基于VC＋＋6．0的生物信息处理软件的设计和实现

根据生物实验室的数据处理需要，采用面向对象的方法，设计和开发了生物信息处理软件BioTools。实现生物信息分析的自动化，是生物实验室特别是从事分子生物学研究工作的好帮手。     

甘蓝型油菜芜菁花叶病毒分离物TuMVH1的生物学研究

采自杭州甘蓝型油菜上的芜菁花叶病毒分离物ＴｕＭＶＨ１经寄主反应测定，不侵染茄科普通烟和心叶烟，对多数供试甘蓝型油菜和十字花科蔬菜品种（品系）有强的致病力。枯斑指示植物检测和ＥＬＩＳＡ检测，选择成青２号大白菜作为毒原繁殖寄生，提纯病毒的得率为６－７ｍｇ病毒／１００ｇ鲜病叶，用提纯病毒制备的兔抗血清经环状沉淀反应测得其效价为１／２００００，免疫电镜观察，ＴｕＭＶＨ１与同源纯病毒制备的兔抗血清经环状沉淀     

基于VC++6.O的生物信息处理软件的设计和实现

根据生物实验室的数据处理需要,采用面向对象的方法,设计和开发了生物信息处理软件BioTools.实现生物信息分析的自动化,是生物实验室特别是从事分子生物学研究工作的好帮手.     

柞蚕滞育关联蛋白基因dap2的表达特征及分子特性

滞育关联蛋白(DAP)在昆虫滞育进程中可能发挥重要作用。从NCBI获取柞蚕滞育关联蛋白基因2(Antheraea pernyi diapause-associated protein 2,dap2)的序列,序列分析表明该基因的cDNA全长1 187bp,ORF为874bp,编码278个氨基酸。NCBI数据库氨基酸序列比对,DAP2与烟草天蛾和家蚕的眼色素结合蛋白(omminbinding protein,OBP)同源性分别达到57%和58%。通过荧光定量PCR和Western blotting方法,分别检测柞蚕不同发育时期和五龄幼虫不同组织中dap2的转录表达水平,结果表明dap2在滞育蛹中转录和表达水平最高;在5龄幼虫不同组织中的分析表明其转录水平在脂肪体和血淋巴中最高,在翻译水平上血淋巴中表达最高。分离纯化后,对天然DAP2蛋白分子特性进行初步研究,吸收光谱分析不能表明其携带色素,去糖基化修饰分析表明其为糖蛋白,双向电泳表明其可能存在三种不同程度的翻译后修饰,推测其可能是柞蚕的一种眼色素结合蛋白(ommin-binding protein,OBP)。     

镀锌军绿色钝化工艺的维护

通过试验分析军绿色钝化槽液各成分含量对膜层品质的影响,从而确定了合适的初始配槽方案。根据实际生产中钝化膜色泽变化及各成分含量对膜层品质的影响,确定了钝化槽液各成分的补加规律,确保了军绿色钝化产品的膜层品质稳定,并延长槽液的更换周期。     

家蚕孤雌生殖相关蛋白ERp57基因的克隆和分析

ERp57蛋白是一种二硫化物异构酶,它是目前发现的最为突出的多功能蛋白之一,除了二硫键的异构酶的基本功能外,还具有其他多种生物学功能。应用二维凝胶电泳（2DE）技术研究家蚕孤雌生殖的总蛋白质,通过和正常家蚕卵总蛋白进行比较分析得到家蚕卵中可能与孤雌生殖相关的差异蛋白点,得到了一个与家蚕蛋白折叠相关的钙结合蛋白——ERp57。根据已有的cDNA文库,从家蚕蛹中克隆得到的ERp57基因的cDNA。利用各种生物信息学的方法和工具,对这个基因的核酸水平和蛋白质水平进行了详细的分析,为进一步研究其结构与功能的关系提供参考。     

家蚕BmLITAF基因的克隆表达及生物信息学分析

在对家蚕蛹cDNA文库进行分析时,发现一条与脂多糖诱导肿瘤坏死因子α的转录激活因子LITAF的保守结构域同源的保守序列。基因序列全长为981 bp,由97 bp的5端非翻译区序列(5 UTR)、390 bp的开放读码框(ORF)和494 bp的3端非翻译区序列(3 UTR)组成。利用生物信息学方法对BmLITAF进行基因结构分析发现,此基因由3个外显子和2个内含子组成,编码129个氨基酸残基;其预测理论分子量为13.9 kDa,预测等电点6.47;在90~100位氨基酸残基区域具有较高的疏水性,具有跨膜结构域;定位细胞内的可能性较大。根据BmLI-TAF的cDNA序列进行PCR扩增获得目的基因,将其克隆到质粒pGEX-4T-3中,测序验证克隆正确。经IPTG诱导,结果发现目的蛋白主要以包涵体的形式存在。     

家蚕znfhit基因的克隆表达及序列分析

在对家蚕蛹 cDNA文库的测序中发现了znfhit(zinc finger HIT)的 EST序列(GenBank登录号 DY230769).经过比对发现znfhit全长为1019bp,由297bp的 5'端非编码区序列(5'UTR)、462bp的开放读码框(ORF)和260bp的3'端非编码区序列(3'UTR)组成.将该基因的cDNA和家蚕基因组序列比对,此基因由3个外显子和2个内含子组成.ZNFHIT蛋白的疏水性最大值为1.533,最小值为-3.267,且不含跨膜区域.用PCR方法扩增获得znfhit基因,将其克隆至质粒pET-28a上,构建重组质粒pET-znfhit,并在大肠杆菌中大量表达,经镍离子亲和层析纯化得到重组蛋白,质谱鉴定其分子量为21.11KD,为后续研究其功能提供了条件.