运用PCR技术进行5种液态奶的鉴别

采用聚合酶链式反应(PCR)对牛奶、羊奶、水牛奶、骆驼奶、黄豆奶这五种液态奶进行鉴别。其中,羊奶以ATP6为目的基因设计其特异性引物,能扩增出大小为292 bp的DNA片段,水牛奶以12SrRNA为目的基因设计特异性引物对,扩增出大小为328 bp的DNA片段,牛奶、骆驼奶以细胞色素b(cyt b)为目的基因设计引物,可以分别扩增出大小为725 bp和363 bp的DNA片段,黄豆浆以细胞色素f(cyt f)为目的基因,扩增出大小为510 bp的DNA片段,各引物对对于其它物种奶类无特异性扩增,并采用两种限制性内切酶验证了该扩增的特异性。通过不同物种的基因序列差距设计的引物,能同时鉴别出这几种液态奶,是一种可靠、简单、快捷的液态奶鉴别方法。     

DNA条形码技术在肉品防欺诈鉴别中的应用

以DNA条形码技术鉴别进出口监督抽检的鱼肉等水产制品的种类来源,用以判别其与申报或产品标签是否相符.分别提取鱼肉等样品的基因组DNA,以目前国际上比较公认的动物线粒体细胞色素氧化酶COⅠ基因通用引物进行PCR扩增.PCR产物经测序分析后,将得到的扩增片段序列与Genbank数据库进行序列比对,同时提交Barcoding Life DNA条形码数据库(BOLD)进行鉴定分析.本批次监督抽检的16份鱼肉、鱼丸等水产制品中除1份样品未能成功获得鱼肉COⅠPCR扩增外,其余15份样品均顺利得到种类来源鉴定,鉴定结果约有31.25％的样品与产品标签标示不符.作为一种简单、快速、有效的分子鉴定技术,DNA条形码可以直接应用于鱼肉等动物源性食品的种类鉴定.     

PCR法检测肉制品中鹅源性成分

目的 建立一种PCR法检测肉制品中鹅源性成分的方法。方法 根据鹅的线粒体DNA(mtDNA)序列设计引物, 以9种动物的DNA为模板, 利用新设计的鹅的特异性引物进行PCR反应, 并用琼脂糖凝胶电泳检测引物的特异性和敏感性。结果 通过PCR反应, 仅鹅的DNA扩增得到了194 bp的目的片段, 其余物种DNA和空白对照均无目的片段。扩增产物的核苷酸序列与GENBANK中检索到的相应序列基本相符合。 结论 该方法特异性强、灵敏度高, 适合检测肉制品中的鹅源性成分。     

应用PCR-FINS技术鉴定金枪鱼罐头中金枪鱼种类

为考察金枪鱼罐头中DNA降解程度以及鉴定金枪鱼罐头中金枪鱼种类,文中根据鱼类线粒体基因组(m t DNA)细胞色素b(cyt b)基因和12S r DNA基因,利用3对通用引物分别扩增片段大小为358 bp(cyt b)、224bp(12S r DNA)、123bp(cyt b)的目的片段,同时,基于123 bp线粒体cytb基因片段,通过法医信息核苷酸测序(PCR-FINS)技术来鉴别金枪鱼罐头中金枪鱼的种类,并对17个市售金枪鱼罐头样品进行金枪鱼种类鉴定。结果表明:金枪鱼罐头中DNA降解严重,其片段大小在100~200 bp;该研究建立的PCR-FINS技术,可以实现金枪鱼罐头中金枪鱼种类的准确鉴别;17个市售金枪鱼罐头样品中,58.8%来源于价格低廉的鲣鱼,其次还包括长鳍金枪鱼、青干金枪鱼、扁鮀鲣、鲔鱼。     

食品中动物源性成分的多重PCR快速检测

目的利用多重PCR技术对市售的多种食品进行检测,确定动物源性成分的种类,进行掺假及真伪鉴别。方法对鸡、猪、牛、兔、绵羊、山羊、马、鹿8种动物源性产品进行DNA提取,根据不同动物线粒体DNA设计特异性引物,根据脊椎动物细胞色素b基因mt DNA序列设计通用引物作为内源参照,对8种动物源性产品的DNA进行多重PCR扩增,同时对多种成分进行鉴定。结果琼脂糖凝胶电泳表明,此方法能同时扩增出8种动物的特异性条带,检测灵敏度达到0.01%。结论所建立的鉴定多种动物源性成分的新方法,操作简便、快速准确,可为各检验机构对食品进行检测提供方法指导。     

DNA条形码COI序列在常见肉类鉴别中的应用研究

为了对常见的4种肉类及相关肉制品进行掺假鉴定,判别与产品标签是否相符,本研究以COI基因为靶基因,建立了4种动物源性食品DNA条形码鉴别技术。分别提取牛、羊、猪、鸭四大物种的基因组DNA为模板,以其COI基因的保守序列区设计6对通用引物,结合文献报道及数据库提供的7对通用引物进行PCR扩增,并将测序结果提交Gen Bank数据库Blast比对,评价不同DNA条形码的检测鉴别能力。筛选出COI-A为最优序列,在4个物种中扩增效率100%。对抽检的20个批次的肉加工品样品进行检测,鉴定结果约有90%的样品与产品标签标示的成分相符。其中1个批次的牛丸制品因肉类成分含量低未扩增成功,1个批次的牛丸制品检出鸭源成分,判定掺假。DNA条形码技术快速有效,本研究筛选的COI-A序列可直接用于牛、羊、猪、鸭及其肉制品的鉴定,并为其它常见动物源性食品的种类鉴定提供一定参考依据。     

PCR鉴别猪鸡兔肉方法的建立与应用

建立一种快速准确鉴别生鲜猪肉、鸡肉和兔肉,以及混合或加工过的肉制品中这3种肉成分的方法。以猪肉、鸡肉和兔肉的线粒体细胞色素b基因为特征靶基因设计3组特异性引物对:F/R猪、F/R鸡和F/R兔,通过PCR得到特异性扩增片段,分析电泳图中是否出现目标条带,进而检测肉样是否掺假。结果表明,所设计的引物特异性良好,猪肉DNA扩增后产生331 bp的特异性条带,鸡肉DNA扩增后产生148 bp的特异性条带,兔肉DNA扩增后产生258 bp的特异性条带,而其他肉类未见该特异性条带。该方法准确、稳定,可为猪肉鉴别真假提供技术支持。     

利用16S rDNA序列分析鉴定一株产抗菌物质的微生物菌株

从桃子上分离纯化得到1株产抗菌物质的菌株,命名为fmb3菌,通过抑菌实验发现该菌对革兰氏阳性菌蜡样芽孢杆菌、革兰氏阴性菌大肠埃希菌和真菌扩展青霉等3种常见食品病原菌具有显著的抑菌效果。利用16SrDNA分析对该菌作了系统进化鉴定,首先提取fmb3菌基因组DNA,根据不同种属的细菌的16SrDNA序列两端的保守性设计通用引物,对fmb3菌16SrDNA片断进行PCR扩增,对扩增得到的目标片段测序,并且利用NCBIBLAST对测序结果进行比对,构建系统进化树进行分析,初步确定该菌属于枯草芽孢杆菌。     

用Cytb基因序列分析鉴定肉制品掺假

目的采用Cytb基因进行肉制品真伪鉴定的尝试性探索。方法随机采集21份肉制品样品,首先采用CTAB法方法提取样品DNA,基于Cytb基因的通用引物对21份样品DNA进行PCR扩增,把扩增产物进行测序,然后采用DNAMAN软件进行序列的比对分析。结果 CTAB方法适合肉制品的DNA提取。10份牛肉样品中9份与标注吻合,1份检测出是猪肉;2份羊肉样品中1份与标注吻合,1份检测是猪肉;2份猪肉样品中1份与标注吻合,1份检测是鸡肉;1份鸡肉样品与标注吻合;6份牦牛肉样品中2份与标注吻合,4份检测是水牛肉。结论用Cytb基因序列分析比对方法适合肉制品的真伪鉴定,市场上肉制品存在掺假问题。     

利用SNP分子标记对阿根廷滑柔鱼和科氏滑柔鱼的分子鉴定

目的:建立快速、准确的鉴定阿根廷滑柔鱼及其混淆品科氏滑柔鱼的DNA分子标记方法。方法:提取阿根廷滑柔鱼及科氏滑柔鱼的基因组DNA,利用PCR扩增2种鱿鱼品种的细胞色素C氧化酶亚基I(Cytochrome Oxidase Subunit I,COI)的核苷酸序列,利用序列比对发掘2种鱿鱼的品种特异性位点。根据2种鱿鱼品种的SNP位点,通过引入错配碱基设计品种特异性引物,并建立鉴定2种鱿鱼品种的多重PCR体系。结果:建立的多重PCR反应体系使阿根廷滑柔鱼扩增出了516 bp的特异性条带,科氏滑柔鱼产生了419 bp的特异性条带,2种鱿鱼的混合品则同时扩增出了516 bp和419 bp的条带。结论:利用SNP分子标记建立的多重PCR体系,快速、准确、特异性强,可作为阿根廷滑柔鱼及其加工产品原料来源鉴定的分子手段。     

基于FemAB基因特异引物的动物双歧杆菌PCR检测方法的建立

分离和鉴定了两株双歧杆菌,通过16SrDNA通用引物扩增条带测序和非特异引物随机扩增法扩增条带测序推测其为动物双歧杆菌。随后使用以编码肽聚糖肽桥形成蛋白(Peptidoglycan bridge formation protein)FemAB基因为目的扩增片段设计的特异引物进行了扩增鉴定。结果表明,此特异引物对这两株动物双歧杆菌菌株扩增结果为阳性,其他对照菌株扩增结果为阴性,且扩增条带测序结果与预计一致。FemAB基因在PCR特异扩增法鉴定细菌种属中具有较好的分辨能力,并使用其建立了动物双歧杆菌PCR检测方法。本研究旨为应用FamAB基因鉴定细菌种属以及双歧杆菌属微生物的鉴定提供了数据参考。     

环介导恒温扩增法鉴定牛羊肉中的搀杂肉

建立了一个鉴定牛羊肉中搀杂杂动物肉的环介导恒温扩增检测方法。确定了一套可在牛羊肉中特异并灵敏地检测出搀杂肉成分的引物对,以动物细胞色素b基因组为模板可在恒温63℃恒温特异性扩增出猪等基因片段而无其他扩增片段影响。可检测牛肉中0.01%～2%的猪肉成分。经与PCR方法比对,结果表明,该方法可有效用于实际生鲜肉或加工肉制品样本的鉴定。     

定量检测食品中榛果过敏原成分

定量检测食品中过敏原榛果过敏蛋白,构建目的基因的标准品及标准曲线。以榛果的DNA为模板,针对油体蛋白基因设计引物进行PCR扩增,构建质粒,经鉴定测序,用荧光定量PCR制作标准曲线。成功克隆油体蛋白目的基因片段,并以此为标准制作出荧光定量PCR标准曲线,线性关系良好,灵敏度高,检测限低于10个拷贝,特异性强,准确可靠。成功建立荧光PCR方法定量检测食品中过敏原榛果成分,构建油体蛋白基因的标准品及标准曲线。     

PCR-焦磷酸测序检测单核细胞增生李斯特氏菌研究

目的 建立结合PCR-焦磷酸测序检测单核细胞增生李斯特氏菌的方法.方法 根据单核细胞增生李斯特氏菌的hly基因设计扩增引物和测序引物,特异地扩增目的片段,再制备单链模板,在测序引物引导下进行焦磷酸测序,通过测序结果与GenBank中的hly基因序列的比对进行鉴定.结果 扩增引物和测序引物表现出良好的特异性,16株单核细胞增生李斯特氏菌菌株均扩增出大小249 bp的DNA片段,焦磷酸测序结果与hly基因序列100％匹配,而阴性对照菌株均未扩增出DNA条带,焦磷酸测序结果为阴性.结论 建立的方法特异性高,是快速从DNA序列水平上检测单核细胞增生李斯特氏菌的有效手段.     

羊肉与鸭肉的分子生物学鉴别技术

本研究建立羊肉与鸭肉的分子生物学鉴别方法,以羊肉和鸭肉线粒体细胞色素b基因(cytb)为特征靶基因,设计1条通用上游引物F和2条特异性下游引物:R_羊、R_鸭,并按照一定浓度比例组成混合引物,进行一次聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)扩增即可获得目的DNA片段,根据琼脂糖凝胶电泳的DNA条带大小来判断羊肉中是否掺杂鸭肉。结果表明:当被检样本在367 bp和480 bp处分别出现特异性条带时,说明该样本的羊肉中掺杂了鸭肉;当被检样本在367 bp处出现特异性条带,而在480 bp处未出现特异性条带时,则说明该样本的羊肉中没有掺杂鸭肉。该方法准确、可靠、简单快捷,可用于食品中肉类种属的筛选和肉类掺假的检测和监管。     

可视化-跨越式滚环等温扩增技术检测鼠肉掺假

目的 建立可视化-跨越式滚环等温扩增技术检测肉制品中鼠肉掺假的分析方法.方法 选取鼠的线粒体cyt b基因为靶基因,设计并筛选出一对引物,选择9个不同物种的新鲜肌肉组织样本为研究对象,验证跨越式滚环等温扩增技术(saltatory rolling circle isothermal amplification,SRCA...     

烟草拟茎点霉快速检测方法的建立

为实现烟草拟茎点霉的快速准确检测,利用真菌rDNA-ITS通用引物对拟茎点霉和其他10种烟草病原菌基因组DNA进行了PCR扩增、片段回收及DNA测序,在序列比对基础上设计了两对特异性检测引物,并鉴定了引物的检测灵敏度和特异性,同时优化建立了PCR反应体系。结果表明,在退火温度为60 ℃时,两对特异性引物P2F/P3R和P3F/P3R从烟草拟茎点霉DNA样本中分别扩增出来420 bp和381 bp的特异性条带,而在其他10种烟草病原菌DNA以及阴性对照中均不能扩增到任何条带。两对特异性引物的检测灵敏度均达到10 pg/μL。建立的基于两对特异性引物P2F/P3R和P3F/P3R的分子检测方法可实现对病原菌烟草拟茎点霉的快速准确检测。      

多基因DNA条形码鉴定6 个鳗鱼物种

建立6?种鳗鱼的物种多基因DNA条形码精准鉴定方法。以鳗鱼DNA为模板,采用3?对通用引物对6?种鳗鱼的3?个基因（16S rRNA、Cyt b、COⅠ）部分DNA片段进行聚合酶链式反应扩增、测序,结果6?种鳗鱼各获得3?条16S rDNA（638～643?bp）、Cyt?b（464～466?bp）、COⅠ（705～707?bp）基因部分DNA序列,从中选取各物种序列同源的片段设计3 对新引物对6 种鳗鱼的16S rRNA、Cyt b、COⅠ基因部分DNA片段进行PCR扩增,其产物大小分别为504～507、400、609?bp,再从各片段中筛选出具有6?种鳗鱼物种特异性强的、碱基数分别为262、280、300?bp的3?条DNA片段序列,作为6?种鳗鱼物种的3?个基因的标准DNA条形码,应用DNAMAN?V6软件进行同源性分析,并通过GenBank数据库的比对验证,制定了供检测实践用的同源率判别指标,建立鳗鱼物种的多基因条形码检测方法。应用该方法对30?个待检鳗鱼样品进行检测,结果表明,各样品基于3?个基因DNA条形码的比对,符合同源率指标,物种判别结果互相吻合,从而精准判别样品的所属物种。该方法稳定、精准、易于操作,可应用于6?种鳗鱼的物种鉴定,值得推广。     

金褐链霉菌SYAU0709中AURJ3M基因的克隆和序列分析

以金褐链霉菌SYAU0709的DNA为模板,根据GenBank中公布的PimM的序列设计引物,通过PCR扩增方法从金褐链霉菌中扩增出约579bp的目的片段。将PCR产物克隆至PMD19-T Vector中,通过PCR扩增及测序分析发现,金褐链霉菌SYAU0709来源的AURJ3M基因和纳塔尔链霉菌PimM基因的序列具有95%的相似性。通过摇瓶发酵显示AURJ3M基因能促进金褐霉素的生物合成。     

基于Cyt-B基因鉴定肉制品中鸭源性成分的研究

基于Cyt-B基因设计特异性引物,建立高效快速检测肉制品中鸭源性成分的方法。选取Cyt-B基因作为检测靶标,应用生物信息学技术设计各物种特异性引物,建立聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)体系检测肉制品中鸭源性成分,并将鸭特异性基因片段进行克隆和测序分析。该检测体系可以对鸭肉含量为1pg的肉制品实现稳定检测,灵敏度髙,特异性好。测序分析结果显示克隆的特异性基因序列与Genbank中相同物种(序列ID:EU755253.1)的核苷酸同源性达100%。该文建立的基于Cyt-B基因的PCR检测方法,可实现对肉制品中鸭源性成分高效快速的检测,既为肉类产品DNA鉴定试剂盒的研发提供试验基础,也有望对肉制品的市场监管和相关执法提供有力的技术保障。