先天性心脏传导阻滞药物作用靶点的生物信息学研究

目的通过对CHB药物靶点的研究,为研发CHB特异性治疗药物提供理论依据。方法 201609-201812月,构建与先天性心脏传导阻滞直接相关的阳性基因和蛋白集合以及候选阴性集,通过语义相似性计算两个集合间基因的相关性,利用ENDEAVOUR数据库对潜在药物靶点进行功能注释,然后使用GENECODIS对潜在药物靶点蛋白及基因分别进行GO、KEGG、SNP和MicroRNA富集分析。结果挖掘出20个潜在的CHB药物靶点,GO富集分析发现药物靶点蛋白分子功能主要集中于电压门控离子通道活性、转运活性和信号转导活性等;KEGG通路主要富集于钙信号传导通路;SNP富集次数最多的是C/T,出现773次;MicroRNA富集分析发现有15个基因富集于hsa-miR-770-5P上。结论候选阴性集中的20个蛋白可能是CHB潜在的药物靶点,可能为下一步CHB的治疗和药物研发奠定基础。     

基于系统药理学探讨消癌解毒方防治结直肠腺瘤性息肉癌变机制

目的:探讨消癌解毒方防治结直肠腺瘤性息肉癌变的潜在机制。方法:运用中药系统药理学数据库收集消癌解毒方所含化合物对应的相关靶点;使用OMIM、TTD、PharmGkb、DiGSeE数据库,分别检索与肠腺瘤(Colorectal Adenoma)、肠癌(Colorectal cancer)相关的疾病靶点;使用Cytoscape 3.2.1软件进行"消癌解毒方-化合物-关键靶点"网络关联,并通过Enrichr数据库,进行关键靶点的基因本体(gene ontology,GO)和基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)富集分析。结果:消癌解毒方所含化合物对应靶点243个、肠腺瘤对应靶点3 279个、肠癌对应靶点4 119个,三者交集的关键靶点110个。关键靶点的GO富集条目有2 522条,其中生物过程相关的条目2 033条,细胞组成相关的条目132条,分子功能相关的条目357条;关键靶点的KEGG富集通路涉及PI3K-Akt信号通路、IL-17信号通路、肿瘤坏死因子信号通路、细胞衰老、细胞凋亡等。结论:消癌解毒方防治结直肠腺瘤性息肉癌变的潜在作用机制可能与调控免疫炎症反应、细胞增殖及凋亡、机体衰老及体内激酶活性等过程有关,具有多靶点、多途径、多系统的机制特点。     

麻杏石甘汤治疗新型冠状病毒肺炎邪热壅肺证的潜在药效物质及作用机制探析

将网络药理学和分子对接技术相结合,旨在探析麻杏石甘汤治疗新型冠状病毒肺炎(Corona Virus Disease 2019,COVID-19)邪热壅肺证的潜在药效物质,并预测其作用机制.首先利用中药系统药理数据库和分析平台(TCMSP)筛选麻杏石甘汤的主要活性成分及作用靶点,并运用Cytoscape 3.7.1软件构建"活性成分-靶点"网络并进行分析.借助Uniprot数据库和Genecards数据库分别获取靶蛋白基因名和疾病相关靶点,将二者的共同靶点上传STRING数据库构建蛋白质相互作用核心网络,筛选出核心靶标.通过DAVID 6.8数据库进行基因本体(Gene Ontology,GO)功能富集分析和KEGG (Kyoto encyclopedia of genes and genomes)通路富集分析.最后利用分子对接软件将关键活性成分与潜在治疗COVID-19的作用靶点进行对接筛选.结果表明,麻杏石甘汤采用多种活性成分作用于多个靶点,通过炎症通路、抑制细胞因子风暴、免疫调节等多条途径,从而对新型冠状病毒肺炎发挥治疗作用.     

基于网络药理学的酒炖白芷药效作用机制研究

目的:通过网络药理学研究酒炖白芷的活性成分、作用靶点、相关信号通路和疾病的关联性,揭示酒炖白芷药效的作用机制。方法:选取酒炖白芷中27个活性成分,依据反向药效团匹配(Pharm Mapper)方法预测活性成分作用靶点,进而构建活性成分-作用靶点、疾病-作用靶点-通路网络,进行GO富集和KEGG通路富集分析,研究酒炖白芷的作用机制。结果:根据疾病-作用靶点-通路网络分析,涉及偏头痛的关键靶点为ESR1、IL-2和NOS3;涉及鼻炎的关键靶点为EGFR和MAPK8;涉及癫痫的关键靶点为GSTA1、GSTP1和GSTM1。GO富集条目1316个,其中生物过程相关的条目1172个,分子功能相关的条目48个,细胞组成相关的条目96个。KEGG通路117条,主要涉及hsa04024、hsa04022、hsa04151、hsa04370、hsa04014等通路。结论:酒炖白芷的药效作用机制体现了中药多成分-多靶点-多通路的特点,本研究为酒炖白芷炮制机理、药效作用的深入研究及都梁丸的临床应用提供科学依据。     

基于网络药理学方法分析小半夏汤药效物质及作用机制

目的:运用网络药理学方法研究小半夏汤活性成分、靶点、通路及生物过程,探讨其药效物质及作用机制。方法:通过TCMSP数据库及BATMAN-TCM分析平台获取小半夏汤活性成分及靶点;采用string数据库构建PPI网络,运用Cytoscape软件进行可视化展示;通过DAVID数据库富集靶点KEGG信号通路;利用BINGO、ClueGO插件进行GO生物过程富集和聚类分析。结果:发现小半夏汤16种活性成分作用于209个靶基因,主要富集在心血管、神经、癌症、炎症等7大类30条KEGG通路;SRC、MAPK1、FOS、JUN、CREB1、ESR1、 BCL2、TNF等43个关键靶基因,主要参与轴突再生、神经元投影再生等神经生物过程。结论:小半夏汤除了化痰散饮、和胃降逆的传统功效外,还可能在炎症、癌症以及心血管和神经系统方面具有药理作用。     

红鳍东方鲀卵巢与精巢的蛋白质组比较分析

为研究红鳍东方鲀Takifugu rubripes性腺发生的相关机制,选择3龄体质量约2.0 kg的红鳍东方鲀成熟卵巢与精巢组织,利用非标记定量技术(Lable-free)对卵巢与精巢两种组织蛋白质组进行定性与定量分析,并运用GO、KEGG分析等方法对差异表达的蛋白进行富集分析。结果表明:非标记定量显示,在两组织间卵巢中特有的蛋白为150个,精巢中特有的蛋白为132个,有172个在卵巢中表达较高的蛋白及161个在精巢中表达较高的蛋白,在卵巢中存在与卵巢发育相关的高表达蛋白ELAVL2、RNA helicase、LSM4和FRUYP1,而在精巢中特异表达蛋白GSDF影响精巢发育;经GO分析发现,RNA结合(RNA binding)可能影响卵巢发育,两组织差异蛋白在膜组成部分(Integral component of membrane)具有最大差值;GO功能显著性富集分析得出,转移酶活性(Transferase activity)在两组织之间差异最显著;KEGG通路分析显示,核糖体通路(Ribosome)在两组织间差异蛋白最多,该通路也可能与性腺发育相关,通路中核糖体蛋白L10A被证实与一些物种性别发育相关,并发现吞噬体(Phagosome)、溶酶体(Lysosome)及鞘脂代谢通路(Sphingolipid signaling pathway)可能与精子成熟相关。研究表明,红鳍东方鲀卵巢与精巢蛋白质组差异较大,与卵巢发育相关的蛋白有ELAVL2和RNA helicase及核糖体通路等,与精巢发育相关的蛋白有GSDF及吞噬体通路等,本研究结果可为红鳍东方鲀性腺组织发育研究提供参考。     

茯苓杏仁甘草汤与橘枳姜汤“同病异治”冠状动脉粥样硬化性心脏病

目的:基于网络药理学方法探讨茯苓杏仁甘草汤与橘枳姜汤治疗冠状动脉粥样硬化性心脏病(简称冠心病)的作用靶点及可能作用机制。方法:利用TCMSP、DrugBank数据库,采用口服生物利用度和药物相似性筛选获取茯苓杏仁甘草汤与橘枳姜汤的成分和靶点,通过CTD、DrugBank数据库筛选抗冠心病相关的蛋白,构建成分-靶点网络图,用DAVID数据库对基因富集分析,通过KEGG通路分析结果,获得参与相关通路的候选基因及功能。结果:目前,茯苓杏仁甘草汤与橘枳姜汤的化学成分分别为186、163个;茯苓杏仁甘草汤与橘枳姜汤共有270个潜在靶点,其中256个潜在靶点与冠心病相关;成分-靶点网络图显示两方可能通过CHRM2、PTGS2、SLC6A2、CHRM1与PTGS1等关键基因,经由神经信号传递通路、cGMP-PKG信号通路、钙离子信号通道、血清素神经突触和甲状腺激素信号通路等干预冠心病的进程。茯苓杏仁甘草汤调节NOS2、PTGS2、F2、ABAT与PLA2G2E基因及Mapk信号通路和Egf信号通路等通路发挥特有的干预冠心病基础;F12、CHRM5、SELE、OPRD1与HAS2基因及抗生素的生物合成、脯氨酸代谢等通路的调控为橘枳姜汤特有的治疗冠心病机制。结论:茯苓杏仁甘草汤及橘枳姜汤药物之间存在相同及不同的化学成分及靶点效应干预冠心病,通过分析成分、靶点及通路的相互关系分析"同病异治"的科学内涵。     

基于网络药理学探讨半夏厚朴汤作用机制

目的:基于网络药理学分析半夏厚朴汤的重要成分与作用机制,为半夏厚朴汤的临床应用、实验研究提供客观依据。方法:基于中药系统药理学分析平台检索半夏厚朴汤的化学成分,以口服生物利用度≥30%和类药性≥0. 18为标准筛选主要活性成分;运用Swiss Target Prediction系统依次检索各活性成分的作用靶点,并构建半夏厚朴汤活性成分-靶点网络图、靶蛋白互作网络图;利用David平台进行KEGG信号通路以及GO生物过程富集分析。结果:通过筛选共挖掘出半夏厚朴汤主要活性成分44个,其相应的作用靶点218个,并筛选出100个关键作用靶点以及10条重要的信号通路。结论:本研究初步揭示了半夏厚朴汤的药效物质基础,并探讨了半夏厚朴汤的药理作用机制,为半夏厚朴汤的临床应用以及实验研究提供了重要参考依据。     

Hedgehog信号通路在肺癌中的研究进展

肺癌发病率高、预后差,其发生过程涉及多个信号通路的异常改变,其中Hedgehog通路在肺癌中的作用逐渐被发现,Hedgehog通路最早发现于果蝇胚胎发育过程,近来发现其涉及了肺、消化等多个组织器官的发育及癌变过程,特别是肺癌中发现,Hedgehog通路的异常激活参与了肺癌的耐药、增殖、转移等过程。本文从Hedgehog信号通概述、Hedgehog在小细胞肺癌中的作用、非小细胞肺癌增殖、耐药中的作用进行综述分析,旨在为Hedgehog通路在肺癌的研究提供新的思路及寻找肺癌治疗的新靶点。     

非小细胞肺癌脾虚痰湿证相关蛋白质组学研究

目的:比较非小细胞肺癌脾虚痰湿证和其他证型血清蛋白质组学的差异,筛选能用于非小细胞肺癌脾虚痰湿证客观化辨证的血清生物学标志物。方法:利用双向荧光差异凝胶电泳技术(two-dimensional fluorescence difference gel electrophoresis,2D-DIGE)比较非小细胞肺癌脾虚痰湿证血清(3例)和其他证型血清(3例)蛋白图谱的差异,使用基质辅助激光解吸电离—飞行时间质谱(matrix-assisted laser desorptionionization time-of-flight mass spectrometry,MALDI-TOF-MS)及生物信息学相关技术对获得的差异蛋白进行鉴定和初步分析。结果:成功建立了非小细胞肺癌脾虚痰湿证血清差异蛋白质组学的研究方法;通过质谱分析初步鉴定出6个差异蛋白。结论:非小细胞肺癌脾虚痰湿证血清和其他证型血清蛋白表达存在明显差异,可能为非小细胞肺癌脾虚痰湿证辨证客观化提供新的线索和实验基础。     

高效减水剂对钙矾石结晶形成影响的研究进展

在水泥水化初期,钙矾石的形成对水泥浆体的流动性和流动性经时损失等性能有着重要的影响。本文综述了掺加高效减水剂对钙矾石结晶形成的不同作用效果,分析了产生两种不同作用效果(吸附抑制和吸附促进)的原因。     

骨料对混凝土质量影响的探讨

主要研究了粗、细骨料粒径、级配以及砂率变化对混凝土质量的影响,测定了在基准配合比下,砂的细度模数变化以及碎石颗粒级配变化对混凝土质量的影响,并就骨料粒径、级配的变化对混凝土质量的影响从理论上进行了初步的分析。     

以城镇化推进西部大开发

西部地区地域广阔,各地差异极大,开发不可能整体平面展开,必须有重点,以点带线带面顺序展开。城镇的聚集效益和规模效益决定了其在区域开发中的战略高地作用。西部地区城镇建成区面积只占国土面积的万分之七,但聚集了西部25%的人口和55%的社会生产力。城镇是实现西部大开发五大战略任务的空间集合点。实施西部大开发,应以推进城镇化为主线,带动西部经济社会全面协调发展。一、以城镇为中心带动区域发展,在世界范围内具有普遍性区域发展理论表明,经济要素由于具有流动性(土地除外)和空间分布的不均衡性,在趋利动机的作用下,会向着能够获得较…     

关于建筑物出口条件对人员疏散的影响研究

通过以建筑物出口条件作为主要研究对象,分析建筑物出口条件对人员疏散的影响,得出建筑物的内外出口、疏散指示、疏散门以及疏散通道等均会直接影响人员的疏散效率及人员自身的安全,因此建筑物有必要加强对出口条件的合理设计。     

再生细骨料对混凝土性能的影响研究

研究了再生细骨料对再生混凝土表观密度、抗压强度以及抗氯离子渗透性能的影响.结果表明,新拌再生混凝土的表观密度与再生细骨料掺量之间存在较好的线性关系,表观密度随着再生细骨料掺量的增加而逐步减小.水灰比为0.55时,再生混凝土的抗压强度低于普通混凝土,水灰比为0.35时,再生细骨料掺量为30％时混凝土抗压强度最高,且各掺量下均高于普通混凝土.不加任何矿物掺合料的情况下,各龄期的电通量变化规律与相应龄期的强度变化规律基本一致.再生混凝土的强度越高,其抗氯离子渗透性能越好.     

界面对建设工程造价的影响分析

分析了建设项目实施过程中界面管理的必要性、界面对工程造价的影响和界面管理方法,对常见管理模式下的界面对工程造价的影响进行了详细论述,提出了有效控制工程造价的界面管理方法,并且探讨了信息技术在项目界面造价管理中的应用.     

滨水度假酒店设计探析

在实地考察体验的基础上,以海南三亚和浙江千岛湖滨水度假酒店为例,对滨水度假酒店在特色表达方面的设计策略和手法进行分析。     

粉土对砂不稳定性影响的试验研究

通过对净砂和粉砂土（粉土含量为10％，20％）试样进行三轴不排水试验，研究了粉土对砂不稳定性的影响。试验结果表明：如使用粒间孔隙比es，就可以在与砂土相同的框架内描述粉砂土的不稳定特性。     

Study on the influence of voids on high-rise building on the wind environment

Building Simulation - The purpose of this study was to investigate the effects of voids in tall buildings on the surrounding wind environment. With the development of modular technology, there has...     

浅析试验参数对沥青混合料抗剪性能的影响

利用直接剪切试验结合无侧限抗压试验和劈裂试验对沥青混合料的抗剪性能进行了研究。结果表明,C值随沥青用量的增加而先增加后减小,值随沥青用量的增加而减小,随着温度的升高,混合料的抗剪强度降低,C值和值也随之减小。