大规模生物网络马尔可夫聚类的并行化算法

马尔可夫聚类算法（MCL）是在大规模生物网络中寻找模块的一个有效方法，能够挖掘网络结构和功能影响力较大的模块。算法涉及到大规模矩阵计算，因此复杂度可达立方阶次。针对复杂度高的问题，提出了基于消息传递接口（MPI）的并行化马尔可夫聚类算法以提高算法的计算性能。首先，生物网络转化成邻接矩阵；然后，根据算法的特性，按照矩阵的规模判断并重新生成新矩阵以处理非平方倍数矩阵的计算；其次，并行计算通过按块分配的方式能够有效地实现任意规模矩阵的运算；最后，循环并行计算直至收敛，得到网络聚类结果。通过模拟网络和真实生物网络数据集的实验结果表明，与全块集体式通信（FCC）并行方法相比，平均并行效率提升了10个百分点以上，因此可以将该优化算法应用在不同类型的大规模生物网络中。     

蛋白质相互作用网络的相似子网搜索问题研究

蛋白质相互作用网络（Protein-Protein Interactions Network,PIN）的相似性问题是目前生物信息学领域研究的热点。将计算机科学和生物学相结合,提出了蛋白质相互作用网络邻居优先搜索算法。该算法综合蛋白质的序列信息和蛋白质相互作用网络的拓扑结构信息,适度提高与相似蛋白质有直接相互作用的蛋白质之间的相似系数,实现了不同物种间蛋白质相互作用相似子网络的搜索。与同类算法的对比实验表明,该算法可以处理更大规模的目标子网搜索,计算速度明显提高,且利用该算法获得的结果与目标子网具有更长的相似路径。论文采用该算法研究了酵母和果蝇的蛋白质相互作用网络,获得了10条相对保守的蛋白质相互作用（Protein-Protein Interactions,PPI）。     

基于网格的分布式数据计算预测蛋白质相互作用关系

随着不同物种蛋白质相互作用关系数据的大量积累,蛋白质相互作用特别是大规模蛋白质相互作用的研究成为生命科学领域的又一个研究热点.目前互联网上存在大量分布式的、异构的蛋白质相互作用关系数据源,用户难以高效地整合这些数据源中的信息.本文针对多个大容量的蛋白质相互作用关系数据库,在数据网格BD-Grid环境下,提出了预测蛋白质相互作用关系通用结构框架,通过有效的元数据管理服务和合理的数据分类服务,屏蔽异构数据库间的差异,实现了用户对数据的透明存取,并在该数据平台上,实现了预测蛋白质相互作用关系的应用,使相关领域的研究人员能以生物信息学的方法研究蛋白质的相互作用关系.初步的实验结果说明,该BD-Grid具有较好的性能.     

基于消息传递接口的大规模生物网络比对并行化算法

为有效降低生物网络比对算法的时间复杂度,提出一种基于可扩展的蛋白质相互作用网络比对(SPINAL)算法的消息传递接口(MPI)并行化实现方法。该方法将MPI并行化思想运用在SPINAL算法中,在多核环境中采用并行排序代替算法原本的排序方式,并结合负载均衡策略合理分配任务。实验结果表明,与未使用并行排序以及负载均衡策略相比,该方法在处理大规模生物网络比对时能有效地缩短计算时间,提高运算效率,对于不同组比对数据都有较为稳定的优化保障,具有良好的可扩展性。     

利用标本实现软件体系结构的重用

在软件重用技术中，除了功能部件的重用之外，还应当有软件体系结构和框架的重用。文本阐述了具有类Ａｄａ风格的软件标本重用的技术，提出将标本作为重用库中的可重用单元。阐明了标本重用的基本概念，途径及实现方法。是时，本文提出了重用库中的单元组成标准的建议。     

湖北网上电信营业厅解决方案

结合湖北电信的特点，从软硬件配置、技术实现、业务设置、关键技术等各方面提出了通过Internet技术实现网上电信营业厅的全面解决方案。该方案遵循业界分布式计算的各项工业标准和集团公司提出的业务需求。     

西露天矿周边建筑物损害区位特征分析

近百年来,辽宁抚顺西露天矿在开采过程中引发的地裂缝、地表沉陷导致周围城区建筑物开裂、倾斜甚至拆迁,严重影响到周边居民的生产与生活。通过对抚顺西露天矿周边城区36 km²内建筑物的详细调查,综合分析城区地质情况、地表监测数据和数值模拟,得到边坡影响区的地表变形规律,揭示了位于露天矿边坡不同距离、修建年代、结构形式的建筑物损害特征,并提出针对不同区位建筑物的加固建议和措施。研究表明,城区建筑物损害主要是砖混结构,损害机理按距矿坑边界距离分为北帮0～100 m为边坡卸荷变形、北帮100～500 m为地表沉陷、北帮500～700 m与南帮0～600 m为地裂缝活动。卸荷变形区由于北帮边坡坡顶产生指向坑内位移,引起建筑物基础剪切破坏,上部墙体产生裂缝。地表沉陷区由于北帮"三角楔形体"向南倾倒,导致位于沉陷外缘区建筑物墙体受拉错动。地裂缝区建筑物由于地裂缝活动产生的不均匀沉降造成建筑物墙体受剪破坏。针对建筑物损害特征,提出距矿坑边界不同距离建筑物加固建议。北帮距矿坑0～100 m建筑物重点加固基础,100～500 m建筑物重点加固墙体及梁柱,500～700 m建筑物重点加固墙...     

“公共建筑的‘公共性’之思”主题沙龙

本次沙龙是继9月4日“城市社区体育设施建设与实践”主题沙龙之后．《城市建筑》在北京组织的第三场学术沙龙。作为《城市建筑》原本以笔谈形式操作的开篇论坛栏目的转型．我们希望通过这种面对面交流的沙龙形式．对每一次的议题探讨都能扎实深入下去．尝试找到对现实问题的一些解答。     

高技术企业成长理论综述

高技术企业不仅是当今全球现代化的竞争焦点,而且是中国经济发展的推动力量.对高技术企业成长全过程进行整体研究,建立适合发展中国家与中国特定环境的企业成长理论,才能指导中国高技术企业的健康成长,最终形成长期、持续的竞争优势.关于企业成长的理论与实证研究主要是针对工业化背景下企业成长的动力与方式等问题,国内相关研究主要在消化、吸收、综合国外理论文献的基础上,综合中国企业成长的经验教训,初步提出了一些有建设性的学术观点;国外研究主要集中在现代化进程中企业成长中的质(企业素质的提高)与量(企业规模的扩大)两个方面.目前,也有研究者开始致力于将高技术企业作为一个独立对象进行研究,但现有的研究还是相对表面与局部,其深入与综合的程度有待进一步提高.     

平海1000MW超超临界机组锅炉运行参数精细化控制

本文介绍了广东惠州平海发电厂有限公司两台1000MW超超临界机组投产后通过改变氧量、一次风压、制粉系统自动逻辑的传统控制策略,实现了对不同工况、不同煤种运行参数的精细化控制,对提高锅炉效率及降低厂用电率取得了良好的效果并大大降低了运行人员日常操作调整的工作量。