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51.
1IntroductionWeobtainedaphysicalmodelfortheCNF--SATproblemyearsago['--'].Fromthismodel,andbyobservationandcomputing,wegotthephysicalhypothesisPHHYsimilartothatin[3].Now,wehavearrivedatthefollowingstrictmathematicalstatement.StatemeDt.IfthehypothesisPHHYiscorrect,thentherewillbeanalgorithmAforcheckingsatisfiabilityofanygivenCNFx.Awillgiveadefiniteanswer.TheprobabilityforAtogivearightansweriswherelxlisthelengthofx,Pisanabsolute(universal)polynomialwithpositivecoefficients,tistherunning… 相似文献
52.
HP模型是一种被广泛研究的简化的蛋白质折叠模型.在蛋白质螺旋结构的预测上有很高的可信度.但是HP的正方格点模型存在能量计算缺陷,影响其对链上特定结构的计算.针对这一缺陷,给出一种模型上的修正,引入了三角化的格点模型.利用求解格点蛋白质模型高效的算法PERM对通用算例进行了基于2-D三角格点模型的仿真计算.得到了紧密的蛋白质链折叠构型.构型最小能量比正方格点模型更低,得到的标准算例构型比较吻合实际蛋白质折叠的直观构型.计算结果验证了改进模型的有效性.对后续的研究提出了建议. 相似文献
53.
HP格点模型是目前预测蛋白质折叠结构的一种最简单和最流行的模型,该模型已被证明是NP完全问题。将问题的解空间组织成树型结构,利用启发式规则—k步探测法对结点的可能分支进行评估,采用最佳优先策略搜索解空间树。最后用最佳优先搜索算法(BF)对一组公认的算例进行了实算,计算结果表明,BF计算效率优于传统的遗传算法和Monte Carlo方法。 相似文献
54.
55.
56.
求解蛋白质结构预测问题的二维连续模型及其相应的拟物算法 总被引:7,自引:1,他引:6
研究了生物信息学中的一个重要问题,即蛋白质结构预测.受物理世界的物体间相互作用的规律的启发,给出了该问题一个二维欧氏空间连续模型.它比离散模型有一定的优越性,此模型的优点可能在于让计算很自然地利用到了一个客观存在的“天然导引”,这个“天然导引”即是疏水氨基酸之间的引力,从而在构形优度相当的前提下,连续模型有助于计算速度的提高.然后根据这个连续模型找到了相应的拟物算法,最后给出了一些实验结果,它们也说明了这个连续模型及相应的拟物算法的优点. 相似文献
57.
对继承策略在求解SAT问题的严格算法中如何运用做了初步的研究,用继承策略改进了李初民于1997年提出的一种严格算法,改进后的算法速度提高5%左右。 相似文献
58.
一种基于禁忌搜索的作业车间调度算法 总被引:8,自引:0,他引:8
文章描述了一种解决作业车间调度最短完工时间问题的有效的启发式算法。该算法基于禁忌搜索技术和前瞻思想,为了得到更好的结果,还将倒转技术引入到算法中。从对一组问题基准实例的实验计算结果看,该算法在合理的计算时间内,对多个实例得到比2004年提出的ISSB算法和另一种基于禁忌搜索的TSAB算法更好的结果。 相似文献
59.
求解SAT问题的拟人退火算法 总被引:18,自引:3,他引:18
该文利用一个简单的变换,将可满足性(SAT)问题转换为一个求相应目标函数最小值的优化问题,提出了一种用于跳出局部陷阱的拟人策略,基于模拟退火算法和拟人策略,为SAT问题的高效近注解得出了拟人退火算法(PA),该方法不仅具有模拟退火算法的全局收敛性质,而且具有一定的并行性,继承性。数值实验表明,对于本文随机产生的测试问题例,采用拟人策略的模拟退火算法的结果优于局部搜索算法,模拟退火算法以及近来国际上流行的WALKSAT算法,因此拟人退火算法是可行的和有效的。 相似文献
60.
求解具有NP难度的圆形packing问题具有很高的理论与实用价值.现提出一个启发式方法,求解了货运中常遇到的矩形区域内的不等圆packing问题.此算法首先将待布局圆按半径大小降序排列,然后用占角动作来逐个放置.通过试探性地放入一个或多个待布局圆,给出了占角动作的度以及更全局的有限枚举策略来评价占角动作的优度.在放置每一个圆时,以贪心的方式选取当前具有最大优度的占角动作来放置.最后用测试算例验证了算法的高效性. 相似文献