电子病历命名实体识别和实体关系抽取研究综述

电子病历（Electronic medical records,EMR）产生于临床治疗过程,其中命名实体和实体关系反映了患者健康状况,包含了大量与患者健康状况密切相关的医疗知识,因而对它们的识别和抽取是信息抽取研究在医疗领域的重要扩展. 本文首先讨论了电子病历文本的语言特点和结构特点,然后在梳理了命名实体识别和实体关系抽取研究一般思路的基础上,分析了电子病历命名实体识别、实体修饰识别和实体关系抽取研究的具体任务和对应任务的主要研究方法. 本文还介绍了相关的共享评测任务和标注语料库以及医疗领域几个重要的词典和知识库等资源. 最后对这一研究领域仍需解决的问题和未来的发展方向作了展望.     

基于BERT的中文电子病历命名实体识别

针对中文电子病历命名实体识别过程中实体特征利用率低,语义表示不充分等问题,提出一种基于BERT语言模型的命名实体识别方法。运用Char-CNN学习字符的多种特征,将特征加入BERT预训练生成的词向量中,获得融合领域信息和汉字特征的词向量表示,将词向量输入迭代扩张卷积神经网络中进行特征抽取,引入注意力机制加强实体特征的关注度,通过CRF解码标注命名实体。实验结果表明,该方法在CCKS17中取得91.64%的F₁值,识别性能优于现有方法。     

基于RoBERTa-WWM的中文电子病历命名实体识别

电子病历(EMRs)中包含着丰富的信息,如临床症状、诊断结果和药物疗效.命名实体识别(Named Entity Recognition,NER)旨在从非结构化文本中抽取命名实体,这也是从电子病历中抽取有价值信息的初始步骤.本文提出一种基于预训练模型RoBERTa-WWM (A Robustly Optimized BE...     

基于最大熵的句内时间关系识别

分别对句内事件-时间对关系以及事件对之间的时间关系识别进行研究。分析影响时间关系识别的语言特征,如时间关系对之间的依存关系序列、间隔词数、信号词及其位置等,并使用基于最大熵的方法进行识别。实验结果表明,运用该方法获得的事件-时间对关系识别准确率为87.83%,事件对之间的时间关系识别准确率为80.79%。     

面向中文电子病历的多粒度医疗实体识别

在现有的面向中文临床电子病历的命名实体识别任务中,实体标注粒度通常过细或过粗,过细的标注结果难以找到实际应用场景,而过粗的标注结果通常需要在进行复杂的处理后,才能明确实体的规范形式和语义类型,以便于后续的数据挖掘应用.为简化处理步骤,根据常见的7类粗粒度临床实体的特点,定义了用以解释粗粒度实体的9类细粒度解析实体.同时...     

基于知识增强的中文电子病历命名实体识别

针对中文电子病历中医疗嵌套实体难以处理的问题, 本文基于RoBERTa-wwm-ext-large预训练模型提出一种知识增强的中文电子病历命名实体识别模型ERBEGP. RoBERTa-wwm-ext-large采用的全词掩码策略能够获得词级别的语义表示, 更适用于中文文本. 首先结合知识图谱, 使模型学习到了大量的医疗实体名词, 进一步提高模型对电子病历实体识别的准确性. 然后通过BiLSTM对电子病历输入序列编码, 能够更好捕获病历的中上下语义信息. 最后利用全局指针网络模型EGP (efficient GlobalPointer)同时考虑实体的头部和尾部的特征信息来预测嵌套实体, 更加有效地解决中文电子病历命名实体识别任务中嵌套实体难以处理的问题. 在CBLUE中的4个数据集上本文方法均取得了更好的识别效果, 证明了ERBEGP模型的有效性.     

电子病历命名实体识别研究进展

电子病历命名实体识别（named entity recognition,NER）旨在识别电子病历文本中的医疗实体,并将其归为预定义的医疗实体类别,为进一步的医疗关系抽取、医疗信息检索、医疗智能问答等自然语言处理任务提供支持。系统梳理了电子病历命名实体识别的定义、标注方法、评价指标及难点;从电子病历命名实体识别难点及技术发展历程两个角度,综述了每类电子病历命名实体识别方法的优势与不足;详细梳理了国内医疗领域命名实体识别的评测任务及数据集;详细讨论和总结电子病历命名实体识别每一类难点的解决方案;总结全文并展望了医疗领域命名实体识别的发展方向。     

中文电子病历命名实体和实体关系语料库构建

电子病历是由医务人员撰写的面向患者个体描述医疗活动的记录,蕴含了大量的医疗知识和患者的健康信息.电子病历命名实体识别和实体关系抽取等信息抽取研究对于临床决策支持、循证医学实践和个性化医疗服务等具有重要意义,而电子病历命名实体和实体关系标注语料库的构建是首当其冲的.在调研了国内外电子病历命名实体和实体关系标注语料库构建的基础上,结合中文电子病历的特点,提出适合中文电子病历的命名实体和实体关系的标注体系,在医生的指导和参与下,制定了命名实体和实体关系的详细标注规范,构建了标注体系完整、规模较大且一致性较高的标注语料库.语料库包含病历文本992份,命名实体标注一致性达到0.922,实体关系一致性达到0.895.为中文电子病历信息抽取后续研究打下了坚实的基础.     

采用Transformer-CRF的中文电子病历命名实体识别

命名实体识别是自然语言处理的基本任务之一。针对中文电子病历命名实体识别传统模型识别效果不佳的问题,提出一种完全基于注意力机制的神经网络模型。实验采用自建真实中文电子病历数据集并对数据集进行人工标注、分词等预处理;对Transformer模型进行训练优化,以提取文本特征;利用条件随机场对提取到的文本特征进行分类识别。为验证所提方法的有效性,将构建的Transformer-CRF神经网络模型与其他7种传统模型进行比较研究,实验采用精确率、召回率和[F1]值三个指标评估模型的识别性能。实验结果显示,在同一语料集下,Transformer-CRF模型对身体部位类的命名实体识别效果较好,[F1]值高达95.02%;且与其他7种传统模型相比,Transformer-CRF模型的精确率、召回率和[F1]值均较高,在一定程度上验证了所构建模型具有较好的识别性能。     

基于预训练模型的中文电子病历实体识别

为提升传统中文电子病历实体识别预训练模型的语义特征提取能力并增强中文隐含特征表示,提出基于改进预训练语言模型的医疗命名实体识别方法。提出动态词长的逆向最大匹配算法对病历文本进行标注歧义处理,在此基础上构建用户自定义医疗实体字典辅助PKU分词,提高预训练模型掩码效果。输入向量层加入字向量,引入注意力机制学习字向量的全局语义特征。改进预训练模型mask策略和机制并去掉下一句预测,提升词向量语义表征能力。实验结果表明,该方法有效提高了医疗实体的识别效果,F1值达到90.57%。     

自由文本电子病历信息抽取综述

电子病历信息抽取技术能够从自由文本电子病历中获取到有用的关键信息,从而为医院的信息管理和后续的信息分析处理工作提供帮助.简要介绍了现阶段自由文本电子病历信息抽取的主要流程,分析了近十几年来关于自由文本电子病历中命名实体、实体修饰与实体间关系三类关键信息的单独抽取以及联合抽取方法的研究成果,对这些成果所采用的主要方法、使...     

基于电子病历的实体识别和知识图谱构建的研究

针对中文电子病历中命名实体识别和实体关系抽取研究方法中存在的问题,提出了一种基于双向长短时记忆网络（bidirectional long short term memory）与CRF（conditional random field）结合的实体识别和实体关系抽取方法。该方法首先使用词嵌入技术将文本转换为数值向量,作为神经网络BiLSTM的输入,再结合CRF链式结构进行序列标注,输出最大概率序列,并对识别结果知识图谱化。实验证明,该方法对中文电子病历进行实体识别和实体关系抽取时的准确率、召回率、◢F◣值有明显的提升。实验结果满足临床中系统应用需求,对帮助研究构建临床决策支持系统、个性化医疗推荐服务有引导作用。     

基于最大熵的汉语人名地名识别方法研究

构建了一个基于最大熵原理的汉语人名地名自动识别混合模型．该模型分为训练和识别两个模块．先从训练语料中抽取特征，利用最大熵方法对特征进行训练．然后使用经过训练的特征，并结合动态词表和少量规则，对测试文本中的汉语人名地名进行识别．达到了比较满意的识别效果．最后对实验结果进行了分析．     

中文医疗文本中的嵌套实体识别方法

实体识别是信息抽取的关键技术. 相较于普通文本, 中文医疗文本的实体识别任务往往面对大量的嵌套实体. 以往识别实体的方法往往忽视了医疗文本本身所特有的实体嵌套规则而直接采用序列标注方法, 为此, 提出一种融合实体嵌套规则的中文实体识别方法. 所提方法在训练过程中将实体的识别任务转化为实体的边界识别与边界首尾关系识别的联合训练任务, 在解码过程中结合从实际医疗文本中所总结出来的实体嵌套规则对解码结果进行过滤, 从而使得识别结果能够符合实际文本中内外层实体嵌套组合的组成规律. 在公开的医疗文本实体识别的实验上取得良好的效果. 数据集上的实验表明, 所提方法在嵌套类型实体识别性能上显著优于已有的方法, 在整体准确率方面比最先进的方法提高0.5%.     

基于强化学习的实体关系联合抽取模型

针对现有的基于远程监督的实体和关系抽取方法存在着标签噪声问题，提出了一种基于强化学习的实体关系联合抽取方法。该模型有两个模块：句子选择器模块和实体关系联合抽取模块。首先，句子选择器模块选择没有标签噪声的高质量句子，将所选句子输入到实体关系联合抽取模型；然后，实体关系联合抽取模块采用序列标注方法对输入的句子进行预测，并向句子选择器模块提供反馈，指导句子选择器模块挑选高质量的句子；最后，句子选择器模块和实体关系联合抽取模块同时训练，将句子选择与序列标注一起优化。实验结果表明，该模型在实体关系联合抽取中的F1值为47.3%，与CoType为代表的联合抽取模型相比，所提模型的F1值提升了1%；与LINE为代表的串行模型相比，所提模型的F1值提升了14%。结果表明强化学习结合实体关系联合抽取模型能够有效地提高序列标注模型的F1值，其中句子选择器能有效地处理数据的噪声。     

中文篇章级句间语义关系识别

篇章句间关系识别(Discourse Relation Recognition)是篇章分析的重要内容,该文对中文篇章句间关系识别任务进行初步探索,包括显式篇章句间关系识别与隐式篇章句间关系识别两类任务。针对显式篇章句间关系,我们提出基于关联词规则的方法进行识别,取得了很好的效果;针对隐式篇章句间关系,我们抽取词汇、句法、语义等特征,采用有指导模型进行识别。该文的分析和实验结果为后续研究提供了参考和基本对照系统。     

基于多元特征的分块人物关系识别系统

随着互联网的飞速发展,大量的文本信息被分享到网上,如何在海量的网络信息中提取出可靠性较高的人物关系已成为信息抽取领域中的一个重要研究课题。为深入进行人物关系识别任务在中文方面的研究,提出了基于多元特征的分块人物关系识别系统,设计了较为完备的特征池,包括词袋特征、相关频率特征、依存树(DT)特征、命名实体识别(NER)特征等,为不同的关系从特征池中选择效果最佳的特征集合,并实验了多种基于有监督的机器学习分类算法。本系统在2015年中国机器学习会议竞赛(CCML Competition)举办的两个任务(Task1是从单个新闻标题中判定给定人物的关系;Task2是从多个新闻标题中判定人物的关系)的数据集上分别取得了75.68%和76.58%的MacroF1值,均位列参赛成绩的第一名。     

基于多步聚类的汉语命名实体识别和歧义消解

命名实体识别和歧义消解是自然语言理解的重要研究内容。针对提供实体知识库情况下的命名实体识别和歧义消解任务,该文提出了一种基于多步聚类的方法。首先通过两轮聚类将命名实体与知识库实体定义链接,然后通过层次聚合式聚类对知识库中未出现的实体进行聚类,最后进行普通词的识别和基于K-Means聚类的结果调整。在CLP-2012的汉语命名实体识别和歧义消解评测数据上的实验表明,该文的方法表现出良好的性能,在测试集上的F值高出评测参赛队伍最好水平6.46%,达到86.68%。     

端到端维吾尔语语音识别研究

近几年来,基于端到端模型的语音识别系统因其相较于传统混合模型的结构简洁性和易于训练性而得到广泛的应用,并在汉语和英语等大语种上取得了显著的效果.本文将自注意力机制和链接时序分类损失代价函数相结合,将这种端到端模型应用到维吾尔语语音识别上.考虑到维吾尔语属于典型的黏着语,其丰富的构词形式使得维吾尔语的词汇量异常庞大,本文引入字节对编码算法进行建模单元的生成,从而获得合适的端到端建模输出单元.在King-ASR450维吾尔语数据集上,提出的算法明显优于基于隐马尔可夫模型的经典混合系统和基于双向长短时记忆网络的端到端模型,最终识别词准确率为91.35%.     

融合多特征的最大熵汉语命名实体识别模型

最大熵模型能有效整合多种约束信息,对于汉语命名实体识别具有很好的适用性,因此,将其作为基本框架,提出一种融合多特征的最大熵汉语命名实体识别模型,该模型集成局部与全局多种特征,同时为降低搜索空间并提高处理效率,而引入了启发式知识,基于SIGHAN 2008命名实体评测任务测试数据的实验结果表明,所建立的混合模式是一种组合统计模型与启发式知识的有效汉语命名实体识别模式,基于不同测试数据的实验说明,该方法针对不同测试数据源具有一致性.