订提供技术支撑。     

一起因食用热狗沙拉面包引起的肠炎沙门氏菌食源性疾病事件调查分析

目的 对一起食源性疾病事件进行调查分析,为预防此类事件的发生提供参考。方法 通过现场流行病学、食品卫生学调查、实验室检测,查找可疑食品、致病因子及污染来源。结果 该事件共搜索198名病例,患病率为50.13%(198/395),主要症状以腹泻（90.40%）、发热（87.88%）、腹痛（66.16%）为主,平均潜伏期为13.8 h(4～47 h)。57名病例标本、3份食品、2份食品材料、1份物表涂抹样均培养出肠炎沙门氏菌,对3份食品、2份食品原材料、1份物表涂抹样随机抽取的病例标本进行脉冲场凝胶电泳分子溯源分析,结果显示上述样品DNA指纹图谱相似度为100%。结论 此次事件为一起因食用被沙门氏菌污染的热狗沙拉面包引起的食源性疾病事件。建议食品监管部门应加强食品生产企业的监管和对食品从业人员的食品安全相关知识培训,避免类似事件的发生。     

食品中蜡样芽孢杆菌污染的预测模型及风险评估进展

蜡样芽孢杆菌（Bacillus cereus）是一种食品中常见的食源性条件致病菌,其引发的食源性疾病不仅对食用者健康造成严重损伤,也对社会经济造成严重损失。本文综述了近年来国内外对食品中Bacillus cereus污染预测模型的研究及其在风险评估中的应用进展。将影响因素、食品基质、生产链环节、初级模型和次级模型常用拟合模型等进行总结,发现当前预测模型研究最多的是温度、食品成分、水分活度、pH值等因素对Bacillus cereus增殖影响,而温度是主要影响因素;食品主要集中于动物性食品和大米及其制品。Gompertz模型、Logistic模型、Baranyi模型、Weibull等模型常用于拟合生长或失活曲线,建立初级模型;二次多项式模型和平方根模型常用来拟合生长速率或延滞期的变化,建立次级模型;在此基础上,用软件系统建立三级模型。当前的风险评估研究仅涉及到生产环节或从销售到消费环节,尚未见到某类食品从原料环节到消费环节Bacillus cereus预测模型研究的报道。本文展望了食品中Bacillus cereus污染的风险评估研究,以期为今后的研究提供参考。     

循证美国近50年感染性沙门菌流行病学变化趋势

目的 循证美国近50年感染性沙门菌优势菌型流行病学变化趋势。方法 统计和分析美国1968—2011年人感染的30种沙门菌型（包括肠内和肠外优势型）与养殖动物（疫病与非疫病组）沙门菌的生态优势菌型,剖析美国2006—2016年间国家肠道沙门菌型病例监测大数据,关联2006—2017年美国本土食源性和宠物源性沙门菌型的跨州暴发数据。结果 美国近50年养殖业使某些沙门菌型与养殖动物间形成定殖与致病的生态特征,定殖动物的沙门菌优势菌型与人群感染菌型间存在暴露剂量-反应关系,人与动物长期互作使两者沙门菌的优势菌型高度契合;美国近50年人群感染沙门菌基线呈渐增趋势,病例多发“一老一小”,以1岁以下幼儿发病率最高,南部和中西部病例偏多,2008年肠炎替代鼠伤寒成为美国沙门菌首位人群感染菌型;归因食源性跨州暴发的食物,具有从传统的肉、蛋、奶,向蔬菜、即食食品、水果等过渡的消费特征,2006年后逐渐增多,与家庭养殖爬行动物等活体动物有关的宠物源沙门菌跨州暴发属于行为生态型传染病,较食源性暴发的跨时更长、病例更分散和隐匿性更高。结论 美国沙门菌的疾病生态学特征,可为我国兽医与人的沙门菌病的综合防控提供参考。     

中国大陆2010—2020年蛋及蛋制品引发的食源性疾病暴发事件分析

目的 分析中国大陆地区由蛋及蛋制品引发的食源性疾病暴发事件的发生规律及流行病学特点,为制定相应的预防和控制措施提供科学依据。方法 对2010—2020年国家食源性疾病暴发监测系统中报告的蛋及蛋制品引发的食源性疾病暴发事件的流行病学特征进行描述性分析。结果 2010—2020年中国大陆共报告蛋及蛋制品引发的食源性疾病暴发事件529起,发病3 609人,其中死亡3人,年平均发病率每千万人口2.4人。以夏秋季节为主,其中又以7月事件数最多,占20.6%（109/529）;此类事件主要分布于西南、华东和华中地区,以西南地区的事件数最多,占59.2%（313/529）,其中皮蛋引发的事件数、发病人数和死亡人数均最多,分别占61.8%（327/529）、41.1%（1 485/3 609）和66.7%（2/3）。皮蛋的致病因素主要是沙门菌（60.9%,199/327）,主要感染原因是原料污染（20.5%,67/327）和存储不当（11.0%,36/327）,皮蛋引发的事件中西南地区家庭最多,占42.5%（139/327）,其次是西南地区街头摊点,占18.7%（61/327）。结论 皮蛋是高危食品,沙门菌是主要致病因素,原料污染和存储不当是主要污染环节,建议相关监管部门加强合作,加强对皮蛋的监测和街头摊点的管理,在高危季节的西南地区落实食品安全的健康教育。     

重庆市某区一起肠炎沙门菌引起的食源性疾病暴发事件调查分析

目的 对一起因食用被肠炎沙门菌污染面包引起的食源性疾病暴发事件进行调查分析,为今后处置类似事件提供依据。方法 利用描述性流行病学方法分析病例的临床特征、流行病学分布及相关危险因素,开展回顾性队列研究确定病因食品,采集病例和食堂从业人员生物标本、剩余食品和环境样品进行实验室检验,结合卫生学调查情况,综合分析暴发事件的发生原因。结果 回顾性队列研究显示2021年5月20日重庆市某食品厂生产的某批次预包装面包为可疑食物,在食用该批次面包的73人中,有55人发病,患病率为75.34%,潜伏期中位数为15 h,同时,在剩余食品、相关环境样品、病人肛拭子中均检出肠炎沙门菌。结论 本次事件是一起因进食受肠炎沙门菌污染的面包导致的食源性疾病暴发事件。