PCR-DGGE技术在食品微生物中应用的研究进展

聚合酶链式反应(Polymerase Chain Reaction,PCR)结合变性梯度凝胶电泳(Denaturing Gradient Gel Electrophoresis,DGGE)技术能快速的研究微生物物种多样性,该技术不依赖于微生物的分离培养,便能快速、准确地获取复杂样品中微生物的菌群组成及其遗传信息,因此被广泛应用于微生物生态学、食品微生物学等领域。本文主要介绍了PCR-DGGE在食品微生物中和其他一些方面应用的研究进展。     

高通量测序技术对杀菌型益生菌含乳饮料菌群结构分析

目的：探查杀菌型益生菌含乳饮料中微生物菌群组成分析，及宣称的添加益生菌真实性和合规性分析。方法：对市售11批次产品直接提取的细菌总核酸，扩增，电泳检测核酸的质量；分别对产品的16S rRNA基因V3/V4进行高通量测序技术（NGS）测序，对测序序列、稀释曲线、Alpha多样性、聚类、丰度分布曲线与菌群结构分析，获得信息与产品明示值和相关规范对比进行合规性分析。结果：共得到39231条优质序列，分布在210-518bp范围内；共注解到16个门、37个纲、71个目、129个科、265个属；从门分类水平主要为厚壁菌门( Firmicutes 91.66 %) ，从纲的分类水平主要为芽孢杆菌纲( Bacill 90.43 %)，从目的分类水平主要为为乳杆菌目(Lactobacillales 82.74 %) ；优势菌种为德氏乳杆菌保加利亚亚种、嗜热链球和乳酸乳球菌；同时产品有检出携带致病性非益生菌菌群。部分产品标示菌种未被检出、部分产品检出了未标示菌种、部分产品检出益生菌与标示菌种不一致。结论：本文建立的NGS测序技术能准确、快速的对杀菌型益生菌食品微生物菌群精确筛选，市售产品益生菌种类丰富，但同质化程度较高，产品间菌群分布均匀度相差较大；同时也能深度挖掘到微量的携带致病性的菌群。     

电化学方法在微生物快速检测中的应用

综述了传统电化学方法在微生物快速检测中的应用。将相关研究归为阻抗(电导)法、伏安分析法、电位电流分析法等三大类,回顾了阻抗法在临床微生物学、环境微生物学、食品卫生学中的研究发展过程,比较了其它几种电化学技术的检测能力和不同特点,最后讨论了电化学微生物检测方法的发展方向。     

肉类调理食品中细菌多样性的分析

肉类调理食品方便快捷,营养美味,深受消费者青睐,但其丰富的营养物质容易造成微生物的滋生,影响食品品质和消费者健康。高通量测序技术可以全面、准确的研究肉类调理食品中微生物群落结构,为微生物防控和标准化生产提供理论基础。本文通过均质提取法对肉类调理食品中微生物基因组进行提取,并以16S rRNA可变区V3-V4作为测序片段,分析细菌多样性。实验表明,4种肉类调理食品细菌多样性均较高,菌群结构具有一定的相似性,炸鸡块、骨肉相连和冷冻牛排的优势菌群是Anderseniella属,而羊肉串优势菌群是不动杆菌属,此外肉类调理食品中还存在芽胞杆菌属、梭菌属、泛菌属、假单胞菌属、嗜冷杆菌属和乳球菌属等。本论文明确了使用均质提取法对肉类调理食品中微生物进行16S rRNA V3-V4区测序分析,为后续大规模菌群研究提供思路和方法。     

预测食品微生物学在肉品安全领域的应用

预测食品微生物学是一门对食品微生物进行数量化预测的新兴学科,可以在不进行传统微生物检测的条件下快速对食品的安全性和货架期进行预测。本文简述了预测食品微生物学的概念,模型分类及建模步骤,重点介绍了预测食品微生物学在肉品安全中的定量微生物风险评估、危害分析和关键控制点以及产品货架期等领域的应用,并对其未来发展进行了展望。     

食品微生物研究领域中高通量测序技术的应用研究

高通量测序技术已经成为食品微生物学研究领域的重要工具。在研究过程中,DNA提取和质量控制、文库构建和测序平台选择等步骤需要特别注意。在数据处理和分析过程中,数据质量控制和过滤、群落组成分析、基因功能注释和代谢通路分析等是非常重要的环节。高通量测序技术的应用为深入了解食品微生物的多样性、变化和演替以及微生物与食品品质的关系提供了更全面、深入的视角。这些研究成果有助于更好地保护食品安全、改善食品品质,为人们的健康生活作出更大的贡献。     

PCR-DGGE技术在微生物物种多样性研究中的局限性及其解决措施

变性梯度凝胶电泳(denaturing gradient gel electrophoresis,DGGE)技术目前已经成为研究微生物物种多样性和动态变化的分子检测工具之一.该技术不依赖于微生物的分离培养,便能快速、准确地获取复杂样品中微生物的菌群组成及其遗传信息,因此被广泛应用于微生物生态学、食品微生物学等领域.但DGGE技术存在一定的局限性,有时会造成分析结果的偏差.本文简单概述了DGGE技术的基本原理及其在微生物群落分析中的应用,重点对造成DGGE结果偏差的因素,如DNA提取、PCR扩增、DGGE条件以及DGGE图谱分析等进行讨论,并提出相应的解决措施,旨在对DGGE检测结果的分析提供参考.     

应用人工神经网络技术建立航空配餐微生物生长模型

首次将预测微生物学应用于航空配餐,利用人工神经网络(ANN)技术建立配餐微生物数学模型。选用猪肉冷荤作为研究食品,大肠杆菌、金黄色葡萄球菌和猪肉冷荤本底菌群作为研究微生物;猪肉冷荤灭菌后染有不同浓度组合的研究微生物,检测不同氯化钠和温度水平下,储存2～27h微生物生长繁殖结果:应用人工神经网络技术对大肠杆菌、金黄色葡萄球菌和本底菌群分别建立生长模型,以及3种微生物合并建立模型;通过筛选确定以3种微生物合并建模的第2号MLP模型作为最佳模型,网络拓扑结构为6∶5∶3,训练准确率、测试准确率和验证准确率分别为0.848329、0.871849和0.897135。人工神经网络建立的数学模型能较好地应用于航空配餐冷荤多种微生物生长的预测。     

AFLP技术在食品微生物研究中的应用

随着现代分子生物学技术的发展 ,对微生物学的研究也进入到分子、基因水平。扩增片段长度多态性(AFLP)是一种基于PCR的高分辨率DNA指纹技术 ,它能检测整个微生物基因组的多态性 ,并且结果可重复、分辨率高。近些年来 ,AFLP在细菌等微生物的遗传相关性鉴定、流行病学分型等上的应用得到迅速发展。文中介绍了AFLP技术的基本原理、反应流程 ,探讨了其在食品微生物研究领域中的应用现状和前景     

基于16S rRNA的高通量测序和DGGE法对比新鲜与4℃贮藏腐败的凡纳滨对虾微生物菌群变化

以新鲜和4℃条件下贮藏4 d腐败后的凡纳滨对虾为研究对象,分别采用高通量测序和变性梯度凝胶电泳(DGGE)指纹图谱技术研究对虾微生物菌群组成。结果显示:微生物在门、纲、目、科和属的分类水平上,高通量测序技术检测出新鲜对虾和腐败对虾分别有18和19门、33和46纲、60和89目、93和150科、191和304属;而DGGE法对新鲜对虾和腐败对虾均仅检测到1门、1纲,分别检测到4和5目,3和4科,6和7属。高通量测序检测到新鲜和腐败凡纳滨对虾微生物的4个优势门类群分别为变形菌门(87.54%和91.17%)、拟杆菌门(8.93%和1.05%)、厚壁菌门(1.01%和4.54%)和梭杆菌门(1.01%和0.2%),而DGGE法检测到的门水平优势类群仅变形菌门,表明高通量测序法与DGGE法在反映样本微生物群落规模上具有较大差异。通过DGGE法和高通量测序法发现贮藏期间腐败凡纳滨对虾中弧菌属微生物的相对丰度较新鲜对虾明显降低,而以腐败希瓦氏菌和波罗的海希瓦氏菌为主的希瓦氏菌属微生物相对丰度上升,说明这两种方法在反映优势菌群演替变化规律上结果一致,其中,高通量测序法检测灵敏度和精度更高。     

食品工程中微生物检验技术的创新与应用

<正>微生物检验作为食品安全保障体系的重要组成部分,对于保障公众健康发挥着不可替代的作用。近年来,微生物检验技术经历了从传统培养方法到分子生物学技术再到当前快速检测技术的飞速发展。其中,分子生物学技术如聚合酶链反应(PCR)和基因测序,为检测路径微生物提供了更高的灵敏度和特异性;快速检测技术如免疫分析和生物传感器,极大地缩短了检测时间,提高了工作效率;自动化和信息化技术如自动化培养系统和实验室信息管理系统(LIMS),正在改变传统微生物检验的工作流程,可以实现对数据的高效管理和追踪。本文将探讨食品工程中微生物检验技术的创新与应用,以期为提高食品安全水平提供见解和建议。     

高通量测序在食品微生物生态学研究中的应用

随着分子生物学的发展,越来越多新的研究投入到对食品微生物的研究中。高通量测序作为一种新兴的分子生物学技术,具有数据产出通量高、分析全面、灵敏、快速等特点,被广泛用于食品微生物生态学的研究中。本文对高通量测序的操作流程及其在食品微生物生态学研究中的应用进行总结,评价该技术的优势和局限性,并对其在食品微生物研究中的应用前景进行展望,以期为食品微生物生态学的研究提供参考。     

食品微生物检测的快速方法和自动化

微生物检测的快速方法和自动化研究和应用对解决应用微生物学和食品安全性问题有很大的帮助。本文对取样、样品制备方面;活细胞计数方法;评估总菌量和生物量的新方法和微生物技术的微量化;及诊断工具的应用等方面发展和应用状况进行了讨论。     

食品微生物学的快速检测方法和自动化操作:25年回顾和预测

食品微生物学的快速检测方法和自动化操作属于应用微生物学的动态领域,旨在研究微生物的分离、早期检测、鉴定、计数及在食品、临床、医药、工业和环境样品中的微生物的改进方法.在过去的25年里,这一领域已成为应用微生物学整体领域的一个重要分支,并发展为一些国家和国际的研究和应用领域,以监控与食品腐败、食品保存、食品发酵、食品安全和食源性致病菌相关的微生物的数量、种类及代谢物.     

预测微生物学的研究进展及其在食品中的应用

预测微生物学是食品微生物学中的一个亚学科。本文阐述了预测模型的分类及修改后主要模型的方程式;预测微生物学的研究内容,包括预测模型的改进,环境因子(温度、pH、水分活度等)对微生物(以致病菌和腐败菌为主)生长的影响以及在食品货架期预测、食品安全质量管理等方面的应用等。提出目前研究中存在的问题,并展望该领域今后的研究方向。     

浅析食品微生物检验检测中新技术的应用

人们的生活质量提升后,对食品安全也提出了更高的要求。通过对食品进行检验检测,可以确保食品的安全及质量,而食品微生物是检验检测的重点。在食品微生物检验检测中,需要积极应用先进技术,以此来提升食品微生物检验检测质量,保证食品安全。     

荧光定量PCR在预测微生物学中的应用

食品微生物是影响食品安全的重要因素之一,快速准确预测食品加工和贮存过程中的微生物变化对食品风险评估具有重要意义。本文首先介绍了荧光定量PCR技术的历史及其发展,着重介绍了荧光染料法和水解探针法的基本原理,讨论了其优缺点并对其应用进行总结和展望。然后介绍了预测微生物学的历史及其发展,同时对一二三级模型进行了归纳和分类,并讨论预测模型的意义及在食品领域研究所需要注意的问题。最后介绍了荧光定量PCR技术在预测微生物学中的应用,归纳了当前国内外研究的现状,并指出发展缓慢的可能原因,提出荧光定量PCR技术只停留在检测层面并没有很好用于预测微生物学模型的构建。通过本综述以期推动荧光定量PCR技术在预测微生物学领域的全面应用,进而推动预测微生物学的进一步发展。     

PCR-DGGE技术及其在食品菌相分析中的应用

传统培养、鉴定的方法研究微生物菌相变化的缺点突出,不易对微生物的变化情况进行实时的分析.近年来,使用聚合酶链式反应-变性梯度凝胶电泳技术(PCR-DGGE)分析食品中菌群变化情况的优点逐渐突显.本文介绍了PCR-DGGE技术的原理、优点和缺点,以及在食品菌相研究中的应用,并对该技术在食品微生物研究中的前景进行了展望.     

食品检测专业群微生物学及操作技术课程思政探索

<正>微生物学及操作技术课程是食品检测专业群中的一门重要的基础课程,涉及与微生物相关的理论学习和技能训练。通过该课程的学习,学生可以掌握微生物学的基本知识和技能,为今后从事食品生产加工、检验检测等工作奠定基础。     

白酒酿造窖泥未培养微生物菌群的可培养化策略

窖泥是厌氧微生物的重要栖息地,厌氧微生物菌群的代谢活动对浓香型白酒的香气和风味形成起着重要作用。但大多数窖泥厌氧微生物尚未能在人工实验室培养条件下培养,这严重阻碍了对窖泥厌氧菌群功能的解析。采用CGM、NBM和MCI三种营养成分丰富度不同的培养基,以典型窖泥作为菌群接种源,探索富集菌群的种类与动力学变化。扩增子测序分析表明,寡营养的MCI培养基对于富集窖泥主体菌群是较为有效的,可以同时富集得到产甲烷菌群和细菌菌群,主要包括古菌的广古菌门(Euyarchaeota)、细菌的拟杆菌门(Bacteroidetes)和厚壁菌门(Firmicutes)。使用基于MCI培养基的寡营养技术能有效富集窖泥中高丰度和低丰度厌氧菌,如普雷沃氏菌科(Prevotellaceae)、理研菌科(Rikenellaceae)、Dysgonomonadaceae、太阳杆菌科(Heliobacteriaceae)、瘤胃菌科(Ruminococcaceae)和甲烷八叠球菌科(Methanosarcinaceae)等;同时对扩增子测序无法检测的稀有微生物,包括甲烷鬃菌科(Methanosaetaceae)、消化链球菌科(...