An empirical molecular docking study of a di-iron binding protein with iron ions

Various molecular docking software packages are available for modeling interactions between small molecules and proteins.However,there have been few reports of modeling the interactions between metal ions and metalloproteins.In this study,the AutoDock package was employed to example docking into a di-iron binding protein,bacterioferritin.Each binding site of this protein was tested for docking with iron ions.Blind docking experiments showed that all docking conformations converged into two clusters,one for internal iron binding in sites within the metalloprotein and the other for external iron binding on the protein surface.Local docking experiments showed that there were significant differences between two internal iron binding sites.Docking at one site gave a reasonable root-mean-square deviation(RMSD) distribution with relatively low binding energy.Analysis of the binding mode quality for this site revealed that more than half of the docking conformations were categorized as having good binding geometry,while no good conformations were found for the other site.Further investigations indicated that coordinating water molecules contributed to the stability of binding geometries.This study provides an empirical approach towards the study of molecular docking in metalloproteins.     

一种变形表面的三维测量方法

提出一种新的利用标定图像进行三维测量的方法。利用SIFT算法找到初始的对应点,然后根据这些点生成三维空间中的种子点,再以这些种子点为中心,向外区域增长,直到完成整个物体表面测量。在每次增长的过程中,需要计算增长的三维空间平面在两个相机上的投影之间的图像相关系数。图像相关系数较大时认为是正确的增长,否则是错误的增长。实验证明,使用该方法能够得到很好的三维测量结果。     

利用SQLServer实现局域网软件自动升级

介绍了一种只利用SQLServer,无需其他专门服务器就可以轻松实现的局域网软件自动升级方法。     

C++语言编程技术分析

阐述了C++语言与C语言的关系,以及C++编程技术的基础,对C++最为突出的程序设计功能类和对象进行分析,给出了C++语言编程的有关技巧.     

软件类专业校企合作共建实训基地研究

从国家发展时工程型人才需求出发,分析了工程应用型人才培养的必要性,以及校企共建实训基地在工程应用型人才培养方面所起的作用.结合高校软件类专业工程应用型人才培养的现状、特点和要求,以及软件类专业实训基地的特点,提出了当前软件类专业校企合作实训基地的模式,探讨了建立校企合作实训基地必须要考虑和解决的问题.     

非圆曲线的数控处理及程序实现

引用优化设计中一维搜索和黄金分割法,针对数控加工中非圆曲线的处理,给出实用、简洁和新颖的宏程序实现方法,解决在数控系统中求解方程组的问题,是数控用户快速解决相关应用问题的有效手段。     

WebGIS车辆监控系统的空间数据存储技术研究

本文介绍了WebGIS技术,论述了基于这种技术建立的车辆监控系统的总体框架和系统的工作原理,分析了系统数据特点和数据存储要求,详细阐述了利用Oracle Spatial管理WebGIS车辆监控数据系统的空间数据,包括模型的建立、空间表的创建与存储过程、空间数据的导入以及空间数据索引的创建。最后,给出了该系统与数据库连接的方法,即采用Java语言开发,利用JDBC方式实现系统与应用程序的连接。     

基于MiniGUI的图像即时处理终端实现的关键技术

以现代嵌入式电子产品中图像处理终端为研究对象,本文对图像即时编辑功能进行了分析和设计。基于嵌入式ARM开发平台,使用MiniGUI嵌入式图形界面开发系统,最终实现一个可完成图像浏览、更新、标注以及利用二分聚类算法实现搜索功能的图形界面应用程序,实现了图像的即时处理,并提高了图像检索速度。     

基于B/S模式的数据监视技术研究与实现

作为过程工业监测的核心内容,数据监视被广泛应用于过程工业实际生产领域。本文试图从理论设计与实际应用两方面研究全新的基于B/S模式的数据监视技术。理论上,该技术系统的设计需要着重考量系统架构和功能的设计方式;应用上,该技术系统的实现将有赖于AJAX这一重要技术的引入。本文将以流程图模块与实时趋势图模块的实现为例,深入解释该技术在实际中的运用方法。