母乳及婴儿粪便菌群分析及功能菌株筛选

目的 探究母乳喂养婴儿粪便菌群及母乳菌群相关性,获得具有潜在益生功能菌株.方法 对健康母子母乳及婴儿粪便样本进行Illumina高通量测序,探究母乳与婴儿粪便样本菌群结构组成,母乳菌群在婴儿肠道垂直传递情况.通过体外益生性质研究,对分离的菌株进行筛选.结果 母乳中的主要菌科为肠杆菌科、莫拉氏菌科、葡萄球菌科和链球菌科;...     

汉族和藏族婴儿肠道微生物群落结构和多样性分析（英文）

为了解民族因素对婴儿的影响,对中国汉族和藏族母乳喂养的健康婴儿粪便微生物菌群进行研究。通过16SrRNA高通量测序技术,发现两组粪便微生物的组成存在差异。在门水平上,汉族婴儿的放线菌门相对丰度较高,而藏族则以厚壁菌门为主,且两组间的厚壁菌门差异显著(P0.05)。基于UniFrac的非加权和加权的主坐标分析表明汉族和藏族婴儿肠道微生物群结构有显著性差异。此外,偏最小二乘判别分析显示两组间微生物明显分离。研究表明,肠道微生物群可以在不同民族的婴儿之间进行区别,从而扩展人类及其共生肠道微生物群共同进化的认识。     

基于宏基因组技术分析产褥期新生儿肠道菌群变化的研究

目的 研究影响产褥期新生儿肠道微生物群的建立过程中的因素。方法 采用宏基因组技术,对不同喂养方式、出生方式和性别的4名在月子会所中产褥期新生儿肠道微生物生态系统形成的过程进行研究。结果 新生儿肠道菌群多样性均明显增加,满月时新生儿肠道菌群中存在显著差异的纲为拟杆菌和放线菌（P<0.05）。母乳与婴儿配方奶粉间隔喂养的混合喂养的新生儿肠道中乳酸杆菌比例显著低于母乳喂养方式的新生儿。母乳喂养的新生儿肠道菌群多样性较低,而混合喂养的新生儿菌群结构则多样性高,拟杆菌、肠杆菌、梭菌的丰度高于母乳喂养的新生儿。在纲水平上,母乳喂养与混合喂养组肠道菌群中存在显著差异的菌为杆菌。满月时女婴肠道菌群物种组成与男婴相比更丰富、分布均匀度更高。结论 喂养方式、分娩方式、性别均在不同程度上影响产褥期新生儿肠道微生物的构成。     

汉族和藏族婴儿肠道微生物群落结构和多样性分析

为了解民族因素对婴儿的影响,对中国汉族和藏族母乳喂养的健康婴儿粪便微生物菌群进行研究。通过16S rRNA高通量测序技术,发现两组粪便微生物的组成存在差异。在门水平上,汉族婴儿的放线菌门相对丰度较高,而藏族则以厚壁菌门为主,且两组间的厚壁菌门差异显著（P＜0.05）。基于UniFrac的非加权和加权的主坐标分析表明汉族和藏族婴儿肠道微生物群结构有显著性差异。此外,偏最小二乘判别分析显示两组间微生物明显分离。研究表明,肠道微生物群可以在不同民族的婴儿之间进行区别,从而扩展人类及其共生肠道微生物群共同进化的认识。     

高通量测序技术研究不同喂养和分娩方式对不同月龄婴幼儿肠道菌群的影响

采用高通量测序技术分析比较54 份不同喂养方式（母乳、羊乳配方粉、牛乳配方粉）、不同分娩方式（顺产、剖宫产）和不同月龄（I段：0～6?个月、II段：6～12?个月、III段：12～36?个月）婴幼儿粪便样本,研究不同影响因素下婴幼儿肠道菌群的构成,尤其是羊乳配方粉对婴幼儿肠道构成的影响,分析肠道菌群的丰度及多样性,比较优势菌丰度,为婴儿配方食品的开发及婴幼儿科学喂养提供技术支撑。结果表明：在相同喂养方式、相同月龄的婴幼儿中,分娩方式对其肠道菌群影响不尽相同,I段顺产母乳喂养组中门水平Actinobacteria（放线菌门）、Firmicutes（厚壁菌门）、Bacteroidets（拟杆菌门）、Proteobacteria（变形菌门）的相对丰度分别为43.74%、25.48%、17.93%、9.71%;I段剖宫产母乳喂养组分别为40.83%、44.31%、3.81%、11.01%;II段顺产羊乳配方粉喂养组分别为41.44%、43.84%、8.38%、6.27%;II段剖宫产羊乳配方粉喂养组分别为60.76%、24.85%、8.66%、5.70%;III段顺产羊乳配方粉喂养组分别为26.58%、47.73%、24.07%、1.58%;III段剖宫产羊乳配方粉喂养组分别为34.77%、51.94%、11.10%、2.16%。在分娩方式相同且相同月龄的婴幼儿中,喂养羊乳配方粉的婴幼儿肠道菌群构成更为多样,且主要优势菌相对丰度更高,Actinobacteria在I段顺产羊乳配方粉喂养组中占62.98%,在I段顺产母乳喂养组中占43.74%;Bacteroidets在II段顺产羊乳配方粉喂养组中占43.84%,在II段顺产牛乳配方粉喂养组中占35.71%。对于相同分娩方式、相同喂养方式的婴幼儿,随着月龄的增长其肠道菌群构成存在显著差异（P＜0.05）,以II段婴幼儿肠道菌群更为多样,且Lactobacillales（乳杆菌目）较I、III段相对丰度更高,为差异显著的优势菌。本研究为婴幼儿的健康、代谢及相关疾病的防御提供参考依据。     

高通量测序技术研究高糖饮食对小鼠肠道菌群的影响

目的比较高糖饮食和普通饲料喂养对小鼠肠道菌群的影响。方法选取16只C57BL/6J小鼠,经适应喂养1周后,随机分为正常组和高糖组,于第5周末,对小鼠粪便菌群16S r RNA的V1-V3区进行扩增,Miseq高通量测序平台测定其基因序列,与silva数据库中微生物基因序列进行比对、分类。结果研究发现:尽管差异性不显著,高糖饮食组小鼠体重和血糖值较正常饮食小鼠有明显升高;正常饮食小鼠粪便菌群多样性高于高糖饮食的小鼠;高糖组粪便中含有大量的Firmicutes(厚壁菌门),较正常组显著升高;高糖组Bacteroidetes(拟杆菌门)数量显著低于正常组;在属的水平上,正常组和高糖组粪便菌群中含量最高的是Allobaculum,其含量无显著差异;而两组在Lactobacillus和S24-7_norank的含量上存在着显著差异。结论饮食类型对肠道菌群有着显著的影响,因而可通过调整饮食结构改善肠道菌群。     

采样方法对冷鲜鸡表面细菌DNA提取及高通量测序结果的影响

目的:比较涂抹法和冲洗法对冷鲜鸡表面细菌DNA提取及高通量测序结果的影响。方法:将4只冷鲜鸡对半分开,分别采用涂抹法和冲洗法采集其表面微生物,提取基因组DNA,对细菌16S rRNA基因V3~V4区进行聚合酶链式反应扩增,通过Illumina Hiseq测序平台对扩增产物进行高通量测序,使用QIIME等软件对测序序列进行分析统计。结果:两种方法采集的样品在细菌基因组DNA提取、菌群丰富度、多样性及菌群结构等方面均无显著差异(P0.05)。高通量测序结果表明,冷鲜鸡表面细菌菌群主要分布于7个门,10个属。变形菌门为优势菌门,占70%以上;希瓦氏菌属、假单胞菌属、不动杆菌属、嗜冷杆菌属和环丝菌属为优势菌属,分别占10%~20%。结论:两种采样方法对冷鲜鸡表面细菌DNA提取及高通量测序没有明显影响,但冲洗法比涂抹法简单易行,且不易发生二次污染,因此更具有实用性。本实验同时也为冷鲜鸡表面细菌的研究提供了数据资料。     

菠萝蜜多糖对小鼠肠道菌群的调节作用

为探究菠萝蜜多糖（JFP-Ps）对小鼠肠道菌群多样性及其结构的影响,将24只雄性昆明小鼠随机分为四组:对照组、JFP-Ps（50 mg/kg BW）组、JFP-Ps（100 mg/kg BW）组和JFP-Ps（200 mg/kg BW）组,连续灌喂2周后,收集新鲜小鼠粪便,提取粪便DNA扩增肠道菌群16S rRNA基因的V3~V4区,通过Illumina高通量测序技术研究菠萝蜜多糖对小鼠肠道菌群的调节作用。结果表明,JFP-Ps可通过调节拟杆菌门（Bacteroidetes）和厚壁菌门（Firmicutes）等肠道优势菌群的组成和结构,增加肠道菌群的多样性。通过属水平分析发现,JFP-Ps可增加拟杆菌属（Bacteroides）、异杆菌属（Allobaculum）、乳酸杆菌属（Lactobacillus）和副拟杆菌（Parabacteroides）等产SCFAs菌属的丰度,减少普雷沃菌属（Prevotella）等菌属丰度,发挥肠道微生物调节作用,改善宿主肠道微生态健康,研究结果为JFP-Ps在肠道益生产品的研发应用奠定理论基础。     

葡萄蒸馏酒对高尿酸血症模型小鼠肠道菌群的调节作用

为了探讨葡萄蒸馏酒与高尿酸血症模型小鼠肠道菌群的关系,将6周龄SPF级雄性小鼠随机分为52%葡萄蒸馏酒低剂量组、中剂量组、高剂量组、空白对照组、模型组和乙醇组,连续灌胃7 d后测定小鼠粪便中的短链脂肪酸和肠道微生物。利用Illumina MiSeq平台进行高通量测序,检测小鼠粪便16S rDNA基因,分析小鼠肠道菌群的变化,并使用气相色谱-质谱联用仪检测小鼠粪便中短链脂肪酸的含量变化。研究发现,低、中剂量葡萄蒸馏酒能提高高尿酸血症模型小鼠肠道微生物的多样性,显著增加拟杆菌门(Bacteroidota)的相对丰度(P<0.05),显著降低厚壁菌门(Firmicutes)的相对丰度(P<0.05),改善高尿酸血症模型小鼠的菌群失调及厚壁菌门与拟杆菌门比值的升高,并增加了肠道有益菌如丁蓖麻球菌、瘤胃球菌、罗氏菌、厌氧棍状菌、梭菌等的相对丰度;葡萄蒸馏酒中剂量组的乙酸、丙酸和正丁酸含量显著高于模型组和乙醇组(P<0.05)。结论：每日摄入52%葡萄蒸馏酒1 mL/kg m_b或2 mL/kg m_b可以改善高尿酸血症模型小鼠肠道菌群失调...     

高通量测序技术研究糖尿病大鼠与正常大鼠粪便菌群的结构差异

为研究糖尿病大鼠和正常大鼠粪便菌群的结构差异,选取SD雄性大鼠,随机分为正常组和糖尿病组,于第4周末,对大鼠粪便菌群16S r RNA的V1~V3区进行扩增,Miseq高通量测序平台测定其基因序列,与silva数据库中微生物基因序列进行比对、分类。研究发现:糖尿病大鼠体重较正常组显著下降;糖尿病大鼠粪便菌群多样性高于正常大鼠;糖尿病大鼠粪便菌群中肠杆菌目,假单孢杆菌目等机会致病菌增多;同时克里斯滕森菌科,明串珠菌科,黄杆菌科,Clostridium sensu stricto 1,Gastranaerophilales_norank,Ruminococcaceae_incertae_sedis等在糖尿病组粪便中大量存在。结果表明:糖尿病大鼠肠道菌群结构与正常大鼠差异显著,存在肠道菌群紊乱的状况,提示临床上可通过调节饮食结构来改善肠道菌群,达到防治2型糖尿病的目的。     

凝固型苦荞酸奶对小鼠肠道菌群的调节作用

通过动物实验,利用实时荧光定量聚合酶链式反应方法、气相色谱-质谱、Illumina高通量测序技术,对小鼠肠道菌群数量和种类,以及主要代谢产物——短链脂肪酸（乙酸、丙酸、丁酸、乳酸）的含量进行分析,探究凝固型苦荞酸奶对小鼠肠道菌群的调节作用。结果表明：与对照组相比,凝固型苦荞酸奶使肠道中3 种有益菌（乳酸杆菌、双歧杆菌、柔嫩梭菌）的数量分别增加了523.81、911.01、12.18 倍,3 种有害菌（肠杆菌、肠球菌、拟杆菌）的数量分别减少了99.89%、97.31%、99.02%。同时,凝固型苦荞酸奶组小鼠粪便中的乙酸、丙酸、丁酸、乳酸的含量分别增加了36.87%、75.59%、56.26%、92.36%,且效果优于普通酸奶组。高通量测序结果表明,凝固型苦荞酸奶较普通酸奶可以显著增加小鼠肠道菌群多样性,在门水平上显著降低厚壁菌门和疣微菌门的丰度,显著提高拟杆菌门的丰度（P＜0.05）;且在属水平上显著提高norank_f__Bacteroidales_S24-7_group、Faecalibaculum菌属的相对丰度,显著降低Ruminococcaceae_UCG-014、unclassified_f__Lachnospiraceae、Lachnospiraceae_UCG-006菌属的相对丰度（P＜0.05）,提高肠道菌群优势菌属的地位。综上所述,凝固型苦荞酸奶相较于普通酸奶,可以更好地促进小鼠肠道内有益菌的增殖并抑制有害菌的增殖,促进短链脂肪酸的生成,增加肠道菌群多样性,优化菌群结构。     

肉桂精油对小鼠肝肠组织抗氧化能力以及肠道菌群结构的调节作用

目的：探究肉桂精油对小鼠肝脏代谢相关酶活性,肝、十二指肠、结肠组织抗氧化能力及肠道菌群的影响,评价肉桂精油的摄入对机体健康的潜在影响。方法：将8 周龄C57雄性小鼠随机分为3 组：对照组和肉桂精油低、高剂量（100、300 mg/（kg·d））组;饲养4 周后测定小鼠体质量、肝脏代谢相关酶活性以及肝、十二指肠、结肠组织抗氧化能力,运用Illumina高通量测序技术测定小鼠肠道菌群的变化情况,利用气相色谱-质谱联用仪检测小鼠粪便中短链脂肪酸含量变化情况。结果：肉桂精油的摄入能够显著降低小鼠腹脂指数,使肝脏丙氨酸氨基转移酶活力、肠道抗氧化能力显著提高（P＜0.05）;摄入肉桂精油后,在门水平上小鼠粪便中软壁菌门（Tenericutes）相对丰度显著降低（P＜0.05）,在属水平上布劳特氏菌属（Blautia）、真杆菌属（[Eubacterium]_fissicatena_group）等条件致病菌相对丰度显著降低（P＜0.05）,罗氏菌属（Roseburia）、粪芽孢菌属（Coprobacillus）等有益菌相对丰度显著上升（P＜0.05）;肉桂精油高剂量组小鼠粪便中乙酸、丙酸、总酸的含量显著降低（P＜0.05）。结论：肉桂精油的摄入能够调节肠道氧化还原状态平衡和肠道菌群结构,抑制致病菌群生长,促进有益菌群增殖,具有潜在促进机体健康的作用。     

高通量测序分析新疆不同产区葡萄酒对大鼠肠道菌群多样性的影响

将雄性SD大鼠随机分为5组（A1～A5）,分别灌胃新疆焉耆盆地、伊犁河谷、天山北麓、吐哈盆地葡萄酒、蒸馏水8周后,收集粪便,采用高通量测序技术分析大鼠肠道菌群变化,探讨不同产区葡萄酒对大鼠肠道菌群的影响。结果表明,各组大鼠肠道菌群具有一定的差异,主要共有优势菌门为厚壁菌门（Firmicutes）和拟杆菌门（Bacteroidetes）,优势菌属为乳杆菌属（Lactobacillus）,A1～A4组中主要优势菌门和菌属的相对丰度之和均比A5组显著升高（P<0.05）,其中A2组升高幅度最大,其有害菌门变形菌门（Proteobacteria）、脱硫菌门（Desulfobacterota）相对丰度显著降低（P<0.05）;有益菌属罗姆布茨菌属（Romboutsia）、艾克蔓菌属（Akkermansia）及乳杆菌属（Lactobacillus）相对丰度显著增加（P<0.05）。结合多级物种差异判别分析,A2组肠乳杆菌（Lactobacillus intestinalis）的富集最具差异性（P<0.05）。说明适量摄入伊犁河谷干红葡萄酒一定程度上能改善肠道菌群。     

Dietary PUFA for preterm and term infants: review of clinical studies

Human milk contains n-3 and n-6 LCPUFA (long chain polyunsaturated fatty acids), which are absent from many infant formulas. During neonatal life, there is a rapid accretion of AA (arachidonic acid) and DHA (docosahexaenoic acid) in infant brain, DHA in retina and of AA in the whole body. The DHA status of breast-fed infants is higher than that of formula-fed infants when formulas do not contain LCPUFA. Studies report that visual acuity of breast-fed infants is better than that of formula-fed infants, but other studies do not find a difference. Cognitive development of breast-fed infants is generally better, but many sociocultural confounding factors may also contribute to these differences. The effect of dietary LCPUFA on FA status, immune function, visual, cognitive, and motor functions has been evaluated in preterm and term infants. Plasma and RBC FA status of infants fed formulas supplemented with both n-3 and n-6 LCPUFA was closer to the status of breast-fed infants than to that of infants fed formulas containing no LCPUFA. Adding n-3 LCPUFA to preterm-infant formulas led to initial beneficial effects on visual acuity. Few data are available on cognitive function, but it seems that in preterm infants, feeding n-3 LCPUFA improved visual attention and cognitive development compared with infants receiving no LCPUFA. Term infants need an exogenous supply of AA and DHA to achieve similar accretion of fatty acid in plasma and RBC (red blood cell) in comparison to breast-fed infants. Fewer than half of all studies have found beneficial effects of LCPUFA on visual, mental, or psychomotor functions. Improved developmental scores at 18 mo of age have been reported for infants fed both AA and DHA. Growth, body weight, and anthropometrics of preterm and term infants fed formulas providing both n-3 and n-6 LCPUFA fatty acids is similar in most studies to that of infants fed formulas containing no LCPUFA. A larger double-blind multicenter randomized study has recently demonstrated improved growth and developmental scores in a long-term feeding study of preterm infants. Collectively, the body of literature suggests that LCPUFA is important to the growth and development of infants. Thus, for preterm infants we recommend LCPUFA intakes in the range provided by feeding of human milk typical of mothers in Western countries. This range can be achieved by a combination of AA and DHA, providing an AA to DHA ratio of approximately 1.5 and a DHA content of as much as 0.4%. Preterm infants may benefit from slightly higher levels of these fatty acids than term infants. In long-term studies, feeding more than 0.2% DHA and 0.3% AA improved the status of these fatty acids for many weeks after DHA; AA was no longer present in the formula, enabling a DHA and AA status more similar to that of infants fed human milk. The addition of LCPUFA in infant formulas for term infants, with appropriate regard for quantitative and qualitative qualities, is safe and will enable the formula-fed infant to achieve the same blood LCPUFA status as that of the breast-fed infant.     

配方奶粉和母乳中结构脂质差异及其对婴幼儿生理功能的影响研究进展

母乳喂养和配方奶粉喂养婴儿的差异可以归因于母乳中多种成分在数量和质量上与配方奶粉的不同,特别是甘油三酯的结构和类型。本文基于国内外不同配方奶粉和母乳中结构脂质差异的研究现状,对两者结构脂质差异、消化与吸收过程、粪便排泄、脂肪酸代谢等作用分别进行了综述,并就不同结构脂质对婴幼儿生理健康的影响进行了总结归纳。     

新疆新源县酸马奶细菌菌群分析

通过对新疆那拉提高海拔草原自然发酵变酸后的传统酸马奶采用Illumina MiSeq平台高通量测序和生物信息学分析,检测酸马奶中可培养和不可培养的细菌菌群组成;同时利用MRS培养基分离纯化获得可培养乳酸菌,对菌株进行形态学、生理生化特征及分子生物学鉴定。结果表明,高通量测序后根据操作分类单元（OTU）划分水平,显示出酸马奶的细菌菌群结构丰富,但菌群多样性较低,其中厚壁菌门（Firmicutes）为酸马奶中的优势菌门,占所有菌群的85.78%;乳杆菌属（Lactobacillus）为酸马奶中的优势菌属,占所有菌群的84%。通过传统乳酸菌培养分离出菌株MN-Is,经鉴定为乳杆菌属（Lactobacillus）。     

金柚幼果膳食纤维改善糖尿病小鼠的肠道健康

为了研究金柚幼果膳食纤维对小鼠肠道健康的影响。将小鼠随机分为6组,按照0.2mL/10g体重的剂量进行灌胃。灌胃4周后,HE染色观察结肠组织损伤情况,收集小鼠粪便及结肠,测定水分、pH值和短链脂肪酸(SCFAs)含量。通过试剂盒提取各组小鼠粪便细菌总DNA,利用高通量测序技术对16S rRNA基因的V4区域进行测序,最后通过生物信息学方法对测序数据进行分析,并结合前期研究进行血糖相关指标与肠道菌群的相关性分析。结果显示:金柚幼果膳食纤维实验组可提高糖尿病小鼠在结肠及粪便中的水分含量,SCAFs含量,降低pH值水平,其中水分含量以TDF组上升最为显著,分别提高了8.04%和21.36%;SCAFs含量在结肠、粪便中均在TDF组有显著变化,分别升高475.19%(乙酸)和702.56%(正丁酸)。同时HE染色实验表明金柚幼果膳食纤维在一定程度上可以减缓因糖尿病导致的肠道黏膜损伤;其能够促进有益菌群繁殖,同时抑制有害微生物增殖;该膳食纤维调节小鼠的血糖水平可能与其进入肠道后被益生菌发酵,产生短链脂肪酸有关。结果表明金柚幼果膳食纤维可以维持肠粘膜屏障的完整性,调节肠道菌群的结构,对小鼠的肠道健康具有改善调节的作用。