中国野桑蚕mtDNA COⅡ-ATPase 6基因区域的序列测定及分析

对中国山东青州野桑蚕mtDNA COⅡ-ATPase 6基因区域进行了序列测定与分析。结果表明在所测定的1．9kb左右的片段中,含有COⅠ基因的部分序列、tRNA—Leu基因、COⅡ基因、tRNA-Lys基因、tRNA—Asp基因、ATPase 8基因、ATPase 6基因和部分COⅢ基因,该片段的基因组织结构与其他家蚕／野桑蚕的基本一致,显示蚕类线粒体基因排列的保守性。COⅡ、ATPase 8、ATPase 6三个结构基因不同家蚕／野桑蚕之间的比对分析表明,它们在核苷酸水平、氨基酸水平的同源性很高。结构基因密码子与其他蚕类的相似;3个tRNA基因(tRNA—Leu、tRNA—Lys、tRNA—Asp)的碱基错配率高,TψC环缺乏相对保守的T-ψ-C-Pu-A序列,各臂的碱基配对数、各环碱基数目变化较大。以CoⅡ、ATPase 8、ATPase 6基因的核苷酸序列进行家蚕／野桑蚕的分子进化分析表明,家蚕同中国野桑蚕的亲缘关系最近,是家蚕起源于中国野桑蚕的又一证据。     

苏州大学学报（工科版）2005年总目录（卷终）

第1期中国野桑蚕mtDNACOⅡ-ATPase 6基因区域的序列测定及分析何泽,陈淼,郑小坚等(1)………………………………………家蚕微孢子虫16SrRNA基因序列及分子进化潘中华,曹广力,薛仁宇等(8)……………………………………………………………水溶性纳米级纤维毡的纺制工艺…徐明,戴宏钦,潘志娟等(14)家蚕和野蚕杂交后代线粒体的异质性贡成良,蜷木理,原和二郎(19)……………………………………………………………………桑叶天然染料的萃取和稳定性研究邓一民,张高军,凌国宇等(23)………………………………………………………………………纤维…     

石柱参人参皂苷合成酶基因SS的克隆与序列分析

以石柱参近缘种野生山参的人参皂苷合成酶基因SS为模板,利用NCBI中的primer-BLAST设计特异性引物,应用PCR技术从石柱参叶片基因组DNA克隆了SS基因。序列分析显示,克隆的基因片段为1 285 bp,能够编码25个氨基酸以上的ORF (Open Reading Frame)有10个,其中最长能够编码295个氨基酸。NCBI序列对比显示,该基因与人参的人参皂苷合成酶基因SS的同源性为97. 05%,与西洋参的人参皂苷合成酶基因SS的同源性为96. 63%。这些数据表明,从石柱参克隆的基因为其人参皂苷合成酶基因SS。     

中国浓香型白酒窖池中原核微生物的特性及系统发育分析

利用PBS缓冲液富集窖池酒醅中的微生物菌体，研究窖池中微生物区系分布及相互关系。在分子分类水平上，运用PCR扩增技术和16S rDNA序列同源性分析等方法测定窖池中原核微生物的16S rRNA基因全序列，根据与基因数据库中相似菌群16S rDNA序列的同源性比较建立系统发育树图。结果发现：当浓香型窖池中酒醅发酵60d后，窖池中心部位仅有细菌分布且主要分为4个菌群，高G C(mol)％革兰氏阳性放线菌群、低G C(mol)％革兰氏阳性乳酸细菌群、梭杆菌群、革兰氏阴性紫细菌群，其中，β-紫细菌群约占窖池中原核微生物的80％。     

脑膜炎奈瑟氏菌NspA基因的克隆及序列分析

为了获得脑膜炎奈瑟氏菌(Nesseria meningitidis,Nm)表面蛋白A(NspA)基因,从脑膜炎患者的血液中分离出脑膜炎奈瑟氏菌并对其进行鉴定.然后根据NspA基因的核苷酸序列,设计合成一对特异性引物,通过聚合酶链式反应(PCR)技术体外扩增得到NspA基因.进行克隆、测序及序列分析.结果显示,其核苷酸序列同源性与Genbank报道的标准菌株相比同源性为100%.克隆获得的基因保持了脑膜炎奈瑟氏菌表面蛋白NspA基因的完整性,保留了其抗原性,为以后进一步开发脑膜炎基因工程疫苗奠定了实验基础.     

ND序列加权和的收敛性

在ND序列样本下,利用马尔科夫不等式及ND序列相应的矩不等式,讨论了在一定条件下ND序列加权和的收敛性质,并得出了ND序列加权和收敛性的两个结论。     

ND序列加权和的收敛性

在ND序列样本下,利用马尔科夫不等式及ND序列相应的矩不等式,讨论了在一定条件下ND序列加权和的收敛性质,并得出了ND序列加权和收敛性的两个结论.     

基于动态算法的序列分析

为了获得2009年新型甲型H1N1流感病毒与2008流感病毒的基因序列及氨基酸序列的一致性,以便对一个基因家族的生物学特征有一个简明扼要的了解,针对目前流行的新型甲型H1N1流感病毒的基因序列及其所编码的氨基酸序列,采用动态规划算法对其一级序列进行序列相似度分析,获得了2009年新型甲型H1N1流感病毒的NA和M基因片段以及2008年猪源性甲型H1N1流感病毒的相应基因片段同源性高、在有些位点发生了基因突变增添和突变缺失等重要基因信息。为此次新型甲型H1N1流感病毒的研究提供了依据。     

异源包装家蚕核型多角体病毒的特性研究

利用PCR方法分离AcMNPV多角体蛋白基因及其启动子的特异片段 ,将该基因片段正确克隆到转移载体pBacPAK(API 4)中 ,得到重组转移载体pBacOAc(API4)。将它与已缺失多角体蛋白基因的BmNPV(即 :CrBK)基因组DNA共转染BmN细胞 ,将AcMNPV多角体蛋白基因及慈菇蛋白酶抑制剂基因定向克隆到CrBK基因组中 ,得重组病毒BmNPV(OAc -API4)。发现该重组病毒能被AcMNPV多角体蛋白所识别 ,并形成多角体包埋型病毒 ;CrBK粒子能被正确包装 ,同时也能表达慈菇蛋白酶抑制剂。比较了该重组病毒在家蚕细胞及家蚕幼虫中的增殖情况 ,发现它的芽生型病毒能正常感染家蚕细胞和经皮下注射的家蚕幼虫 ,然而其包埋型病毒不能经口感染家蚕幼虫。表明NPV的经口感染与多角体蛋白的种类有关。     

一株伯克氏菌中两个阿魏酸酯酶的比较分析

本文从NCBI数据库中检索得到Burkholderia phytofirmans PsJN的两个阿魏酸酯酶基因序列,分别标记为BpfaeI和Bpfae2,运用生物信息学方法对其核苷酸序列、编码的氨基酸序列进行分析,并对其二级和三级结构进行预测。结果表明,Bpfael的基因全长为1671bp,该基因编码的氨基酸为556aa,此蛋白质的等电点为8.33,分子量为59978.22Da。Bpfae2的基因全长为1734bp,该基因编码的氨基酸为577aa,此蛋白质的等电点5.42,分子量为59339.25Da。序列比对结果表明,Bpfael与Burkholderia xenovorans同源性最高为90%。Bpfae2与Burkholderia glumae同源性最高为83%,这两个阿魏酸酯酶蛋白的同源率为29%。另外对这两个阿魏酸酯酶的立体结构进行了同源模拟。     

家蚕新基因Bmbzj的表达、抗体制备及亚细胞定位

在自建的家蚕蛹cDNA文库中发现了一条新基因序列,GenBank登录号为DY231426.该基因是一个同源性很低的基因,未发现保守结构域,将其命名为Bmbzj.Bmbzj基因全长661bp,由99 bp的5'端非翻译区序列(5'UTR)、486 bp的开放读码框(ORF)和76 bp的3'端非翻译区序列(3'UTR)组成.生物信息学分析结果表明蛋白Bmbzj可能存在跨膜区和信号肽.将该基因插入到载体pGEX-4T-3中,构建了该基因编码的重组质粒pGEX-4T-3-Bmbzj,转化大肠杆菌Rosetta后,IPTG诱导表达了该融合蛋白,并利用亲和层析的方法纯化该重组蛋白,免疫新西兰兔制备多克隆抗体.亚细胞定位实验结果表明该蛋白只存在于细胞质中.     

用GC-MS法分析家蚕茧中的游离有机酸

文中报道了用毛细管柱气相色谱—质谱联系技术,分离并鉴定出家蚕茧中的游离有机酸有八种:癸酸、十二酸、十四酸、2—甲基十四酸、9—十六烯酸、十六酸、9—十八烯酸、十八酸和邻苯二甲酸酯类。还发现不同荧光颜色的家蚕茧中所含的游离有机酸基本相同。     

农杆菌介导法获得抗病毒病转基因大白菜

为获得抗芜菁花叶病毒病的大白菜植株,用携带TuMV-cp基因的农杆菌R1000和EHA105转化大白菜子叶和下胚轴,PCR、PCR-Southern检测证实TuMV-cp基因已导入并整合到大白菜的基因组中.RT-PCR检测表明TuMV-cp在转录水平上获得了稳定表达.TuMV-cp基因在转基因植株T1代中获得了稳定的遗传.抗病性鉴定结果表明转基因植株T1代较非转基因植株对TuMV的抗性增强,获得了抗病毒病的转基因大白菜植株.     

Isolation and identification of a sulfate reducing bacteria and sequence analysis of its dissimilatory sulfite reductase gene

A sulfate reducing bacteria was isolated from mining sewage of Daqing Oilfield by Hungate anaerobic technology. Physiological-biochemical analysis showed that the strain could utilize polyacrylamide as sole carbon and nitrogen source. The sequence analysis of 16S rDNA illustrated that the similarity of F8 and Desulfovibrio desulfuricans (AF192153) was 99%, and the similarity sequence of dissimilatory sulfite reductase gene (DSR) cloned from the strain and Desulfovibrio desulfuricans (AF273034) was 98%. Their phylogenitic analysis was basically anastomosed, and thus temporarily named as Desulfovibrio desulfuricans F8. The DSR cloned from F8 strain was 2740 bp in length consisting of three ORF, DSRA, DSRB and DSRD as a single operon (DSRABD) regulated by the same operator. DSRA contained typical conservative box of sulfate—sulfite reducing enzyme (SiteⅠand SiteⅡ), which could bind siroheme and [Fe4S4]. DSRB retained a [Fe4S4] binding site, with an uncomplimentary structure for siroheme binding. There was no conservative box in DSRD. Sequence analysis of DSR will provide a theoretical basis for quantitative detection, metabolic pathway modification through gene engineering, and sulfate reducing bacteria (SRB) suppression.     

Isolation and characterization of acidophilic bacterium from Dongxiangshan Mine in Xinjiang Province, China

One bioleaching bacterium, named as strain DXS, was isolated from acid mine drainages (AMDs) of Dongxiangshan Mine of Hami, Xinjiang Province, China. The strain DXS is gram-negative and rod-shaped with a size of (0.40±0.05) μm×(1.3±0.5) μm. The optimal temperature and pH for growth are 30 ℃ and pH 2.0, respectively. It can grow autotrophically by using ferrous iron, elemental sulfur and NaS2O3 as sole energy sources. In the phylogenetic tree, strain DXS has similarity with Acidithiobacillus ferrooxidans typ...     

高应变速率下载荷方向对镁合金力学性能的影响

为了研究高应变速率下AZ31B镁合金动态力学行为各向异性,采用分离式霍普金森压杆（SHPB）对沿挤压方向（ED）、法向（ND）及横向（TD）加工的AZ31B镁合金在应变速率为1.058~2.500s-1范围内进行冲击压缩实验,并采用扫描电镜观察压缩断口形貌.结果表明：高应变速率下AZ31B镁合金沿ED方向和ND方向有明显的应变强化现象,而沿TD方向应力对应变速率不敏感;随应变速率的增加,不同载荷方向屈服强度与最大应力值的差值变化程度有所不同,其中沿ND方向差值变化最大,沿TD方向差值变化最小;通过观察扫描断口形貌发现,在高应变速率下AZ31B镁合金在不同载荷方向下的断裂方式均为解理断裂.     

读音和语义处理中双语被试脑功能的差异研究

利用功能性磁共振成像(fMRI)技术探讨双语被试语义和读音处理时脑活动的差异.实验使用汉语和日语中语义和读音处理相关实验刺激任务,通过两组被试各自判断任务中不同的脑激活情况探讨中日双语和日本人被试在语义和读音处理时脑活动的差异.结果表明对于中日双语被试,中文语义判断任务和中文读音判断任务相减,没有得到差异性脑区,而日文语义判断任务和日文读音判断任务相减得到了二者差异性脑区,主要表现在:右侧额叶前回(BA8/9),左侧纺锤状回(BA37)以及右侧颞叶(BA22/38);对于日本人被试,日文语义判断任务和日文读音判断任务相减得到二者差异性脑区,主要表现在:左侧颞上回(BA40)和左侧颞叶(BA22).     

Silk materials for medical,electronic and optical applications

Silk derived from the silkworm Bombyx mori is among the most important fibrous protein biomaterials due to large-scale production from natural sources, excellent biocompatibility, unique mechanical properties and controllable degradation. Silk fibroin can be processed into a variety of formats to match different applications, such as tissue engineering, drug delivery or as the passive substrate of a bio-device. Advances in fabrication technologies provide new possibilities for the combination of silk fibroin with other nanomaterials to functionalize silk fibroin for specialized purposes, including sensing, cell visualization,resistance to ultraviolet light and provision of antibacterial properties. As the requirement for wearable and intelligent devices has become increasingly important over recent years, silk fibroin has been utilized as the active element in electronic and optical instruments. This review summarizes these recent advances in the innovative applications of silk fibroin.     

汉语中日语借词刍议

日语中的汉字本来源自中国,汉语词汇是日语词汇的重要组成部分。但是,日语中的汉语词汇并非全都来自中国,有相当一部分是日本人自己创造的。其中有很多随着中日交流传入中国,成为汉语中的日语借词。本文从日语借词传入中国的背景、日语借词的分类及传入中国后的意思流变等几方面进行了剖析和论述。