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提出了基于Levenberg-Marquardt(LM)算法的BP神经网络对蛋白质序列进行家族分类的新方法.该方法采用二肽含量对蛋白质序列进行特征提取,根据影响因子评价特征的相对重要性,用改进的BP神经网络LM优化算法构造一个三层人工神经网络,通过对PIR数据库中三类家族的学习,该网络对未知蛋白质序列分类的准确率分别达到了98.9%.98.1%,97.8%。 相似文献
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基于神经网络集成的DNA序列分类方法研究 总被引:1,自引:0,他引:1
研究DNA序列分类问题,针对DNA序列数据的特点和目前DNA序列分类精度低的问题,提出了一种基于神经网络集成的DNA序列分类方法。方法实现的第一步采用三种方法提取DNA序列特征,第二步采用附加动量对单个BP神经网络权值进行调整,加快网络的收敛速度,第三步对学习率进行自适应调整,减少迭代次数,第四步利用改进的BP神经网络模型对提取的每种特征分别进行训练分类,第五步神经网络集成决策DNA序列属于哪一类。经实验证明,利用改进方法比单个神经网络分类有更高的分类效率和正确率,具有一定的推广意义。 相似文献
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基于隐马尔科夫模型的DNA序列分类方法 总被引:1,自引:0,他引:1
DNA序列分类是生物信息学的一项基础任务,目的是根据结构或功能的相似性预测DNA序列所属的类别。为进行有效分类,如何将序列映射到特征向量空间并最大程度地保留序列中蕴含的碱基间顺序关系是一项困难的任务。为克服现有方法容易导致因DNA序列碱基残缺而影响分类精度等问题,提出一种新的DNA序列特征表示方法。新方法首先为每条序列训练一个隐马尔科夫模型(HMM),然后将DNA序列投影到由HMM状态转移概率矩阵的特征向量构成的向量空间中。基于这种新的特征表示法,构造了一种 K-NN分类器对DNA序列进行分类。实验结果表明,新型特征表示方法可以较为完整地保留 DNA 序列中不同碱基间的关系,充分反映序列的结构信息,从而有效提高了序列的分类精度。 相似文献
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隐马尔可夫模型是对DNA序列建模的一种简单且有效的模型, 实际应用中通常采用一阶隐马尔可夫模型. 然而, 由于其一阶无后效性的特点, 一阶隐马尔科夫模型无法表示非相邻碱基间的依赖关系, 从而导致序列中一些有用统计特征的丢失. 本文在分析DNA序列特有的生物学构造的基础上, 提出一种用于DNA序列分类的二阶隐马尔可夫模型, 该模型继承了一阶隐马尔可夫模型的优点, 充分表达了蕴涵在DNA序列中的生物学统计特征, 使得新模型具有明确的生物学意义. 基于新模型, 提出一种DNA序列的贝叶斯分类新方法, 并在实际DNA序列上进行了实验验证. 实验结果表明, 由于二阶隐马尔可夫模型充分反映了DNA序列碱基间的结构信息, 新方法有效地提高了序列的分类精度. 相似文献
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从传感器阵列响应曲线中提取有效特征是传统人工神经网络在电子鼻模式识别应用中的第一步.文中提出将传感器阵列时间序列信号直接输入到一种具有丰富动力学特性的嗅觉神经网络中进行模式分类的方法.该方法不仅在仿生角度上使电子鼻进一步模拟了生物嗅觉系统信息处理过程,而且与以前所用的特征提取加神经网络的方法相比,在6种有机挥发物的分类识别中表现得更佳. 相似文献
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张毅 《计算机与数字工程》2012,40(6):30-32,141
针对蛋白质序列难以分类的问题,提出了基于神经网络的蛋白质序列分类算法,通过采用基于频繁模式扫描的蛋白质序列特征抽取技术,采集得到了蛋白质序列的特征参数。在此基础上,构建了三层的神经网络,用于蛋白质序列的分类,经过大量数据对神经网络的训练,经测试表明,文章所设计的蛋白质序列分类算法,其精度达到了98%,尤其是对于一些新出现的蛋白质序列分类效果更好。 相似文献
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针对目前聚类算法在分析DNA序列数据时的低效性和分类精度低问题,提出一种基于蚁群优化聚类算法(ACOC)的DNA序列分类方法,在密度函数中加入自适应感应量并应用模拟退火中的α-适应量的冷却策略,采用DNA序列分布特征对DNA序列进行特征提取,并将pearson相关系数引入蚁群聚类算法作为相似性度量。在EMBL-DNA数据库中4个数据集上进行性能测试,与统计聚类和k-means算法的比较表明,该方法具有一定的时间和精度的优越性,适于解决大规模DNA序列数据分类问题。 相似文献
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针对图片数据的分类问题,从动态构造网络的思想出发,讨论了序列构造神经网络的基本方法,并且把其应用于图片分类中,最后给出标准测试集的分类测试结果,并对其进行了比对、分析和讨论,实验结果表明此方法适合多维数据分析,取得了满意的效果。 相似文献
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提出了一种基于约束规划的选择性神经网络集成方法,在训练出个体网络之后,用约束规划方法选择出相对最佳的个体网络组成神经网络集成。理论分析和实验结果表明,该方法设计过程简单,能够以较小的运算代价提高神经网络集成的泛化能力。 相似文献
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神经网络在控制系统中的应用现状及展望 总被引:1,自引:0,他引:1
本文分析了神经网络在控制系统中的应用,并对目前几种较重要的神经网络控制现状进行了评述,最后对神经网络控制的发展作了展望。 相似文献
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本文分析了神经网络在控制系统中的应用,并对目前几种较重要的神经网络控制现状进行了评述,最后对神经网络控制的发展作了展望。 相似文献
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神经网络方法用于分辨三种化学物质 总被引:2,自引:0,他引:2
采用了一种基于神经网络的杂交算法,用于识别来自氧化锡传感器阵列的三种化学品:丙酮、甲醇和乙醇的信号.算法利用梯度收敛方法并结合仿真退火和遗传算法进行权值初值化来加速运算速度和提高分类准确度。这种方法能较好地避免局部最小点,大量运算实例用来构造最优网络结构并说明这种方法是较好的模式分类方法并可以作为“人工电子鼻”的数据处理方法。 相似文献
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系统故障诊断的一种神经网络方法 总被引:4,自引:0,他引:4
该文首先提出一个通用故障示例模型,然后运用一种自适应神经网络学习算法来寻找差错属性与故障类型之间的对应关系,由此对故障进行诊断。因为网络的结构事先并不确定,而是在训练的同时进行同步构造,所以确保了训练后建立网络具有较好的适应性。 相似文献