适合一类复杂异构超算系统的HPL并行计算模型研究

[目的]为快速分析超算系统性能,加速HPL基准测试优化,本文分析了HPL主要影响因素,建立了相关并行计算模型.[方法]基于曙光先进计算系统HPL基准测试程序并行优化,采用理论分析与实验验证相结合的方法,分别对HPL效率上限、快速预测、不同参数影响等问题进行分析,建立了相应的并行计算模型.[结果]与曙光先进计算系统测试结...     

基于改进图划分的异构并行计算模型设计

为了实现大规模计算机集群上的高效分布式并行计算,设计了一种基于改进图划分和量子遗传算法的异构节点并行计算模型;首先,介绍了传统图划分模型并分析了其不足,然后从图的有向性、通信开销计算和负载均衡度等方面对传统的图划分模型进行了改进,从而得到一个改进的图划分模型;最后,以最小化通信开销和优化资源负载均衡为目标,通过设计编码方案,在改进的图划分模型上提出了采用量子遗传算法获取最优任务划分方案的最优解;仿真实验表明:文中方法能有效实现任务的并行计算,与其它方法相比,具有较小的通信开销和较好的负载均衡度,具有很强的可行性。     

异构型并行分布计算系统PVM的结构分析

本文描述了异构型并行分布计算系统ＰＶＭ的组成和特征，详细分析了它的软件结构、工作流程和消息通信机制，并提出了它存在的不足之处。     

异构并行计算系统可扩展模型的实现

效率和可扩展性是并行系统的2个重要的性能指标,虽然异构系统越来越普遍,但对其可扩展性的研究还很少。给出一种适合同构系统和异构系统的效率的定义,根据此定义对可扩展性进行分析,得出既适用于同构系统又适用于异构系统的等效率模型,并根据开销比得出在某一效率常数保持一致的情况下系统规模和工作负载应如何变化。实验结果表明该模型可以对效率和可扩展性进行较好的评测,并能预测算法的可扩展性。     

面向异构集群系统的动态负载均衡技术研究

在集群系统中的一个非常重要的问题就是尽量确保负载的均衡.由于目前的负载均衡算法大多针对同构的集群系统,没有很好的扩展性.研究了异构集群系统,提出了一种异构服务器集群的动态负载均衡算法,并取得了较好的效果,特别是在负载较重的时候.     

面向CPU-GPU异构系统的数据分析负载均衡策略

应用于高性能计算领域的通用GPU拥有强大的并行计算能力,以通用GPU作为主处理器的数据分析系统相较于传统数据库能够提供更好的性能。在大数据场景下,如何根据CPU和GPU的资源在处理器之间合理分配工作负载是亟待解决的问题。提出了一种CPU GPU异构数据分析系统上的负载均衡处理策略。该策略采用流水线模型将工作负载分解,基于流水线设计了负载均衡模型,将工作负载合理分配至异构处理器,减少系统总执行时间开销,实现了性能提升。实验结果表明,提出的基于流水线的负载均衡模型能适应不同查询请求下的不同数据量场景,具有良好的性能。     

一种分布式异构带宽环境下的高效数据分区方法

在分布式大数据处理框架的作业运行过程中,会有大量的数据通过网络传输,数据在各节点之间传输所需的时间已成为作业运行的主要开销之一.在节点异构带宽的情况下,因为带宽瓶颈节点的存在,传统的数据分区方法效率低下.针对这个问题,建立了节点间的数据传输模型,该模型以降低数据传输时间为目标,根据各节点的上下行带宽和初始数据量大小,计算出各节点的最优数据分发比例.以该模型为基础,设计了基于带宽的数据分区方法,该数据分区方法使得各节点按最优数据分发比例来分配数据.最后在Apache Flink框架中将基于带宽的数据分区方法进行了实现,并通过实验进行了验证.实验结果表明:异构带宽条件下,基于带宽的数据分区方法可以有效减少数据分区所需的时间.     

基于Linux集群的并行计算

对普通用户来说,在专业集群中进行并行计算的处理,存在费用高、管理困难和操作复杂等问题。针对该问题,利用PC和以太网相连的实验环境,采用集群工作框架和并行计算的关键技术,提出基于Linux集群的并行计算系统环境。在该环境上对系统的性能进行测试,结果证明了系统的可行性。     

SMB协议在异构网络并行FDTD计算中的应用研究

在多系统异构局域网中,由于不同操作环境的消息传递接口（MPI）程序缺乏互操作性,使得并行时域有限差分运算(FDTD)难以充分利用局域网内的计算资源。对此,提出利用应用层服务消息块（SMB）协议实现异构FDTD计算,并通过内存文件存取、内存映射数组以及引入冗余计算等方法来缓解与克服SMB通信延迟对并行性能的影响。数值模拟实例验证了新方法的可行性与正确性,所得加速比、并行效率等性能指标参数与常规同构MPI消息传递方法基本相当。     

基于异构多核的CCA并行构件模型

并行构件技术的出现提高了并行软件的开发效率,但现有的并行构件技术缺乏对异构多核平台的支持.为了提高并行构件程序在异构平台上的执行性能,扩展CCA(通用构件体系结构)并行构件模型支持CCA异构并行构件,提出了一种异构的CCA并行构件模型.使用管理者—工人模式调度CCA异构并行构件内的计算任务到异构多核平台上加速执行.在CCA构件工具包的基础上实现了支持扩展CCA并行构件模型的编译系统和运行时框架.在CELL BE和GPU两种异构多核处理器上进行的实验证明了提出的方法比原始的CCA构件程序具有较优的性能.提出的并行构件模型应用在并行程序开发中可以提高并行程序的性能.     

An efficient parallel mixed method for flow simulations in heterogeneous geological media

The permeability of a 3D geological fracture network is determined by triangulating the fractures and solving the 2D Darcy's equation in each fracture. Here, the numerical modelling aims to simulate a great number of networks made up of a great number of fractures i.e. from 10³ to 10⁶ fractures. Parallel computing allows us to solve very large linear systems improving the realism of simulations. Several algorithms to simulating fluid flow are proposed for the cases of significant matrix permeability. In the case of a weak permeability matrix, the flow is focused in the fractures having a strong permeability and fluids percolate through networks of interconnected fractures. In this paper, we present a complete parallel algorithm for solving flow equations in fracture networks. We consider an imprevious matrix. The different parts of the algorithm are detailed. Numerical examples using the mixed finite element (MFE) method for various fracture networks illustrate the efficiency and robustness of the proposed algorithm. To the best of our knowledge, results for parellel simulation of fluid flow in discrete-fractured media with impervious matrix using the MFE method are the first to appear in the literature.     

基于龙格库塔法的弹塑性有限元并行计算

基于MPI集群环境对弹塑性区域分解有限元并行计算进行研究。提出了基于三阶和四阶的龙格库塔（Runge-Kutta）方法对应力-应变关系进行积分的算法。积分过程中自动调整子步大小来控制积分过程中的误差。研制了采用最小残余平滑法的子结构预处理共轭梯度并行求解算法。算法在基于工作站机群的并行环境下实现。计算结果表明：该算法具有良好的并行加速比和效率,是一种有效的并行求解算法。     

异构机群系统上并行计算双序列的最长公共子序列*

针对处理机节点具有不同计算速度、不同通信能力的情况,考虑计算和通信启动开销,给定处理机分配顺序,基于可分负载理论,提出一种存储受限异构机群系统的序列串最优分配线性规划模型,给出相应的序列串最优分配方法。实验结果表明,基于最优序列串分配方法的双序列最长公共子序列并行算法优于平均分配序列串算法,获得了较好的加速,并具有良好的可扩展性。     

随机行走的电路分析应用及并行化改进

论述了随机行走算法的基本原理,理论分析了给定允许误差和置信概率下,随机行走算法的结束条件;讨论了随机行走算法在电路分析中的应用,并结合应用实例分析了算法的性能;讨论了算法的时间复杂性和影响算法执行时间的主要因素,重点分析了算法的并行特征,提出了采用并行计算技术提高算法性能的新方法,通过与串行算法的实验比较,表明了并行计算技术是提高随机行走算法执行速度的有效方法,比现有的方法适应性更广。     

基于有效并行求解策略的显式有限元分析并行算法

针对大规模结构非线性动力问题的有限元分析非常耗时,基于消息传递接口（MPI）机群环境,提出多种基于并行求解策略的显式有限元并行算法。基于显式消息传递的区域分解技术,采取重叠、非重叠区域分解技术及动态任务分配方法,通过将计算与通信重叠,优化处理器间的通信,对非重叠通信区域分解并行算法、重叠通信区域分解并行算法、群动态任务分配算法、动态任务分配算法及动态负载平衡算法进行研究。为在机群环境下实现非线性动力有限元分析,开发了基于有效并行求解策略的显式有限元并行算法。编写了基于消息传递编程模式的并行有限元程序,在工作站机群上实现了数值算例,分析了算法的性能,并与传统的Newmark算法进行了比较。算例表明：群动态任务分配算法的性能优于动态任务分配算法,低于区域分解算法的性能,动态负载平衡算法最优。对相同规模的问题提出的算法比Newmark算法快,优于Newmark算法。对结构非线性动力问题的有限元分析,所提出的并行算法是可行有效的。     

一种针对异构计算平台的编译期优化方法

针对OpenCL(open computing language)编译时期的特有模式, 提出了一种新的针对异构计算平台的编译期优化方法。该方法根据设备端和主机端的各自特点, 将设备端的一些冗余操作提到主机端或者新的设备端kernel中去执行, 以达到降低存储器读写的目的。这种方法充分利用了异构计算平台的特点, 较传统优化方法相对灵活。大多数情况下能有效提高OpenCL的运行速度, 测试用例中在应用原有编译器优化的基础上最快提高了270%。